КАРТОЧКА ПРОЕКТА,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 19-14-00320

НазваниеСовременная система морских и пресноводных диатомовых водорослей (Achnanthales, Naviculales): синтез морфологических и молекулярных данных

РуководительКуликовский Максим Сергеевич, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регионФедеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева Российской академии наук, г Москва

Года выполнения при поддержке РНФ2019 - 2021

КонкурсКонкурс 2019 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-102 - Ботаника

Ключевые словаДиатомовые водоросли, система, морфология, филогения, молекулярно-генетический анализ, биотехнологии

Код ГРНТИ34.29.00


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Попытки создания системы диатомовых водорослей продолжались в течение длительного времени. С пионерными работами Bory (1828), многие авторы пытались суммировать данные для понимания близости отдельных таксонов, на основе изучения живых клеток диатомовых и их симметрии (Agardh 1831; Kützing 1833, 1844), морфологии хлоропластов (Pfitzer 1871, Bessey 1899; Mereschkowsky 1902). С использованием кремнеземного панциря, как уникальной структуры, присущей только диатомовым водорослям, его изучение в световом (Van Heurck 1896; Schütt 1896; Karsten 1928; Hustedt 1930), а также в сканирующем и трансмиссионном электронных микроскопах (Simonsen 1979; Semina & Beklemishev 1981; Round & Crawford 1984; Nikolaev 1988; Nikolaev & Harwood 2002) позволили создать ряд новых систем, наиболее разработанной и используемой из которых является система Round et al. (1990). Эта система была создана около тридцати лет назад, но с тех пор является единственно используемой. При этом все попытки создания систем диатомовых водорослей строились на основе личного понимания авторов об эволюции диатомовых без формального анализа признаков такими методами, как например, кладистический анализ или молекулярно-генетические методы. Молекулярно-генетический анализ филогении водорослей стал использоваться в конце 90-х годов прошлого столетия и принес много новых вопросов, часть из которых остаются нерешенными до сих пор. Созданная значительно раньше, чем началось использование молекулярно-генетических методов, система Round et al. (1990) не включает большое число вновь описанных родов. Это же можно сказать про систему, предложенную Cox (2015). Построенные за последнее время филогенетические деревья включают небольшое число таксонов (Sorhannus 1999; Medlin & Kaczmarska 2004; Sims et al. 2006; Ruck & Theriot 2011; Theriot et al. 2012, Nakov et al. 2018 и др.). Тем не менее, использование современных подходов позволило понять ряд эволюционных взаимоотношений среди диатомовых водорослей. Среди главных минусов построенных деревьев можно отметить, что большие группы родов отсутствуют в них до сих пор, неоднородно представлены морские и пресноводные таксоны; идут дебаты о способах построения деревьев и являются ли отдельные группы монофилитическими. Существуют также сомнения по отдельно взятым таксонам и достоверности их определения в GenBank (стоит признать, что ранее сделанные молекулярно-генетические работы не включали ведущих систематиков, а, следовательно, многие определения таксонов ошибочны). В рамках этого проекта мы предполагаем использовать и проанализировать морфологические особенности диатомовых водорослей для анализа значения отдельных признаков в эволюции диатомовых водорослей посредством использования молекулярно-генетических методов. Это позволит приблизиться к созданию естественной системы. Проект предполагает рассмотрение молекулярной филогении и морфологии двух крупных порядков диатомовых водорослей Achnanthales Silva 1962 и Naviculales Bessey 1907 sensu Round et al. 1990. Ранее представители этих порядков рассматривались как две независимые линии, когда Achnanthales включали моношовные водоросли, а Naviculales виды с щелевидным (навикулоидным) швом. В настоящее время показано, что моношовные диатомовые водоросли являются «производными» от двушовных, за счет редукции шва на ранних стадиях онтогенеза панциря. При этом моношовные диатомовые водоросли не являются монофилитической группой. На филогенетическом древе диатомовых моношовные водоросли располагаются в разных частях дерева (преимущественно среди Naviculales), показывая, что редукция шва шла независимо в разных эволюционных линиях диатомовых водорослей. Несмотря на понимание этих фундаментальных вещей, мы еще плохо представляем себе филогению моношовных и навикулоидных диатомовых водорослей, так как сильно ограничены в молекулярных данных для большого числа известных таксонов. Морские диатомовые изучены хуже, чем пресноводные. Практически отсутствуют данные по оценке морфологических признаков для систематики диатомовых водорослей с использованием молекулярно-генетических данных. Не разработана классификация порового аппарата у пеннатных диатомовых водорослей, тогда как именно поровый аппарат играл важную роль в эволюции диатомовых водорослей (Kulikovskiy et al. 2018). Проект является продолжением ранее проводимых нами работ, когда были получены широкомасштабные результаты и осознана необходимость синтеза морфологических и молекулярно-генетических данных в анализе филогении и эволюции диатомовых водорослей. Стала очевидной необходимость детального изучения порового аппарата пеннатных диатомовых водорослей, тогда как ранее классификация порового аппарата была разработана только для центрических диатомовых. Важным будет являться изучение гимена у навикулоидных диатомей, так как отсутствуют исчерпывающие данные по морфологии этого типа перфораций. Будет изучено филогенетическое положение большого числа родов, ранее относимых нами к группе таксонов с неясным положением (Куликовский и др. 2016). В работу будут включены обширные данные, которые были получены нами ранее и являются заделом для успешного выполнения проекта. Это роды, которые были описаны из Байкала без формального отнесения к известным семействам, коллекция культур диатомовых водорослей и банк ДНК, которые включают более 3000 штаммов из морских и пресных экосистем. Дополнительным подходом будет изучение состава жирных кислот в разных семействах диатомовых, как возможный (но еще слабо разработанный) метод разделения таксонов. Это будет представлять интерес для возможности практически использования полученных результатов в косметической промышленности, для создания биотоплива и т.п. Эти работы идут во всем мире и нами накоплен значительный задел и опыт работы. Главной задачей будет попытка построения естественной системы диатомовых водорослей, включение в систему новых родов водорослей, описание новых семейств, синтез морфологических и молекулярно-генетических данных. Переработанная система Round et al. с включением большого числа новых таксонов будет иметь основополагающее значение для проведения прикладных изысканий, экологических работ, понимания филогении группы, основой обучения студентов высших учебных заведениях, будет базисом для последующего изучения диатомовых водорослей.

