КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 17-14-01089

НазваниеРазнообразие морфогенезов и типов клеточного поведения в эмбриональном и постэмбриональном развитии животных

РуководительЕресковский Александр Вадимович, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет", г Санкт-Петербург

Период выполнения при поддержке РНФ 2017 г. - 2019 г.  , продлен на 2020 - 2021. Карточка проекта продления (ссылка)

Конкурс№18 - Конкурс 2017 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-106 - Биология развития

Ключевые словаморфогенез, эмбриональное развитие, регенерация, аннелиды, губки, эволюция

Код ГРНТИ34.21.00, 34.21.17, 34.15.49


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Фундаментальные знания процессов и понимание механизмов индивидуального развития важны не только для решения многих проблем теоретической биологии, но и используются в различных областях прикладной биологии, медицины и экологии. Ключевыми процессами в развитии многоклеточных животных являются морфогенезы – события, приводящие путем скоординированных перемещений клеток на фоне различных молекулярных событий к изменениям морфологии и формированию дифференцированных органов и тканей. Уникальной чертой морфогенезов является чрезвычайное разнообразие, ведущее, однако, к одинаковому результату при образовании конкретного плана строения тела, типа клеточной дифференцировки и тканевой организации. Нарушения критически важных событий морфогенезов, как эмбриональных, так и постэмбриональных (в ходе регенерации и бесполого размножения) может приводить к катастрофическим последствиям в виде патологий летального характера, но в некоторых случаях служить для создания и поддержания биоразнообразия. Несмотря на важность и актуальность понимания морфогенетических процессов в ходе развития, исследования до сих пор ведутся на небольшом количестве моделей биологии развития и ограничены применением отдельных методических подходов в каждом конкретном случае. Вместе с тем, c развитием современных технологий исследования появилась возможность объединить рассмотрение морфологических, клеточных, молекулярных и функциональных аспектов того или иного биологического процесса. Предлагаемый проект направлен на комплексное исследование животных, обладающих максимальным разнообразием морфогенезов, как в эмбриональном, так и в постэмбриональном развитии, демонстрирующих принципиально различную тканевую организацию, типы специализированных клеток и стволовые элементы. Задача проекта – сравнить морфогенезы во время создания плана строения тела (эмбриогенез) и при его восстановлении (в ходе бесполого размножения и посттравматической регенерации) и установить универсальные и уникальные закономерности реализации морфогенезов в развитии относительно примитивных беспозвоночных животных с ярко выраженной тканевой пластичностью (у губок и аннелид). В результате реализации предлагаемого проекта на основе комплексных сравнительных исследований будут получены новые фундаментальные знания о молекулярных и клеточных механизмах морфогенезов у животных из различных филогенетических групп. Кроме того, будут разработаны новые перспективные модельные объекты принципиально разного уровня организации, что позволит приблизиться к пониманию происхождения и эволюции морфогенезов, выявлению эволюционно консервативных (плезиоморфных) и специализированных (апоморфных) элементов морфогенеза у многоклеточных животных.

