Прогнозирование распространения птичьего гриппа в России и Японии для предупреждения и контроля: роль Восточноазиатского-Австралийского пролетного пути в перемещении генов и реассортации вируса гриппа

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 17-44-07001

НазваниеПрогнозирование распространения птичьего гриппа в России и Японии для предупреждения и контроля: роль Восточноазиатского-Австралийского пролетного пути в перемещении генов и реассортации вируса гриппа

Руководитель Шаршов Кирилл Александрович, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины» , Новосибирская обл

Конкурс №21 - Конкурс 2017 года на получение грантов Российского научного фонда по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований международными научными коллективами» (совместно с Министерством сельского, лесного и рыбного хозяйства Японии - MAFF/AFFRCS)

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-110 - Общая и молекулярная микробиология; вирусология

Ключевые слова вирус птичьего гриппа, мониторинг, экология, перемещение генов, реассортация, характеризация, патогенность, широтное распространение, раннее обнаружение, прогнозирование

Код ГРНТИ34.15.31

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Широкое распространение в мире новых или вновь возникающих патогенов (например, высокопатогенного вируса гриппа птиц (HPAIV), коронавирусов, вызывающих тяжелый острый респираторный синдром (SARS) и ближневосточный респираторный синдром (MERS)) является серьезной угрозой для человека. Эти патогены возникают в результате появления новых вариантов вирусов вследствие генетических изменений или проникновения нового варианта вируса из новых регионов или природных резервуаров. Такие патогены вызывают эпидемии и эпизоотии с высокой потенциальной опасностью для человека. По этой причине крайне необходимо разрабатывать систему прогнозирования, которая позволит оценить риск появления таких возбудителей, опасных для человека и животных, с целью оптимизации современной диагностики, профилактики и лечения. Грипп птиц находится в центре глобальной исследовательской работы и сбора данных; он является глобальной моделью контроля и прогнозирования заболеваний. Вместе с тем, необходим комплексный и эффективный подход, который позволяет прогнозировать и инициировать раннее предупреждение распространение заболевания. Основной целью предлагаемого проекта является расширение наших знаний о гриппе птиц для получения информации, способствующей разработке комплекса мер в сфере сельского хозяйства и здравоохранения, направленных на противодействие распространению гриппа птиц, особенно высокопатогенного вируса гриппа птиц В рамках выполнения данного проекта предлагается впервые создать Международный Консорциум квалифицированных вирусологов и орнитологов двух стран, которые будут осуществлять комплексное исследование биологического материала, собранного от диких перелетных водоплавающих птиц, гнездящихся на озерах и реках азиатской части России и Японии. В ходе выполнения проекта будут собраны образцы от диких перелетных водоплавающих птиц, из которых будут выделены вирусы гриппа с последующим получением полногеномных нуклеотидных последовательностей и проведением молекулярно-биологического и филогеографического анализа. Во время экспедиции японские участники Проекта будут устанавливать датчики для GPS-телеметрии перелетным птицам, чтобы выявить их миграционные пути, которые позволяют вирусу гриппа птиц распространяться в другие регионы. Еще одним важным аспектом этого проекта является изучение молекулярных маркеров патогенности, а также выявление механизмов патогенности для высокопатогенных вирусов гриппа птиц на животных моделях (мыши, куры). Это исследование поможет комплексному пониманию проблемы экологии и патобиологии вирусов гриппа птиц, в том числе высокопатогенных, в их естественных резервуарах, что приведет к дальнейшему выяснению роли миграции диких водоплавающих птиц как предполагаемого вектора передачи вируса на дальние расстояния по всему миру. Собранная информация будет использована для создания системы прогнозирования распространения высокопатогенного вируса гриппа птиц, что будет способствовать быстрому выявлению и диагностике заболевания на Дальнем Востоке России и в Японии. Одной из ключевых проблем является раннее выявление новых потенциально опасных вариантов на территории России для своевременного совершенствования методов и средств диагностики, профилактики и лечения; для совершенствования мероприятий по контролю инфекции. Предлагаемый проект направлен на решение конкретной задачи в рамках заявленного научного приоритета РФ, обусловленного проблемой социально-экономического развития общества, а именно, проблемой птичьего гриппа. Подобное фундаментальное исследование является базовым и перспективным для международного сообщества региона, имеющее огромное прикладное значение в области здравоохранения, ветеринарии, охраны природы и биобезопасности. Успешная реализация такой масштабной задачи возможна исключительно в рамках предложенного Международного Консорциума (Россия, Япония). Зарубежные партнеры имеют многолетний результативный опыт работ и значительный задел в области исследований вируса гриппа и экологии его хозяев в Азиатско-Тихоокеанском регионе, что послужит базой для эффективного выполнения совместного заявляемого Проекта с использованием уникальной взаимодополняющей материально-технической и организационно-методической базы научных организаций Консорциума. Таким образом, впервые будет создан Консорциум из российских и японских организаций для решения конкретных ключевых задач в рамках приоритета, получения результатов мирового уровня и создание существенного задела для решения ключевых проблем научного приоритета. Тема Проекта полностью соответствует научному приоритету и государственным интересам РФ в Азиатско-Тихоокеанском регионе.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Шаршов К.А., Курская О.Г., Соболев И.А., Леонов С.В., Кабилов М.Р., Аликина Т.П., Алексеев А.Ю., Юшков Ю.Г., Сайто Т., Учида Ю., Майн Ю, Ирза В.Н., Шестопалов А.М. The first detection of G1-like H9N2 virus in Russia, 2018 Journal of Veterinary Science (год публикации - 2019)

