КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 18-11-00178

НазваниеСоздание математических методов и вычислительных алгоритмов для реконструкции функциональной структуры человеческого тела по данным многоканальных измерений

РуководительУстинин Михаил Николаевич, Доктор физико-математических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук", г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2018 г. - 2020 г. 

Конкурс№28 - Конкурс 2018 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 01 - Математика, информатика и науки о системах, 01-205 - Математические модели в науках о живом

Ключевые словаэнцефалография, кардиография, миография, анализ многоканальных спектров, распознавание паттернов поля, распределение источников поля, неинвазивная функциональная диагностика

Код ГРНТИ27.35.43


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
В основе многих методов медицинской диагностики лежит измерение внешних электрических и магнитных полей, производимых электрическими источниками внутри человеческого тела. Регистрация и анализ таких полей в энцефалографии, кардиографии, миографии позволяют исследовать различные системы и делать выводы о тех или иных аномалиях в их работе. При этом, как правило, изучаются отклики на различные стимулы (за исключением кардиографии). Авторами проекта были заложены методические основы анализа спонтанной активности различных систем по данным многоканальных внешних измерений, подана заявка на патент США. Предложенный подход был успешно апробирован при анализе спонтанной активности головного мозга человека, в 2014-2015 гг. опубликованы статьи в международных журналах. В 2014 году результаты по функциональной томографии мозга, полученные с помощью предложенного метода, вошли в число избранных проектов РФФИ по разделу «Инфокоммуникационные технологии и вычислительные системы» (http://www.rfbr.ru/rffi/ru/best_projects/n_607). Научная новизна: В 2015 году были получены прорывные научные результаты, открывающие новые возможности для развития электрофизиологии и функциональной диагностики. Экспериментально обнаружено, что организм человека генерирует спонтанные поля, достаточные для реконструкции пространственного распределения источников. С помощью предложенного нами метода были восстановлены трехмерные функциональные структуры головы, сердца и руки человека по производимым ими магнитным полям, без каких-либо внешних воздействий. Актуальность: Метод может применяться к анализу электрических и магнитных полей, что позволяет ставить вопрос о создании принципиально новых диагностических систем, показывающих области аномально высокой или подавленной активности нервной или мышечной систем. Изменения активности могут быть связаны с теми или иными патологическими процессами и указывать на необходимость применения других диагностических методов. Таким образом, предложенный метод открывает принципиально новые возможности для развития медицинской функциональной диагностики. В настоящем проекте будут созданы методы и программы для реконструкции функциональной структуры человеческого тела по многоканальным временным рядам, измеряемым в различных диагностических исследованиях, таких, как магнитная и электроэнцефалография, магнитная и электрокардиография, магнитная и электромиография.