Ожидаемые результаты
В результате реализации предлагаемого проекта на основе комплексных сравнительных исследований на морфологическом (включая ультраструктурное), клеточном, молекулярно-биологическом и функциональном уровне: - будут получены новые фундаментальные знания о морфогенезах и их клеточных источниках, особенностях клеточного поведения и межклеточного взаимодействия при различных формах развития животных, обладающих разной тканевой организацией и занимающих разное филогенетическое положение среди Metazoa; - получены новые данные о пластичности клеточной дифференцировки, а также об участии генов - региональных организаторов в управлении морфогенезами; - будут получены новые фундаментальные знания о механизмах регуляции новообразований при регенерации у губок и аннелид из различных филогенетических групп, а также о степени эволюционного консерватизма этих процессов; - будет создана база для последующего определения молекулярного профиля и ниши стволовых клеток, а также поиска фундаментальных механизмов активации регенерационных способностей у губок и аннелид; - будут предложены модели поведения стволовых и малодифференцированных клеток при изменениях экспрессии ключевых генов-участников восстановительных морфогенезов, вызванных экспериментальным путем; - будут разработаны новые перспективные модельные объекты принципиально разного уровня организации, что позволит приблизиться к пониманию происхождения и эволюции морфогенезов, выявлению эволюционно консервативных (плезиоморфных) и специализированных (апоморфных) элементов морфогенеза у многоклеточных животных. Полученные нами данные о молекулярных и клеточных механизмах, лежащих в основе морфогенезов в процессе формирования плана строения тела (эмбриогенез) и при его восстановлении (бесполое размножение и регенерация), являются приоритетными для Российской науки. Квалификационный уровень участников проекта, использование современных методов и подходов обеспечат проведение данного проекта на высоком уровне, не уступающем мировому. Полученные результаты будут обобщены в ряде публикаций в высокорейтинговых международных журналах, представлены на международных конференциях, станут основой для двух кандидатских и магистерских диссертаций, а также войдут в программы университетских курсов по биологии развития и клеточной биологии.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2017 году
В 2017 году успешно проведен сбор губок Halisarca dujardini, Leucosolenia complicata, Sycon ciliatum, отработаны условия их культивирования, проведены эксперименты по репаративной регенерации фрагментов тела, реагрегации клеток, а также фиксации материала для ультраструктурных и молекулярно-биологических исследований. Исследованы морфогенезы и поведение клеток в ходе реагрегации клеток у губок, клеточная пролиферация в ходе реагрегации клеток и регенерации с помощью меченных нуклеотидов (EdU). Проведен биоинформационный анализ транскриптомных баз данных по аннотации компонентов Wnt и FGF/RTK сигналинга у Halisarca dujardini и Platynereis dumerilii с последующим филогенетическим анализом последовательностей и подтверждающим клонированием некоторых наиболее перспективных лигандов и рецепторов. Отработаны условия и методы для (1) прижизненной микрофотосъемки, цейтраферной видеосъемки процессов развития и репаративной регенерации у губок и аннелид, (2) прижизненной флуоресцентной окраски клеток губок с помощью DiI и Hoechst 33342, (3) визуализации клеток в состоянии апоптоза с помощью меток TUNEL и CellEvent Caspase-3/7 Green ReadyProbe, (4) выделения суспензий клеток отдельных типов методами центрифугирования в градиенте плотности и проточной цитометрии с сортировкой у Halisarca dujardini, (5) тестирования имеющихся антител к рекомбинантному бета-катенину H. dujardini с помощью вестерн-блоттинга. В результате первого года работы по проекту получены следующие основные результаты. 1. Описаны основные стадии и динамика процессов реагрегации клеток и последующей регенерации из многоклеточных агрегатов у Leucosolenia complicata, Sycon ciliatum (класс Calcarea) и Halisarca dujardini (класс Demospongiae) что позволило впервые составить общую картину протекания данного процесса у губок. 2. Получены новые сведения о строении и клеточном составе основных стадий реагрегации (первичные многоклеточные агрегаты, ранние примморфы, настоящие примморфы), а также о морфогенезах и поведении клеток, которые сопровождают развитие многоклеточных агрегатов L. complicata. 3. Описаны дифференцировки и трансдифференцировки клеток, а также явления пролиферации и клеточных перемещений на протяжении всего процесса реагрегации клеток H. dujardini и L. complicata. Была выявлена значительная разница в пролиферации клеток в ходе реагрегации этих губок. 4. Оценены морфогенетические потенции и судьба отдельных клеточных типов. 5. Описаны морфогенезы, сопровождающие восстановление целого организма из диссоциированных клеток. На начальных этапах реагрегации характерна массовая дедифференцировка большинства типов клеток губок. Дальнейшее развитие агрегатов сопровождается трансдифференциацией, мезенхимо-эпителиальными переходами и эпителизацией поверхности агрегатов. Морфогенезы, обеспечивающие, эпителизацию поверхности примморфов значительно отличаются у Calcarea и Demospongiae. К их сходствам у Calcarea и Demospongiae можно отнести участие в этом процессе хоаноцитов, трансдифференцирующихся в экзопинакоциты. Интенсивность пролиферации в ходе реагрегации Calcarea и Demospongiae значительно различается: у H. dujardini клетки делятся на всех этапах реагрегации, а у L. complicata клеточная пролиферация не наблюдается ни на одной из стадий развития агрегатов. 6. Подобраны методы изоляции отдельных типов клеток у губки H. dujardini. Наиболее производительным методом является центрифугирование в градиенте плотности перколла со ступенями 10/20/25/30/35/45% и ускорении центрифугирования 800g в течение 20 мин. Это позволит сравнить белковые профили каждого из типов клеток и идентифицировать маркеры каждого из клеточных типов. 7. Получены новые для науки данные по прижизненным наблюдениям над репаративной регенерацией небольших фрагментов тела и проведено стадирование этого процесса у L. complicata и S. ciliatum. Также впервые описаны на электронно-микроскопическом уровнях основные стадии и процессы, проходящие при репаративной регенерации указанных видов. Описаны тонкие механизмы морфогенеза и трансдифференциации клеток при регенерации этих губок. 8. Выявлены клеточные источники регенерации известковых губок и восстановления полноценного тела из экстирпированных оскулярных трубок губки Halisarca dujardini. Оценены способности различных клеточных типов губок к дифференцировкам, трансдифференцировкам, миграциям и пролиферации. Заживление известковых губок включает в себя 3 этапа: 1) выравнивание краев раны, 2) формирование регенеративной мембраны (РМ), 3) восстановление исходного строения стенки тела. Регенерация L. сomplicata и S. ciliatum идет по типу морфаллаксиса, когда утраченные части тела замещаются за счет ремоделлинга оставшихся тканей. Пролиферация клеток не играет важной роли. Основными морфогенетическими механизмами в ходе регенерации являются растягивание, уплощение и слияние эпителиальных пластов. Эта регенерация сопровождается трансдифференциацией дифференцированных клеток в районе раны. Основным источником новой экзопинакодермы является интактная экзопинакодерма, а новой хоанодермы – интактная хоанодерма, окружающие рану. Клетки мезохила не принимают участия в регенерационных процессах. Во время регенерации S. ciliatum проявляется четкая аксиализация, которая проявляется в разной скорости и последовательности морфогенетических процессов на разных полюсах (апикальных и базальных) раны. 9. При регенерации оскулярной трубки Halisarca dujardini пролиферация клеток поддерживается на низком уровне и почти исключительно в хоаноцитах. Данная регенерация происходит с сохранением попавших в регенерат элементов водоносной системы. 10. Нами также впервые изучены и описаны морфогенезы и клеточные источники бесполого размножения по типу почкования у Haliclona fulva (Demospongiae). 11. Проанализирован транскриптом губки H. dujardini: для Wnt-сигналлинга идентифицированы 10 лигандов, 5 рецепторов Frizzled, 3 растворимых формы рецептора – ингибиторы (sFRP), 1 полноценный корецептор LRP и 3 LRP-подобных белка, а также участники внутриклеточного проведения сигнала (dishevelled, axin, APC, GSK3beta, beta-catenin, TCF/Lef, Groucho). Гомологи H. dujardini не кластеризуются с семействами соответствующих Wnt, описанными у других Metazoa. Лигандов типа FGF в транскриптоме не обнаружено, но их рецепторы, имеющие Ig-подобные повторы во внеклеточной части и тирозинкиназный домен – в цитоплазматической, представлены двумя последовательностями. Это позволяет предположить, что лиганды возникли в эволюции позже, как надстройка молекулярного механизма сигнализации. 12 .На полихете A. virens показано участие основных клеточных линий в построении ларвального тела. Особую роль в данном процессе играют бластомеры, называемые первым и вторым соматобластами. Претерпевая череду стереотипных делений на ранних стадиях дробления, они дают клетки основной массы эктодермы и мезодермы туловища. Cледует отметить, что при формировании тела личинки телобластический способ делений бластомеров выражен очень слабо и только на ранних этапах дробления. В результате активной пролиферации потомков второго и третьего квартетов микромеров формируется материал вентральной и латеральных сторон туловища, включая нейроэктодерму, хетоносные мешки и стомодеум. Дальнейшее развитие и метаморфоз состоит в образовании и специализации всех дефинитивных органов и частей тела. Морфогенезы при этом имеют преимущественно эпителиальный характер. 13. Анализ клеточной пролиферации у A. virens показал сложную и быстро меняющуюся картину в ходе личиночного развития. У трохофор и ранних метатрохофор наблюдается более равномерное распределение клеток в S-фазе и митозе с преобладанием метки в покровных тканях вентральной стороны тела. У средних метатрохофор отмечается снижение интенсивности мечения покровов 1го и 2го сегментов, но с активной пролиферацией в задних областях тела. При переходе к стадии нектохеты обособляется медиальная зона меченых ядер нейроэктодермы и развивающейся средней кишки. Наиболее интенсивно у нектохет метка включается в передней части пигидия. Маркеры митоза чаще выявляются в медиальной нейроэктодерме, основании параподий и пигидии. Развитие стомодеума, пигидиальных лопастей и цирр лишь на начальных этапах сопровождается локальной наработкой клеточного материала. Позднее морфогенез указанных зачатков идет в отсутствие активной пролиферации. Рост латеральных участков простомиума, нейроэктодермы, кишки и параподий на всем протяжении личиночного развития связан с локальными центрами вступления клеток в митоз. У нетохет перед завершением метаморфоза метка ДНК встречается почти исключительно в предпигидиальной области, вероятно, отражая появление материала новых постларвальных сегментов. Т. о., наши данные говорят о существовании транзиторных зон активных клеточных делений, которые обуславливают формообразовательные процессы и по-разному соотносятся с ними во времени. В случае регенерации A. virens метка предшественников ДНК активно включается в ткани прилежащего к ране сегмента уже в первый день, а затем и регенерата. Т. о, процессы закрытия раны не связанны с интенсивной пролиферацией покровных клеток. Клетки бластемы, вероятно, происходят из прилежащих к ране мезодермальных тканей. Дальнейшее развитие регенерата идет преимущественно за счет локальных делений клеток бластемы и покровов. 14. Анализ постэмбриональных морфогенезов у олигохеты P. longiseta говорит о возможном участии на начальных этапах формирования зоны паратомии мигрирующих клеток и значительной роли покровного эпителия. В зоне деления мышечная система претерпевает локальные изменения, образуя бреши. Клетки покровов теряют признаки дифференцированных и переходят в вентролатеральные бластемные скопления, с клетками которых они обнаруживают значительное сходство на уровне ультраструктуры. 15. Результаты анализа in silico говорят о сохранении анцестрального репертуара участников Wnt и FGF/RTK сигналинга у P. dumerilii. Дополнительно к данным открытых баз данных об основных участниках канонического Wnt - beta-catenin сигналинга, в неаннотированной базе транскриптомных и черновых геномных данных нам удалось идентифицировать и охарактеризовать последовательности, кодирующие гомологи Dickkopf и Groucho/TLE. Гомологов Cerberus и Shisa, ингибиторов Wnt пути, известных только для позвоночных, нами обнаружено не было. При поиске компонентов слабо изученного у беспозвоночных FGF/RTK пути обнаружены еще два паралога FGFR, вероятно FGFR2 и FGFR3. 16. Секвенирован и собран транскриптом олигохеты E. coronatus, позволяющий в дальнейшем анализировать различными методами возможное участие целого набора генов в реализации механизмов морфогенезов. В ходе первого года, опубликовано две статьи в международных журналах WoS/Scopus, две статьи в материалах всероссийской конференции, две он-лайн публикации в интернет-журнале, а также 6 тезисов докладов на международных конференциях. Подготовлено две рукописи к публикации в международных журналах WoS/Scopus, по восстановительным морфогенезам у губок, обе из которых будет входить в квартиль Q1 WoS/Scopus. Полученные материалы доложены на двух международных конгрессах, всероссийской конференции с международным участием и на двух всероссийских конференциях в одном приглашенном докладе, 8 устных и 5 стендовых сообщениях.

