КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 22-15-00308
НазваниеМолекулярный ландшафт рака полости рта у пациентов молодого возраста
Руководитель Чойнзонов Евгений Лхамацыренович, Доктор медицинских наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук" , Томская обл
Конкурс №68 - Конкурс 2022 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-208 - Онкология
Ключевые слова Плоскоклеточная карцинома полости рта, молодой возраст, полноэкзомное секвенирование, секвенирование единичных клеток, соматические мутации, экспрессия генов, микроокружение
Код ГРНТИ76.29.49
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Карциномы головы и шеи являются шестым по распространенности типом злокачественных новообразований во всем мире, почти в половине случаев поражая ротовую полость. Плоскоклеточная карцинома полости рта (ПКПР) является одной из важнейших медицинских и социально-экономических проблем в большинстве развитых стран мира в связи с высокой смертностью от данного заболевания (около 40%) на первом году после постановки диагноза. При этом заболеваемость ПКПР среди пациентов моложе 45 лет растет с каждым годом. Для молодых пациентов с ПКПР характерно агрессивное течение заболевания, малоэффективное применение стандартных схем лечения, а также отсутствие классических этиологических факторов, характерных для больных опухолями головы и шеи старшего возраста: употребление табака, алкоголя и инфицирование вирусом папилломы человека. В связи с этим важной задачей является выявление патогенетических причин возникновения ПКПР у молодых пациентов.
Настоящий проект направлен на анализ молекулярно-генетических особенностей ПКПР у пациентов молодого возраста. Применение полноэкзомного секвенирования позволит идентифицировать соматические генетические нарушения, являющиеся драйверами формирования и прогрессирования ПКПР у пациентов моложе 45 лет. Секвенирование РНК единичных клеток позволит изучить фенотипическое разнообразие опухолевых клеток и клеток микроокружения ПКПР у молодых пациентов и обнаружить клеточные популяции, вовлеченные в рост опухоли и опухолевую прогрессию.
Помимо фундаментальной значимости полученные результаты будут обладать несомненной практической ценностью. В частности, выявленные в ходе данного проекта генетические нарушения и транскрипционные характеристики ПКПР у молодых пациентов будут использоваться как основа для разработки диагностических и прогностических маркеров и новых терапевтических мишеней.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1. Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Колегова Е.С., Патышева М.Р., Денисов Е.В., Чойнзонов Е.Л.,Поляков А.П., Мордовский А.В., Ребрикова И.В., Каприн А.Д., Аверинская Д.А., Романова М.Э., Шаталов П.А., Шегай П.В., Кудашкина Д.С., Яковлева Л.П., и др. Лечение молодых пациентов с раком полости рта: текущее состояние и перспективы (консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»). Часть 1 Голова и шея. Российский журнал., 10(4) (год публикации - 2022)
2. Колегова Е.С., Щеголева А.А., Воробьев Р.С., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В. Особенности мутационного ландшафта рака полости рта у молодых пациентов III Всероссийская конференция “Высокопроизводительное секвенирование в геномике”. Тезисы, Новосибирск: Академиздат, 2022.- 122 с. – С. 101. (год публикации - 2022)
3. Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Колегова Е.С., Патышева М.Р., Денисов Е.В., Чойнзонов Е.Л.,Поляков А.П., Мордовский А.В., Ребрикова И.В., Каприн А.Д., Аверинская Д.А., Романова М.Э., Шаталов П.А., Шегай П.В., Кудашкина Д.С., Яковлева Л.П., и др. Лечение молодых пациентов с раком полости рта: текущее состояние и перспективы (консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»). Часть 2 Голова и шея. Российский журнал. (год публикации - 2023)
4.
Простакишина Е.А., Дампилова Т.Д., Кононова Л.А., Ямщиков П.С., Патышева М.Р., Колегова Е.С., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В.