Ожидаемые результаты
В процессе работы будут выявлены и описаны новые для науки таксоны на родовом и видовом уровнях. Будет изучена морфология отдельных видов и родов, по которым отсутствуют необходимые данные. Будут получены первые широкомасштабные данные по филогении диатомовых на основе изучения материала из большого числа водоемов разных природных зон. В итоге, это позволит предложить современную филогенетическую систему диатомовых водорослей (главным образом для Achnanthales, Naviculales в понимании Round et al. 1990), основанную на синтезе молекулярно-генетических и морфологических данных. Также будет проведён биохимический скрининг штаммов с целью установить особенности накопления жирных кислот в различных систематических группах диатомовых водорослей и поиска биохимических маркеров, пригодных для разделения таксонов различного ранга. Работы коллектива в изучении диатомовых водорослей из различных регионов выполняются на самом современном уровне с использованием для этого самого современного оборудования. Участие Фонда позволит поддерживать молодых исследователей и способствовать развитию альгологии в нашей стране. Работы группы публикуются в ведущих фикологических изданиях, было издано несколько капитальных трудов по флорам и систематике диатомовых водорослей из озера Байкал, Монголии, Беларуси в ведущих сериях Iconographia Diatomologica и Bibliotheca Diatomologica. Коллектив планирует продолжить широкомасштабные работы. В процессе работы новые виды и роды диатомовых водорослей будут описаны на основе морфологических и молекулярно-генетических методов. Это будет весомым вкладом в разработку систематики этой группы организмов. В процессе работы будет продолжено изучение флоры диатомовых водорослей из древних водоемов Азии, при этом количество озер значительно расширено нами в этом исследовании, за счет получения новых данных в последние годы. Работы в этом направлении являются необходимыми для разработки современной оценки качества воды, экологического мониторинга с разработкой современных методов, таких как штрих-кодирование (barcoding). Современное документирование находок с использованием световых и электронных микроскопов дает возможность проведения точной идентификации организмов, выявления новых видов, обоснованное сравнение флор и выявление экологических преференций организмов. Важным для России является разработка современных методов оценки качества поверхностных вод, использование водорослей в биомониторинге. Проблема загрязнения поверхностных вод – одна из важнейших для обеспечения безопасности и здоровья населения. При использовании воды для различных целей встаёт вопрос о разработке критериев её качества. Помимо оценки пригодности воды для тех или иных целей, в настоящее время очень важным моментом для сохранения естественной природной среды и прогноза изменений является мониторинг качества воды в реках, озёрах и водохранилищах. Биологические показатели качества воды занимают центральное место в системе мониторинга. Для оценки качества воды необходимы простые, но в то же время информативные критерии, унифицированные для использования в различных странах. В настоящее время в европейских странах действует Директива Евросоюза по стандартам качества воды (The European Union Water Framework Directive), согласно которой для оценки качества воды рекомендованы и широко применяются диатомовые индексы. Перспективным и активно разрабатываемым методом для экспресс-анализа видового состава следует считать метод штрих-кодирования, основанный на идентификации видов по коротким характерным последовательностям нуклеотидов. Созданный нами банк ДНК является базой для современных экологических изысканий и использования этих данных в будущем. Важным представляется поддержка Фонда для проведения дальнейших работ по выделению водорослей в культуру и выделение геномной ДНК. Эти работы имеют важное фундаментальное значение, так как это база для изучения филогении организмов, особенностей эволюции отдельных признаков. Результаты фундаментальных исследований являются основой для использования водорослей в прикладных