2. Прокопьева Е.А., Цинзерлинг В.А., Ючан Бае, Ёнгкук Квон, Курская О.Г., Соболев И.А., Комиссаров А.Б., Фадеев А.В., Петров В.Н., Шестопалов А.М., Шаршов К.А. Pathobiology of H5N8 (clade 2.3.4.4) virus in chickens Journal of Molecular Histology (год публикации - 2019)

3. Курская О.Г., Рябиченко Т.И., Леонова Н.В., Ши В., Би Х., Шаршов К.А., Казачкова Е.А., Соболев И.А., Прокопьева Е.А., Карцева Т.А., Алексеев А.Ю., Шестопалов А.М. Viral etiology of acute respiratory infections in hospitalized children in Novosibirsk City, Russia (2013 – 2017) PLoS ONE, 2018 Sep 18;13(9):e0200117 (год публикации - 2018)
10.1371/journal.pone.0200117

4. Юрченко К.С., Жоу П., Ковнер А.В., Завьялов Е.Л., Шестопалова Л.В., Шестопалов А.М. Oncolytic effect of wild-type Newcastle disease virus isolates in cancer cell lines in vitro and in vivo on xenograft model PLoS ONE, 13(4): e0195425 (год публикации - 2018)
10.1371/journal.pone.0195425

5. Прокопьева Е.А., Шаршов К.А., Романовская А.А., Соболев И.А., Курская О.Г., Соловьева Е.И., Шестопалова Л.В., Зайковская А.В,, Алексеев А.Ю., Шестопалов А.М. Сравнительный анализ патогенности вирусов гриппа А(H5N1) и A(H1N1)pdm09 у лабораторных мышей Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии, №2, С.38-44 (год публикации - 2018)

6. Шестопалов А.М., Щелканов М.Ю., Шаршов К.А. НОВЫЕ ВЫСОКОПАТОГЕННЫЕ ВИРУСЫ ГРИППА ПТИЦ (2016–2017 гг.) Материалы "ПЕРВОГО ВСЕРОССИЙСКОГО ОРНИТОЛОГИЧЕСКОГО КОНГРЕССА", г. Тверь, 2018, С. 353 (год публикации - 2018)

7. Шаршов К.А., Ли Д., Ли С.,Мурашкина Т.А., Курская О.Г., Соболев И.А., Алексеев А.Ю., Свэйн Д.Е., Сайто Т., Шестопалов А.М. Avian Influenza Surveillance: Reassortant Clade 2.3.4.4 Avian Influenza H5N8 virus in northern Eurasia (2016-2017) Proceedings of the International Conference "Global Alliance for Research on Avian Diseases", P.16 (год публикации - 2018)

8. Шаршов К., Курская О., Соболев И., Леонов С., Кабилов М., Аликина Т., Алексеев А., Дерко А., Юшков Ю., Сайто Т., Учида Ю., Минэ Ю., Ирза В., Шестопалов А. The first detection of G1-like H9N2 virus in Russia, 2018 Korean Journal of Veterinary Research, 59(1)37~42 (год публикации - 2019)
10.14405/kjvr.2019.59.1.37

