КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 19-14-00098
НазваниеПоиск и изучение функций генов эмбрионального скейлинга.
Руководитель Зарайский Андрей Георгиевич, Доктор биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук , г Москва
Конкурс №35 - Конкурс 2019 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-106 - Биология развития
Ключевые слова эмбриональное развитие, эмбриональные регуляции, скейлинг, дифференцировка клеток, морфогены, морфогенетическое поле, морфогены, сиквенс нового поколения, анализ транскриптомов, экспрессия генов.
Код ГРНТИ34.15.49
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Предлагаемый проект направлен на решение одной из важнейших проблем биологии развития - выяснение молекулярных механизмов формирования морфогенетических полей - крупномасштабных динамических структур, обеспечивающих правильную пространственную разметку эмбриональных зачатков. Главная цель проекта – исследование функций найденных нами ранее генов, ответственных за эмбриональный скейлинг – уникальное и малоизученное свойство эмбрионов регулировать свою пространственную структуру в зависимости от своего размера. Также планируется поиск с помощью разработанного ранее подхода новых регуляторов эмбрионального скейлинга. Данный подход основан на предсказании наших теоретических исследований о том, что, по-крайней мере некоторые компоненты реакционно-диффузионных систем, ответственных за формирования морфогенетических полей в эмбрионах – транскрипты определенных генов, названных нами скейлерами (от английского scale - масштаб), в отличие от транскриптов большинства генов, должны резко менять свою концентрацию при изменении размеров эмбриона. Из этого предсказания следует, что транскрипты скейлеров могут быть идентифицированы в результате сравнения транскриптомов эмбрионов разного размера. В предыдущем проекте с помощью этого подхода, при сравнении транскриптомов искусственно уменьшенных и нормальных эмбрионов шпорцевой лягушки на стадии поздней гаструлы, в качестве потенциального скейлера мы идентифицировали секретируемую матриксную металлопротеиназу-3 (MMP3). Было показано, что в уменьшенных эмбрионах экспрессия этого гена резко снижается, что приводит к уменьшению общего количества одного из основных эмбриональных индукторов – белка Chordin. Мы установили, что уменьшение количества этого белка, при снижении концентрации MMP3, происходит в следствие того, что MMP3 "спасает" Chordin от его деградации в результате действия другой металлопротеиназы - Tolloid. В свою очередь, уменьшение количества Chordin изменяет масштаб дорсо-вентральной разметки эмбриона в соответствии с его уменьшенными размерами. Тем самым было подтверждено, что MMP3 действительно функционирует как скейлер. В результате реализации настоящего проекта планируется, во-первых, выяснить механизм зависимости экспрессии гена MMP3 от размеров эмбриона. Во-вторых, изучить молекулярные функции и роль в сейлинге идентифицированного ранее другого потенциального скейлера - гена, кодирующего трансмембранный транспортный белок SLC16A6 из суперсемейства solute carrier, и в отличие от MMP3, резко усиливающего свою экспрессию в уменьшенных эмбрионах. В-третьих, расширить применение разработанного нами подхода, проведя поиск скейлеров на стадии ранней гаструлы у эмбрионов шпорцевой лягушки, а также у эмбрионов двух эволюционно далеких от лягушки организмов - у морского ежа Strongilocentrotus pallidus и у гидроида Nematostella vectenesis. В-четвертых, с использованием полученных и литературных данных провести математическое моделирование процессов эмбрионального скейлинга у эмбрионов шпорцевой лягушки, а также уточнить класс моделей, в принципе обладающих характеристикой скейлинга. Таким образом, в результате реализации предлагаемого проекта будут получены абсолютно новые данные, имеющие важное значение для решения одной из фундаментальных проблем биологии - для выяснения механизмов формирования морфогенетических полей в эмбриогенезе. В частности, впервые на молекулярно-генетическом уровне будут изучены механизмы, обеспечивающие уникальное свойство морфогенетических полей - их способность к скейлингу при изменении размеров эмбрионов.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., зарайский А.Г., Байрамов А.В.