Ожидаемые результаты
В результате выполнения проекта будут получены следующие результаты: - методы, алгоритмы и программы для реконструкции электрической функциональной структуры тела человека по данным неинвазивных многоканальных измерений; - экспериментальные и диагностические методики. Планируемые результаты обладают новизной и превосходят существующий мировой уровень знаний. Они лягут в основу новых подходов к медицинской функциональной диагностике. По результатам выполнения проекта будет опубликовано не менее 10 статей в журналах, входящих в мировые системы цитирования.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2018 году
Предложен новый метод анализа данных магнитокардиографии, основанный на преобразовании Фурье протяженных временных рядов и на массовом решении обратной задачи для всех спектральных компонент. Магнитокардиограммы (МКГ) регистрировались в плоскости над грудной клеткой испытуемого в узлах квадратной сетки измерений (6 × 6) с шагом 40 мм, с помощью девятиканального СКВИД-магнитокардиографа на базе аксиальных градиометров второго порядка в обычных лабораторных условиях без какого-либо магнитного экранирования внешних помех. Для получения всех 36 МКГ измерения проводились в четырех позициях испытуемого под инструментом. Для каждой из позиций регистрации МКГ вычислялась частная функциональная томограмма, представляющая собой пространственное распределение элементарных магнитных диполей, наблюдаемых в этой позиции. Полная функциональная томограмма грудной клетки вычислялась суммированием четырех частных функциональных томограмм, содержащих информацию об одном и том же объекте, наблюдаемом с разных позиций. Фильтрация и контрастирование полной функциональной томограммы позволили выделить пространственный объект, представляющий собой функциональную структуру сердца. Метод был апробирован на пяти субъектах и показал согласующиеся между собой результаты. Возможно его дальнейшее использование в кардиографии, так как получаемый массив функциональной томограммы содержит всю измеренную информацию об индивидуальном сердце. Предложен новый метод анализа данных магнитной энцефалографии, позволяющий преобразовать многоканальные временные ряды в пространственную структуру активности головного мозга. Задачей данной работы было дальнейшее развитие метода с целью определения преимущественного направления электрических источников активности мозга в каждой точке расчетной сетки. Рассмотрены экспериментальные данные, полученные на трех 275-канальных магнитных энцефалографах: в Нью-Йоркском университете, в Университете Макгилла и в Монреальском университете. В качестве модельного объекта было выбрано явление альфа-ритма человека. Магнитные энцефалограммы спонтанной активности мозга регистрировались в течение 5–7 минут в магнитоизолирующем помещении. Было выполнено преобразование Фурье полных временных рядов, что позволило получить детальные многоканальные спектры. Для всех спектральных компонент была решена обратная задача в приближении элементарного токового диполя и была построена функциональная структура активности мозга в изучаемой полосе частот 8–12 Гц. Для оценки локального направления активности, в каждой точке расчетной сетки был выбран вектор решения обратной задачи с наибольшей спектральной мощностью. Это позволило построить трехмерную карту векторного поля активности мозга – направленную функциональную томограмму. Такие карты были построены для 15 субъектов, были найдены общие закономерности в направлениях элементарных источников альфа-ритма. Метод может быть использован для изучения локальных свойств активности мозга в любом спектральном диапазоне и в любой части мозга. Предложен новый метод анализа данных магнитомиографии, основанный на преобразовании Фурье протяженных временных рядов и на массовом решении обратной задачи для всех спектральных компонент. Для тестирования метода был поставлен следующий эксперимент. Испытуемый напрягал и расслаблял согнутую кисть руки в течение пяти минут, сжимая рукоятку, зафиксированную на измерительном столе. Магнитомиограммы регистрировались вблизи от руки с помощью семиканального СКВИД-магнитометра на базе аксиальных градиометров второго порядка. Испытуемый и экспериментальная установка размещались в толстостенной алюминиевой камере, предназначенной для изоляции от переменного электромагнитного поля. Защита от постоянного магнитного поля отсутствовала. Магнитные миограммы амплитудой 20 пикотесла были зарегистрированы в широкой полосе частот (до 500 Гц), с отношением сигнал/шум свыше 20. После фильтрации и выделения периодов сжатия/расслабления были сформированы две синтетические миограммы, каждая длительностью 135 секунд. Далее были вычислены многоканальные спектры и рассчитаны функциональные томограммы. В случае расслабленной руки значимых объектов обнаружено не было. В случае напряженной руки был выделен пространственный объект, представляющий собой функциональную структуру мышц, напряженных в данном эксперименте. Метод может быть использован для изучения и диагностики мышечной системы человека.

 

Публикации

1. Устинин М.Н., Масленников Ю.В., Рыкунов С.Д., Крымов В.А. Реконструкция функциональной структуры сердца человека по малоканальной магнитной кардиограмме Математическая биология и биоинформатика, Т. 13. № 2. С. 392–401 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.17537/2018.13.392

2. Устинин М.Н., Рыкунов С.Д., Бойко А.И., Маслова О.А., Волтон К.Д., Линас Р.Р. Оценка направлений элементарных источников альфа-ритма методом функциональной томографии мозга человека по данным магнитной энцефалографии Математическая биология и биоинформатика, Т. 13. № 2. С. 426-436 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.17537/2018.13.426

