КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 21-15-00212

НазваниеРоль метилирования ДНК и полиморфизма генов глутаматергической системы в клинике, когнитивном дефиците и терапии шизофрении

РуководительФедоренко Ольга Юрьевна, Доктор медицинских наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук", Томская обл

Период выполнения при поддержке РНФ 2021 г. - 2023 г. 

Конкурс№55 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-226 - Психиатрия

Ключевые словашизофрения, клинический полиморфизм, когнитивный дефицит, эффективность терапии, побочные эффекты антипсихотической терапии, глутаматергическая система, генетический полиморфизм, метилирование ДНК

Код ГРНТИ76.29.52


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Шизофрения представляет собой серьезную медико-социальную проблему во всем мире в связи с хроническим течением, тяжелыми характерными изменениями личности (шизофренический дефект) и нейрокогнитивным дефицитом, которые ухудшают качество жизни и являются причиной высокого процента инвалидизации пациентов. Согласно последним данным, глутаматергическая система играет важную роль в нейробиологии шизофрении, нарушения в этой системе тесно связаны с когнитивным дефицитом, антипсихотическим ответом и клиническим исходом при шизофрении. Эти результаты подтверждают текущие усилия по разработке фармакологических вмешательств, нацеленных на глутаматную систему, поскольку глутаматергические соединения могут быть более эффективными в определенных подгруппах пациентов или стадиях заболевания. Показано повышение уровня глутамата в мозге до начала психоза, имеющее отношение к исходу у лиц с высоким клиническим риском (Egerton A. et al., Schizophrenia Research, 2020). Согласно данным Консорциума по психиатрической генетике среди полиморфных вариантов генов, повышающих риск развития шизофрении, выявлены те, которые связаны с глутаматергической системой (Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium, Nature, 2014), причем они не влияют на концентрацию глутамата в головном мозге пациентов с шизофренией (Juan R Bustillo et al., Front Psychiatry, 2017). Это предполагает участие других генетических факторов или факторов окружающей среды, влияющих на вариабельность глутамат связанных SNPs рисков, способствующих увеличению глутамата мозга на ранних стадиях заболевания. Известно, что эпигенетические изменения регулируют экспрессию генов, и одним из механизмов является метилирование ДНК - ферментативное добавление метильной группы к остатку цитозина в сайте CpG, часто встречающееся в промоторных последовательностях. Опубликованы данные об изменении метилирования ДНК промоторной последовательности GRIN2B (гена, кодирующего субъединицу NR2B рецептора NMDA) у пациентов на ранних стадиях шизофрении и его участии в когнитивной функции [Fachim HA et al., 2019]. Ранее сообщалось, что у этих пациентов в плазме снижается субъединица NR2 [Loureiro CM et al., 2018]. Из этих данных следует, что метилирование ДНК может быть вовлечено в нарушение регуляции генов, связанных с глутаматергической нейротрансмиссией при шизофрении. Однако неясно, может ли лечение антипсихотиками изменить или обратить вспять эти эпигенетические изменения, хотя есть исследования, показывающие, что некоторые препараты могут влиять на метилирование ДНК [Reynolds GP, Fachim HA., 2016]. Проект направлен на комплексные генетические, эпигенетические, фармакогенетические и биохимические исследования нарушений глутаматергической системы, обусловливающие развитие шизофрении, ее клинический полиморфизм, когнитивный дефицит, эффективность и побочные эффекты антипсихотической терапии на достаточно большой выборке пациентов в русской популяции Сибирского региона. Планируется обследование 900 больных шизофренией, 400 здоровых доноров. Реализация проекта позволит получить новые приоритетные данные в области биологической психиатрии о роли метилирования ДНК и 50 полиморфных вариантов генов глутаматергической системы (GRIN2A, GRIN2B, GRIK4, GRM3, GRM7, GRM8, SLC1A2 и SLC17A7) в механизмах развития и неблагоприятного течения шизофрении, нейрокогнитивного дефицита, низкой эффективности и побочных эффектов антипсихотической терапии. Полученные данные будут использованы для выявления молекулярно-генетических маркеров риска развития шизофрении, неблагоприятного течения шизофрении, нейрокогнитивного дефицита, низкой эффективности и побочных эффектов антипсихотической терапии для усовершенствования ранней диагностики и персонализированной терапии пациентов, страдающих шизофренией. Это позволит повысить качество и продолжительность жизни пациентов и уменьшить прямые и косвенные медицинские затраты психиатрических служб.

Ожидаемые результаты
В рамках реализации настоящего проекта с использованием современных методов исследования планируется получить как новые фундаментальные результаты, обеспечивающие заявленному проекту охраноспособность и приоритетность, так и результаты, имеющие непосредственную практическую значимость. Впервые будут получены данные комплексного генетического, эпигенетического, фармакогенетического и биохимического исследования глутаматергической системы у больных шизофренией, которые позволят выявить молекулярно-генетические маркеры риска развития шизофрении, неблагоприятного течения шизофрении, нейрокогнитивного дефицита, низкой эффективности и побочных эффектов антипсихотической терапии. Полученные результаты будут использованы для оптимизации ранней диагностики неблагоприятного течения шизофрении и персонализированной терапии данных пациентов, снижения уровня инвалидизации и повышения качества жизни больных, страдающих шизофренией. По результатам проекта планируется опубликовать 20 публикаций, в том числе 12 публикаций в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection или Scopus, в том числе относящихся к 1 квартилю (предварительно: World J Biol Psychiatry, Hum Psychopharmacol., Pharmacogenomics and personalized medicine), ко 2 квартилю (Genetic Testing and Molecular Biomarkers, Clinical Pharmacology: Advances and Applications), новую медицинскую технологию, 1 результат интеллектуальной деятельности (патент РФ или свидетельство).