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ЛАНДШАФТ РАКА ПОЛОСТИ РТА У МОЛОДЫХ ПАЦИЕНТОВ
ГЕНЕТИКА, том 59, № 11, с. 1290–1302 (год публикации - 2023)
10.31857/S0016675823110103
5. Колегова Е.С., Щеголева А.А., Воробьев Р.С., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Поляков А.П., Мордовский А.В., Яковлева Л.П., Вялов А.С., Циклаури В.Т., Кропотов М.А., Сучкова Н.Г., Сукорцева Н.С., Решетов И.В., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ РЕЦИДИВА РАКА ЯЗЫКА У МОЛОДЫХ БОЛЬНЫХ БЮЛЛЕТЕНЬ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ БИОЛОГИИ И МЕДИЦИНЫ (год публикации - 2024)
6.
Простакишина Е.А., Патышева М.Р., Колегова Е.С., Хозяинова А.А., Меняйло М.Е., Ларионова И.В., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В.
ОСОБЕННОСТИ ИММУННОГО ЛАНДШАФТА РАКА ЯЗЫКА У МОЛОДЫХ ПАЦИЕНТОВ
X Международная конференция молодых ученых: биоинформатиков, биотехнологов, биофизиков, вирусологов и молекулярных биологов — 2023: Cб. тез., Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2023. — 814 с. – C.712-713 (год публикации - 2023)
10.25205/978-5-4437-1526-1-363
7. М.С. Третьякова, Е.А. Простакишина, Е.С. Колегова, Е.Л. Чойнзонов, Е.В. Денисов Опухолевые модели в изучении патогенеза и разработке методов лечения рака полости рта Вестник Российского университета дружбы народов. Серия: МЕДИЦИНА (год публикации - 2025)
8. Е.А. Простакишина, Е.А. Сиденко, Е.С. Колегова, М.Р. Патышева, Г.А. Кононова, Е.Л. Чоинзонов Premalignant lesions of the oral cavity: a narrative review of factors and mechanisms of transformation into cancer International Journal of Oral & Maxillofacial Surgery (год публикации - 2025)
9.
М.Р. Патышева, Е.С. Колегова, А.А. Хозяинова, Е.А. Простакишина, В.Ю. Коробейников, М.Е. Меняйло, П.С. Ямщиков, Д.М. Лоос, О.И. Ковалев, М.В. Завьялова, И.К. Федорова, Д.Е. Кульбакин, И.В. Ларионова, А.П. Поляков, Л.П. Яковлева, М.А. Кропотов, Н.С. Сукорцева, Ю. Лу, Л. Цзя, Р. Арора, Е.Л. Чойнзонов, П. Бозе, Е.В. Денисов
Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics
Scientific Reports, 1; 14(1): 26255 (год публикации - 2024)
10.1038/s41598-024-76044-2
10. Е. Колегова, М. Патышева, Е. Простакишина, А. Коробейникова, М. Меняйло, Р. Воробьев, А. Хозяинова, И. Жалсанова, А. Зарубин, Н. Скрябин, И. Федорова, Д. Кульбакин, А. Мордовский, Д. Кудашкина, А. Поляков, А. Каприн, А. Вялов, Л. Яковлева, В. Циклаури, О. Саприна, М. Кропотов, Н. Сукорцева, С. Самойлова, И. Решетов, Е. Чоинзонов, Е. Денисов Multi-omics of early-onset oral cancer 17th ANNUAL MEETING OF THE KOREAN SOCIETY OF MEDICAL ONCOLOGY & 2024 INTERNATIONAL CONFERENCE SEP. 26-27, 2024, SEOUL, KOREA, 17th ANNUAL MEETING OF THE KOREAN SOCIETY OF MEDICAL ONCOLOGY & 2024 INTERNATIONAL CONFERENCE SEP. 26-27, 2024, SEOUL, KOREA, PP275, P. – 401 (год публикации - 2024)
11.