The expression of FoxG1 in the early development of the European river lamprey Lampetra fluviatilis demonstrates significant heterochrony with that in other vertebrates
Gene Expression Patterns, 34:119073 (год публикации - 2019)
10.1016/j.gep.2019.119073
2.
Короткова Д.Д., Любецкий В.А., Иванова А.С., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Зверков О.А., Мартынова Н.Ю., Нестеренко А.М., Терёшина М.Б., Пешкин Л. Зарайский А.Г.
Bioinformatics Screening of Genes Specific for Well-Regenerating Vertebrates Reveals c-answer, a Regulator of Brain Development and Regeneration
Cell Reports, 29(4):1027-1040 (год публикации - 2019)
10.1016/j.celrep.2019.09.038
3. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Паршина Е.А., Зарайский А.Г. КОМПАКТНАЯ МОДЕЛЬ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ С УЧЕТОМ ВРЕМЯ-ЗАВИСИМОЙ КОМПЕТЕНЦИИ. СЛУЧАЙ ЛАТЕРАЛЬНОЙ РАЗМЕТКИ МЕЗОДЕРМЫ АМФИБИЙ СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VI СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ, С. 309-310 (год публикации - 2019)
4. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Бородулин А.В., Паршина Е.А., Иванов И.И., Белогуров А.А., Голышев С.А., Зарайский А.Г. СВЯЗЫВАНИЕ С ГЕПАРИНОВЫМ МАТРИКСОМ КАК ОСНОВНОЙ ФАКТОР, ВЛИЯЮЩИЙ НА ПОДВИЖНОСТЬ БЕЛКОВ В МЕЖКЛЕТОЧНОМ ПРОСТРАНСТВЕ СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VI СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ, С. 309-310 (год публикации - 2019)
5. Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г. NGS approach to study embryonic scaling: an evidence for a new scaling mechanism. The Second European Amphibian Club 2019, p. 57 (год публикации - 2019)
6. Зарайский А.Г. Как найти гены эмбрионального скейлинга? Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития». (год публикации - 2019)
7.
Байрамов А.Г., Ермакова А.Г., Зарайский А.Г.
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕХАНИЗМЫ РАННЕГО РАЗВИТИЯ КОНЕЧНОГО МОЗГА, КАК ОТРАЖЕНИЕ ИСТОРИИ ПОЯВЛЕНИЯ И ЭВОЛЮЦИИ ЭТОГО УНИКАЛЬНОГО ОТДЕЛА ЦЕНТРАЛЬНОЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ ПОЗВОНОЧНЫХ
Онтогенез, том 51, № 3, с. 193–209 (год публикации - 2020)
10.31857/S0475145020030052
8.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., Зарайский А.Г., Байрамов А.В.
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ПАТТЕРНОВ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ СЕМЕЙСТВА NOGGIN НА РАННИХ СТАДИЯХ РАЗВИТИЯ ГОЛОВНЫХ СТРУКТУР ЕВРОПЕЙСКОЙ РЕЧНОЙ МИНОГИ LAMPETRA FLUVIATILIS
Онтогенез, том 52, № 1, с. 1–10 (год публикации - 2021)
10.31857/S0475145021010031
9.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., Зарайский А.Г., Байрамов А.В.
Discovery of four Noggin genes in lampreys suggests two rounds of ancient genome duplication
Communications Biology, 3: 501 (год публикации - 2020)
10.1038/s42003-020-01234-3
10.
Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г.
РОЛЬ МАТЕРИНСКОГО ГЕНА pou5f3.3/oct60 В РЕГУЛЯЦИИ НАЧАЛЬНЫХ ЭТАПОВ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ ТКАНЕЙ В ЭМБРИОГЕНЕЗЕ ШПОРЦЕВОЙ ЛЯГУШКИ Xenopus laevis
Биоорганическая химия, том 46, № 6, с. 719–728 (год публикации - 2020)
10.31857/S013234232006024X
11.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Ерошкин Ф.М., Зарайский А.Г.
