Новости

14 июля, 2021 14:46

Квантовая инженерия генов

Источник: Журнал Connect
Группа ученых из «Российского квантового центра» под руководством Алексея Федорова совместно с исследователями из компании «Genotek» сократила время сборки генома с помощью квантовых и квантово-вдохновленных алгоритмов. В ходе эксперимента исследователи сравнили данные, полученные на устройстве квантового отжига (ионный процессор) и российском программном эмуляторе SimCIM для модельных данных и для генома реального организма бактериофага. Результаты были опубликованы в журнале семейства Nature — Scientific Reports и представлены на VI Международной конференции по квантовым технологиям ICQT-2021. Исследование было поддержано Российским научным фондом, а также доступом к квантовым вычислительным устройствам в рамках глобальной борьбы с COVID-19.
Источник: PublicDomainPictures/Pixabay

Ионный процессор

Первый геном был секвенирован более 40 лет назад (бактериофаг фХ 174). Однако если первая сборка генома человека заняла около 13 лет, то сегодня государственные и частные учреждения способны реализовывать этот процесс за несколько недель. Участники эксперимента показали эффективность квантовых вычислений в биоинформатических задачах, впервые проведя исследования как на основе реальных, так и смоделированных данных. Квантовые вычислительные устройства способны обработать большее количество переменных, при этом кратно сокращая не только временные, но и финансовые затраты.

В рамках проведенного исследования специалисты «Российского квантового центра» показали возможность использовать определенные типы квантовых компьютеров — устройства квантового отжига или ионные процессоры — для решения задач сборки генома. Они использовали квантово-вдохновленный алгоритм отжига, который был посчитан с помощью облачных вычислений и основан на моделировании поведения квантовых систем. Полученные результаты могут значительно облегчить изучение новых видов и структурных изменений ДНК, которые не удается обнаружить методом классического картирования, и геномных перестроек в раковых клетках. Таким образом, внедрение квантовых технологий способствует более оперативному развитию персонализированной медицины.

«Одна из важнейших задач квантовых вычислений — это поиск полезных приложений, – считает ведущий автор исследования «Российского квантового центра» Алексей Федоров. – Биоинформатика и генетика часто сталкиваются со сложными вычислительными задачами, решение которых может быть ускорено за счет квантовых компьютеров. В будущем спектр применения квантовых вычислительных технологий в задачах генетики может быть значительно расширен».

Медицинские перспективы квантовых вычислений

«Возможности квантовых компьютеров позволяют по-новому взглянуть на задачи, в том числе биоинформатические, которые ранее казались вычислительно слишком сложными, – заявил директор по продукту Genotek Александр Ракитько. – В нашем исследовании мы оценили перспективы применения квантовых компьютеров в анализе  геномов человека и других организмов. На стыке этих областей появляются новые методы, с помощью которых растущие объемы данных анализируются более качественно. Кроме того, новые методы позволяют не ждать сутками результатов генетических исследований в тех ситуациях, когда счет идет на часы».

15 июля, 2026
Создан алгоритм, помогающий оборудованию заводов работать без задержек
Ученые из России разработали новые алгоритмы для составления расписаний работы промышленных устрой...
26 июня, 2026
Альфа-частицы на карте мира: казанский ученый применил физику высоких энергий к теореме о четырех цветах
Математик разработал новый способ расчета важной числовой характеристики для целого класса математ...

Хотите рассказать о своем исследовании? Заполните форму на нашем сайте