Простакишина Е., Патышева М., Колегова Е., Меняйло М., Хозяинова А., Федорова И., Арора Р., Чоинзонов Е., Кульбакин Д., Бозе П., Денисов Е.
Spatial transcriptional landscape of early-onset tongue cancer
Четырнадцатая международная мультиконференция
«Биоинформатика регуляции и структуры геномов /
системная биология», 5–10 авг. 2024 г., Новосибирск, Четырнадцатая международная мультиконференция
«Биоинформатика регуляции и структуры геномов /
системная биология», 5–10 авг. 2024 г., Новосибирск,
2372 с. (год публикации - 2024)
10.18699/bgrs2024-4.2-19
Публикации
1. Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Колегова Е.С., Патышева М.Р., Денисов Е.В., Чойнзонов Е.Л.,Поляков А.П., Мордовский А.В., Ребрикова И.В., Каприн А.Д., Аверинская Д.А., Романова М.Э., Шаталов П.А., Шегай П.В., Кудашкина Д.С., Яковлева Л.П., и др. Лечение молодых пациентов с раком полости рта: текущее состояние и перспективы (консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»). Часть 1 Голова и шея. Российский журнал., 10(4) (год публикации - 2022)
2. Колегова Е.С., Щеголева А.А., Воробьев Р.С., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В. Особенности мутационного ландшафта рака полости рта у молодых пациентов III Всероссийская конференция “Высокопроизводительное секвенирование в геномике”. Тезисы, Новосибирск: Академиздат, 2022.- 122 с. – С. 101. (год публикации - 2022)
3. Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Колегова Е.С., Патышева М.Р., Денисов Е.В., Чойнзонов Е.Л.,Поляков А.П., Мордовский А.В., Ребрикова И.В., Каприн А.Д., Аверинская Д.А., Романова М.Э., Шаталов П.А., Шегай П.В., Кудашкина Д.С., Яковлева Л.П., и др. Лечение молодых пациентов с раком полости рта: текущее состояние и перспективы (консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»). Часть 2 Голова и шея. Российский журнал. (год публикации - 2023)
4.
Простакишина Е.А., Дампилова Т.Д., Кононова Л.А., Ямщиков П.С., Патышева М.Р., Колегова Е.С., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В.
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ЛАНДШАФТ РАКА ПОЛОСТИ РТА У МОЛОДЫХ ПАЦИЕНТОВ
ГЕНЕТИКА, том 59, № 11, с. 1290–1302 (год публикации - 2023)
10.31857/S0016675823110103
5. Колегова Е.С., Щеголева А.А., Воробьев Р.С., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Поляков А.П., Мордовский А.В., Яковлева Л.П., Вялов А.С., Циклаури В.Т., Кропотов М.А., Сучкова Н.Г., Сукорцева Н.С., Решетов И.В., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ РЕЦИДИВА РАКА ЯЗЫКА У МОЛОДЫХ БОЛЬНЫХ БЮЛЛЕТЕНЬ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ БИОЛОГИИ И МЕДИЦИНЫ (год публикации - 2024)
6.
Простакишина Е.А., Патышева М.Р., Колегова Е.С., Хозяинова А.А., Меняйло М.Е., Ларионова И.В., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В.
ОСОБЕННОСТИ ИММУННОГО ЛАНДШАФТА РАКА ЯЗЫКА У МОЛОДЫХ ПАЦИЕНТОВ
X Международная конференция молодых ученых: биоинформатиков, биотехнологов, биофизиков, вирусологов и молекулярных биологов — 2023: Cб. тез., Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2023. — 814 с. – C.712-713 (год публикации - 2023)
10.25205/978-5-4437-1526-1-363
7. М.С. Третьякова, Е.А. Простакишина, Е.С. Колегова, Е.Л. Чойнзонов, Е.В. Денисов Опухолевые модели в изучении патогенеза и разработке методов лечения рака полости рта Вестник Российского университета дружбы народов. Серия: МЕДИЦИНА (год публикации - 2025)
8. Е.А. Простакишина, Е.А. Сиденко, Е.С. Колегова, М.Р. Патышева, Г.А. Кононова, Е.Л. Чоинзонов Premalignant lesions of the oral cavity: a narrative review of factors and mechanisms of transformation into cancer International Journal of Oral & Maxillofacial Surgery (год публикации - 2025)
9.