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2021 году
В рамках выполнения проекта проведен патентный поиск, который продемонстрировал, что тема исследования является охраноспособной. Разработаны протокол исследования, информированное согласие пациента, информационный листок, базисная карта пациента и получено разрешение локального биоэтического комитета на проведение исследования. Проведено клинико-психопатологическое, психометрическое обследование 400 больных шизофренией, получающих терапию антипсихотическими препаратами. Отбор пациентов проводился сплошным методом. Ведущая клинико-психопатологическая симптоматика у больных шизофренией помимо клинического интервью и динамики симптомов в процессе терапии антипсихотиками оценивалась с помощью Шкалы позитивных и негативных синдромов (PANSS). Изучены основные социально-демографические и клинические характеристики пациентов: пол, возраст, возраст дебюта шизофрении, социальный статус и уровень образования, семейное положение, наследственная отягощенность по шизофрении; длительность болезни, частота госпитализаций, ведущий профиль шизофренической симптоматики, наличие отдельных поведенческих паттернов: суицидального, гетероагрессивного и аддиктивного (курение и злоупотребление алкоголем) поведения. Проведено генотипирование 500 образцов ДНК больных шизофренией, 400 образцов ДНК здоровых лиц русской популяции Сибирского региона по 17 полиморфным вариантам гена GRIN2A (rs9989388, rs7190619, rs8049651, rs7196095, rs9921541, rs7192557, rs9788936, rs7206256, rs11866328, rs4782039, rs1345423, rs11644461, rs11646587, rs8057394, rs1650420, rs2650427, rs1969060), 9 полиморфным вариантам гена GRIN2B (rs12300851, rs220599, rs7313149, rs12827536, rs10772715, rs10845838, rs1805481, rs2192970, rs2300242) на секвеноме MassARRAY® Analyzer 4 (Agena Bioscience™) с использованием наборов SEQUENOM Consumablesi PLEXGold 384; на амплификаторах StepOnePlus TM Real-Time PCR System и Applied Biosystems™ QuantStudio™ 5 Real-Time PCR System (Applied Biosystems, США) с использованием наборов TaqMan1 Validated SNP Genotyping Assay (Applied Biosystems, США). Относительными факторами риска развития шизофрении являются: GRIN2A rs1650420*GG (OR=1,672; 95% CI: 1,003 – 2,787; р = 0,025), GRIN2A rs4782039*А (OR=1,526; 95% CI: 1,066 – 2,187; р = 0,021), GRIN2B rs10845838*GG (OR=1,690; 95% CI: 1,024 – 2,791; р = 0,021); GRIN2B rs12827536*GG/G (OR=2,179; 95% CI: 1,212 – 3,918; р = 0,029 для генотипа GG и OR=1,505; 95% CI: 1,069 – 2,118; р = 0,019 для аллеля G), GRIN2B rs2300242* ТТ (OR=3,015; 95% CI: 1,660 – 5,475; р = 0,045), GRIN2B rs1805481*АА (OR=1,947; 95% CI: 1,032 – 3,675; р = 0,036). Ранний возраст начала шизофрении рассматривается как фактор риска более тяжелого течения болезни. При сравнении групп пациентов с «ранним» (до 18 лет) и «взрослым» (18 лет и старше) возрастом начала шизофрении выявлены ассоциации GRIN2A rs7206256*A (OR=1,599; 95% CI: 1,078 – 2,372; p = 0,020), GRIN2A rs1164446*GG/G (OR=2,312; 95% CI: 1,203 – 4,443; p = 0,034 для генотипов; OR=1,505; 95% CI: 1,0413 – 2,176; p = 0,030 для аллелей) и GRIN2B rs7313149*A (OR=1,667; 95% CI: 1,002 – 2,775; p = 0,048) с «ранним» возрастом начала шизофрении. Полученные данные опубликованы в журнале Life (Q1 Web of Science, Scopus) в статье «Study of early onset schizophrenia: associations of GRIN2A and GRIN2B polymorphisms». Получены новые пилотные данные об ассоциации GRIN2A rs9788936*А с ведущей негативной симптоматикой шизофрении (OR=1,498; 95% CI: 1,034 – 2,169; р = 0,032). Анализ частоты генотипов и аллелей полиморфных вариантов GRIN2B не выявил «локусов-модификаторов» в отношении ведущей позитивной или негативной симптоматики шизофрении. Исследование полиморфных вариантов GRIN2A и GRIN2B не показало их роли в развитии шизофрении с непрерывным или эпизодическим типом течения. В группе больных шизофренией, злоупотребляющих алкоголем, чаще встречаются носители GRIN2A rs11866328*C (OR=1,72; p<0,001), GRIN2A rs9788936*А (OR=2,15; p=0,04), GRIN2B rs10845838*G (OR=1,64; p=0,04). При сравнении групп курящих и некурящих пациентов с шизофренией обнаружена ассоциация GRIN2A rs7190619*G с употреблением никотина (OR= 2,05; p=0,03). Установлено, что GRIN2A rs11866328 вносит значительный вклад (р=0,026) в формирование суицидального риска у больных шизофренией. Частотный анализ в группах больных шизофренией с гетероагрессивным поведением и без него показал статистически значимые различия в распределении аллелей полиморфизма rs7190619 гена GRIN2A (p=0,02). Пациенты с гетероагрессивным поведением в анамнезе чаще были носителями аллеля G (OR=2,49). Опубликована статья в журнале Life (Q1 Web of Science, Scopus); принята в печать статья в журнале «Сибирский психологический журнал» (Web of Science, Scopus, РИНЦ), опубликованы тезисы Всемирного конгресса по психиатрической генетике (VIRTUAL World Congress of Psychiatric Genetics (WCPG), October 11-15, 2021) в журнале European Neuropsychopharmacology (Q1 Web of Science, Scopus); опубликованы тезисы научно-практической конференции «Психотерапия и психосоциальная работа в психиатрии», Санкт-Петербург 24-25 июня 2021 года) (РИНЦ); приняты в печать 2 тезиса на 34th ECNP Congress, материалы которого опубликуются в журнале European Neuropsychopharmacology (Q1 Web of Science, Scopus) 1 января 2022 г. Полученные результаты представлены в виде стендовых докладов на конференциях различного уровня: 1. Представлены материалы на научно-практической конференции «Психотерапия и психосоциальная работа в психиатрии» (Санкт-Петербург, 24-25 июня 2021 года), опубликованы тезисы доклада «Предпочтения врачей-психиатров при выборе класса антипсихотической терапии с целью редукции позитивных симптомов» (Корнетова Е.Г., Герасимова В.И., Федоренко О.Ю.). 2. E-poster TH.85 «Association of the GRIN2B gene with schizophrenia in the Russian population of the Siberian region», авторы: E.G. Poltavskaya, O.Yu. Fedorenko, E.G. Kornetova, S.A. Ivanova на Всемирном конгрессе по психиатрической генетике (VIRTUAL World Congress of Psychiatric Genetics (WCPG), October 11-15, 2021), опубликованы тезисы доклада в журнале European Neuropsychopharmacology (Q1 Web of Science, Scopus). 3. E-poster P.0471 «Relationship between antipsychotic therapy and the severity of negative symptoms in inpatients with schizophrenia», авторы: V. Gerasimova, E. Kornetova, O. Fedorenko, S. Ivanova на 34th ECNP Congress Hybrid, Lisbon, Portugal, 2-5 October 2021. 4. E-poster P.0880 «Polymorphism of GRIN2A gene and schizophrenia in the Siberian region», авторы: E.G. Poltavskaya, O.Yu. Fedorenko, E.G. Kornetova на 34th ECNP Congress Hybrid, Lisbon, Portugal, 2-5 October 2021.