разработках. Интерес и перспективность изучения диатомовых водорослей только возрастает в научных центрах мира, что связано с возможностью широкого практического использования этой группы организмов в медицине, создании биотоплива и кормовой базы водных животных, криминалистике, нанотехнологиях, современных методов оценки качества поверхностных вод (включая анализ «цветения» водоемов и наличия опасных для человека токсинов). Отдельные исследовательские группы в Европе и Америке работают над созданием и использованием биоматериалов, как например хитин, выделяемый некоторыми диатомовыми водорослями. Применение водорослей многообразно, хорошим примером является использование диатомовых в криминалистике для выяснения как мест происшествий, так и способов возникновения несчастных случаев. Ведутся работы по созданию биотоплива и, в целом, выращиванию водорослей в промышленных целях, как основы использования ценных веществ в аквакультуре и фармацевтике. Важный тренд в западных странах связан с проблемой создания биотоплива. Несмотря на отсутствие экономического эффекта в настоящее время эти работы продолжаются. Уже сейчас очевидно, что для разработки этой проблемы необходимы исследования по обоснованности использования того или иного вида в определенных условиях. Именно поэтому в США уделяется огромное внимание биологическим основам выявления подходящих видов и особенностей их культивирования. Созданная нами коллекция культур водорослей, включающая сотни штаммов, является базой для такого типа изысканий в России. Важным является то, что эти исследования задействуют комплексный подход, включая изучение филогении отдельных групп и их способность продуцировать необходимые соединения. В ходе фундаментальных и прикладных исследований за последние десятилетия было выяснено, что многие виды водорослей способны синтезировать и накапливать в коммерчески значимых количествах широкий спектр уникальных биологически активных веществ, обладающих выраженным положительным действием на организм человека и животных (Larsen et al. 2011 и др.). Была показана высокая пластичность метаболизма водорослей в зависимости от условий окружающей среды, что позволяет разрабатывать технологии, обеспечивающие максимальный выход нужного компонента (Khozin-Goldberg et al. 2011 и др.). В качестве веществ, продуцируемых водорослями, в последнее время основное внимание сосредоточено на омега-3-полиненасыщенных жирных кислотах, каротиноидах, фикобилипротеинах, антибиотиках, цитостатиках (Mimouni et al. 2012 и др.). Также водоросли рассматриваются в качестве корма или добавок к корму для выращивания видов в аквакультуре, животноводстве и птицеводстве. Также продукты на основе водорослей находят применение в сельском хозяйстве (стимуляторы роста, удобрения, фунгициды, гербициды, инсектициды), идут поиски путей выращивания и переработки водорослей как источника энергии (с получением метана, биодизеля, этанола, водорода). В мире всё возрастает интенсивность исследований данной группы организмов, в частности, поиск потенциальных объектов промышленного выращивания и анализ их химического состава, исследование особенностей роста и метаболизма для разработки технологии культивирования и работы по внедрению продуктов на основе водорослей в производство. В многочисленных экспериментах показана эффективность применения водорослей в качестве корма или добавки к кормам на различных стадиях роста беспозвоночных и рыб. Это определяет большую востребованность продуктов на основе водорослей на рынке. Всё большее число крупных концернов обращает внимание на использование водорослей в качестве сырья для получения биологически активных соединений, используемых как действующее вещество в лекарствах или как пищевые добавки для человека или животных. К настоящему времени уже существует ряд специализированных компаний-производителей продуктов из водорослей (Aquanos Energy Ltd, AlgaFuel, Algaetech Group of Companies, Green Sea Bio System, AlgoSource Technologies и др.). Однако круг используемых штаммов водорослей всё ещё довольно узок. Новые ценные штаммы и разработка методов их