М.Р. Патышева, Е.С. Колегова, А.А. Хозяинова, Е.А. Простакишина, В.Ю. Коробейников, М.Е. Меняйло, П.С. Ямщиков, Д.М. Лоос, О.И. Ковалев, М.В. Завьялова, И.К. Федорова, Д.Е. Кульбакин, И.В. Ларионова, А.П. Поляков, Л.П. Яковлева, М.А. Кропотов, Н.С. Сукорцева, Ю. Лу, Л. Цзя, Р. Арора, Е.Л. Чойнзонов, П. Бозе, Е.В. Денисов
Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics
Scientific Reports, 1; 14(1): 26255 (год публикации - 2024)
10.1038/s41598-024-76044-2
10. Е. Колегова, М. Патышева, Е. Простакишина, А. Коробейникова, М. Меняйло, Р. Воробьев, А. Хозяинова, И. Жалсанова, А. Зарубин, Н. Скрябин, И. Федорова, Д. Кульбакин, А. Мордовский, Д. Кудашкина, А. Поляков, А. Каприн, А. Вялов, Л. Яковлева, В. Циклаури, О. Саприна, М. Кропотов, Н. Сукорцева, С. Самойлова, И. Решетов, Е. Чоинзонов, Е. Денисов Multi-omics of early-onset oral cancer 17th ANNUAL MEETING OF THE KOREAN SOCIETY OF MEDICAL ONCOLOGY & 2024 INTERNATIONAL CONFERENCE SEP. 26-27, 2024, SEOUL, KOREA, 17th ANNUAL MEETING OF THE KOREAN SOCIETY OF MEDICAL ONCOLOGY & 2024 INTERNATIONAL CONFERENCE SEP. 26-27, 2024, SEOUL, KOREA, PP275, P. – 401 (год публикации - 2024)
11.
Простакишина Е., Патышева М., Колегова Е., Меняйло М., Хозяинова А., Федорова И., Арора Р., Чоинзонов Е., Кульбакин Д., Бозе П., Денисов Е.
Spatial transcriptional landscape of early-onset tongue cancer
Четырнадцатая международная мультиконференция
«Биоинформатика регуляции и структуры геномов /
системная биология», 5–10 авг. 2024 г., Новосибирск, Четырнадцатая международная мультиконференция
«Биоинформатика регуляции и структуры геномов /
системная биология», 5–10 авг. 2024 г., Новосибирск,
2372 с. (год публикации - 2024)
10.18699/bgrs2024-4.2-19
Аннотация результатов, полученных в 2024 году
Третий год проекта направлен на решение следующих задач: 1. Оценить ассоциацию генетических нарушений, транскрипционных особенностей и популяционного состава ПКПР с клинико-патологическими параметрами и прогрессированием заболевания у пациентов молодого возраста; 2. Определить функциональное значение молекулярных изменений, ассоциированных с ПКПР у пациентов молодого возраста; 3. Разработать панель маркеров для прогнозирования риска прогрессирования ПКПР у пациентов молодого возраста.
