КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 21-74-00100

НазваниеПоиск новых ингибиторов бактериальных рибосом среди защитных пептидов животных и изучение их механизма действия

Руководитель Пантелеев Павел Валерьевич, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук , г Москва

Конкурс №60 - Конкурс 2021 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-202 - Протеомика; структура и функции белков

Ключевые слова Антимикробный пептид, пролин-богатый пептид, рибосома, трансляция, резистентность, геном, биоинформатический поиск, рекомбинантный аналог

Код ГРНТИ31.23.27, 34.43.23, 62.13.35


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
В последние десятилетия в результате широкого распространения устойчивых к антибиотикам штаммов патогенных микроорганизмов медицина столкнулась с серьезной проблемой, угрожающей свести на нет прогресс, достигнутый в области терапии инфекционных заболеваний. Перспектива быстрого возникновения резистентности к препарату, в свою очередь, снижает интерес фармацевтических компаний к разработке новых антибиотиков. Из-за проблемы «переоткрытия» уже известных соединений, ключевой задачей научного сообщества является разработка альтернативных подходов к поиску и дизайну новых антибиотиков. Около половины известных антибиотиков нацелены на аппарат трансляции клеток-мишеней и представляют важнейшее значение для медицины. Ингибиторы трансляции нового поколения должны обладать высокой эффективностью в отношении широкого спектра патогенов и отличными от известных антибиотиков механизмами действия, что снизит вероятность возникновения кросс-резистентности к ним. Одним из классов искомых соединений, которым в последние годы уделяется большое внимание учёных, являются пролин-богатые антимикробные пептиды (ПБ-АМП) – защитные факторы врождённого иммунитета животных. Благодаря множественным контактам пептида в рибосомном тоннеле риск появления бактериальной кросс-резистентности к ПБ-АМП минимален. В целом сравнительно низкая цитотоксичность позволяют рассматривать ПБ-АМП как перспективные молекулярные скаффолды для разработки антибиотиков. С фундаментальной точки зрения, обнаружение и исследование новых ПБ-АМП может пролить свет на особенности регуляции аппарата трансляции различных клеток. В рамках проекта будет проведен биоинформатический поиск в геномных и транскриптомных базах данных принципиально новых структурных семейств ПБ-АМП, изучены особенности механизма действия пептидов на бактерии, а также молекулярные механизмы резистентности к ним. Полученные результаты по изучению природного разнообразия ПБ-АМП, их структурно-функциональные исследования, а также механизмы возможной бактериальной резистентности позволят обосновать пути для дальнейшего дизайна новых пептидных антибиотиков и их рационального применения.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

Публикации

1. Пантелеев П.В., Сафронова В.Н., Кругликов Р.Н., Болосов И.А., Богданов И.В., Овчинникова Т.В. A novel proline-rich cathelicidin from the alpaca Vicugna pacos with potency to combat antibiotic-resistant bacteria: mechanism of action and the functional role of the C-terminal region Membranes, 12(5), 515 (год публикации - 2022)
10.3390/membranes12050515

2. Пантелеев П.В., Сафронова В.Н., Кругликов Р.Н., Болосов И.А., Овчинникова Т.В. Genomic insights into bacterial resistance to proline-rich antimicrobial peptide Bac7 Membranes, 13(4), 438 (год публикации - 2023)
10.3390/membranes13040438

3. Пантелеев П.В. и соавт. Rumicidins are a family of mammalian host-defense peptides plugging the 70S ribosome exit tunnel Nature Communications, 15(1):8925 (год публикации - 2024)
10.1038/s41467-024-53309-y


 

Публикации

1. Пантелеев П.В., Сафронова В.Н., Кругликов Р.Н., Болосов И.А., Богданов И.В., Овчинникова Т.В. A novel proline-rich cathelicidin from the alpaca Vicugna pacos with potency to combat antibiotic-resistant bacteria: mechanism of action and the functional role of the C-terminal region Membranes, 12(5), 515 (год публикации - 2022)
10.3390/membranes12050515

2. Пантелеев П.В., Сафронова В.Н., Кругликов Р.Н., Болосов И.А., Овчинникова Т.В. Genomic insights into bacterial resistance to proline-rich antimicrobial peptide Bac7 Membranes, 13(4), 438 (год публикации - 2023)
10.3390/membranes13040438

3. Пантелеев П.В. и соавт. Rumicidins are a family of mammalian host-defense peptides plugging the 70S ribosome exit tunnel Nature Communications, 15(1):8925 (год публикации - 2024)
10.1038/s41467-024-53309-y