 

Публикации

1. Корнетов А. Н., Языков К. Г., Корнетова Е. Г., Федоренко О. Ю., Гончарова А. А., Семке А. В., Иванова С. А., Шмуклер А. Б., Бохан Н. А. Нормативная оценка когнитивных функций по шкале «Краткая оценка когнитивных функций у пациентов с шизофренией» (BACS) в томской популяции: конституциональные факторы вариативности Сибирский психологический журнал, - (год публикации - 2021)

2. Полтавская Е.Г., Федоренко О.Ю., Корнетова Е.Г., Лунен А., Корнетов А.Н., Бохан Н.А., Иванова С.А. Study of early onset schizophrenia: associations of GRIN2A and GRIN2B polymorphisms Life (Basel)., 2021 Sep 22;11(10):997. (год публикации - 2021) https://doi.org/10.3390/life11100997

3. Корнетова Е.Г., Герасимова В.И., Федоренко О.Ю. Предпочтения врачей-психиатров при выборе класса антипсихотической терапии с целью редукции позитивных симптомов Психотерапия и психосоциальная работа в психиатрии. Выпуск VII. Материалы научно-практической конференции, 24-25 июня 2021 года, Санкт-Петербург, С.55-56. (год публикации - 2021)

4. Полтавская Е.Г., Федоренко О.Ю., Корнетова Е.Г., Иванова С.А. ASSOCIATION OF THE GRIN2B GENE WITH SCHIZOPHRENIA IN THE RUSSIAN POPULATION OF THE SIBERIAN REGION European Neuropsychopharmacology, Vol. 51, Page e240 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.euroneuro.2021.08.256

