КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 17-15-01175

НазваниеИсследование ключевых параметров клеток мозга на ранних стадиях развития ишемического инсульта.

РуководительБилан Дмитрий Сергеевич, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук, г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2020 г. - 2021 г. 

Конкурс Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами» (18).

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-101 - Экспериментальная медицина

Ключевые словаинсульт головного мозга, ишемия-реперфузия, нейроны, астроциты, генетически кодируемые флуоресцентные индикаторы, флуоресцентная микроскопия

Код ГРНТИ34.15.43


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Проект посвящен исследованию биологических процессов в клетках мозга при развитии ишемического инсульта в модели окклюзии средней мозговой артерии лабораторных крыс. Подход основан на применении популярных в современных медико-биологических исследованиях генетически кодируемых биосенсоров на основе флуоресцентных белков. Их принцип работы основан на изменении спектральных характеристик при изменении исследуемого параметра клетки или концентрации соединения. Используя такие инструменты, мы разработали принципиально новый подход изучения патогенеза инсульта, который позволяет регистрировать динамику исследуемого процесса in vivo одновременно в разных точках мозга в режиме реального времени с первых секунд развития заболевания. Для этого животным в область мозга с экспрессией гена биосенсора, доставленного в клетки с помощью заражения вирусом, имплантируют короткие оптические волокна, через которые в дальнейшем осуществляют регистрацию флуоресцентного сигнала при развитии ишемического инсульта. Поскольку биосенсор представляет собой белковую молекулу, используя специфичные промоторы и сигнальные последовательности, инструмент легко можно локализовать в разных типах клеток тканей мозга, а также в их отдельных компартментах. Используя такой подход, мы исследовали изменение величины рН в разных клетках тканей мозга при ишемии и реперфузии, показав, что динамика изменений рН в разных структурах мозга при инсульте может существенно отличаться. В 2019 году произошел революционный прорыв в области разработок генетически кодируемых биосенсоров. В коллекции инструментария редокс-биологии появились сверхбыстрые и сверхчувствительные биосенсоры, флуоресцентный сигнал которых стабилен в клетках даже в условиях сильный изменений рН. Таким образом, совокупность имеющихся на данный момент технических и методологических подходов позволяет, наконец, вывести исследования патологических процессов мозга на совершенно новый уровень. Впервые в реальном времени нами будет показана динамика окислительного стресса при ишемии тканей мозга и последующей реперфузии не только в разных клетках и их компратментах, но и в разных зонах повреждения: ядерной зоне инсульта и зоне ишемической полутени (пенумбре). Одновременно с in vivo исследованиями в рамках Проекта мы будем изучать динамику окислительного стресса и ацидоза в нейронах и астроцитах первичной гиппокампальной культуры клеток в условиях гипоксии-реоксигенации. Данная модель позволит нам исследовать зависимость динамики этих процессов от концентрации биохимических субстратов в среде, а также выявить возможные эффекты влияния ингибирования клеточных систем транспорта лактата и потенциальных источников активных форм кислорода после реоксигенации. Подход in vivo исследования биологических процессов с помощью оптического волокна не позволяет визуализировать отдельные клетки и внутриклеточные структуры. Однако для некоторых задач, например, при исследовании взаимодействий разных типов клеток, необходим другой метод регистрации сигнала. Теоретически для решения подобных задач можно использовать флуоресцентную микроскопию тканей мозга in vivo через краниальное окно. Однако возможности этого метода сильно ограничены крайне низкой прозрачностью мозговой ткани в видимой части спектра. Решить эту задачу позволяет использование технологии многофотонной микроскопии. Переход в дальне-красную и ближнюю инфракрасную области спектра существенно увеличивает глубину, на которой возможно производить наблюдение в тканях, сохраняя при этом высокое пространственное разрешение. Принцип основан на том, что используемый в модели хромофор одновременно поглощает два или три инфракрасных фотона, после чего эмиссия наблюдается в видимом диапазоне спектра. В рамках Проекта с использованием подхода мультифотонной микроскопии мы впервые проведем in vivo визуализацию клеток коры головного мозга крыс через краниальное окно при развитии ишемического инсульта. Мы также сосредоточимся на исследовании в клетках ацидоза и окислительного стресса при инсульте.

