Аннотация результатов, полученных в 2021 году
В рамках проекта ведется работа по трем направлением. В первый год по направлению «Разработка микробных биотехнологий очистки сточных вод от соединений азота и фосфора». Выполнены задачи проекта: 1) охарактеризован состав и функциональный потенциал микробных консорциумов активных илов, удаляющих азот и фосфор из коммунальных сточных вод, методами метагеномики (объекты – микробные сообщества, удаляющие аммоний с помощью процесса анаммокс и сообщества фосфат-аккумулирующих микроорганизмов) и 2) определены экофизиологические функции микроорганизмов – членов консорциумов. Получены следующие основные результаты 1. Собраны кольцевые геномы анаммокс-бактерий видов Ca. “Jettenia asiatica” и Ca. “Brocadia fulgida”. Сравнительный геномный анализ позволил предположить у анаммокс-бактерии родов Ca. “Brocadia” и Ca. “Jettenia” разные стратегии выживания. Подвижность и хемотаксис позволяют представителям рода Ca. “Brocadia” эффективно ориентироваться в новых условиях окружающей среды и быстро занимать наиболее благоприятную нишу. Неподвижность Ca. “Jettenia” spp. заставляет ее лучше адаптироваться к изменениям окружающей среды, и на месте, при столкновении с неблагоприятным воздействием, более или менее успешно вырабатывать подходящий для ситуации защитный механизм. 2. В исследуемом микробном сообществе спутниками анаммокс-бактерий были представители филумов Chloroflexi, Bacteroidota, Ca. Armatimonadota, Patescibacteria. Роль органотрофных представителей филумов Chloroflexi, Bacteroidota и Patescibacteria в анаммокс-сообществе вероятнее всего заключается в разложении отмершей клеточной биомассы активного ила и образованных анаммокс-бактериями ЭПС. Кроме того, у представителей филумов Chloroflexi, Ignavibacteria и Ca. “Armatimonadota” выявлены различные ферменты азотного метаболизма. Они могут осуществлять процесс денитрификации, с одной стороны конкурируя с анаммокс-бактериями за нитрит, с другой - удаляя нитрат с образованием оксида азота в качестве промежуточного продукта, который дальше может использоваться анаммокс-бактериями. Данные бактерии могут служить источником вторичных метаболитов, стимулирующих активность анаммокс-бактерий. 3. Усовершенствована конструкция анаммокс-реакторов для выращивания биомассы активного ила анаммокс: 1) прикрепления активного ила анаммокс к подвижной плавающей загрузке 2) оптимизации гидродинамики 3) обеспечение в составе реактора нескольких параллельных линий для корректного сравнения исследуемых параметров; 4) использование прозрачного материала для обеспечения визуального контроля над перемешиванием содержимого реактора. В реакторах новой конструкции накоплена биомасса активного ила анаммокс для работы на следующем этапе. 4. Выполнен скрининг микробных сообществ активных илов аэротенков 9 автономных очистных сооружений г. Москвы (Курьяновские и Люберецкие очистные сооружения, АО Мосводоканал). Выявлены доминирующие в илах представители филумов бактерий Proteobacteria, Bacteroidota, Actinobacteriota, Chloroflexi, Myxococcota, Firmicutes, Patescibacteria, Verrucomicrobiota, Bdellovibrionota, Nitrospirota и Planctomycetota) и архей. (Nanoarchaeota, Halobacterota, Euryarchaeota и Thermoplasmatota). Сравнение состава активных илов московских сооружений с очистными сооружениями, расположенными по всему миру, показал, что все московские образцы сгруппированы вместе. Это указывает на большее влияние культурных, социальных и экологических факторов на состав сообщества, чем технологии эксплуатации очистных сооружений. 5. Подобраны условия культивирования ДФАО - фосфат-аккумулирующих организмов, способных к использованию, как кислорода, так и альтернативных акцепторов электронов (нитратов, нитритов). В ходе культивирование наблюдалось формирование 2-х морфологически различных типов флоккул в реакторе происходило через 2 нед с момента запуска реактора. Точечный анализ элементного состава включений в клетках флоккул I типа показал наличие в них высокого содержания фосфора. Во флоккулах I типа доминировали ФАО Ca. “Accumulibacter phosphatis”, доля которых составляла 40%. Во флоккулах II типа доминировали ГАО Ca. “Competibacter”, доля которых составляла 32%. В рамках направления по «Разработка биогидрометаллургических технологий извлечения цветных и благородных металлов» было проведено исследование биоокисления сульфидного концентрата в разных условиях. Концентрат содержал 56% пирита и 12% арсенопирита, 43 г/т золота. Концентрат относился к упорным, так как степень извлечения золота цианированием из концентрата составляла 31%. Биоокисление проводили в лабораторных реакторах в непрерывном режиме при 40, 45 и 50°С. Время пребывания составляло 6 суток, плотность пульпы 1 : 10 (Т : Ж). Исследовали влияние источников углерода на процесс биоокисления, добавляя в пульпу 0.02% мелассы или осуществляя подачу CO2. Контрольный эксперимент проводили без использования дополнительных источников углерода. Микробные популяции анализировали с помощью