5. - Томские ученые проводят генетические исследования шизофрении Министерство науки и высшего образования Российской Федерации, - (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
В рамках выполнения проекта проведено клинико-психопатологическое, нейропсихологическое, психометрическое обследование 150 больных шизофренией с выделением ведущей симптоматики и когнитивных нарушений. Ведущая клинико-психопатологическая симптоматика у больных шизофренией помимо клинического интервью и динамики симптомов в процессе терапии антипсихотиками оценивалась с помощью PANSS. Изучены основные социально-демографические и клинические характеристики пациентов: пол, возраст, возраст дебюта шизофрении, социальный статус и уровень образования, семейное положение, наследственная отягощенность по шизофрении; длительность болезни, частота госпитализаций, ведущий профиль шизофренической симптоматики, наличие отдельных поведенческих паттернов: суицидального, гетероагрессивного и аддиктивного поведения. Проведено нейропсихологическое обследование больных шизофренией с использованием шкалы «Краткая оценка когнитивных функций у пациентов с шизофренией» (BACS). С помощью кластерного анализа методом K-средних выделены три кластера нейрокогнитивного дефицита, отличающихся между собой клинической выраженностью: 1) легкий, 2) умеренно выраженный, 3) выраженный. У всех пациентов проводилась комплексная оценка побочных эффектов антипсихотической терапии. Основные двигательные нарушения, такие как тардивная дискинезия и акатизия регистрировались с помощью шкалы патологических непроизвольных движений AIMS и шкалы акатизии Барнса (BARS, BAS) соответственно. Пролактин и глутамат в сыворотке крови измеряли иммуноферментным методом. Гиперпролактинемия диагностировалась при уровне пролактина выше 25 нг/мл у женщин и 20 нг/мл – у мужчин. Сформирована группа контроля из 420 здоровых добровольцев, стандартизированных по полу и возрасту по отношению к основной группе. Прогенотипировано 900 образцов ДНК больных шизофренией, 420 образцов ДНК здоровых лиц русской популяции Сибирского региона по вариантам генов GRIK4, SLC1A2, SLC17A7, GRM3, GRM7, GRM8. Прогенотипировано 400 образцов ДНК больных шизофренией, обследованных в 2021-2022 гг. по вариантам генов GRIN2A, GRIN2B. Генотипирование проводили на секвеноме MassARRAY® Analyzer 4 (Agena Bioscience™) с использованием наборов SEQUENOM Consumablesi PLEXGold 384. Уровень значимости р<0,05. Выявлены относительные факторы риска развития шизофрении: GRIN2A rs7190619*GG, GRIN2A rs7190619*G, SLC1A2 rs12361171*АА, SLC1A2 rs12361171*А, GRM3 rs2299225*G, GRM7 rs1396409*G. У больных шизофренией носителей GRIN2A rs9788936*СС выявлена высокая концентрация глутамата в сыворотке крови по сравнению с носителями генотипов ТС и ТТ. Пациенты носители GRIN2B rs1805481*СА отличались более высокой концентрацией глутамата по сравнению с носителями генотипа СС. В группе с ранним дебютом заболевания до 18 лет обнаружена статистически более высокая частота GRM3 rs2299225*ТТ/Т, GRM7 rs12491620*СС/С. Эти варианты можно рассматривать как относительные факторы риска раннего начала и более неблагоприятного течения шизофрении. Стабильная негативная симптоматика и непрерывный характер течения заболевания связаны с более высокой степенью прогрессирования шизофрении. Относительными факторами риска развития ведущей негативной симптоматики у больных шизофренией является носительство GRIN2A rs7206256*АА, SLC1A2 rs10742338*С, SLC1A2 rs7936950*С. Показана ассоциация непрерывного характера течения шизофрении с GRIN2A rs11644461*С, GRIN2A rs8057394*G, GRIN2B rs7313149*С, SLC1A2 rs1042113*СТ/С и, SLC1A2 rs12294045*СТ. Проведено сравнение распределений частот аллелей и генотипов исследуемых генов между больными шизофренией в зависимости от сопутствующих поведенческих паттернов. Выявлена ассоциация GRM7 rs779746*Т со злоупотреблением алкоголем. Обнаружена ассоциация SLC1A2 rs1042113*Т, SLC1A2 rs10742338*Т и rs7936950*С, GRM8 rs2299472*С со злоупотреблением табака. Полиморфные варианты SLC1A2 rs3812778*А и GRM7 rs12491620*С предрасполагали к совершению суицидальных попыток. Получены новые данные об ассоциации изучаемых полиморфных вариантов генов с нейрокогнитивными нарушениями при шизофрении. На основании кластеризации когнитивных нарушений пациенты были объединены в 3 группы в зависимости от варианта нейрокогнитивного дефицита. Анализ по трем генотипам выявил значимые ассоциации в двух кластерах (легкий и умеренно выраженный против выраженного нейрокогнитивного дефицита) для GRIN2B, GRIN2A и GRM8. Из трех вариантов GRIN2B (rs10772715, rs12827536, rs220599) только один rs12827536 оставался значимым при анализе рецессивной /доминантной модели, как и GRIN2A rs9788936. Результаты для GRM8 rs2237748, rs2299472 оставались значимыми (р=0,001) после анализа рецессивной/доминантной модели. После применения коррекции на частоту ложных открытий (FDR), только GRM8 rs2237748*CC и rs2299472*CC оставались значимо ассоциированными с более высокой частотой нейрокогнитивных нарушений. При анализе результатов для GRM8 отдельно у мужчин и женщин, эффект оставался значимым в каждой группе для rs2299472 и rs2237748. Дальнейшее исследование связи с отдельными когнитивными доменами для GRM8 показало, что ассоциации достигают значимых значений только для rs2299472 с кодированием символов и тестом «Башня Лондона». Эти когнитивные функции связаны с вниманием и исполнительной функцией мышления в проблемно-решающем поведении соответственно. GRIN2A rs9788936 был значимо связан с кодированием символов и слухоречевой памятью, тогда как GRIN2B rs12827536 был значимо связан только с моторными навыками, оценивающим реципрокную координацию движений. В результате ассоциативного анализа получены значимые результаты между общей тардивной дискинезией и GRIN2A rs8057394*GC, GRIN2B rs10772715*GА, GRIN2B rs7313149*ТС, SLC1A2 rs1042113*СС/С, SLC1A2 rs10768121*А, SLC1A2 rs12361171*Т, SLC1A2 rs3812778*АА/А, GRM3 rs1468412*TT/T, GRM3 rs2237562*ТС/СС/С. Установлена значимая ассоциация между тороколюмбальной тардивной дискинезией и GRIN2A rs7192557*А. Применение логистической регрессии и поправки Бонферрони на множественное сравнение позволило обнаружить гаплотип риска развития тардивной дискинезии, состоящий из аллелей CAT вариантов SLC1A2 rs1042113 rs10768121 и rs12361171. Относительными факторами риска развития антипсихотик-индуцированной гиперпролактинемии являются GRIN2A rs9788936*TT/T, GRM7 rs12491620*G. Опубликована статья в журнале «Diagnostics» (Web of Science, Scopus, Q2); статья в журнале «Бюллетень Сибирской медицины» (Web of Science, Scopus, RSCI); принята в печать статья в журнал «Молекулярная биология» (Web of Science, Scopus, RSCI); опубликованы две статьи в журнале «Медицинская генетика» (RSCI); две статьи в журнале «Психиатрия» (Scopus); статья в журнале «Актуальные вопросы психиатрии и наркологии»; опубликованы два тезиса 34th ECNP Congress в журнале «European Neuropsychopharmacology» (Q1 Web of Science, Scopus); тезисы в сборнике тезисов Всероссийского конгресса с международным участием «Психоневрология: Век XIX – Век XXI», г. Санкт-Петербург; статья в сборнике материалов конгресса молодых ученых «Актуальные вопросы фундаментальной и клинической медицины», г. Томск. Полученные результаты представлены на Всероссийском конгрессе с международным участием «Психоневрология: Век XIX – Век XXI», Санкт-Петербург; 7-й Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Психическое здоровье человека и общества. Актуальные междисциплинарные проблемы и возможные пути решения», Москва; 5-я Костромской Всероссийской школе молодых ученых и специалистов в области психического здоровья «Биологическая парадигма клиники психических расстройств», Кострома; Конгрессе молодых ученых «Актуальные вопросы фундаментальной и клинической медицины», г. Томск; Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Психиатрическая генетика: современные возможности и перспективы трансляции в клиническую практику», г. Санкт-Петербург.