культивирования будут востребованы на рынке. Поэтому мы планируем также изучать особенности поведения отдельных таксонов диатомовых водорослей в культуре, выявлять наиболее перспективные таксоны «неприхотливые» для длительного культивирования, и провести наращивание биомассы для проведения скрининга веществ в культурах, которые могут быть интересны для биотехнологических целей. Характер кормовой базы в аквакультуре и животноводстве оказывает решающее влияние на обмен веществ в организме, рост и развитие, накопление массы и продуктивность животных. Так, обильное и полноценное кормление рыбы, особенно в молодом возрасте, способствует увеличению массы, более быстрому достижению половой зрелости, отчетливому проявлению признаков экстерьера (Дмитрович 2017). Перспективность использования водорослей как источника липидов для питания животных во многом определяется их высокой производительностью и широкой экологической устойчивостью (Sheehan et al. 1998; Chisti 2007; Bona et al. 2014; Fields et al. 2014). Диатомовые водоросли могут служить промышленным источником липидов в связи с их хорошим ростом в условиях культуры, а также высокопродуктивному накоплению триглицеридов при дефиците питательных элементов (Chen 2012; Hildebrand et al. 2012; Scholz, Liebezeit 2013; Guo et al. 2017). Среди диатомовых водорослей к лидерам по накоплению липидов можно отнести Cyclotella cryptica (до 41,57% в сухом весе), Hantzschia DI-160 (до 66%), Navicula acceptata (42,7 %), Navicula saprophila (44%) (Fields, Kociolek 2015). Сбалансированный рацион для рыб и ракообразных должен содержать значительное количество ненасыщенных жиров, которые усваиваются на 90-95%. Наиболее ценной группой в этом семействе жирных кислот являются омега-3-полиненасыщенные жирные кислоты (ω3-PUFA), среди которых эйкозапентаеновая (EPA, C20:5 ω3) и докозагексаеновая (DHA, C22:6 ω3) кислоты являются жизненно важными. Обильно накапливающие ω3-PUFA водоросли встречаются среди разных таксономических групп. Среди диатомовых водорослей наибольшее количество EPA было обнаружено у представителей разных семейств: Cymbella cistuliformis CP2c (до 8,75 мг/г EPA), Navicula sp. (13 мг/г), Cymbella sp. (27 мг/г), Phaeodactylum tricornutum (28,4 мг/г), Nitzschia rustulum (32 мг/г) и др.; DHA была обильна у Nitzschia sp. (до 0,6 мг/г), Cymbella cistula (7,47 мг/г) и др. (Renaud et al., 1994; Patil et al., 2006; Jagannathan et al. 2010; Duong et al., 2015). В целом показано, что представители диатомовых водорослей способны накапливать до 46,8-49,4% полиненасыщенных жирных кислот от общего количества жирных кислот, что подтверждает возможность их эффективного использования как в аквакультуре и животноводстве, так и в биотехнологии в целом.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
В текущем году были получены результаты, с использованием молекулярно-генетических и морфологических подходов, которые позволили пролить свет на филогению и морфологию ряда сложных групп диатомовых водорослей. Была изучена филогения двух спорных таксонов Navicula flabellata и Naviculadicta amphiboliformis. Было установлено их филогенетическое положение с отнесением к семейству Cymbellaceae Greville sensu Kulikovskiy et al. 2016. Нашими исследованиями показано, что несмотря на навикулоидную симметрию и помещением прежде к навикулоидным диатомовым водорослям, эти виды принадлежат к цимбеллоидным диатомовым. Был изучен поровый аппарат этих водорослей и показано его положение в классификации порового аппарата, установлено, что он не принадлежит велуму, а представлен тектулюмом в широком смысле. Тектулюм в понимании Cox не является однотипной структурой в пределах группы таксонов, куда относятся роды Placoneis, Paraplaconeis, Ochigma. Это же можно отнести к группе видов вокруг Navicula flabellata, где тектулюм представлен двумя или максимум четырьмя кремнеземными выростами параллельно плоскости створки внутри продолговатой ареолы, а не шестью бочонковидными выростами, которые перпендикулярны плоскости створки, как в роде Placoneis. Виды вокруг таксона Naviculadicta amphiboliformis характеризуются