3. Устинин М.Н., Рыкунов С.Д., Поликарпов М.А., Юреня А.Ю., Наурзаков С.П., Гребенкин А.П., Панченко В.Я. Реконструкция функциональной структуры кисти руки человека по магнитной миограмме Математическая биология и биоинформатика, Т. 13. № 2. С. 480–489 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.17537/2018.13.480

4. Рыкунов С.Д., Устинин М.Н. RECONSTRUCTION OF THE FUNCTIONAL STRUCTURE OF COMPLEX SYSTEMS BY THE MASSIVE SOLUTION OF THE INVERSE PROBLEMS XVII International Seminar MATHEMATICAL MODELS & MODELING IN LASER PLASMA PROCESSES & ADVANCED SCIENCE TECHNOLOGIES, с. 56 (год публикации - 2018)

5. Устинин М.Н., Рыкунов С.Д., Рыкунова Е.Д., Бойко А.И. Методы изучения локальных свойств функциональной структуры человеческого тела Интеллектуализация обработки информации: Тезисы докладов 12-й Международной конференции, с. 156-157 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.30826/IDP201871

6. Рыкунова Е.Д., Рыкунов С.Д., Бойко А.И., Устинин М.Н. Программный комплекс для анализа данных магнитной энцефалографии методом виртуальных электродов Доклады Международной конференции “Математическая биология и биоинформатика”, Том 7 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.17537/icmbb18.91


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
Получил дальнейшее развитие и воплощение в программных средствах метод функциональной томографии человеческого тела по данным многоканальных измерений. Был разработан новый метод анализа данных многоканальных измерений – метод виртуальных электродов. По данным магнитной энцефалографии строится функциональная томограмма – пространственное распределение источников поля на дискретной сетке. Функциональная томограмма отображает на пространство головы информацию, содержащуюся в многоканальных временных рядах энцефалограммы. Это достигается решением обратной задачи для всех элементарных осцилляций, выделяемых с помощью преобразования Фурье. Каждой частоте осцилляции соответствует узел трехмерной сетки, в котором располагается источник. Пользователь задает местоположение, размер и форму области мозга для детального изучения частотной структуры функциональной томограммы – виртуальный электрод. Совокупность осцилляций, попавших в заданную область, представляет собой парциальный спектр данной области. По данному спектру восстанавливаются временные ряды энцефалограммы, измеренной виртуальным электродом. Метод был применен к анализу данных магнитной энцефалографии в двух вариациях – виртуальный электрод большого радиуса и точечный виртуальный электрод. Был создан программный комплекс FTViewer для изучения и представления функциональных томограмм мозга, сердца и мышц по магнитным измерениям, имеющий следующие возможности: - загрузка функциональных томограмм, рассчитанных по данным магнитной энцефалографии, магнитной кардиографии и магнитной миографии; - выбор между отображением спектральных мощностей и дипольных моментов; - выбор полосы частот для отображения; - фильтрация по качеству решения; - фильтрация помех от электрической сети на заданной частоте; - фильтрация отображения по минимальной и максимальной спектральной мощности/дипольному моменту; - показ положения приемных катушек измерителя; - экспорт отфильтрованных результатов в виде трехмерного массива в формате программного комплекса MRIAN. Методы и алгоритмы функциональной томографии были обобщены для анализа данных электроэнцефалографии и электрокардиографии, проведены тестовые расчеты для простейших моделей источников.

 

Публикации

1. Недайвода И.В., Примин М.А., Масленников Ю.В. Algorithm for Analysis of Magnetocardiac Signals: The Principal Component Method Journal of Communications Technology and Electronics, Vol. 64, No. 12, pp. 1414–1421 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1134/S1064226919110196

2. Поликарпов М.А., Устинин М.Н., Рыкунов С.Д., Юреня А.Ю., Наурзаков С.П., Гребенкин А.П., Панченко В.Я. Study of anisotropy of magnetic noise, generated by magnetic particles in geomagnetic field Journal of Magnetism and Magnetic Materials, том 475, страницы 620-626 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.jmmm.2018.12.011