 

Публикации

1. Пожидаев И.В., Полтавская Е.Г., Корнетова Е.Г., Гончарова А.А., Иванова С.А, Федоренко О.Ю Ассоциация гена GRIN2A с тардивной дискинезией у больных шизофренией Медицинская генетика, №8, Том 21, С. 31-34 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.08.31-34

2. Полтавская Е.Г. Ассоциация генов GRIN2A и GRIN2B с ранним дебютом шизофрении Психиатрия, 3, 20, 134-135 (год публикации - 2022)

3. Полтавская Е.Г., Корнетова Е.Г., Герасимова В.И., Бочарова А.В., Иванова С.А., Федоренко О.Ю. Исследование ассоциации полиморфизма гена SLC1A2 с типом течения шизофрении Медицинская генетика, №8, Том 21, С. 27-30 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.08.27-30

4. Тигунцев В.В., Герасимова В.И., Корнетова Е.Г., Федоренко О.Ю., Корнетов А.Н., Гончарова А.А., Полтавская Е.Г., Бойко А.С. АССОЦИАЦИЯ УРОВНЯ СЫВОРОТОЧНОГО ПРОЛАКТИНА И ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ GRIN2A, GRM3, GRM7 У БОЛЬНЫХ ШИЗОФРЕНИЕЙ, ПРИНИМАЮЩИХ КОНВЕНЦИОНАЛЬНЫЕ И АТИПИЧНЫЕ АНТИПСИХОТИКИ Молекулярная биология, T. 57, № 1, стр. 47-55 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.31857/S0026898423010159

5. Тигунцев В.В., Герасимова В.И., Корнетова Е.Г., Федоренко О.Ю., Семке А.В., Корнетов А.Н. Ассоциации полиморфных вариантов генов GRIN2A и GRIN2B со злоупотреблением алкоголем и табаком у больных шизофренией. Бюллетень сибирской медицины, Бюллетень сибирской медицины. 2022;21(3):105-111. (год публикации - 2022) https://doi.org/10.20538/1682-0363-2022-3-105-111

6. Тигунцев В.В., Гончарова А.А., Герасимова В.И. Изучение ассоциации полиморфных вариантов гена SLC1A2 c клинической картиной шизофрении Психиатрия, 3, 20, 2, 41-42 (год публикации - 2022)

7. Тигунцев В.В., Корнетова Е.Г., Федоренко О.Ю. Изучение вклада полиморфного варианта rs1954787 в формирование гетероагрессии у пациентов с шизофренией Актуальные вопросы психиатрии и наркологии, 1, 20, 149-150 (год публикации - 2022)

8. Федоренко О.Ю., Падерина Д.З., Корнетова Е.Г., Полтавская Е.Г., Пожидаев И.В., Гончарова А.А., Фрейдин М.Б., Бочарова А.В., Бохан Н.А., Лунен А. Дж.М., Иванова С.А. Genes of the Glutamatergic System and Tardive Dardive Dyskinesia in Patients with Schizophrenia Diagnostics, Diagnostics 2022, 12, 1521. https://doi.org/10.3390/ diagnostics12071521 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.3390/diagnostics12071521

9. Герасимова В., Корнетова Е., Федоренко О., Иванова С. Relationship between antipsychotic therapy and the severity of negative symptoms in inpatients with schizophrenia European Neuropsychopharmacology, V. 53, S 346-347 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.euroneuro.2021.10.444

10. Полтавская Е.Г., Федоренко О.Ю., Корнетова Е.Г. Polymorphism of GRIN2A gene and schizophrenia in the Siberian region European Neuropsychopharmacology, V. 53, S644-S645 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.euroneuro.2021.10.736

