КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 16-15-00149
НазваниеРазработка метода определения статуса адаптивного иммунитета при иммунодефицитных состояниях на основе анализа структуры репертуара Т-клеточных рецепторов наивных Т-лимфоцитов
Руководитель Британова Ольга Владимировна, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук , г Москва
Конкурс №11 - Конкурс 2015 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований по приоритетным тематическим направлениям исследований» (11)
Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-108 - Иммунология
Ключевые слова Т клеточный рецептор (ТКР), структура репертуара ТКР, высоко-производительное секвенирование, биоинформатика
Код ГРНТИ34.15.00, 34.15.33
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Адаптивный иммунитет играет ключевую роль в защите организма от вирусных инфекций и онкологических заболеваний. Высокое индивидуальное разнообразие наивного репертуара Т- и B-лимфоцитов (по нашим оценкам, не менее 10 миллионов уникальных вариантов (14)) является залогом эффективной защиты организма от широкого диапазона патогенов и патологических клеток.
В настоящее время наблюдается стремительный рост объемов данных для индивидуальных репертуаров ТКР и антител, получаемых с применением массированного секвенирования в исследовательских лабораториях университетов, клиниках и фармацевтических компаниях (5-7, 9, 24). Многие крупные фармацевтические компании в настоящее время активно используют или начинают использовать этот инструмент в повседневной работе (1,2).
В предлагаемом проекте разработанные в нашей лаборатории эффективные технологии анализа иммунных рецепторов будут использованы для разработки диагностических методов оценки статуса адаптивного иммунитета. Диагностическая система будет базироваться на исследованиях анализа структуры и разнообразия Т клеточных рецепторов наивных Т лимфоцитов в норме и при иммунодефицитных состояниях. Будут сформированы основные параметры диагностической шкалы, в которые войдут оценка наблюдаемого разнообразия репертуара ТКР наивных лимфоцитов, структурные характеристики гипервариабельного домена бета цепи ТКР, а также параметры иммунофенотипирования.
В рамках настоящего проекта будет разработан метод определения статуса адаптивного иммунитета, основанный на точном анализе структуры репертуара наивных Т лимфоцитов. Используя такой подход будет проведено исследование долговременных последствий воздействия высокодозного ионизирующего излучения на адаптивный иммунитет, а также сравнительное исследование восстановления разнообразия Т клеточного репертуара лимфоцитов после различных протоколов трансплантации гемопоэтических клеток и иммуносупресионной терапии.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Егоров Е.С.,Касацкая С.А., Зубов В.Н, Израельсон М., Наконечная Т.О., Староверов Д.Б, Кукку Ф., Мамедов И.З, Розатти Е., Франке А., Шугай М, Погорелы М.В,, Чудаков Д.М,, Британова О.В.
The Changing Landscape of Naive T Cell Receptor Repertoire With Human Aging
Front Immunol (год публикации - 2018)
10.3389/fimmu.2018.01618
2. На Ли, Винсент Ван Унен, Тамим Абделаал, Memory CD4+ T cells are generated in the human fetal intestine Nature Immunology (год публикации - 2018)
3. Егоров Е., Касацкая С., Израельсон М., Наконечная Т. , Британова О. LANDSCAPES OF T CELL RECEPTOR REPERTOIRES The FEBS journal, Volume 284,S1 September 2017, P.3.3.B-022 (год публикации - 2017)
4. Е. М. Мерзляк, С.А. Касацкая, А.В Сосновская, М.А. Израельсон, Д.Б. Староверов , Т.О. Наконечная, П.И. Новиков, Д.М.Чудаков, О.В.Британова Long-term effect of high cyclophosphamide doses on the repertoire of the T-cell receptors of peripheral blood T-lymphocytes in patients with autoimmune vasculitis Bulletin of RSMU (год публикации - 2017)
5.
Британова ОВ, Шугай М, Мерзляк ЕМ, Староверов ДБ, Путинцева ЕВ, Турчининова МА, Мамедов ИЗ, Погорелый МВ, Болотин ДА, Израильсон М, Давыдов А, Егоров ЕС, Касацакая СА, Ребриков ДВ, Лукьянов С, Чудаков ДМ
Dynamics of Individual T Cell Repertoires: From Cord Blood to Centenarians.
J Immunol (год публикации - 2016)
10.4049/jimmunol.1600005
6.
Британова ОВ, Шугай М, Мерзляк ЕМ, Староверов ДБ, Путинцева ЕВ, Турчининова МА, Мамедов ИЗ, Погорелый МВ, Болотин ДА, Израильсон М, Давыдов А, Егоров ЕС, Касацакая СА, Ребриков ДВ, Лукьянов С, Чудаков ДМ
Long-term dynamics of individual T-cell receptor beta repertoires
European Jourmnal of Immunology (год публикации - 2016)
10.1002/eji.201670200
7. Егоров Е.С., Израельсон М.А., Касацкая С.А., Наконечная Т.О. , Британова О.В. ВОЗРАСТНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ В СТРУКТУРЕ Т-КЛЕТОЧНЫХ РЕПЕРТУАРОВ ACTA NATURAE, СПЕЦВЫПУСК №1 2017 ТОМ 9, 85 (год публикации - 2017)
8.