Ожидаемые результаты
С появлением недавно разработанных технологий в рамках Проекта 2020 нами будет впервые исследована динамика окислительного стресса в разных типах клеток и их компартментах в тканях мозга модельного объекта крысе при развитии ишемического инсульта в режиме реального времени. Созданный подход позволяет регистрировать динамику сигнала используемого биосенсора в любых координатах мозга, таким образом, динамика окислительного стресса будет исследована в ядерной зоне инсульта, а также в тканях на периферии в зоне ишемической полутени. Несмотря на актуальность данной темы и многочисленные попытки создать терапию лечения на основе подавления в клетках окислительного стресса, из-за отсутствия подходящих методов исследования in vivo динамика активных форм кислорода при инсульте головного мозга до сих пор не была показана прямым способом. Подобные сведения представляют огромную ценность для медицины, и только сейчас полученный инструментарий позволяет провести исследования на таком уровне. Мы также продолжим исследования динамики ацидоза тканей мозга при ишемии-реперфузии и получим больших данных о динамике значения рН в ядерной зоне инсульта, пенумбре и в здоровых тканях, клетки которых в некоторых структурах мозга также демонстрируют закисление. Мы исследуем динамику окислительного стресса и ацидоза с помощью биосенсоров в разных компартментах нейронов и астроцитов первичной гиппокампальной культуры клеток в условиях гипоксии-реоксигенации. Это позволит сравнить особенности изучаемых процессов на выделенных клетках и в составе тканей целого организма. Данные результаты имеют фундаментальное значение, поскольку внесут вклад в общее понимание целесообразности применения клеточных моделей в изучении сложных заболеваний, как, например, в нашем исследовании патогенеза инсульта головного мозга. В случае обнаружения общих закономерностей внутриклеточных патологических процессов in vivo при инсульте и в культуре клеток при гипоксии-реоксигенации, на клеточной модели мы получим сведения о том, как динамика ацидоза и окислительного стресса зависят от концентрации в среде энергетических субстратов, например, глюкозы. Используя ингибиторы клеточных систем транспорта лактата и потенциальных источников активных форм кислорода, мы выявим по изменению динамики рН и концентрации пероксида водорода, какие из клеточных систем вносят больший вклад в развитие патологического состояния клеток при гипоксии-реоксигенации. Исследования будем проводить на смешанной культуре нейронов и клеток глии, а также на изолированных нейронах. Это позволит установить, зависит ли от клеточного окружения нейронов динамика развития ацидоза и окислительного стресса в исследуемой модели. Разработанный нами подход может оказаться полезным для последующих исследований. В частности, полученная модель микроскопии клеток в условиях гипоксии-реоксигенации в дальнейшем может быть использована для скрининга соединений, воздействующих на биохимические внутриклеточные события клеток, динамика которых визуализируется с помощью генетически кодируемых биосенсоров. Подходы, влияющие на патологические состояния клеток, которые могут быть найдены с помощью такого способа, в дальнейшем могут быть протестированы на модели визуализации патологических процессов in vivo. С помощью подхода мультифотонной микроскопии мы впервые проведем in vivo микроскопию нейронов и астроцитов, экспрессирующих флуоресцентные биосенсоры, в коре головного мозга крыс при развитии ишемического инсульта. Это позволит регистрировать события одновременно в разных типах клеток, а также исследовать их взаимодействия при развитии патологических состояний.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
Мы разработали экспериментальную установку для моделирования гипоксии/реоксигенации клеток первичной гиппокампальной культуры, полученной из гиппокампов эмбрионов мышей. Созданная установка позволяет помещать клетки в условия аноксии (концентрация кислорода <0,05 мг/л) менее чем за 1 – 2 минуты, а также проводить моментальную реоксигенацию среды. Используя генетически кодируемые флуоресцентные биосенсоры нового поколения HyPer7 и SypHer3s, мы исследовали динамику концентрации пероксида водорода и рН в клетках в условиях гипоксии и последующей реоксигенации. Принято считать, что митохондрии вносят основной вклад в генерацию в клетках активных форм кислорода при ишемии/реперфузии. Однако в экспериментах на культуре нейронов мы не обнаружили образования пероксида водорода в матриксе митохондрий ни в условиях гипоксии, ни в условиях последующей реоксигенации. При этом в нейронах происходит сильное изменение рН. С первых секунд наступления гипоксии рН в цитоплазме клеток резко снижается и остается пониженным на протяжении всей гипоксии. Реоксигенации вызывает защелачивание, возвращая рН приблизительно к исходным значениям. Ранее мы показали in vivo схожую динамику изменения рН повсеместно в различных типах клеток тканей мозга крыс в зоне формирования ишемического инсульта. Мы протестировали рН-биосенсор SypHer3s в режиме двухфотонной микроскопии в различных типах клеток, а также в свежеполученных срезах головного мозга крысы. Мы протестировали в нейронах мыши новый биосенсор Hypocrates для регистрации хлорноватистой кислоты и ее производных. Новый инструмент может оказаться чрезвычайно полезным для исследования механизмов патогенеза ишемического инсульта. Например, ряд исследований показали быструю инфильтрацию нейтрофилов в область ишемического поражения. Кроме того, клетки микроглии также содержат фермент миелопероксидазу, который катализирует реакцию образования хлорноватистой кислоты.