9. Корнеев Д., Курская О., Шаршов К., Иствуд Д., Страховская М. Ultrastructural Aspects of Photodynamic Inactivation of Highly Pathogenic Avian H5N8 Influenza Virus Viruses, 11(10). pii: E955 (год публикации - 2019)
10.3390/v11100955

10. Соболев И., Курская О., Леонов С., Кабилов М., Аликина Т., Алексеев А., Юшков Ю., Сайто Т., Учида Ю., Минэ Ю., Шестопалов А. Шаршов К., Novel reassortant of H1N1 swine influenza virus detected in pig population in Russia Emerging Microbes & Infections, 2019;8(1):1456-1464 (год публикации - 2019)
10.1080/22221751.2019.1673136

11. Прокопьева Е.А., Цинзерлинг В.А., Бае Ю.Ч., Квон Ю., Курская О.Г., Соболе И.А., Кожин П.М., Комиссаров А., Фадеев А., Петров В.Н., Шестопалов А.М., Шаршов К.А. Pathology of A(H5N8) (Clade 2.3.4.4) Virus in Experimentally Infected Chickens and Mice Interdisciplinary Perspectives on Infectious Diseases, Volume 2019, Article ID 4124865, 8 (год публикации - 2019)
10.1155/2019/4124865

12. Цунекуни Р., Судо К., Нгуен П.Т., Луу Б.Д., Фуонг Т.Д., Тан Т.М., Нгуен Т., Минэ Д., Накаяма М., Таникава Т., Шаршов К., Такемае Н., Сайто Т. Isolation of highly pathogenic H5N6 avian influenza virus in Southern Vietnam with genetic similarity to those infecting humans in China Transboundary and Emerging Diseases (год публикации - 2019)
10.1111/tbed.13294

13. Минэ Ю., Учида Ю., Шаршов К., Соболев И., Шестопалов А., Сайто Т. Phylogeographic evidence for the inter- and intracontinental dissemination of avian influenza viruses via migration flyways PLoS ONE, 14(6): e0218506. (год публикации - 2019)
10.1371/journal.pone.0218506

14. Минэ Ю., Учида Ю., Накаяма М., Цунекуни Р., Шаршов К., Соболев И., Шестопалов А., Сайто Т. Genetics and pathogenicity of H5N6 highly pathogenic avian influenza viruses isolated from wild birds and a chicken in Japan during winter 2017–2018 Virology, Volume 533, July 2019, Pages 1-11 (год публикации - 2019)
10.1016/j.virol.2019.04.011

15. Шаршов К., Минэ Ю., Соболев И., Курская О., Дубовицкий Н., Кабилов М., Аликина Т., Накаяма М., Цунекуни Р., Дерко А., Прокопьева Е., Алексеев А., Щелкано М., Друзяка А., Гаджиев А., Учида Ю., Шестопалов А., Сайто Т. Characterization and Phylodynamics of Reassortant H12Nx Viruses in Northern Eurasia Microorganisms, 7, 643 (год публикации - 2019)
10.3390/microorganisms7120643

16. Такемае Н., Тсунекуни Р., Шаршов К., Таникава Т., Учида Ю., Ито Х., Сода К., Усуи Т., Соболев И., Шестопалов А., Ямягучи Т., Майн Й., Ито Т., Сайто Т. Five distinct reassortants of H5N6 highly pathogenic avian influenza A viruses affected Japan during the winter of 2016-2017 Virology, 2017 Dec;512:8-20. Epub 2017 Sep 9. (год публикации - 2017)
10.1016/j.virol.2017.08.035

17. Шаршов К.А., Сивай М.В., Музыка В.В., Сайфутдинова С.Г., Алексеев А.Ю., Сакода И., Сайто Т., Ранстадлер Дж.Аю, Кида Х., Шестопалов А.М. Avian influenza virus circulation in wild birds migrating along the East Asian-Australian Flyway in Russian Far East Australian Veterinary Journal (год публикации - 2018)

18. Прокопьева Е.А., Романовская А.А., Шаршов К.А., Соболев И.А., Алексеев А.Ю., Дурыманов А.Г., Шестопалов А.М. Molecular determinants possibly involved in the adaptation of pandemic A(H1N1)09 influenza virus to a new host Future Virology, 12(9), 491–498 (год публикации - 2017)
10.2217/fvl-2017-0026

Публикации