ЦИТОСКЕЛЕТНЫЙ БЕЛОК ЗИКСИН МОДУЛИРУЕТ ЭКСПРЕССИЮ ГЕНОВ-МИШЕНЕЙ Shh CИГНАЛЬНОГО КАСКАДА В КЛЕТКАХ НЕРВНОЙ ПЛАСТИНКИ ЭМБРИОНОВ ШПОРЦЕВОЙ ЛЯГУШКИ Xenopus laevis
Биоорганическая химия, том 46, № 4, с. 396–403 (год публикации - 2020)
10.31857/S013234232004020X
12.
Паршина Е.А., Ерошкин Ф.М., Орлов Е.Е., Гиоева Ф.К., Шохина А.Г., Староверов Д.Б., Белоусов В.В., Жигалова Н.А., Прохорчук Е.Б., Зарайский А.Г., Мартынова Н.Ю.
Cytoskeletal Protein Zyxin Inhibits the Activity of Genes Responsible for Embryonic Stem Cell Status
Cell Reports, V33, N7, 108396 (год публикации - 2020)
10.1016/j.celrep.2020.108396
13. Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г., Targeted identification of scaling genes: mmp3 scales dorsal-ventral patterning in frog embryos Developmental Cell (год публикации - 2021)
14. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Borodulin А., Паршина Е.А., Иванов И.И., Белогуров А.А., Голышев С.А., Зарайский А.Г. Kinetics of heparin binding as an important factor of protein mobility in the intercellular space Biochemical and Biophysical Research Communications (год публикации - 2021)
15.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Protocol for separation of the nuclear and the cytoplasmic fractions of Xenopus laevis embryonic cells for studying protein shuttling.
STAR Protocols, 2, 2,100449 (год публикации - 2021)
10.1016/j.xpro.2021.100449
16.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Using RNA-binding proteins for immunoprecipitation of mRNAs from Xenopus laevis embryos
STAR Protocols, 2.2.100449 (год публикации - 2021)
10.1016/j.xpro.2021.100552
17.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Cytoskeletal protein Zyxin in embryonic development: from controlling cell movements and pluripotency to regulating embryonic patterning
FEBS Journal, FEBS J. 2021 Dec 1.Online ahead of print. (год публикации - 2021)
10.1111/febs.16308
18.
Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г.
Targeted search for scaling genes reveals matrix metalloproteinase 3 as a scaler of the dorsal-ventral pattern in Xenopus laevis embryos
Developmental Cell, 57, 1-19 (год публикации - 2022)
10.1016/j.devcel.2021.11.021
Публикации
1.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., зарайский А.Г., Байрамов А.В.
The expression of FoxG1 in the early development of the European river lamprey Lampetra fluviatilis demonstrates significant heterochrony with that in other vertebrates
Gene Expression Patterns, 34:119073 (год публикации - 2019)
10.1016/j.gep.2019.119073
2.
Короткова Д.Д., Любецкий В.А., Иванова А.С., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Зверков О.А., Мартынова Н.Ю., Нестеренко А.М., Терёшина М.Б., Пешкин Л. Зарайский А.Г.
Bioinformatics Screening of Genes Specific for Well-Regenerating Vertebrates Reveals c-answer, a Regulator of Brain Development and Regeneration
Cell Reports, 29(4):1027-1040 (год публикации - 2019)
10.1016/j.celrep.2019.09.038
3. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Паршина Е.А., Зарайский А.Г. КОМПАКТНАЯ МОДЕЛЬ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ С УЧЕТОМ ВРЕМЯ-ЗАВИСИМОЙ КОМПЕТЕНЦИИ. СЛУЧАЙ ЛАТЕРАЛЬНОЙ РАЗМЕТКИ МЕЗОДЕРМЫ АМФИБИЙ СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VI СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ, С. 309-310 (год публикации - 2019)
4. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Бородулин А.В., Паршина Е.А., Иванов И.И., Белогуров А.А., Голышев С.А., Зарайский А.Г. СВЯЗЫВАНИЕ С ГЕПАРИНОВЫМ МАТРИКСОМ КАК ОСНОВНОЙ ФАКТОР, ВЛИЯЮЩИЙ НА ПОДВИЖНОСТЬ БЕЛКОВ В МЕЖКЛЕТОЧНОМ ПРОСТРАНСТВЕ СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VI СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ, С. 309-310 (год публикации - 2019)
5. Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г. NGS approach to study embryonic scaling: an evidence for a new scaling mechanism. The Second European Amphibian Club 2019, p. 57 (год публикации - 2019)
6. Зарайский А.Г. Как найти гены эмбрионального скейлинга? Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития». (год публикации - 2019)
7.