11. Тигунцев В.В., Гончарова А.А., Герасимова В.И., Пожидаев И.В., Падерина Д.З., Полтавская Е.Г. Исследование ассоциации GRIN2B rs1805502 с ведущей клинической симптоматикой шизофрении Издательство Томского университета, Томск, Издательство Томского университета, Томск, 2022 - 395 с. (год публикации - 2022)

12. Федоренко О.Ю., Полтавская Е.Г., Бойко А.С., Тигунцев В.В., Корнетова Е.Г. Ассоциации полиморфных вариантов генов GRIN2A и GRIN2B с антипсихотик - индуцированной гиперпролактинемией у больных шизофренией Санкт-Петербург [Электронное издание]/ под общ. ред. Н.Г. Незнанова. — СПб.: НМИЦ ПН им. В.М. Бехтерева, 2022. – 406 с., 1, 278-279 (год публикации - 2022)


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
В рамках выполнения проекта проведено клинико-психопатологическое, нейропсихологическое, психометрическое обследование 50 больных шизофренией с выделением ведущей симптоматики и когнитивных нарушений. Ведущая клинико-психопатологическая симптоматика у больных шизофренией помимо клинического интервью и динамики симптомов в процессе терапии антипсихотиками оценивалась с помощью PANSS. Изучены основные социально-демографические и клинические характеристики пациентов. Проведено нейропсихологическое обследование больных шизофренией с использованием шкалы «Краткая оценка когнитивных функций у пациентов с шизофренией» (BACS). С помощью кластерного анализа методом K-средних выделены три кластера нейрокогнитивного дефицита, отличающихся между собой клинической выраженностью: 1) легкий, 2) умеренно выраженный, 3) выраженный. У всех пациентов проводилась комплексная оценка побочных эффектов антипсихотической терапии. Двигательные нарушения тардивную дискинезию и акатизию регистрировали с помощью шкалы патологических непроизвольных движений AIMS и шкалы акатизии Барнса (BARS, BAS). Пролактин и глутамат в сыворотке крови измеряли иммуноферментным методом. Гиперпролактинемия диагностировалась при уровне пролактина выше 25 нг/мл у женщин и 20 нг/мл – у мужчин. Для верификации метаболического синдрома (МС) проводились измерения артериального давления, окружности талии, определение биохимических показателей (уровень глюкозы, триацилглицеридов, липопротеидов высокой плотности). Общую группу больных шизофренией составили 900 человек, контрольную – 420 здоровых лиц русской популяции Сибирского региона, у которых выполнено генотипирование образцов ДНК по вариантам GRIN2A, GRIN2B, GRIK4, GRM3, GRM7, GRM8, SLC1A2, SLC17A7 на секвеноме MassARRAY® Analyzer 4 (Agena Bioscience™). Исследован уровень метилирования сайтов CpG в промоторах 11 генов: GRIA3, GRIN2A, GRIN2B, GRM2, GRM3, GRM7, GRM8, SLC17A7, SLC1A1, SLC1A2 и SLC38A7 у 37 больных шизофренией и 18 здоровых лиц методом таргетного бисульфитного массового параллельного секвенирования на приборе MiSeq (Illumina, США). На основании кластеризации когнитивных нарушений пациенты (n=250) объединены в 3 группы в зависимости от варианта нейрокогнитивного дефицита. Выявлены значимые ассоциации в двух кластерах (легкий и умеренно выраженный против выраженного нейрокогнитивного дефицита) для GRIN2B, GRIN2A и GRM8. Из трех вариантов GRIN2B (rs10772715, rs12827536, rs220599) только один rs12827536 оставался значимым при анализе рецессивной /доминантной модели, как и GRIN2A rs9788936, GRM8 rs2237748, rs2299472. После применения коррекции на частоту ложных открытий (FDR), только GRM8 rs2237748*CC и rs2299472*CC оставались значимо ассоциированными с более высокой частотой нейрокогнитивных нарушений. Дальнейшее исследование связи с отдельными когнитивными доменами для GRM8 показало, что ассоциации достигают значимых значений только для rs2299472 с кодированием символов и тестом «Башня Лондона». Эти когнитивные функции связаны с вниманием и исполнительной функцией мышления в проблемно-решающем поведении соответственно. GRIN2A rs9788936 был значимо связан с кодированием символов и слухоречевой памятью, тогда как GRIN2B rs12827536 был значимо связан только с моторными навыками, оценивающим реципрокную координацию движений. Получены новые данные об ассоциации изучаемых полиморфных вариантов генов с МС и его компонентами (концентрация глюкозы, триглицеридов, липопротеинов высокой плотности (ЛПВП) в сыворотке крови, повышенное артериальное давление (АД)) при шизофрении (n=517). Относительными факторами риска развития МС у больных шизофренией являются SLC1A2 rs12294045* СС/С; повышения концентрации глюкозы - SLC1A2 rs10768121*CA, rs11033046*AT, rs3088168*ТС, rs12294045*С, GRM3 rs2237562*СС и rs2299225*GT; повышения концентрации триглицеридов - GRIN2A rs11866328*GT, rs7206256*AG; снижения концентрации ЛПВП - GRIN2A rs11866328*GT и GRIK4 rs1954787*CC; повышения АД - GRIN2B rs12827536*ТТ. Получены новые данные об ассоциации изучаемых полиморфных вариантов генов с акатизией у больных шизофренией (n=285). Объективная акатизия чаще встречалась у носителей GRIN2A rs11644461*CC/С, GRIN2A rs11866328* ТТ/Т, GRIN2A rs1345423*G, GRIN2A rs7206256*A, GRIN2B rs12300851*С, GRIN2B rs220599* G; общеклиническая акатизия - у носителей GRIN2A rs11866328*ТТ/Т. Получены новые данные об уровне метилирования сайтов CpG в промоторах большего количества генов (11), чем заявлено в гранте (8), а именно: GRIA3, GRIN2A, GRIN2B, GRM2, GRM3, GRM7, GRM8, SLC17A7, SLC1A1, SLC1A2 и SLC38A7 у больных шизофренией (n=37) и здоровых лиц (n=18) русской популяции Сибирского региона. Уровень метилирования гена GRM2 значимо повышен в группе с непрерывным течением шизофрении по сравнению с группой пациентов с эпизодическим течением. Уровень метилирования гена GRIA3 был значимо повышен при непрерывном типе течения шизофрении по сравнению с эпизодическим типом течения у мужчин, но не у женщин. Выявлена значимая корреляция с возрастом манифестации заболевания для уровня метилирования одного из регионов гена GRM8. Уровень метилирования генов GRIN2A и GRM2 был значимо выше при ведущей негативной симптоматике по сравнению с позитивной симптоматикой. В контрольной группе значимая корреляция с возрастом индивидов обнаружена для уровня метилирования генов GRIN2A, GRM2 и GRM3, а в группе больных шизофренией - GRM2 и SLC1A2, то есть уровень метилирования гена GRM2 значимо повышался с возрастом индивидов в обеих группах. Обнаружена значимая корреляция уровня метилирования генов GRIN2A и GRM2 с длительностью заболевания в общей группе и GRIA3 – в группе мужчин больных шизофренией. В группе с нейрокогнитивным дефицитом был значимо снижен уровень метилирования генов GRM2 и GRM3. В группе с выраженным эффектом терапии был значимо ниже уровень метилирования генов GRM2, GRM3, GRM7 и SLC1A2 и в группе мужчин - гена GRIA3. В группе с акатизией значимо снижен уровень метилирования генов GRM8 и SLC1A2 и повышен уровень метилирования гена SLC17A7 по сравнению с пациентами без акатизии. Уровень метилирования гена GRM8 был значимо выше в группе больных с метаболическим синдромом по сравнению с пациентами без него. Опубликована статья в журнале Genes (Q2 Web of Science, Scopus); статья в журнале Personalized Psychiatry and Neurology (РИНЦ); опубликованы тезисы 14-й международной школы молодых ученых «Системная биология и биоинформатика (SBB-2023)» (22–26 мая 2023, г. Новосибирск); тезисы XIX Международного междисциплинарного конгресса «Нейронаука для медицины и психологии» (4–10 июня 2023, г. Судак); 2 тезисов XVI Всероссийской школы молодых психиатров (13–17 апреля 2023, г. Суздаль); 3 тезисов V Российской конференции с международным участием «Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии» (17–18 мая 2023, г. Томск). Разработана новая медицинская технология «Технология поддержки принятия решения для назначения антипсихотической фармакотерапии с учетом риска развития тардивной дискинезии у больных шизофренией». Разработана программа для ЭВМ «Программа поддержки принятия врачебных решений выбора антипсихотической терапии для лечения больных шизофренией с учётом риска развития тардивной дискинезии» (свидетельство RU 2023682918). Полученные результаты представлены на расширенном заседании экспертного совета Российского научного фонда по генетическим исследованиям, Москва; Всероссийском конгрессе с международным участием «Нейропсихиатрия в трансдисциплинарном пространстве: от фундаментальных исследований к клинической практике», Санкт-Петербург; V Российской конференции с международным участием «Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии», Томск; 14-й международной школе молодых ученых «Системная биология и биоинформатика (SBB-2023)», Новосибирск.