большим количеством более удлиненных и часто слегка изогнутых выростов, параллельных плоскости створки, внутри практически прямоугольных ареол. Эти выросты довольно длинные и часто сильно закрывают ареолу с внутренней стороны, на них лежит кремнеземный слой. Дополнительным признаком для понимания филогенетического положения стал анализ морфологии хлоропластов. Нами был показан типичный седловидный хлоропласт, который у двух обсуждаемых родов является очень крупным и массивным. Виды Navicula характеризуются двумя пристенными хлоропластами. Проведена широкомасштабная ревизия рода Platessa (Kulikovskiy et al. 2020). Новый род одношовных диатомовых водорослей, Platebaicalia gen. nov., был описан, основываясь на детальном изучении морфологии, используя световую и сканирующую микроскопию. Ранее Platessa elegans Kulikovskiy & Lange-Bertalot был описан из древнего озера Байкал, этот вид является типовым для вновь описанного рода. Platebaicalia elegans является редким таксоном, встречающимся в глубинных частях озера Байкал. Platebaicalia elegans отличается многорядными штрихами на шовной створке, и двурядными штрихами на бесшовной створке, хотя у некоторых представителей появляется короткий третий ряд ареол на некоторых штрихах. Морфология штрихов помогает отделить род Platebaicalia от Platessa и других моношовных родов. Мы рассмотрели морфологические признаки видов рода Platessa, и основываясь на этих данных было выделено восемь таксономических групп внутри данного рода. Проведенный анализ показал, что Platessa в обозначенных рамках может содержать в себе группы видов, которые значительно отличаются между собой по морфологическим признакам. Предлагаются несколько новых комбинаций, когда таксоны из рода Platessa были переведены в Psammothidium и Planothidium. Был подготовлен первый драфт молекулярно-генетического дерева, в который включено более 100 новых штаммов моношовных диатомовых водорослей. Были получены новые данные по филогенетическому положению моношовных диатомовых водорослей из морских и пресноводных родов, в том числе, которые ранее не изучались в мире. Было показано положение новых штаммов солоноватоводных ахнантесов, которые обладают крибрумом в поровом аппарате. Рассмотрен вопрос о связи рода Achnnathes sensu lato с каналошовными диатомовыми водорослями. Был проведен анализ видов из комплекса Achnanthes exigua и показано, что этот вид не принадлежит роду Achnanthidium или роду Lemnicola. Установлено, что это должен быть новый род, который наиболее близок, на основе молекулярно-генетического анализа, роду Lemnicola, а не Achnanthidium. В молекулярном древе этот род включается в большую ветвь с родами Achnanthidium, Pauliella, Psammothidium, Platessa, Planothidium и пресноводные Cocconeis и Rhoicosphenia. Дополнительно изучена морфология и обсуждено значение ставроса в систематике моношовных, и в особенности, рода Achnnathidium. В этом роде ставрос является факультативным, тогда как в группе видов Achnanthes exigua ставрос является обязательным морфологическим признаком и сильно развитым с внутренней стороны. При этом ставрос может пропадать у разных представителей одного рода, как, например, в роде Stauroneis. Интересным результатом нашей работы было установление, что недавно описанный вид Lemnicola uniseriata Y. Shi & B.-H. Kim 2018 на самом деле не принадлежит роду Lemnicola, а принадлежит группе Achnanthes exigua. Был изучен поровый аппарат у представителей из родов Gliwiczia, Platessa, Skabitshewskia. Так при описании рода Gliwiczia не был выявлен тип порового аппарата и этот вопрос требует своего решения. Первый род характеризуется очень толстой кремнеземной перегородкой, что не позволяет отнести ее к гимену. При этом тип перфораций у двух других родов можно отнести к гимену. В статье Kulikovskiy et al. 2020 подробно рассмотрен вопрос порового аппарата среди всех представителей пресноводных моношовных диатомовых водорослей. Был проведен детальный морфологический анализ рода Aneumastus. Этот род довольно хорошо изучен и был обсужден нами и ранее, но впервые нами показана сложная структура порового