3. Рыкунов С.Д., Рыкунова Е.Д., Бойко А.И., Устинин М.Н. Программный комплекс «ВиртЭл» для анализа данных магнитной энцефалографии методом виртуальных электродов Математическая биология и биоинформатика, Т. 14, № 1, С. 340–354 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.17537/2019.14.340

4. Рыкунов С.Д. Применение метода виртуальных электродов к анализу данных магнитной эцефалографии Международная конференция «Аналитические и численные методы решения задач гидродинамики, математической физики и биологии», посвященная 100-летию К. И. Бабенко (Пущино, 26–29 августа 2019г.). Тезисы докладов. М: ИПМ им. М.В.Келдыша РАН, сс. 128-130 (год публикации - 2019)

5. Рыкунов С.Д., Устинин М.Н., Бойко А.И. Evaluation of directions of the magnetic field sources by the method of functional tomography MMCP 2019. Book of Abstracts. EQUILIBRIA. Kosice. Slovakia, p.99 (год публикации - 2019)

6. Устинин М.Н. Реконструкция функциональной структуры человеческого тела по данным многоканальных измерений Международная конференция «Аналитические и численные методы решения задач гидродинамики, математической физики и биологии», посвященная 100-летию К. И. Бабенко (Пущино, 26–29 августа 2019г.). Тезисы докладов. М: ИПМ им. М.В.Келдыша РАН, сс. 156-159 (год публикации - 2019)

7. Устинин М.Н., Рыкунов С.Д., Бойко А.И. Оценка направлений движения магнитных наночастиц методом функциональной томографии Математические методы распознавания образов: Тезисы докладов 19-й Всероссийской конференции с международным участием, г. Москва 2019 г. М.: Российская академия наук, с. 317-318 (год публикации - 2019)


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
Метод функциональной томографии человеческого тела по данным многоканальных измерений получил дальнейшее развитие и воплощение в программных средствах. Выполнена интеграция и отладка программного комплекса, вычисляющего функциональные томограммы различных органов по данным многоканальных магнитных или электрических измерений. Наиболее трудоемкие программы и алгоритмы были оптимизированы по основным параметрам: найдены наилучшие частотное и пространственное разрешение. Программный комплекс предоставлен для широкого использования, его описание опубликовано в приложении к статье Llinás R.R., Ustinin M., Rykunov S., Walton K.D., Rabello G.M., Garcia J., Boyko A., and Sychev V. Noninvasive muscle activity imaging using magnetography. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2020. V. 117. No. 9. P. 4942-4947; https://doi.org/10.1073/pnas.1913135117. Наборы данных и тексты программ для расчета функциональной структуры различных частей человеческого тела доступны для свободного использования в репозитории Open Science Framework по адресу: https://osf.io/tyzdv/?view_only=0bdb0f9f9cfa4b9eb9c5ed50e6aece12. Доступны следующие наборы данных: – данные магнитной энцефалографии, объект – голова и шея человека; – данные магнитной кардиографии, объект – сердце человека; – данные магнитной миографии, объект – кисть руки, изометрическое расширение с ограничением; – данные магнитометрии спины (область крестца) у субъекта с сильной болью (ишиас). Также доступны алгоритмы и тексты программ на языке Octave. Были разработаны и апробированы следующие экспериментальные методики: 1. Методика для 275-канальных магнитоэнцефалографов типа VSM MedTech. Установлены в Нью-Йоркском университете (США), Монреальском Неврологическом институте Университета МакГилл и Университете Монреаля (Канада). Возможна реконструкция функциональной структуры следующих объектов: а) голова, мышцы шеи, носоглотка, глаза. б) мышцы кисти руки, предплечья, нога в согнутом состоянии, стопа; в) сердце; г) спина; д) другие части тела. 2. Методика для 36-канального диагностического комплекса серии «МАГ-СКАН-09». Установлен в Институте радиотехники и электроники им. В.А. Котельникова РАН (г. Москва). Возможна реконструкция функциональной структуры сердца. 3. Методика для 7-канального магнитометра производства ООО «НПО Криотон», установленного в НИЦ «Курчатовский Институт» (г. Москва). Возможна реконструкция функциональной структуры головы, сердца и мышц. 4. Методика для стандартного 19-канального электроэнцефалографа. Возможна реконструкция функциональной структуры головы. Полученные в этих экспериментах многоканальные временные ряды обрабатываются с помощью программного обеспечения, созданного в рамках данного проекта, и преобразуются в функциональную структуру изучаемого объекта – пространственное распределение элементарных электрических источников. Диагностика с помощью метода функциональной томографии основана на том, что каждому узлу расчетной сетки соответствует суммарная электрическая мощность всех источников, расположенных в этом узле. Визуальное обнаружение области с повышенной или пониженной мощностью может свидетельствовать о том или ином патологическом процессе. В отчетном году был опубликован результат магнитографического исследования субъекта с болью в спине, указывающий на принципиальную возможность локализации источников боли с помощью метода, развиваемого в проекте. Таким образом, методика диагностики патологий органов и тканей человеческого тела по функциональной томограмме включает в себя: - регистрацию магнитных или электрических полей, производимых исследуемым объектом; - построение функциональной томограммы; - обнаружение областей аномальной активности; - интерпретацию результатов путем сравнения с анатомическими данными. Создан и запущен в эксплуатацию вычислительный ресурс MathBody, предназначенный для обработки и анализа многоканальных экспериментальных данных методом функциональной томографии. https://www.mathbody.ru