 

Публикации

1. Ланин А.А., Чеботарев А.С., Почечуев М.С., Кельмансон И.В., Котова Д.А., Билан Д.С., Иванов А.А., Панова А.С., Тарабыкин В.С., Федотов А.В.,Белоусов В.В., Желтиков А.М. Single-beam optogenetic multimodal χ(3)/χ(5) nonlinear microscopy and brain imaging Journal of Raman Spectroscopy, 51, 10, 1942-1950 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1002/jrs.5933

2. Чеботарев А.С., Почечуев М.С., Ланин А.А., Кельмансон И.В., Котова Д.А., Фетисова Е.С., Панова А.С., Билан Д.С., Федотов А.В., Белоусов В.В., Желтиков А.М. Enhanced‐contrast two‐photon optogenetic pH sensing and pH‐resolved brain imaging Journal of Biophotonics, e202000301 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1002/jbio.202000301

3. Костюк А.И., Кокова А.Д., Подгорный О.В., Кельмансон И.В., Фетисова Е.С., Белоусов В.В., Билан Д.С. Genetically Encoded Tools for Research of Cell Signaling and Metabolism under Brain Hypoxia Antioxidants, 9(6), 516 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.3390/antiox9060516

4. Костюк А.И., Панова A.C., Кокова А.Д., Котова Д.А., Мальцев Д.И., Подгорный О.В., Белоусов В.В., Билан Д.С. In Vivo Imaging with Genetically Encoded Redox Biosensors International Journal of Molecular Sciences, 21(21), 8164 (год публикации - 2020) https://doi.org/https://www.mdpi.com/1422-0067/21/21/8164/htm


Аннотация результатов, полученных в 2021 году
Ишемический инсульт является одной из главных причин смертности и инвалидизации населения в мире. Патофизиология инсульта активно исследуется на самых разных уровнях и моделях, однако до сих пор существуют серьезные пробелы в понимании метаболических изменений, сопровождающих данное заболевание. Особенно плохо изучены процессы, которые происходят в ткани мозга на самых ранних стадиях ишемии и реперфузии. Используя генетически кодируемые флуоресцентные биосенсоры и подход двухканальной фотометрии через оптические волокна, имплантированные в мозг крыс линии SHR, мы исследовали динамику некоторых биохимических параметров при развитии ишемического инсульта, вызванного окклюзией средней мозговой артерии. Мы показали, что в ишемизированной ткани мозга с первых секунд начинается развитие выраженного ацидоза, значение рН 7,25 ± 0,08 резко снижается до 6,7 ± 0,15. После восстановления кровотока значение рН с гораздо меньшей динамикой вновь увеличивается, однако у большинства животных рН в тканях остается пониженным вплоть до следующих суток. Несмотря на общепринятую концепцию о том, что окислительный стресс является основным повреждающим фактором в острой фазе ишемического инсульта, напрямую динамика активных форм кислорода никогда не была показана в тканях in vivo. Мы впервые показали динамику Н2О2 в нейронах тканей мозга, расположенных в центральной области ишемического инсульта. Вопреки общепринятой теории развития мощной продукции активных форм кислорода при данном патогенезе, мы обнаружили лишь незначительное увеличение Н2О2 в тканях, причем как на стадии ишемии, так и при реперфузии. Выраженный окислительный стресс был обнаружен лишь на следующие сутки, что, вероятно, является следствием воспалительного ответа. В рамках Проекта был протестирован новый биосенсор Hypocrates для регистрации гипогалогенного стресса, в дальнейшем с помощью данного инструмента может быть исследована динамика продуктов миелопероксидазной реакции клеток, участвующих в воспалительных реакциях в поврежденной ткани. Кроме исследований in vivo мы также проводили эксперименты на первичной гиппокампальной культуре клеток мыши, клетки заражали вирусными частицами с генами биосенсоров и подвергали их условиям гипоксии и последующей реоксигенации. Сравнение результатов экспериментов in vivo с исследованиями на культивируемых нейронах в условиях гипоксии/реоксигенации продемонстрировало, что динамика окислительно-восстановительных процессов в этих моделях значительно различается. Это в очередной раз подтверждает, что культура клеток является плохой прогностической моделью метаболических событий, происходящих внутри организма. Однако клеточные модели удобны для поиска факторов, влияющих на динамику наблюдаемых процессов. Например, мы показали, что состояние гипергликемии существенно влияет на динамику ацидоза и концентрации Н2О2 в культивируемых нейронах при гипоксии/реоксигенации. Ингибирование монокарбоксилатных транспортеров, работающих в симпорте с Н+, предотвращает снижение рН в нейронах при гипоксии. Подобные эксперименты по поиску факторов, влияющих на динамику патологических процессов, могут проводиться на этапе подготовки к исследованиям in vivo. Таким образом, мы полностью выполнили все поставленные задачи в рамках настоящего Проекта. Нами разработаны новые методики и технологии, некоторые из которых на сегодняшний день не имеют аналогов. С помощью данных подходов мы получили новые сведения о динамике процессов в клетках тканей мозга, подвергнутых ишемическому повреждению. Результаты наших исследований опубликованы в высокорейтинговых журналах, а также освещены в СМИ. Методологическая платформа, которую мы создали, может быть использована для исследования любых других физиологических и патологических процессов в мозге. Мы продолжим данные исследования с применением новых моделей и новых генетических инструментов.