Байрамов А.Г., Ермакова А.Г., Зарайский А.Г.
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕХАНИЗМЫ РАННЕГО РАЗВИТИЯ КОНЕЧНОГО МОЗГА, КАК ОТРАЖЕНИЕ ИСТОРИИ ПОЯВЛЕНИЯ И ЭВОЛЮЦИИ ЭТОГО УНИКАЛЬНОГО ОТДЕЛА ЦЕНТРАЛЬНОЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ ПОЗВОНОЧНЫХ
Онтогенез, том 51, № 3, с. 193–209 (год публикации - 2020)
10.31857/S0475145020030052
8.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., Зарайский А.Г., Байрамов А.В.
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ПАТТЕРНОВ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ СЕМЕЙСТВА NOGGIN НА РАННИХ СТАДИЯХ РАЗВИТИЯ ГОЛОВНЫХ СТРУКТУР ЕВРОПЕЙСКОЙ РЕЧНОЙ МИНОГИ LAMPETRA FLUVIATILIS
Онтогенез, том 52, № 1, с. 1–10 (год публикации - 2021)
10.31857/S0475145021010031
9.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., Зарайский А.Г., Байрамов А.В.
Discovery of four Noggin genes in lampreys suggests two rounds of ancient genome duplication
Communications Biology, 3: 501 (год публикации - 2020)
10.1038/s42003-020-01234-3
10.
Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г.
РОЛЬ МАТЕРИНСКОГО ГЕНА pou5f3.3/oct60 В РЕГУЛЯЦИИ НАЧАЛЬНЫХ ЭТАПОВ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ ТКАНЕЙ В ЭМБРИОГЕНЕЗЕ ШПОРЦЕВОЙ ЛЯГУШКИ Xenopus laevis
Биоорганическая химия, том 46, № 6, с. 719–728 (год публикации - 2020)
10.31857/S013234232006024X
11.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Ерошкин Ф.М., Зарайский А.Г.
ЦИТОСКЕЛЕТНЫЙ БЕЛОК ЗИКСИН МОДУЛИРУЕТ ЭКСПРЕССИЮ ГЕНОВ-МИШЕНЕЙ Shh CИГНАЛЬНОГО КАСКАДА В КЛЕТКАХ НЕРВНОЙ ПЛАСТИНКИ ЭМБРИОНОВ ШПОРЦЕВОЙ ЛЯГУШКИ Xenopus laevis
Биоорганическая химия, том 46, № 4, с. 396–403 (год публикации - 2020)
10.31857/S013234232004020X
12.
Паршина Е.А., Ерошкин Ф.М., Орлов Е.Е., Гиоева Ф.К., Шохина А.Г., Староверов Д.Б., Белоусов В.В., Жигалова Н.А., Прохорчук Е.Б., Зарайский А.Г., Мартынова Н.Ю.
Cytoskeletal Protein Zyxin Inhibits the Activity of Genes Responsible for Embryonic Stem Cell Status
Cell Reports, V33, N7, 108396 (год публикации - 2020)
10.1016/j.celrep.2020.108396
13. Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г., Targeted identification of scaling genes: mmp3 scales dorsal-ventral patterning in frog embryos Developmental Cell (год публикации - 2021)
14. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Borodulin А., Паршина Е.А., Иванов И.И., Белогуров А.А., Голышев С.А., Зарайский А.Г. Kinetics of heparin binding as an important factor of protein mobility in the intercellular space Biochemical and Biophysical Research Communications (год публикации - 2021)
15.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Protocol for separation of the nuclear and the cytoplasmic fractions of Xenopus laevis embryonic cells for studying protein shuttling.