аппарата. Изучен поровой аппарат в сканирующем и трансмиссионном электронных микроскопах. Ареолы сложные и двухслойные в разрезе, при этом ареолы закрыты кремнеземным слоем без мелких перфораций, характерных для гимена. Вместо этого по двум сторонам от центра имеются два ряда отверстий, которые закрыты более тонким слоем кремнезема. В середине ареолы разделены более толстым кремнеземным слоем, представляющим на трансмиссионных изображениях вид пояса. Отнесение порового аппарата к крибруму или роте не оправдано, и нами показано, что это новый тип порового аппарата, который описывается нами. Дан совместный анализ родов Aneumastus и Mastogloia и показано филогенетическое положение представителей семейства Mastogloiales. Aneumastus и Mastogloia два наиболее близких рода, на основе молекулярных данных, тогда как Achnanthes sensu stricto должен быть помещен в отдельное семейство, по-видимому монотипное, на данный момент. Рассмотрена филогения представителей семейства Stauroneidaceae. По нашему мнению, два основных рода в этом семействе Craticula и Stauroneis не являются монофелитичными. При этом основополагающими признаками для разделения этих родов являются наличие кратикулы в роде Craticula и наличие псевдосепты в роде Stauroneis. Изучался гимен у вышеназванных водорослей и ряде других представителей Naviculales (Sellaphora, Eolimna, Cavicula и др.). Было показано, что среди разных родов гимен не однороден и отличается структурой микроотверстий, их расположением и количеством. Обсуждено филогенетическое положение для ряда родов, которые ранее нами относились к родам с неясным таксономическим положением – Krsticiella и Chamaepinnularia. Эти роды относились к навикулоидным, но без формального отнесения к семействам. Первый род характеризуется ареолами, которые закрыты с внутренней стороны слегка выпуклым гименом. Наличие шва с тупо закругленными дистальными концами, а также слегка удлиненные ареолы, свидетельствуют о возможности отнесения этого рода к семейству Stauroneidaceae. Род Chamaepinnularia характеризуется наличием альвеол, которые закрыты с наружной стороны довольно толстым кремнеземным слоем, что является необычной морфологической особенностью и позволяет говорить о необходимости описания нового семейства. Изучена морфология тропических видов родов Adlafia и Kobayasiella, что позволило вскрыть их высокое видовое разнообразие. Подготовлены описания четырех новых видов из рода Adlafia и шесть новых видов из рода Kobayasiella. Нами показано, что разнообразие этих родов в водоемах Юго-Восточной Азии было значительно недооценено. При этом морфологические особенности новых видов соответствуют другим представителям рода, что особенно важно для рода Adlafia в рамках дискуссии о целесообразности выделения этого таксона. Было опубликовано две работы, в которых мы описали два новых для науки вида из родов Neidiomorpha и Prestauroneis. Это Neidiomorpha gusevii Glushchenko, Kulikovskiy & Kociolek sp. nov., который был обнаружен в озере Ba Bể, в одном из немногих естественных озёр во Вьетнаме. Второй вид – это Prestauroneis genkalii Clushchenko, Kulikovskiy & Kociolek sp. nov. Новый вид описан на основе формы створки, формы концов, количества штрихов и ареол в 10 микронах. P. genklaii sp. nov. имеет все характерные морфологические признаки рода, то есть однорядные штрихи, изнутри покрытые гименом, а также наличие псевдосепт на каждом конце створки, и дистальных концов шва, уходящих на загиб створки. P. genkalii sp. nov. это первый представитель рода Prestauroneis для Юго-Восточной Азии. Описана библиотека с открытом доступом Diat.barcode, которая функционирует с 2012 г. и посвящена диатомовым водорослям. Diat.barcode – это справочная библиотека, посвященная диатомовым водорослям с возможностью работы на уровне рода и вида (https://www6.inra.fr/carrtel-collection_eng/Barcoding-database). Diat.barcode оперирует, в первую очередь, нуклеотидными последовательностями хлоропластного гена rbcL, а также, в меньшей степени, ядерными генами 18S рДНК, 28S рДНК и внутренним транскрибируемым спейсером ITS, митохондриальным геном cox1.