 

Публикации

1. Полтавская Е.Г., Корнетова Е.Г., Фрейдин М.Б., Пожидаев И.В., Падерина Д. З., Бочарова А.В., Семке А.В., Бохан Н.А., Иванова С.А., Федоренко О.Ю. The Role of Glutamatergic Gene Polymorphisms in the Clinical Phenotypes of Schizophrenia Genes (Basel), V. 14, N. 3, P. 575-585 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/genes14030575

2. Полтавская Е.Г., Тигунцев В.В., Бойко А.С., Корнетова Е.Г., Иванова С.А., Федоренко О.Ю. Study of Associations of the GRM8 Gene with Antipsychoticinduced Hyperprolactinemia Personalized Psychiatry and Neurology, 3 (1): 42-47. (год публикации - 2023) https://doi.org/10.52667/2712-9179-2023-3-1-42-47

3. Полтавская Е. Г. Исследование вклада генов глутаматергической системы SLC1A2 и SLC17A7 в клиническую гетерогенность шизофрении Сборник тезисов. XVI Всероссийская школа молодых психиатров. 13-17 апреля 2023, г. Суздаль. 315 с., Сборник тезисов. XVI Всероссийская школа молодых психиатров. 2023. С. 138-141 (год публикации - 2023)

4. Полтавская Е.Г., Корнетова Е.Г., Федоренко О.Ю. Исследование ассоциации гена GRM3 с ведущей симптоматикой шизофрении Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии. сборник тезисов V Российской конференции с международным участием. Томск, 2023. 262 с., Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии. сборник тезисов V Российской конференции с международным участием. Томск, 2023. С. 167-169. (год публикации - 2023)