 

Публикации

1. Ересковский А.В., Геронимо А., Перез Т. Asexual and puzzling sexual reproduction of the Mediterranean sponge Haliclona fulva (Demospongiae): life cycle and cytological structures Invertebrate Biology, том 136, № 4, стр. 403-421 (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1111/ivb.12195

2. Ересковский А.В., Лавров А.И., Большаков Ф.В., Токина Д.Б. Regeneration in White Sea sponge Leucosolenia complicata (Porifera, Calcarea) Invertebrate Zoology, Vol.14. No.2. P.108–113 (год публикации - 2017) https://doi.org/10.15298/invertzool.14.2.02

3. Борисенко И.Е., Адамкий М., Ленинжер С., Ересковский А.В., Адамская М. Wnt pathway is implicated in axial patterning and regeneration in the demosponge Halisarca dujardini 4th International Congress on Invertebrate Morphology 18-23 августа 2017, Москва, Россия. Program & Abstract biook, Изд, ПЕРО, Москва, С. 57 (год публикации - 2017)

4. Ересковский А.В., Борисенко И.Е., Лавров А.И., Адамская М. Regeneration in sponges Book of abstracts of 10th World Sponge Conference NUI Galway. June 25-30 2017, С. 123 (год публикации - 2017)

5. Ересковский А.В., Борисенко И.Е., Лавров А.И., Большаков Ф., Токина Д.Б., Адамская М. Body plan formation during regeneration in sponges 4th International Congress on Invertebrate Morphology 18-23 августа 2017, Москва, Россия. Program & Abstract biook, С. 272 (год публикации - 2017)

6. Ересковский А.В., Лавров А.И., Большаков Ф.В Reparative regeneration of White Sea sponge Leucosolenia Complicata (Porifera, Calcarea): Morphogenesis and cellular sources Материалы XIII Всероссийской конференции с международным участием « Изучение, рациональное использование и охрана природных ресурсов Белого моря »., Изд. Зоологического института РАН. 2017. P. 274-276. (год публикации - 2017)

7. Козин В.В., Филимонова Д.А., Костюченко Р.П. Участие сигнальных каскадов в спецификации и морфогенезе мезодермы у зародышей Spiralia Конференция «Морфогенез в индивидуальном и историческом развитии: онтогенез и формирование биологического разнообразия». Москва, 2017, Тезисы докладов, С. 25-26 (год публикации - 2017)

8. Костюченко Р.П., Никанорова Д.Д. Cell lineage and fate map of the primary somatoblast: the comparative aspects of Annelid development Invertebrate Morphology (ICIM4). 18-23 августа 2017, Москва, Россия, Program & Abstract biook. Москва, Изд. «Pero», С. 282 (год публикации - 2017)

9. Костюченко Р.П., Никанорова Д.Д., Колосов Н.И., Козин В.В., Купряшова Е.Е. Морфогенезы при бесполом размножении и регенерации у аннелид: молекулярные и клеточные аспекты Конференция «Морфогенез в индивидуальном и историческом развитии: онтогенез и формирование биологического разнообразия». Москва, 2017, Тезисы докладов, С.28-29 (год публикации - 2017)

10. Лавров А.И., Косевич И.А. Sponge cell reaggregation: inter- and intraspecific variations Book of abstracts of 10th World Sponge Conference NUI Galway. June 25-30 2017, С.108 (год публикации - 2017)