 

Публикации

1. - Описана библиотека ДНК-штрихкодов диатомовых водорослей РНФ, - (год публикации - ).

2. - Описана библиотека ДНК-штрихкодов диатомовых водорослей Газета.ru, - (год публикации - ).

3. - Описана библиотека ДНК-штрихкодов диатомовых водорослей Indicator, - (год публикации - ).

4. - Микроводоросли: интервью с биологом Максимом Куликовским // Live ПостНаука, - (год публикации - ).

5. - Применение микроводорослей в медицине ПостНаука, - (год публикации - ).

6. Глущенко А.М., Коциолек Дж. П., Кузнецова И.В., Кезля Е.М., Куликовский М.С. Neidiomorpha gusevii – a new diatom species (Bacillariophyceae: Neidiaceae) from Southeast Asia Phytotaxa, V. 415 (5). P. 279–285 (год публикации - 2019).

7. Глущенко А.М., Коциолек Дж.П., Кузнецова И.В., Кезля Е.М., Куликовский М.С. Prestauroneis genkalii - a new diatom species (Bacillariophyceae: Stauroneidaceae) from Southeast Asia Phytotaxa, V. 414. № 4. P. 156–164 (год публикации - 2019).

8. Куликовский М.С., Глущенко А.М., Генкал С.И., Кузнецова И.В., Коциолек Дж.П. Platebaikalia – a new monoraphid diatom genus from ancient Lake Baikal with comments on the genus Platessa Fottea, - (год публикации - 2020).

9. Риме Ф., Гусев Е., Кахлерт М., Келли М., Мальцев Е., Манн Д, Пфаннкучен М., Тробахо Р., Васселон В., Циммерманн Й., Буше А. Diat.barcode, an open-access curated barcode library for diatoms Scientific Reports, V. 9. P. 15116 (год публикации - 2019).