Для решения задачи 1 были проведены следующие работы: полноэкзомное секвенирование парных образцов ткани опухоли и периферической крови 4 молодых больных ПКПР с последующей биоинформатической обработкой образцов по алгоритму первого года проекта; анализ ассоциации генетических нарушений, транскрипционных особенностей и популяционного состава с клиническим течением и прогрессированием ПКПР в молодом возрасте на основе данных полноэкзомного (n=27) и полнотранскриптомного секвенирования единичных клеток (n=10), полученных на 1 и 2 году проекта; валидация соматических мутаций с использованием базы данных Атласа генома рака (TCGA, n=127) и транскрипционных изменений с помощью полнотранскриптного секвенирования единичных клеток ПКПР (n=2), ПЦР в режиме реального времени (n=19, парафиновые блоки и n=18, свежезамороженные образцы) и конфокальной микроскопии (n=19). Выявлена прогностическая значимость соматических мутаций генов TAF1L, CUL7, PRPS1L1 и CDKN2A для безрецидивной выживаемости, PLEC и TEP1 для безметастатической выживаемости и ADGRL3, PREX1 и CDKN2A для общей выживаемости молодых больных ПКПР. Анализ общедоступных данных подтвердил связь мутаций гена CDKN2A с прогрессированием ПКПР в возрасте до 45 лет. Также выявлены гены, экспрессия которых связана с прогрессированием ПКПР в молодом возрасте: POSTN, VCAN, OASL, CTHRC1, FBLN2, RGMA, OLFM2, SLC2A1 и OLR1. Анализ независимой группы молодых пациентов подтвердил ассоциацию высокой экспрессии гена SLC2A1 в ткани опухоли и кодируемого им белка GLUT1 в макрофагах с прогрессированием ПКПР в молодом возрасте.
Для решения задачи 2 были выполнены нокаут и нокдаун генов интереса в клеточных культурах почки 293FT и карциномы языка Cal 27 с использованием технологий CRISPR/Cas9 и siRNA, функциональные тесты и полнотранскриптомное профилирование с помощью секвенирования РНК. Показано, что клеточные линии, содержащие модификации в 6 и 8 экзоне гена ТР53, демонстрируют увеличение пролиферативной активности и активацию сигнальных путей метаболизма кальция и кальциевых каналов. Кроме того, изменения 8 экзона гена ТР53 связаны с потерей межклеточной адгезии. Клеточные линии, несущие изменения 10 экзона EPHB6, характеризуются потерей межклеточной адгезии и активацией сигнальных путей эпителиально-мезенхимального перехода, метаболизма кальция и кальциевых каналов. Во всех клеточных линиях с нокаутом генов ТР53 и EPHB6 наблюдалось повышение экспрессии гена CXCR4.
В рамках задачи 3 была разработана панель для прогнозирования риска прогрессирования ПКПР у пациентов молодого возраста, включающая такие маркеры как мутации генов CDKN2A, ТР53 (6 и 8 экзоны) и EPHB6 (10 экзон), экспрессия гена SLC2A1 и количество GLUT1+/CD68+ клеток в ткани опухоли.
Таким образом, по итогу третьего года проекта выявлены и функционально обоснованы генетические и транскрипционные маркеры, связанные с прогрессированием ПКПР в молодом возрасте.