11. Лавров А.И., Косевич И.А. Sponge cell reaggregation: inter- and intraspecific variations Материалы XIII Всероссийской конференции с международным участием « Изучение, рациональное использование и охрана природных ресурсов Белого моря », Изд. Зоологического института РАН. 2017. P. 267-269 (год публикации - 2017)

12. Мелентий А.Г., Костюченко Р.П., Козин В.В Экспрессия генов полярности сегментов при посттравматической регенерации полихеты Alitta virens Юбилейная конференция Института биологии развития им. Н. К. Кольцова РАН с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития». Москва, 2017, Тезисы докладов, С. 17-18 (год публикации - 2017)


Аннотация результатов, полученных в 2018 году
1. Активность пролиферации и ее значение было подробно изучено в экспериментах по удалению заднего конца тела полихеты Alitta virens. Мы наблюдали эпиморфное развитие новых терминальных структур исключительно за счет размножения примыкающих к ране клеток. Статистический анализ показал наиболее интенсивный прирост количества клеток в первые 3 дня после ампутации. Формирование регенерационной почки (1-2 дня) связано с появлением в области раны активно делящихся клеток покровного эпителия и бластемы. Изменение характера мечения на этом сроке сопровождается массовым вступлением в митотический цикл клеток в покровах животного на границе раны. На основе полученных данных можно предположить наличие у A. virens процессов локальной дедифференцировки клеток, входящих в состав старого сегмента. Этот процесс, равно как и активизация движения клеток по митотическому циклу, скорее всего, обусловлен появлением сигнального центра на месте смыкания кишечного и покровного эпителиев. 2. Гомеодомен-содержащие транскрипционные факторы играют важнейшую роль в развитии многоклеточных животных путем регуляции экспрессии тысяч других генов. Гомеодомен – консервативный участок пептидной цепи протяженностью 60 аминокислотных остатков. Гомеодомен высококонсервативен, т.к. отвечает за связывание транскрипционного фактора с ДНК. Среди гомеодомен-содержащих белков выделяют множество семейств, наиболее известно среди которых Antennapedia, объединяющее классы генов Hox, ParaHox и NKL. Эти гены отвечают за спецификацию передне-задней оси и дифференцировку разных клеточных типов у билатерально-симметричных животных. Многие из генов Antennapedia локализованы в кластер в составе генома, что во многом отражает их эволюционную историю. Для губок, низших многоклеточных, информация о наборе генов Antennapedia, их организации в геноме, и предположительных функциях, известна лишь для демоспонгии Amphimedon queenslandica. Мы предприняли попытку охарактеризовать набор и экспрессию этих генов, управляющих развитием, у демоспонгии Halisarca dujardinii с целью прояснить ранние этапы эволюции программ развития. Было обнаружено, что в транскриптоме у H. dujardinii присутствуют продукты экспрессии 58 гомеобокс-содержащих генов, из которых пятнадцать относятся к классу Antennapedia. Среди них обнаружены представители кластеризованных и диспергированных генов семейства NKL. Hox-гены не были обнаружены, как и у других губок, что говорит об их появлении у стрекающих, либо об их вторичной утрате у губок. 3. Поиск потенциальных участников индукционных процессов был продолжен биоинформационными методами. Анализ геномных и транскриптомных данных у модельных объектов настоящего проекта выявил богатство и ряд уникальных особенностей в наборе многих важнейших генов-регуляторов морфогенеза. У олигохеты Enchytraeus coronatus выявлено не менее 59 генов, относящихся ко всем группам подклассов HOXL (Hox и Parahox) и NKL (Nkx) класса ANTP. В большинстве случаев для E. coronatus показано существование нескольких паралогов. В ряде случаев определена вероятность существования нескольких изоформ гена. Полученные нами новые приоритетные данные (в совокупности с находящимися в открытых базах и ранее опубликованными) говорят о ярко выраженной тенденции к увеличению в геноме числа генов класса ANTP в ряду олигохеты-пиявки, в отличие от разнообразных таксонов полихет. Для нереидных полихет показано наличие гомологов 12 типов лигандов Wnt (Козин и др., 2019), тогда как у олигохеты E. coronatus обнаружено только 7. При этом для всех групп, кроме Wnt1 и Wnt2 у E. coronatus обнаружено по 2-3 паралога. В результате выполнения проекта нами были идентифицированы и частично клонированы гены, кодирующие компоненты Wnt и FGF/RTK сигналинга у аннелид. Для нереидных полихет выявлено по 2 гена-кандидата FGF (отнесенных по филогенетическому анализу к семейству FGF8/17/18), а также по 1 участку FGF-like в протяженных мультидоменных последовательностях. Наши результаты позволяют сделать вывод о преимущественно независимой эволюции FGF-лигандов у крупных таксонов Metazoa. Набор соответствующих генов мог пополняться или претерпевать вторичные утраты у каждого типа животных. Это утверждение удалось подкрепить новыми данными и распространить на всех первичноротых, включая Spiralia. Вместе с тем, филогенетические отношения и известные функциональные данные свидетельствуют о принципиальной роли семейства FGF8/17/18 в эволюции морфогенетических процессов. 4. Экспрессия Wnt1 и его консервативного гена-мишени FoxA, а также комплементарные результаты по распределению белка beta-катенина были описаны у нереидных полихет на протяжении эмбрионального и личиночного развития (Козин и др., 2019; Kostyuchenko et al., 2018). Обнаружена приуроченность канонического Wnt сигналинга к вегетативному/заднему полюсу тела. Ингибиторным анализом установлено принципиальное значение Wnt в определении переднезадней полярности и управлении морфогенезом эктодермальных производных. 5. В ходе развития и регенерации у губок происходят такие процессы, как дедифференцировка клеток, их миграции, апоптоз, фагоцитоз и снова дифференцировка. В связи с изменением морфологии клеток и их перемещением, отследить их судьбу и поведение в морфогенезе невозможно без специфичных молекулярных маркеров. Такими маркерами могут быть белки, специфически синтезируемые в том или ином типе клеток. С помощью сравнения транскриптомов клеток разных типов губки H. dujardinii были выявлены гены, специфически экспрессирующиеся в хоаноцитах, археоцитах и гранулярных клетках. Отдельные типы клеток изолировали диссоциируя губку на клетки в бескальциевой морской воде с последующим центрифугированием в градиенте плотности. Та же задача параллельно решалась с помощью разностного электрофореза (2D-DIGE) и масс-спектрометрии белков, выделенных из тех же фракций клеток. Были отобраны кандидаты на роль маркеров разных клеточных типов. 6. При диссоциации взрослой губки, полученные клетки способны формировать агрегаты – примморфы, развивающиеся впоследствии во взрослую губку. Молекулярно-генетические механизмы, регулирующие этот сходный с развитием процесс, неизвестны. Нами впервые были секвенированы транскриптомы примморф на разных стадиях развития, выявлены количественные отличия в экспрессии генов на разных стадиях. Показано, что наибольшая разница в профилях экспрессии наблюдается через 24 ч и 7 дней после диссоциации губки H. dujardinii на клетки. Морфологическими методами показано, что на этих стадиях происходят события апоптоза/дедифференцировки и дифференцировки клеток, соответственно. 7. В рамках выполнения проекта в 2018 году были исследованы разнообразные восстановительные процессы у известковых губок. Впервые был исследован процесс репаративной регенерации стенки тела губки Clathrina arnesenae с использованием гистологических и ультраструктурных методов; получены первые данные по морфогенезам и поведению клеток, лежащих в основе этого процесс. Также впервые был проведен детальный анализ процесса реагрегации клеток и восстановления исходной организации животного после диссоциации тканей у двух видов губок – Sycon ciliatum и Clathrina arnesenae. Сравнение этих данных с ранее полученными данными по реагрегации клеток Leucosolenia variabilis позволит выявить общие закономерности протекания морфогенезов и поведения клеток при реагрегации у представителей класса известковых губок. В сотрудничестве со специалистами из l’Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier, Université de Montpellier (университет Монпелье, Монпелье, Франция) был отработан протокол и начаты исследования роли апоптоза в восстановительных процессах у известковых губок.