STAR Protocols, 2, 2,100449 (год публикации - 2021)
10.1016/j.xpro.2021.100449
16.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Using RNA-binding proteins for immunoprecipitation of mRNAs from Xenopus laevis embryos
STAR Protocols, 2.2.100449 (год публикации - 2021)
10.1016/j.xpro.2021.100552
17.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Cytoskeletal protein Zyxin in embryonic development: from controlling cell movements and pluripotency to regulating embryonic patterning
FEBS Journal, FEBS J. 2021 Dec 1.Online ahead of print. (год публикации - 2021)
10.1111/febs.16308
18.
Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г.
Targeted search for scaling genes reveals matrix metalloproteinase 3 as a scaler of the dorsal-ventral pattern in Xenopus laevis embryos
Developmental Cell, 57, 1-19 (год публикации - 2022)
10.1016/j.devcel.2021.11.021
Публикации
1.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., зарайский А.Г., Байрамов А.В.
The expression of FoxG1 in the early development of the European river lamprey Lampetra fluviatilis demonstrates significant heterochrony with that in other vertebrates
Gene Expression Patterns, 34:119073 (год публикации - 2019)
10.1016/j.gep.2019.119073
2.
Короткова Д.Д., Любецкий В.А., Иванова А.С., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Зверков О.А., Мартынова Н.Ю., Нестеренко А.М., Терёшина М.Б., Пешкин Л. Зарайский А.Г.
Bioinformatics Screening of Genes Specific for Well-Regenerating Vertebrates Reveals c-answer, a Regulator of Brain Development and Regeneration
Cell Reports, 29(4):1027-1040 (год публикации - 2019)
10.1016/j.celrep.2019.09.038
3. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Паршина Е.А., Зарайский А.Г. КОМПАКТНАЯ МОДЕЛЬ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ С УЧЕТОМ ВРЕМЯ-ЗАВИСИМОЙ КОМПЕТЕНЦИИ. СЛУЧАЙ ЛАТЕРАЛЬНОЙ РАЗМЕТКИ МЕЗОДЕРМЫ АМФИБИЙ СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VI СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ, С. 309-310 (год публикации - 2019)
4. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Бородулин А.В., Паршина Е.А., Иванов И.И., Белогуров А.А., Голышев С.А., Зарайский А.Г. СВЯЗЫВАНИЕ С ГЕПАРИНОВЫМ МАТРИКСОМ КАК ОСНОВНОЙ ФАКТОР, ВЛИЯЮЩИЙ НА ПОДВИЖНОСТЬ БЕЛКОВ В МЕЖКЛЕТОЧНОМ ПРОСТРАНСТВЕ СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VI СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ, С. 309-310 (год публикации - 2019)
5. Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г. NGS approach to study embryonic scaling: an evidence for a new scaling mechanism. The Second European Amphibian Club 2019, p. 57 (год публикации - 2019)
6. Зарайский А.Г. Как найти гены эмбрионального скейлинга? Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития». (год публикации - 2019)
7.
Байрамов А.Г., Ермакова А.Г., Зарайский А.Г.
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕХАНИЗМЫ РАННЕГО РАЗВИТИЯ КОНЕЧНОГО МОЗГА, КАК ОТРАЖЕНИЕ ИСТОРИИ ПОЯВЛЕНИЯ И ЭВОЛЮЦИИ ЭТОГО УНИКАЛЬНОГО ОТДЕЛА ЦЕНТРАЛЬНОЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ ПОЗВОНОЧНЫХ
Онтогенез, том 51, № 3, с. 193–209 (год публикации - 2020)
10.31857/S0475145020030052
8.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., Зарайский А.Г., Байрамов А.В.