Сорчини Д, Брусколи С, Фрамертино Т, Чимино М, Маццон Э, Джалуппо М, Браминти П, Ал-Банчабучи М, Фарли Д, Ермакова О, Британова О, Израельсон М, Чудаков Д, Биаголи М, Спортолетти П, Фламини С, Сцавицци Ф, Нерлов К, Миглиорати Г,, Рикарди Г, Берещенко О
Wnt/β-Catenin Signaling Induces Integrin α4β1 in T Cells and Promotes a Progressive Neuroinflammatory Disease in Mice.
The journal of immunology, November 1, 2017, 199 (9) 3031-3041 (год публикации - 2017)
10.4049/jimmunol.1700247
9.
МС Дэви,КР Уилкокс, СП Джойс, К Ладел, СА Касатская, ДИ Макларен, С Хантер, М Салим, Ф Мохаммед, ДА Прайс, ДМ Чудаков, БИ Уилкокс
Clonal selection in the human Vd1 T cell repertoire indicates gd TCR-dependent adaptive immune surveillance
Nature communications (год публикации - 2017)
10.1038/ncomms14760
10. Израельсон МА, Наконечная Т.О., Шугай М. , Британова О.В. МЕТОД ВСЕСТОРОННЕГО АНАЛИЗА РЕПЕРТУАРА Т-КЛЕТОЧНЫХ РЕЦЕПТОРОВ. ACTA NATURAE, СПЕЦВЫПУСК №1 2017 ТОМ 9, 20 (год публикации - 2017)
Публикации
1.
Егоров Е.С.,Касацкая С.А., Зубов В.Н, Израельсон М., Наконечная Т.О., Староверов Д.Б, Кукку Ф., Мамедов И.З, Розатти Е., Франке А., Шугай М, Погорелы М.В,, Чудаков Д.М,, Британова О.В.
The Changing Landscape of Naive T Cell Receptor Repertoire With Human Aging
Front Immunol (год публикации - 2018)
10.3389/fimmu.2018.01618
2. На Ли, Винсент Ван Унен, Тамим Абделаал, Memory CD4+ T cells are generated in the human fetal intestine Nature Immunology (год публикации - 2018)
3. Егоров Е., Касацкая С., Израельсон М., Наконечная Т. , Британова О. LANDSCAPES OF T CELL RECEPTOR REPERTOIRES The FEBS journal, Volume 284,S1 September 2017, P.3.3.B-022 (год публикации - 2017)
4. Е. М. Мерзляк, С.А. Касацкая, А.В Сосновская, М.А. Израельсон, Д.Б. Староверов , Т.О. Наконечная, П.И. Новиков, Д.М.Чудаков, О.В.Британова Long-term effect of high cyclophosphamide doses on the repertoire of the T-cell receptors of peripheral blood T-lymphocytes in patients with autoimmune vasculitis Bulletin of RSMU (год публикации - 2017)
5.
Британова ОВ, Шугай М, Мерзляк ЕМ, Староверов ДБ, Путинцева ЕВ, Турчининова МА, Мамедов ИЗ, Погорелый МВ, Болотин ДА, Израильсон М, Давыдов А, Егоров ЕС, Касацакая СА, Ребриков ДВ, Лукьянов С, Чудаков ДМ
Dynamics of Individual T Cell Repertoires: From Cord Blood to Centenarians.
J Immunol (год публикации - 2016)
10.4049/jimmunol.1600005
6.
Британова ОВ, Шугай М, Мерзляк ЕМ, Староверов ДБ, Путинцева ЕВ, Турчининова МА, Мамедов ИЗ, Погорелый МВ, Болотин ДА, Израильсон М, Давыдов А, Егоров ЕС, Касацакая СА, Ребриков ДВ, Лукьянов С, Чудаков ДМ
Long-term dynamics of individual T-cell receptor beta repertoires
European Jourmnal of Immunology (год публикации - 2016)
10.1002/eji.201670200
7. Егоров Е.С., Израельсон М.А., Касацкая С.А., Наконечная Т.О. , Британова О.В. ВОЗРАСТНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ В СТРУКТУРЕ Т-КЛЕТОЧНЫХ РЕПЕРТУАРОВ ACTA NATURAE, СПЕЦВЫПУСК №1 2017 ТОМ 9, 85 (год публикации - 2017)
8.
Сорчини Д, Брусколи С, Фрамертино Т, Чимино М, Маццон Э, Джалуппо М, Браминти П, Ал-Банчабучи М, Фарли Д, Ермакова О, Британова О, Израельсон М, Чудаков Д, Биаголи М, Спортолетти П, Фламини С, Сцавицци Ф, Нерлов К, Миглиорати Г,, Рикарди Г, Берещенко О
Wnt/β-Catenin Signaling Induces Integrin α4β1 in T Cells and Promotes a Progressive Neuroinflammatory Disease in Mice.
The journal of immunology, November 1, 2017, 199 (9) 3031-3041 (год публикации - 2017)
10.4049/jimmunol.1700247
9.