 

Публикации

1. Ересковский А.В. Sponge Reproduction Encyclopedia of Reproduction. Academic Press: Elsevier, vol. 6, pp. 485–490 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.1016/B978-0-12-809633-8.20596-7

2. Костюченко Р.П.,* Козин В.В., Филиппова Н.П., ,Сорокина Е.В. FoxA expression pattern in two polychaete species, Alitta virens and Platynereis dumerilii: examination of the conserved key regulator of the gut development from cleavage through larval life, post-larval growth and regeneration Developmental Dynamics, - (год публикации - 2018)

3. Лавров А.И., Большаков Ф.В., Токина Д.Б., Ересковский А.В. Sewing wounds up: the epithelial morphogenesis as a central mechanism of calcaronean sponge regeneration Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution, - (год публикации - 2018) https://doi.org/10.1002/jezb.22830

4. Козин В.В., Борисенко И.Е., Костюченко Р.П. Участие канонического сигнального пути Wnt в определении полярности тела и клеточной идентичности у Metazoa: Новые данные о развитии губок и аннелид Известия РАН. Серия биологическая, - (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1134/S000233291901003X

5. Адамска М., Ересковский А., Адамски М. Regeneration in sponges involves taxonomically restricted and conserved genes. 7th meeting of the European Society for Evolutionary Developmental Biology (EED) June 26-29, 2018, Galway, Ireland, Book of abstracts, c. 114 (год публикации - 2018)

6. Екимова И., Азеведу Ф., Лавров А., Ересковский А.В. Cryptic diversity of genus Leucosolenia (Porifera: Calcarea) of the White and Barents Seas Marine biology, geology, oceanology: interdisciplinary research at marine stations : 80th anniversary of the Nikolai Pertsov White Sea Biological Station », 19-22 november, 2018, Moscow, Russia. Book of abstracts, с. 9 (год публикации - 2018)

7. Ересковский А.В., Большаков Ф.В., Токина Д,Б., Лавров А.И. Sewing up the wounds: the epithelial morphogenesis as a central mechanism of Leucosolenia complicata (Porifera, Calcarea) regeneration 7th meeting of the European Society for Evolutionary Developmental Biology (EED).Book of abstracts, c. 368 (год публикации - 2018)

8. Ересковский А.В., Борисенко И.Е., Большаков Ф.В., Лавров А.И., Токина Д.Б. Regeneration in sponges (Porifera): comparative investigation Marine biology, geology, oceanology: interdisciplinary research at marine stations : 80th anniversary of the Nikolai Pertsov White Sea Biological Station. Book of abstracts. KMK Scientific Press, Moscow, с.14 (год публикации - 2018)

9. Лавров А.И., Большаков Ф.В., Токина Д.Б., Ересковский А.В. Regeneration in calcareous sponges (Calcarea, Porifera) of the White Sea « Marine biology, geology, oceanology: interdisciplinary research at marine stations : 80th anniversary of the Nikolai Pertsov White Sea Biological Station », 19-22 november, 2018, Moscow, Russia. Book of abstracts. KMK Scientific Press, Moscow, с. 18 (год публикации - 2018)

10. Шалаева А.Ю., Борисенко И.Е., Костюченко Р.П., Козин В.В. Cell proliferation dynamics during regeneration and larval development of the White Sea polychaete Alitta virens: method development and first results Marine biology, geology and oceanography — interdisciplinary studies based on the marine Stations and Labs. 80th anniversary of the Nikolai Pertsov White Sea Biological Station. International conference. November 19-21, 2018, Moscow: KMK Scientific Press, p. 21 (год публикации - 2018)

11. Шалаева А.Ю., Костюченко Р.П., Козин В.В. Изучение клеточной пролиферации в ларвальном развитии беломорской полихеты Alitta virens (Annelida) Студенческая Научная Сессия УНБ «Беломорская» СПбГУ. Санкт-Петербург, 9 февраля 2018, с. 121 (год публикации - 2018)

12. Ересковский А.В., Большаков Ф.В., Токина Д.Б., Лавров А.И, Sewing up the wounds: the epithelial morphogenesis as a central mechanism of Leucosolenia complicata (Porifera, Calcarea) regeneration F1000Research, 7:1343 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.7490/f1000research.1115997.1

13. Лавров А.И., Большаков Ф.В., Токина Д.Б., Ересковский А.В. Regeneration in calcareous sponges (Calcarea, Porifera) of the White Sea F1000Research 2018, 7: 1873 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.7490/f1000research.1116325.1

14. Фролова В.С., Лавров А.И. The ability of calcareous sponges (Calcarea, Porifera) to develop from dissociated cells F1000Research, 7:1874 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.7490/f1000research.1116326.1