5. Полтавская Е.Г., Корнетова Е.Г., Федоренко О.Ю. Исследование ассоциации гена рецептора глутамата GRIK4 с антипсихотик-индуцированной гиперпролактинемией Системная биология и биоинформатика (SBB-2023). Тезисы докладов 14-ой международной школы молодых ученых. Новосибирск, 2023. 66 с., Тезисы докладов / Рос. акад. наук, Сиб. отд-ние, Федер. исслед. центр Ин-т цитологии и генетики. – Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2023. – C 27. (год публикации - 2023) https://doi.org/10.18699/SBB-2023-27

6. Тигунцев В.В., Корнетова Е.Г., Петкун Д.А., Федоренко О.Ю. Ассоциации полиморфных вариантов генов глутаматергической системы с формированием аддиктивного поведения у больных шизофренией Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии. сборник тезисов V Российской конференции с международным участием. Томск, 2023. 262 с., Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии. сборник тезисов V Российской конференции с международным участием. Томск, 2023. С. 205-208. (год публикации - 2023)

7. Тигунцев В.В., Корнетова Е.Г., Федоренко О.Ю., Бойко А.С., Иванова С.А. Изучение вклада полиморфного варианта GRIN2A RS8057394 в формирование уровня сывороточного пролактина у пациентов с шизофренией, принимающих галоперидол Сборник тезисов. XVI Всероссийская школа молодых психиатров. 13-17 апреля 2023, г. Суздаль. 315 с., Сборник тезисов. XVI Всероссийская школа молодых психиатров. 13-17 апреля 2023, г. Суздаль. С. 161-163. (год публикации - 2023)

8. Тигунцев В.В., Корнетова Е.Г., Федоренко О.Ю., Корнетов А.Н., Полтавская Е.Г., Бойко А.С. Ассоциация уровня сывороточного пролактина и полиморфных вариантов гена GRM7 у больных шизофренией, принимающих конвенциональные и атипичные антипсихотики Сборник тезисов. XIX Международный междисциплинарный конгресс "Нейронаука для медицины и психологии", 4-10 июня, г. Судак. 328 с., Сборник тезисов. XIX Международный междисциплинарный конгресс "Нейронаука для медицины и психологии", 4-10 июня, г. Судак. С. 278-279. (год публикации - 2023) https://doi.org/10.29003/m3150.sudak.ns2023-19

9. Федоренко О.Ю., Корнетова Е.Г., Иванова С.А., Иваничко А.Г. Клиническая гетерогенность шизофрении: вклад полиморфизма генов глутаматергической системы Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии. сборник тезисов V Российской конференции с международным участием. Томск, 2023. 262 с., Современные проблемы биологической психиатрии и наркологии. сборник тезисов V Российской конференции с международным участием. Томск, 2023. С. 225-227. (год публикации - 2023)

10. О.Ю. Федоренко, Е.Г. Корнетова, М.Б. Фрейдин, Е.Г. Полтавская, Д.З. Падерина, С.А. Иванова, И.В. Пожидаев, В.В. Тигунцев, Н.А. Бохан Технология поддержки принятия решения для назначения антипсихотической фармакотерапии с учетом риска развития тардивной дискинезии у больных шизофренией Томск: Типография ООО «Интегральный переплет», 2023. 42 с., Томск: Типография ООО «Интегральный переплет», 2023. 42 с. (год публикации - 2023)

11. Федоренко О.Ю., Корнетова Е.Г., Фрейдин М.Б., Полтавская Е.Г., Падерина Д.З., Иванова С.А., Пожидаев И.В., Тигунцев В.В., Бохан Н.А. Программа поддержки принятия врачебных решений выбора антипсихотической терапии для лечения больных шизофренией с учётом риска развития тардивной дискинезии -, RU2023682918 (год публикации - )

12. - Исследователь Томского НИМЦ выступила на расширенном заседании экспертного совета Российского научного фонда сайт ТНИМЦ, сайт ТНИМЦ, 31 января 2023 г., сообщение о выступлении 26.01.2023 в РНФ Федоренко О.Ю. (год публикации - )

13. - Томские ученые выявили генетические маркеры раннего начала и неблагоприятного течения шизофрении сайт ТНИМЦ, сайт ТНИМЦ, 19 апреля 2023 г., интервью Федоренко О.Ю. и Корнетовой Е.Г. (год публикации - )

14. - Томские ученые выявили генетические маркеры раннего начала и неблагоприятного течения шизофрении сайт РНФ, сайт РНФ, 21 апреля 2023 г., интервью Федоренко О.Ю. и Корнетовой Е.Г. (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Новая медицинская технология "Технология поддержки принятия решения для назначения антипсихотической фармакотерапии с учетом риска развития тардивной дискинезии у больных шизофренией" предназначена для врачей-психиатров, специалистов, работающих в области биологической психиатрии, а также может быть использована в учреждениях здравоохранения для оказания специализированной медицинской помощи больным психическими расстройствами. В новой медицинской технологии представлен метод поддержки принятия решения для назначения антипсихотической фармакотерапии с учетом риска развития тардивной дискинезии у больных шизофренией на основе программы, алгоритм использования которой заключается во вводе соответствующих фенотипических, клинических и генетических данных с последующим автоматическим вычислением риска развития тардивной дискинезии при лечении больных шизофренией конвенциональными или атипичными антипсихотическими препаратами второго поколения.