Информационные ресурсы в сети Интернет, посвященные проекту:
https://nauka.tass.ru/nauka/22420799
https://poisknews.ru/onkologiya/molekulyarnaya-karta-raka-kak-ona-pomogaet-izuchat-rak-yazyka/
https://rscf.ru/news/medicine/vyyavleny-razlichiya-raka-yazyka-u-molodykh-i-pozhilykh-patsientov/
https://new.ras.ru/activities/news/uchyenye-ustanovili-chto-rak-yazyka-u-molodykh-patsientov-mozhet-yavlyatsya-otdelnoy-molekulyarnoy-f/
https://tomsk.bezformata.com/listnews/razlichiya-raka/139094950/
https://kemerovo.tsargrad.tv/news/issledovateli-raskryli-razlichija-raka-jazyka-u-molodyh-i-pozhilyh-pacientov_1083613
https://www.tomsk.kp.ru/online/news/6094438/
https://dzen.ru/news/story/8dfbf37d-ca14-53c5-ad63-c27e631aaf3d?utm_referrer=www.google.com
https://www.hibiny.ru/murmanskaya-oblast/news/item-osobennosti-razvitiya-raka-yazyka-umolodyh-ipojilyh-pacientov-o-razlichiyah-rasskazali-v-minobrnaukirf-382878/
https://doctor.rambler.ru/medscience/53756261-vyyavleny-razlichiya-raka-yazyka-u-molodyh-i-pozhilyh-patsientov/
https://www1.ru/news/2024/11/17/ucenye-tomskogo-nimc-s-pomoshhiu-prostranstvennoi-transkriptomiki-issledovali-rak-iazyka.html
https://potokmedia.ru/612874/rak-yazyka-uchenye-rf-nashli-razlichiya-v-razvitii-neduga-u-molodyh-i-pozhilyh/
https://59minut.info/news-id28364-/2024/
https://minobrnauki.gov.ru/press-center/news/nauka/91761/
https://www.tnimc.ru/novosti/nii-onkologii/uchenye-ustanovili-chto-rak-yazyka-u-molodykh-patsientov-mozhet-yavlyatsya-otdelnoy-molekulyarnoy-fo/?sphrase_id=434799
https://www.tnimc.ru/novosti/nii-onkologii/mezhdunarodnyy-obmen-opytom-uchenye-so-vsego-mira-sobralis-v-koree-dlya-obsuzhdeniya-peredovykh-meto/?sphrase_id=434799
Публикации
1. Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Колегова Е.С., Патышева М.Р., Денисов Е.В., Чойнзонов Е.Л.,Поляков А.П., Мордовский А.В., Ребрикова И.В., Каприн А.Д., Аверинская Д.А., Романова М.Э., Шаталов П.А., Шегай П.В., Кудашкина Д.С., Яковлева Л.П., и др. Лечение молодых пациентов с раком полости рта: текущее состояние и перспективы (консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»). Часть 1 Голова и шея. Российский журнал., 10(4) (год публикации - 2022)
2. Колегова Е.С., Щеголева А.А., Воробьев Р.С., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В. Особенности мутационного ландшафта рака полости рта у молодых пациентов III Всероссийская конференция “Высокопроизводительное секвенирование в геномике”. Тезисы, Новосибирск: Академиздат, 2022.- 122 с. – С. 101. (год публикации - 2022)
3. Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Колегова Е.С., Патышева М.Р., Денисов Е.В., Чойнзонов Е.Л.,Поляков А.П., Мордовский А.В., Ребрикова И.В., Каприн А.Д., Аверинская Д.А., Романова М.Э., Шаталов П.А., Шегай П.В., Кудашкина Д.С., Яковлева Л.П., и др. Лечение молодых пациентов с раком полости рта: текущее состояние и перспективы (консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»). Часть 2 Голова и шея. Российский журнал. (год публикации - 2023)
4.
Простакишина Е.А., Дампилова Т.Д., Кононова Л.А., Ямщиков П.С., Патышева М.Р., Колегова Е.С., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В.
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ЛАНДШАФТ РАКА ПОЛОСТИ РТА У МОЛОДЫХ ПАЦИЕНТОВ
ГЕНЕТИКА, том 59, № 11, с. 1290–1302 (год публикации - 2023)
10.31857/S0016675823110103
5. Колегова Е.С., Щеголева А.А., Воробьев Р.С., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Поляков А.П., Мордовский А.В., Яковлева Л.П., Вялов А.С., Циклаури В.Т., Кропотов М.А., Сучкова Н.Г., Сукорцева Н.С., Решетов И.В., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ РЕЦИДИВА РАКА ЯЗЫКА У МОЛОДЫХ БОЛЬНЫХ БЮЛЛЕТЕНЬ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ БИОЛОГИИ И МЕДИЦИНЫ (год публикации - 2024)
6.
Простакишина Е.А., Патышева М.Р., Колегова Е.С., Хозяинова А.А., Меняйло М.Е., Ларионова И.В., Федорова И.К., Кульбакин Д.Е., Чойнзонов Е.Л., Денисов Е.В.