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ПАТТЕРНОВ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ СЕМЕЙСТВА NOGGIN НА РАННИХ СТАДИЯХ РАЗВИТИЯ ГОЛОВНЫХ СТРУКТУР ЕВРОПЕЙСКОЙ РЕЧНОЙ МИНОГИ LAMPETRA FLUVIATILIS
Онтогенез, том 52, № 1, с. 1–10 (год публикации - 2021)
10.31857/S0475145021010031
9.
Ермакова Г.В., Кучерявый А.В., Зарайский А.Г., Байрамов А.В.
Discovery of four Noggin genes in lampreys suggests two rounds of ancient genome duplication
Communications Biology, 3: 501 (год публикации - 2020)
10.1038/s42003-020-01234-3
10.
Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г.
РОЛЬ МАТЕРИНСКОГО ГЕНА pou5f3.3/oct60 В РЕГУЛЯЦИИ НАЧАЛЬНЫХ ЭТАПОВ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ ТКАНЕЙ В ЭМБРИОГЕНЕЗЕ ШПОРЦЕВОЙ ЛЯГУШКИ Xenopus laevis
Биоорганическая химия, том 46, № 6, с. 719–728 (год публикации - 2020)
10.31857/S013234232006024X
11.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Ерошкин Ф.М., Зарайский А.Г.
ЦИТОСКЕЛЕТНЫЙ БЕЛОК ЗИКСИН МОДУЛИРУЕТ ЭКСПРЕССИЮ ГЕНОВ-МИШЕНЕЙ Shh CИГНАЛЬНОГО КАСКАДА В КЛЕТКАХ НЕРВНОЙ ПЛАСТИНКИ ЭМБРИОНОВ ШПОРЦЕВОЙ ЛЯГУШКИ Xenopus laevis
Биоорганическая химия, том 46, № 4, с. 396–403 (год публикации - 2020)
10.31857/S013234232004020X
12.
Паршина Е.А., Ерошкин Ф.М., Орлов Е.Е., Гиоева Ф.К., Шохина А.Г., Староверов Д.Б., Белоусов В.В., Жигалова Н.А., Прохорчук Е.Б., Зарайский А.Г., Мартынова Н.Ю.
Cytoskeletal Protein Zyxin Inhibits the Activity of Genes Responsible for Embryonic Stem Cell Status
Cell Reports, V33, N7, 108396 (год публикации - 2020)
10.1016/j.celrep.2020.108396
13. Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г., Targeted identification of scaling genes: mmp3 scales dorsal-ventral patterning in frog embryos Developmental Cell (год публикации - 2021)
14. Нестеренко А.М., Орлов Е.Е., Borodulin А., Паршина Е.А., Иванов И.И., Белогуров А.А., Голышев С.А., Зарайский А.Г. Kinetics of heparin binding as an important factor of protein mobility in the intercellular space Biochemical and Biophysical Research Communications (год публикации - 2021)
15.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Protocol for separation of the nuclear and the cytoplasmic fractions of Xenopus laevis embryonic cells for studying protein shuttling.
STAR Protocols, 2, 2,100449 (год публикации - 2021)
10.1016/j.xpro.2021.100449
16.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Using RNA-binding proteins for immunoprecipitation of mRNAs from Xenopus laevis embryos
STAR Protocols, 2.2.100449 (год публикации - 2021)
10.1016/j.xpro.2021.100552
17.
Мартынова Н.Ю., Паршина Е.А., Зарайский А.Г.
Cytoskeletal protein Zyxin in embryonic development: from controlling cell movements and pluripotency to regulating embryonic patterning
FEBS Journal, FEBS J. 2021 Dec 1.Online ahead of print. (год публикации - 2021)
10.1111/febs.16308
18.
Орлов Е.Е., Нестеренко А.М., Короткова Д.Д., Паршина Е.А., Мартынова Н.Ю., Зарайский А.Г.
Targeted search for scaling genes reveals matrix metalloproteinase 3 as a scaler of the dorsal-ventral pattern in Xenopus laevis embryos
Developmental Cell, 57, 1-19 (год публикации - 2022)
10.1016/j.devcel.2021.11.021