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
В 2019 году нами были получены следующие приоритетные научные результаты. Для исследуемых аннелид (полихеты Alitta virens и олигохеты Enchytraeus coronatus) идентифицированы в транскриптомах, аннотированы и клонированы дополнительные компоненты и вероятные гены-мишени Wnt и FGF/RTK, кодирующие ТФ-регуляторы морфогенезов (En, Bra, Rnt, Twi). Анализ экспрессии отдельных гомологов cdx, передних, средних и задних Hox-генов, а также Nk-генов методом гибридизации in situ для E. coronatus показал, что ни один из них не экспрессируется на стадиях дробления, до начала гаструляции. Наиболее ранняя экспрессия отмечена для ортолога cdx в районе бластопора. Экспрессия Нох-генов, за несколькими исключениями, происходит с соблюдением принципа колинеарности. Большинство исследованных Нох-генов экспрессируется в материале нервной системы, начиная задолго до ее формирования на вентральной стороне. Таким образом, экспрессия Нох-генов сопровождает процессы массового перемещения клеток в ходе гаструляции и органогенеза. При этом наблюдается переднезадний градиент величины доменов и активности экспрессии. Некоторые гены, главным образом из средней группы, начинают экспрессироваться в мезодерме, демонстрируя сходный градиент. При этом они активируются и в эктодерме, но с задержкой во времени. Практически все исследованные средние и задние гены, активны в зоне роста в конце эмбрионального развития. Сравнивая паралогичные гены можно сделать вывод, что у них могут быть разные функции во времени и пространстве. У ювенильных животных уровень экспрессии резко падает, однако он вновь возрастает в ходе передней и/или задней регенерации. Большинство генов активируются в материале бластемы, как передней, так и задней, а также в зоне роста. Данные об экспрессии Нох-генов при передней регенерации аннелид являются приоритетными. В продолжение исследований по определению роли Wnt у полихеты A. virens было описано распределение эффекторного белка β-катенина на ранних этапах эмбриогенеза (Козин и др., 2019а, б), а также проведены комплементарные эксперименты по модуляции Wnt/beta-cat с подсчетом соотношения фенотипов. Обнаруженная нами асимметричная локализацией β-катенина во время спирального дробления имеет существенное значение для детерминации клеточной судьбы, закладки дефинитивных осей симметрии и, в меньшей степени, для паттернирования осей и зачатков. Выявленные на предшествующем этапе проекта гены-кандидаты FGF-сигналинга (Шалаева и др., 2019) были изучены на предмет экспрессии после ампутации заднего конца тела у A. virens. Лиганд и рецепторы FGF активировали свою транскрипцию уже в первые сутки после ампутации. Преимущественно экто- или мезодермальная тканеспецифичность сигнала мРНК позволяет говорить о потенциальной компетенции к FGF всех тканей, вовлеченных в эпиморфную регенерацию. В экспериментах по ингибированию сигнала FGF было отмечено, что подавление пролиферации имеет дозозависимый и обратимый эффект (Шалаева, Козин, 2019). Полученные данные являются первым в мире свидетельством функционирования FGF у представителей клады Spiralia. На пролиферацию у регенератов и личинок A. virens также влияет путь Wnt. В экспериментах с фармакологическими ингибиторами был достигнут ярко выраженный разнонаправленный эффект (Козин, 2019, Козин и др., 2019). Наиболее существенное значение регуляция со стороны Wnt имеет в производных гипосферы, т.е. сегментах туловища и пигидии, и к тому же зависит от положения клетки вдоль переднезадней оси. Полученные на регенерирующих червях количественные данные по динамике пролиферации говорят о значительной гетерогенности клеточных популяций в раневой зоне. Была изучена экспрессия гомеобокс-содержащих генов класса POU у губки Halisarca dujardini (кл. Demospongiae), гомологов одного из регуляторов плюрипотентности – Oct4. Показаны различия в уровнях экспрессии данных генов в разных частях губки, в клеточных типах (хоаноцитах, археоцитах, сферульных клетках), и их изменение в ходе развития примморф из диссоциированных клеток. Обнаружены POU-гены, экспрессия которых ощутимо меняется в ходе развития примморфы. Аннотированы транскрипты, специфичные для разных клеточных типов губки – хоаноцитов, археоцитов, сферульных клеток. Показано, что в разных клеточных типах по числу экспрессирующихся генов преобладают гены с разными функциями. Так, в хоаноцитах большинство транскриптов среди наиболее представленных, связаны с регуляцией клеточного цикла, митозом и структурами ядра. Для многих белков губок в ходе анализа не удается установить гомологию с описанными последовательностями, или найти консервативные домены. Это продукты taxon-restricted genes – генов, получивших экспансию в разных типах беспозвоночных, и, возможно, послуживших основой их разнообразию. Также нами описан на структурном уровне ранее неизвестный мажорный белок поверхностных клеток личинки губки H. dujardini (Borisenko et al. 2019). Белок участвует в энергетическом метаболизме, способен связывать кальций, и распространен среди животных от губок до иглокожих, хотя ранее его гомологи не описывались. Мы предполагаем его участие в метаморфозе личинки, связывая с активностью жгутиковых клеток. Было показано, что восстановление скелета на поздних стадиях регенерации C. arnesenae происходит иначе, чем у ранее изученной Leucosolenia variabilis. Так, скелет C. arnesenae в месте ранения восстанавливается не за счет синтеза новых спикул, а за счет перемещения в раневую область ранее синтезированных спикул из прилежащих интактных тканей. Участие апоптоза в восстановительных процессах было исследовано на двух видах губок - Leucosolenia variabilis и Aplysina cavernicola с разными типами регенерации (морфаллаксисом и эпимирфозом, соответственно). Апоптотирующие клетки присутствуют в районе раны у обоих видов, однако изученные виды различаются количеством и временем появления апоптотирующих клеток. У L. variabilis апоптоз происходит на всех изученных стадиях регенерации, но остается на очень низком уровне в том время, как у A. cavernicola имеют место 2 волны апоптоза клеток: на ранней стадии регенерации, когда происходит элиминация поврежденных клеток, и на поздней стадии – вероятно, для восстановление нормального физиологического состояния тканей в раневой области. Впервые была исследована пролиферация клеток в ходе реагрегации клеток губок на примере известковых губок L. variabilis и Sycon sp. Клетки в многоклеточных агрегатах обоих видов способны синтезировать ДНК и делиться митозом. Количество пролиферирующих клеток на ранних стадиях реагрегации значительно выше, чем в агрегатах на более поздних стадиях. Как и в интактных тканях, в агрегатах и примморфах хоаноциты демонстрируют пролиферативную активность, но их доля не такая значительная; в то же время пролиферация присутствует в клетках других типов, которые не удалось идентифицировать из-за отсутствия специфических маркеров. Также было показано, что по крайней мере часть хоаноцитов L. variabilis и Sycon sp. способны сохранять свою исходную дифференцировку в течении всего процесса реагрегации клеток. Эти данные указывают на неодинаковые потенции хоаноцитов известковых губок, отличаются от потенций хоаноцитов Demospongiae, которые полностью дедифференцируются к моменту формирования настоящих примморфов. Закончено и уточнено описание морфогенезов и трансформации клеток в ходе репаративной регенерации стенки тела асконоидной известковой губки Clathrina arnesenae (подкласс Calcinea), а также впервые описан ее клеточный состав. Впервые выявлены специализированные септированные межклеточные контакты. В отличие от известковых губок из подкласса Calcaronea единственным источником «эндопинакодермы» регенеративной мембраны (РМ) C. arnesenae являются пороциты. При трансформации пороциты, имеющие цилиндрическую форму, сперва замыкают наружное отверстие (в экзопинакодерме) и теряют связь с экзопинакоцитами. Затем принимают подковообразную на срезе форму. При этом они не теряют связь с внутренней средой. Далее эти клетки выселяются на внутреннюю поверхность трубки, расправляются, уплощаются и подстилают хоанодерму. Здесь они формируют между собой контакты, образуя сплошной монослой плоских «эндопинакоцитов» РМ. Хоаноциты при этом дедифференцируются, теряют межклеточные контакты и поклеточно вселяются в мезохил (также как они это делают при сокращении губки). В ходе дальнейшей регенерации, при восстановлении хоанодермы, с пороцитами происходит обратная трансформация, когда они сокращают свою поверхность и втягиваются в мезохил. Таким образом, этот процесс формирования внутренней выстилки РМ можно расценивать как своеобразный эпителиальный морфогенез, сопровождающийся сортировкой клеток, известной как радиальная интеркаляция. Этот механизм увеличения площади поверхности эпителиального слоя описан нами впервые для Porifera. Дедифференцированные хоаноциты, после полного формирования РМ, вновь вселяются во внутреннюю стенку РМ и редифференцируются в нормальные хоаноциты. Это тот же механизм, что при ритмичном сокращении и расслаблении рубки. То есть, это нормальный ее механизм. Возможно, что параллельно хоаноциты, окружающие РМ, начинают активно пролиферировать, заселяя РМ с периферии. Для более глубокого понимания клеточных и морфогенетических механизмов, сопровождающих регенерацию у демоспонгий, нами была изучена регенерация у средиземноморской губки Aplysina cavernicola. В ходе регенерации A. cavernicola мы выявили два основных клеточных источника новой экзопинакодермы: археоциты и хоаноциты. Восстановление хоаноцитных камер осуществляется, главным образом, за счет редифференциации хоаноцитов и, возможно, благодаря дифференциации археоцитов. Регенерационные процессы у этой губки сопровождаются двумя волнами апоптоза и изменением в пролиферативной активности клеток. Показано, что в отличие от известковых губок, у которых регенерация идет по типу морфаллаксиса, заживление раневой поверхности у демоспонгии A. cavernicola, включает элементы эпиморфоза. Этот тип регенерации характеризуется тем, что включает два основных процесса: (1) трансдифференцировку клеток, с их последующей редифференцировкой, (2) активное участие полипотентных клеток, мигрирующих к раневой поверхности (в данном случае, археоцитов и хоаноцитов) и (3) формирование бластемы. Морфогенез по типу мезенхимо-эпителиального перехода, является основным при регенерации эктосомы A. cavernicola.