 

Публикации

1. Линас Р.Р., Устинин М., Рыкунов С., Волтон К.Д., Рабелло Г.М., Гарсиа Д., Бойко А., Сычев В. Noninvasive muscle activity imaging using magnetography Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 117, no 9, pp. 4942-4947 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1073/pnas.1913135117

2. Рыкунов С.Д., Оплачко Е.С., Устинин М.Н. FTViewer Application for Analysis and Visualization of Functional Tomograms of Complex Systems Pattern Recognition and Image Analysis, - (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1134/S1054661820040227

3. Устинин М.Н., Рыкунов С.Д., Бойко А.И., Маслова О.А. Реконструкция функциональной структуры мозга человека по данным электроэнцефалографии Математическая биология и биоинформатика, Т. 15. № 1. С. 106–117 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.17537/2020.15.106

4. - Боль в мышцах визуализировали с помощью магнитометра. Дайджест новостей Российского научного фонда, Боль в мышцах визуализировали с помощью магнитометра. Дайджест новостей Российского научного фонда. #2|2020. Раздел «Открытия», С. 4-5. (год публикации - )

5. - Мозг в 3D: учёные разработали новый биомагнитный метод диагностики Russia Today, Скрынников А. Мозг в 3D: учёные разработали новый биомагнитный метод диагностики. Russia Today. 31 марта 2020. (год публикации - )

6. - Боль в мышцах визуализировали с помощью магнитометра. ТАСС Наука, Боль в мышцах визуализировали с помощью магнитометра. ТАСС Наука. 31 марта 2020. (год публикации - )

7. - Сканер-шлем помог создать 3D-модели мозга, сердца и мышц. Газета.ru, Сканер-шлем помог создать 3D-модели мозга, сердца и мышц. Газета.ru. 01.04.2020. (год публикации - )

8. - Математики визуализировали нервную и мышечную систему с помощью магнитного поля Indicator.ru, Математики визуализировали нервную и мышечную систему с помощью магнитного поля. Indicator.ru. 05 апреля 2020. (год публикации - )

9. - Российские и американские ученые создали новый биомагнитный метод диагностики ОТР. Общественное телевидение России., Анисимов С. Российские и американские ученые создали новый биомагнитный метод диагностики. ОТР. 31 марта 2020 (год публикации - )

10. - Разработан новый биомагнитный метод диагностики организма ВЗГЛЯД. Деловая газета., Зубарев Д. Разработан новый биомагнитный метод диагностики организма. ВЗГЛЯД. 31 марта 2020. (год публикации - )

11. - Ученые из России и США научились составлять 3D-карту электрической активности тела 360tv.ru, Ситникова О. Ученые из России и США научились составлять 3D-карту электрической активности тела. 360tv.ru. 31 марта 2020 (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
не указано