ОСОБЕННОСТИ ИММУННОГО ЛАНДШАФТА РАКА ЯЗЫКА У МОЛОДЫХ ПАЦИЕНТОВ
X Международная конференция молодых ученых: биоинформатиков, биотехнологов, биофизиков, вирусологов и молекулярных биологов — 2023: Cб. тез., Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2023. — 814 с. – C.712-713 (год публикации - 2023)
10.25205/978-5-4437-1526-1-363
7. М.С. Третьякова, Е.А. Простакишина, Е.С. Колегова, Е.Л. Чойнзонов, Е.В. Денисов Опухолевые модели в изучении патогенеза и разработке методов лечения рака полости рта Вестник Российского университета дружбы народов. Серия: МЕДИЦИНА (год публикации - 2025)
8. Е.А. Простакишина, Е.А. Сиденко, Е.С. Колегова, М.Р. Патышева, Г.А. Кононова, Е.Л. Чоинзонов Premalignant lesions of the oral cavity: a narrative review of factors and mechanisms of transformation into cancer International Journal of Oral & Maxillofacial Surgery (год публикации - 2025)
9.
М.Р. Патышева, Е.С. Колегова, А.А. Хозяинова, Е.А. Простакишина, В.Ю. Коробейников, М.Е. Меняйло, П.С. Ямщиков, Д.М. Лоос, О.И. Ковалев, М.В. Завьялова, И.К. Федорова, Д.Е. Кульбакин, И.В. Ларионова, А.П. Поляков, Л.П. Яковлева, М.А. Кропотов, Н.С. Сукорцева, Ю. Лу, Л. Цзя, Р. Арора, Е.Л. Чойнзонов, П. Бозе, Е.В. Денисов
Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics
Scientific Reports, 1; 14(1): 26255 (год публикации - 2024)
10.1038/s41598-024-76044-2
10. Е. Колегова, М. Патышева, Е. Простакишина, А. Коробейникова, М. Меняйло, Р. Воробьев, А. Хозяинова, И. Жалсанова, А. Зарубин, Н. Скрябин, И. Федорова, Д. Кульбакин, А. Мордовский, Д. Кудашкина, А. Поляков, А. Каприн, А. Вялов, Л. Яковлева, В. Циклаури, О. Саприна, М. Кропотов, Н. Сукорцева, С. Самойлова, И. Решетов, Е. Чоинзонов, Е. Денисов Multi-omics of early-onset oral cancer 17th ANNUAL MEETING OF THE KOREAN SOCIETY OF MEDICAL ONCOLOGY & 2024 INTERNATIONAL CONFERENCE SEP. 26-27, 2024, SEOUL, KOREA, 17th ANNUAL MEETING OF THE KOREAN SOCIETY OF MEDICAL ONCOLOGY & 2024 INTERNATIONAL CONFERENCE SEP. 26-27, 2024, SEOUL, KOREA, PP275, P. – 401 (год публикации - 2024)
11.
Простакишина Е., Патышева М., Колегова Е., Меняйло М., Хозяинова А., Федорова И., Арора Р., Чоинзонов Е., Кульбакин Д., Бозе П., Денисов Е.
Spatial transcriptional landscape of early-onset tongue cancer
Четырнадцатая международная мультиконференция
«Биоинформатика регуляции и структуры геномов /
системная биология», 5–10 авг. 2024 г., Новосибирск, Четырнадцатая международная мультиконференция
«Биоинформатика регуляции и структуры геномов /
системная биология», 5–10 авг. 2024 г., Новосибирск,
2372 с. (год публикации - 2024)
10.18699/bgrs2024-4.2-19
Возможность практического использования результатов
Выявленные в ходе данного проекта генетические нарушения и транскрипционные характеристики ПКПР пациентов молодого возраста будут использованы как основа для разработки диагностических и прогностических маркеров.