 

Публикации

1. Борисенко И.Е., Подгорная О.И., Ересковский А.Е. From traveler to homebody: Which signaling mechanisms sponge larvae use to become adult sponges? Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, т. 116, с. 421-449 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/bs.apcsb.2019.02.002

2. Ересковский А.В. Выявление эволюционно первичных черт плана строения и филотипической стадии развития Рorifera Онтогенез, том 50, № 6, с. 398–406 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1134/S047514501906003X

3. Ересковский А.В., Токина Д.Б., Саидов Д.М., Багдиджан С., Ле Гофф Э., Лавров А.И. Transdifferentiation and mesenchymal-to-epithelial transition during regeneration in Demospongiae (Porifera). Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution, - (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1002/jez.b.22919

4. Лавров А.И., Ересковский А.В. Techniques to study whole-body regeneration (WBR) in calcareous sponge Leucosolenia Methods in Molecular Biology, vol. 2450. Pp. 69-93 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1007/978-1-0176-2171-4_4

5. Петренко Я., Саммерс А.П., Симон П., Золотовска С., Мотыленко М., Шимпф С., Рафая Д., Рот Ф., Куммер К., Брендлер Е., Покровский О.С., Галли Р., Высоковский М., Мейснер Х., Недершлаг Е., Жосеп И., Молодцов С., Ересковский А. и др Extreme biomimetics: Preservation of molecular detail in centimeter-scale samples of biological meshes laid down by sponges Science Advances, 5: eaax2805 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1126/sciadv.aax2805

6. Фролова В.С., Лавров А.И. Способность известковых губок (Calcarea, Porifera) к развитию из диссоциированных клеток Труды VII Международной научно-практической конференции “Морские исследования и образование (MARESEDU-2018)”, Т. 4, с. 98-102 (год публикации - 2019)

7. Шалаева А.Ю., Борисенко И.Е., Костюченко Р.П., Козин В.В. Кинетика клеточных популяций при регенерации и в ходе ларвального развития у беломорской полихеты Alitta virens: методические аспекты и первые результаты Труды VII Международной научно-практической конференции “Морские исследования и образование (MARESEDU-2018)”, Т. 4, с. 93-97 (год публикации - 2019)

8. Мартинез П., Балларин Л., Ересковский А.В, Газав Е., Хобмайер Б., Манни Л., Роттингер Э., Спрехер С.Г., Варела-Коело А., Ринкевич Б. Articulating the “stem cell niche” paradigm through the lens of non-model aquatic Invertebrates BMC Biology, 20:23 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1186/s12915-022-01230-5

9. Борисенко И.Е., Ересковский А.В. У обыкновенных губок тоже есть parahox, или система гомеобоксных генов Halisarca dujardini (Demospongiae). ЗООЛОГИЯ БЕСПОЗВОНОЧНЫХ – НОВЫЙ ВЕК: материалы конференции, посвященной 160-летию Кафедры зоологии беспозвоночных Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова (19-21 декабря 2018 г.), с. 23 (год публикации - 2019)