 

Публикации

1. Кельмансон И.В., Шохина А.Г., Котова Д.А., Почечуев М.С., Иванова А.Д., Костюк А.И., Панова А.С., Бородинова А.А., Солотенков М.А., Степанов Е.А., Раевский Р.И., ... , Желтиков А.М., Белоусов В.В., Билан Д.С. In vivo dynamics of acidosis and oxidative stress in the acute phase of an ischemic stroke in a rodent model Redox Biology, Redox biology, vol. 48 102178. (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.redox.2021.102178

2. Костюк А.И., Тосунян М.А., Панова А.С., Таувин М., Раевский Р.И., Эзериня Д., Ван Моль К.В.И., Сергеева А.Д., Вертоммен Д., Гороховатский А.Ю., Баранов М.С., Вриз С., Мессенс Й., Билан Д.С., Белоусов В.В. Hypocrates is a genetically encoded fluorescent biosensor for (pseudo)hypohalous acids and their derivatives Nature Communications, - (год публикации - 2022)

3. Почечуев М.С., Ланин А.А., Кельмансон И.В., Чеботарев А.С., Фетисова Е.С., Билан Д.С., Шевченко Е.К., Иванов А.А., Федотов А.Б., Белоусов В.В., Желтиков А.М. Multimodal nonlinear-optical imaging of nucleoli. Optics letters, Opt. Lett. 46, 3608-3611. (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1364/OL.416300

4. Чеботарев А.С., Ланин А.А., Раевский Р.И., Костюк А.И., Смолярова Д.Д., Билан Д.С., Савитский И.В., Федотов А.Б., Белоусов В.В., Желтиков А.М. Single-beam dual-color alternate-pathway two-photon spectroscopy: Toward an optical toolbox for redox biology Journal of Raman Spectroscopy, J Raman Spectrosc 2021, 1. (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1002/jrs.6183

5. - Созданы биосенсоры для изучения процессов в нервных клетках во время инсульта ТАСС НАУКА, - (год публикации - )

6. - Ученые придумали, как наблюдать за метаболизмом клеток мозга при инсульте газета.ru, - (год публикации - )

7. - Флуоресцентные биосенсоры позволили исследовать процессы, происходящие в нервных клетках во время инсульта Naked Science, - (год публикации - )

8. - Флуоресцентные биосенсоры позволили исследовать процессы, происходящие в нервных клетках во время инсульта Нейроновости, - (год публикации - )

9. - Флуоресцентные биосенсоры позволили исследовать процессы, происходящие в нервных клетках во время инсульта Indicator, - (год публикации - )

10. - Новый метод позволяет наблюдать за биохимическими процессами в клетках мозга прямо в живом организме ПОЛИТ.РУ, - (год публикации - )

11. - Флуоресцентные биосенсоры позволили исследовать процессы, происходящие в нервных клетках во время инсульта НОВОСИБИРСКАЯ ОБЛАСТНАЯ АССОЦИАЦИЯ ВРАЧЕЙ, - (год публикации - )

12. - Флуоресцентные биосенсоры позволили исследовать процессы, происходящие в нервных клетках во время инсульта ПОИСК, - (год публикации - )

13. - Российские ученые создали флуоресцентные биосенсоры, позволяющие исследовать процессы в нервных клетках при инсульте ХИМРАР высокие технологии, - (год публикации - )

14. - ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ БИОСЕНСОРЫ ПОЗВОЛИЛИ ИССЛЕДОВАТЬ ПРОЦЕССЫ, ПРОИСХОДЯЩИЕ В НЕРВНЫХ КЛЕТКАХ ВО ВРЕМЯ ИНСУЛЬТА Научная Россия, - (год публикации - )

15. - Новый метод позволяет наблюдать за биохимическими процессами в клетках мозга прямо в живом организме NEWS POTOK, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
-