МС Дэви,КР Уилкокс, СП Джойс, К Ладел, СА Касатская, ДИ Макларен, С Хантер, М Салим, Ф Мохаммед, ДА Прайс, ДМ Чудаков, БИ Уилкокс
Clonal selection in the human Vd1 T cell repertoire indicates gd TCR-dependent adaptive immune surveillance
Nature communications (год публикации - 2017)
10.1038/ncomms14760
10. Израельсон МА, Наконечная Т.О., Шугай М. , Британова О.В. МЕТОД ВСЕСТОРОННЕГО АНАЛИЗА РЕПЕРТУАРА Т-КЛЕТОЧНЫХ РЕЦЕПТОРОВ. ACTA NATURAE, СПЕЦВЫПУСК №1 2017 ТОМ 9, 20 (год публикации - 2017)
Публикации
1.
Егоров Е.С.,Касацкая С.А., Зубов В.Н, Израельсон М., Наконечная Т.О., Староверов Д.Б, Кукку Ф., Мамедов И.З, Розатти Е., Франке А., Шугай М, Погорелы М.В,, Чудаков Д.М,, Британова О.В.
The Changing Landscape of Naive T Cell Receptor Repertoire With Human Aging
Front Immunol (год публикации - 2018)
10.3389/fimmu.2018.01618
2. На Ли, Винсент Ван Унен, Тамим Абделаал, Memory CD4+ T cells are generated in the human fetal intestine Nature Immunology (год публикации - 2018)
3. Егоров Е., Касацкая С., Израельсон М., Наконечная Т. , Британова О. LANDSCAPES OF T CELL RECEPTOR REPERTOIRES The FEBS journal, Volume 284,S1 September 2017, P.3.3.B-022 (год публикации - 2017)
4. Е. М. Мерзляк, С.А. Касацкая, А.В Сосновская, М.А. Израельсон, Д.Б. Староверов , Т.О. Наконечная, П.И. Новиков, Д.М.Чудаков, О.В.Британова Long-term effect of high cyclophosphamide doses on the repertoire of the T-cell receptors of peripheral blood T-lymphocytes in patients with autoimmune vasculitis Bulletin of RSMU (год публикации - 2017)
5.
Британова ОВ, Шугай М, Мерзляк ЕМ, Староверов ДБ, Путинцева ЕВ, Турчининова МА, Мамедов ИЗ, Погорелый МВ, Болотин ДА, Израильсон М, Давыдов А, Егоров ЕС, Касацакая СА, Ребриков ДВ, Лукьянов С, Чудаков ДМ
Dynamics of Individual T Cell Repertoires: From Cord Blood to Centenarians.
J Immunol (год публикации - 2016)
10.4049/jimmunol.1600005
6.
Британова ОВ, Шугай М, Мерзляк ЕМ, Староверов ДБ, Путинцева ЕВ, Турчининова МА, Мамедов ИЗ, Погорелый МВ, Болотин ДА, Израильсон М, Давыдов А, Егоров ЕС, Касацакая СА, Ребриков ДВ, Лукьянов С, Чудаков ДМ
Long-term dynamics of individual T-cell receptor beta repertoires
European Jourmnal of Immunology (год публикации - 2016)
10.1002/eji.201670200
7. Егоров Е.С., Израельсон М.А., Касацкая С.А., Наконечная Т.О. , Британова О.В. ВОЗРАСТНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ В СТРУКТУРЕ Т-КЛЕТОЧНЫХ РЕПЕРТУАРОВ ACTA NATURAE, СПЕЦВЫПУСК №1 2017 ТОМ 9, 85 (год публикации - 2017)
8.
Сорчини Д, Брусколи С, Фрамертино Т, Чимино М, Маццон Э, Джалуппо М, Браминти П, Ал-Банчабучи М, Фарли Д, Ермакова О, Британова О, Израельсон М, Чудаков Д, Биаголи М, Спортолетти П, Фламини С, Сцавицци Ф, Нерлов К, Миглиорати Г,, Рикарди Г, Берещенко О
Wnt/β-Catenin Signaling Induces Integrin α4β1 in T Cells and Promotes a Progressive Neuroinflammatory Disease in Mice.
The journal of immunology, November 1, 2017, 199 (9) 3031-3041 (год публикации - 2017)
10.4049/jimmunol.1700247
9.
МС Дэви,КР Уилкокс, СП Джойс, К Ладел, СА Касатская, ДИ Макларен, С Хантер, М Салим, Ф Мохаммед, ДА Прайс, ДМ Чудаков, БИ Уилкокс
Clonal selection in the human Vd1 T cell repertoire indicates gd TCR-dependent adaptive immune surveillance
Nature communications (год публикации - 2017)
10.1038/ncomms14760
10. Израельсон МА, Наконечная Т.О., Шугай М. , Британова О.В. МЕТОД ВСЕСТОРОННЕГО АНАЛИЗА РЕПЕРТУАРА Т-КЛЕТОЧНЫХ РЕЦЕПТОРОВ. ACTA NATURAE, СПЕЦВЫПУСК №1 2017 ТОМ 9, 20 (год публикации - 2017)