10. Борисенко И.Е., Лавров А.И., Ересковский А. TGF-beta pathway in Development of the Sponge Halisarca dujardini. Abstract book: European Developmental Biology Congress, Alicante 23rd to 26th October 2019, C. 236 (год публикации - 2019)

11. Борисенко И.Е., Лавров А.И., Козин В.В., Подлевских А. Л ., Ересковский А.В. Транскриптомный подход к изучению механизмов спецификации осей у губки Halisarca dujardini и их примморф. Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития» 14-19 октября 2019 г, Москва., с. 31 (год публикации - 2019)

12. Екимова И.А., Азеведо Ф., Лавров А.И., Койнова А., Ересковский А.В. Криптическое разнообразие рода Leucosolenia (Porifera: Calcarea) в Белом и Баренцевом морях. Труды VII Международной научно-практической конференции “Морские исследования и образование (MARESEDU-2018)”., Т.4. С. 247 (год публикации - 2019)

13. Ересковский А.В. Морфогенезы и клеточные источники реnаративной регенерации у губок (Porifera). Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития» 14-19 октября 2019 г, Москва., С. 12-13 (год публикации - 2019)

14. Ересковский А.В. Stem cells in sponges (Porifera): an update ISJ-INVERTEBRATE SURVIVAL JOURNAL, T. 16, c: 62-63 (год публикации - 2019)

15. Ересковский А.В., Борисенко И.Е., Большаков Ф.В., Лавров А.И., Токина Д.Б. Сравнительное исследование регенерации у губок (Porifera). Труды VII Международной научно-практической конференции “Морские исследования и образование (MARESEDU-2018)”., Т.4. С. 80. (год публикации - 2019)

16. Козин В.В., Борисенко И.Е., Костюченко Р.П. Морфогенетическая роль β-катенина у Alitta virens (Spiralia, Annelida) Беломорская студенческая научная сессия СПбГУ – 2019. Тезисы докладов. Санкт-Петербург: Свое издательство, c. 45 (год публикации - 2019)

17. Козин В.В., Мелентий А.Г., Шалаева А.Ю., Костюченко Р.П. Wnt-зависимая сегментация ларвального и постларвального тела аннелид Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития» 14-19 октября 2019 г, Москва. Издательство Перо, с. 53 (год публикации - 2019)

18. Козин В.В., Мелентий А.Г., Шалаева А.Ю., Костюченко Р.П. Явления зависимой спецификации при формировании плана строения тела у представителей Spiralia ЗООЛОГИЯ БЕСПОЗВОНОЧНЫХ – НОВЫЙ ВЕК: материалы конференции, посвященной 160-летию Кафедры зоологии беспозвоночных Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова (19-21 декабря 2018 г.)., с.62 (год публикации - 2019)

19. Костюченко Р.П., Борисенко И.Е. Разнообразие и экспансия гомеобокс-содержащих генов у губок и аннелид: к чему такие сложности «простым» беспозвоночным? Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития» 14-19 октября 2019 г, Москва., С. 14-15 (год публикации - 2019)

20. Мелентий А.Г., Костюченко Р.П. Особенности экспрессии консервативных регуляторных генов из семейства FoxA у олигохеты Eлchytraeus coronatus. Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития» 14-19 октября 2019 г, Москва, с. 65 (год публикации - 2019)

21. Мелентий А.Г., Цыбатова Е.В., Козин В.В., Костюченко Р.П. Консервативные регуляторные гены развития кишки из семейства FoxA: описание структурной организации и экспрессии у представителей типа Annelida Беломорская студенческая научная сессия СПбГУ – 2019. Тезисы докладов. Санкт-Петербург: Свое издательство, с. 58 (год публикации - 2019)

22. Никанорова Д.Д., Шалаева А.Ю., Козин В.В., Костюченко Р.П. Сравнительный анализ клеточного размножения и тканевых перестроек при регенерации у аннелид Беломорская студенческая научная сессия СПбГУ – 2019. Тезисы докладов. Санкт-Петербург: Свое издательство, с. 59 (год публикации - 2019)

23. Фролова В.С., Лавров А.И. Известковые губки: развитие из диссоциированных клеток Беломорская студенческая научная сессия СПбГУ – 2019. Тезисы докладов., c.75 (год публикации - 2019)

24. Фролова В.С., Лавров А.И. Морфогенетические потенции клеток при реагрегации известковых губок (Calcarea, Porifera). Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития» 14-19 октября 2019 г, Москва. Издательство Перо, с. 99-100 (год публикации - 2019)

25. Шалаева А.Ю., Козин В.В. Изучение пролиферативного пула и FGF-сигналлинга при регенерации Alitta virens (Spiralia, Aппelida). Материалы XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития» 14-19 октября 2019 г, Москва, с. 102-103 (год публикации - 2019)

26. Шалаева А.Ю., Костюченко Р.П., Козин В.В Молекулярная эволюция компонентов FGF-сигналинга: первые данные о разнообразии лигандов и рецепторов у аннелид и моллюсков Беломорская студенческая научная сессия СПбГУ – 2019. Тезисы докладов. Санкт-Петербург: Свое издательство, с. 78 (год публикации - 2019)

27. Шалаева А.Ю., Костюченко Р.П., Козин В.В. Исследование митотической активности при задней регенерации беломорской полихеты Аlitta virens. ЗООЛОГИЯ БЕСПОЗВОНОЧНЫХ – НОВЫЙ ВЕК: материалы конференции, посвященной 160-летию Кафедры зоологии беспозвоночных Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова (19-21 декабря 2018 г.)., с. 128 (год публикации - 2019)

28. Лавров А.И., Большаков Ф.В., Борисенко И.Е., Фролова В.С., Токина Д.Б. Ересковский А.В. Recovery process in sponges: morphogeneses and cell sources Постер, постер (год публикации - 2019)

29. - Губка даст начало целому классу новых материалов Российский Научный Фонд, http://rscf.ru/ru/node/klassu-novykh-materialov (год публикации - )

30. - Российские ученые превратили морскую губку в графит Поиск, https://www.poisknews.ru/news/rossijskie-uchenye-prevratili-morskuyu-gubku-v-grafit/ (год публикации - )

31. - Природный фильтр: российские учёные научились делать графит из морских губок divanews.ru, - (год публикации - )

32. - Природный фильтр: учёные научились делать графит из морских губок Russian today, - (год публикации - )

33. - Губка даст начало целому классу новых материалов Коммерсантъ, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Результаты проекта имеют в основном научный фундаментальный характер и могут быть использованы в учебном процессе в вузах соответствующего профиля, а также как основа для последующих фундаментальных и прикладных исследований.