метабаркодинга фрагментов V3-V4 генов 16S рРНК. При 40°C дополнительные источники углерода незначительно повлияли на процесс биоокисления и не позволили увеличить извлечение золота. Степень окисления пирита при 40°C составила 89–91%, а арсенопирита во всех экспериментах более 99%. Степень извлечения золота в контрольном эксперименте составила 80%, при использовании CO2 – 72%, при использовании мелассы – 58%. При более высоких температурах применение CO2 влияло на биоокисление. Так, при 45°C использование CO2 позволило повысить степень окисления пирита. Степень окисления пирита при 45°C составила в контрольном эксперименте 61%, при использовании CO2 – 89%, при использовании мелассы – 62%. Степень окисления арсенопирита во всех вариантах эксперимента была выше и составила: в контрольном эксперименте 93%, при использовании CO2 – 98%, при использовании мелассы – 93%. Степень извлечения золота в контрольном эксперименте при 45°C составила 92%, при использовании CO2 – 91%, при использовании мелассы – 92%. При 50°C использование диоксида углерода влияло на процесс биоокисления в наибольшей степени. Степень окисления пирита при 50°C составила в контрольном эксперименте 35%, при использовании CO2 – 53%, при использовании мелассы – 36%. Степень окисления арсенопирита во всех вариантах эксперимента была выше и составила: в контрольном эксперименте 89%, при использовании CO2 – 95%, при использовании мелассы – 82%. Степень извлечения золота в контрольном эксперименте при 50°C составила 89%, при использовании CO2 – 92%, при использовании мелассы – 87%. При 40°C источники углерода практически не влияли на состав микробных популяций, а преобладали рр. Leptospirillum (34–40%), Acidithiobacillus (19–27%) и Ferroplasma (34–39%). При 45°С в популяциях всех реакторов была высока доля рр. Acidithiobacillus (26–33%), Ferroplasma (13–25%) и Acidiplasma (16–59%), а в контрольном реакторе относительно высока была также доля бактерий р. Sulfobacillus (5%). При использовании CO2 также высокой была доля архей р. Cuniculiplasma (11%) и некультивируемой группы A-plasma (11%). При 50°C во всех реакторах преобладали представители Acidithiobacillus (5–11%), Sulfobacillus (8–20%) и Acidiplasma (53–60%), а также неизвестные представители р. Acinetobacter (9–16%) При температурах 45 и 50°C в реакторе, куда подавали CO2, общая численность клеток микроорганизмов была в 2-3 раза выше, чем в других реакторах. Таким образом, полученные результаты показывают, что использование CO2 в качестве дополнительного источника углерода может рассматриваться как способ предотвращения ингибирования биоокисления сульфидных концентратов при повышении температуры, а его эффект на биоокисление может объясняться влиянием на состав микробных популяций реакторов. В рамках направления «Разработки биотехнологий для нефтедобывающей промышленности» были исследованы физико-химические характеристики пластовых вод из ряда нефтяных месторождений с песчаными и карбонатными коллекторами и высокой минерализацией пластовых вод. В результате молекулярно-экологических исследований проб пластовой воды и их биоинформатического анализа была получена информация о разнообразии бактерий и архей в нефтеносных горизонтах с разными физико-химическими условиями, температурой пласта и соленостью пластовой воды. Получены новые сведения о представленности и доминировании микроорганизмов основных метаболических групп – сульфатредуцирующих, бродильных, синтрофных и метаногенных, в нагнетаемой и пластовой воде и зависимости состава микробного сообщества от геохимических параметров местообитания. Применение микробных технологий увеличения нефтеизвлечения в пластах с высоким содержанием сульфатов может приводить к увеличению сульфидогенеза и должно сопровождаться мероприятиями по подавлению процесса сульфатредукции путем нагнетания биоцидов или нитрата. Сульфатредуцирующие и тиосульфатредуцирующие представители разных таксономических групп различаются уровнем устойчивости к биоцидам. Показано, что сульфидогенные сообщества нефтяного пласта существуют в виде биопленок, более устойчивых к воздействию биоцидов и нитратов, чем планктонные формы. Сульфатредуцирующие прокариоты обитают также в пластах, не содержащих сульфатов, и вызывают коррозию стали за счет синтрофного роста с метаногенами, в том числе с использованием электрон-проводящих нанотрубок. Бродильные бактерии филума Spirochaetes являются обычными компонентами микробных сообществ низкотемпературных нефтяных пластов. В 2020 году участниками коллектива исполнителей Проекта были выделены галотолерантные сферохеты из нефтяных пластов Татарстана и отнесены к новому виду Sphaerochaeta halotolerans (Bidzhieva et al., 2020). В рамках настоящего Проекта было выполнение обобщение результатов таксономических исследований сферохет. Полученные в ходе работ первого года результаты по составу и метаболическому потенциалу исследуемых микробных сообществ являются основой для последующих работ в области генетической инженерии этих консорциумов.

Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Во второй год выполнения проекта в рамках направления «Разработка микробных биотехнологий очистки сточных вод от соединений азота и фосфора» было исследовано влияние изменения режима аэрации на анаммокс процесс и состав микробного консорциума. С использованием лабораторной установки определена концентрация растворенного О2, при которой эффективность удаления азота снижалась более чем на 50%. После восстановления в реакторе оптимального уровня кислорода наблюдалось быстрое (в течение 4 сут) восстановление эффективности удаления азота до исходного уровня, что свидетельствует об обратимости ингибирования. После 24 ч инкубации при ингибирующих концентрациях О2, во внешней биопленке на загрузке снижется доля анаммокс-бактерий (с 6.4 до 3.2%). Такой результат может быть связан как с гибелью и вымыванием мертвых клеток с загрузки, так и с миграцией клеток во внутренние слои биопленки, где концентрация кислорода ниже. Также снизились доли представителей семейств Leptospiraceae, Terrimicrobiaceae, Micavibrionaceae, Rhizobiaceae и др. что указывает на чувствительность этих бактерий к кислороду. Напротив, увеличилась в 2 и более раз доля бактерий семейств Rhodocyclaceae, Opitutaceae, Competibacteraceae, Phycisphaeraceae, Xanthobacteraceae и некультивируемых планктомицетов, что указывает на аэробный и/или факультативно анаэробный метаболизм представителей данных семейств. Выявлена стратификация прикрепленного на загрузке активного ила. Основная масса анаммокс-бактерий располагалась в толще носителя, куда затруднена диффузия О2. Снаружи носителя нарастал толстый слой биомассы, состоящей преимущественно из аэробных и факультативно анаэробных бактерий. Проведено секвенирование метатранскриптома анаммокс-сообщества в условиях нормальной и повышенной аэрации. В условиях длительного культивирования в биореакторе последовательно-периодического действия получено стабильно функционирующее микробное сообщество, обогащенное фосфат-аккумулирующими организмами (ФАО). Сообщество обладало высоким отношением количества выброшенного фосфора к потребленному ацетату в анаэробную фазу цикла, высокой зольностью биомассы, высоким содержанием в ней фосфора и удаляло фосфор из среды с эффективностью 86.4%. Клетки ФАО содержали одно включение, занимающее почти весь внутриклеточный объем. Установлено, что фосфор в клетках ФАО находится в виде полифосфата. Установлено, что ФАО, доминирующие в реакторе, принадлежали к типам IIB, IC и IIC Ca. Accumulibacter. Известно, что ФАО, относящиеся к типу I, способны сочетать восстановление нитратов с поглощением фосфора. В результате метагеномного анализа были реконструированы пути метаболизма микроорганизмов, доминирующих в сообществе. Собранные геномы Ca. Accumulibacter содержали гены транспорта и усвоения ацетата. В геноме Ca. Accumulibacter IC обнаружен ген acdAB (acetate-CoA ligase), продукт которого участвует в обратном превращении ацетил-КоА в ацетат. Все геномы Ca. Accumulibacter содержат полный набор генов пути синтеза и расщепления гликогена, транспорта фосфатов и синтеза полифосфатов. В рамках направления Разработка биогидрометаллургических технологий извлечения цветных и благородных металлов» было проведено биовыщелачивание медно-цинкового концентрата в разных условиях. Концентрат содержал 16% меди, 5.3% цинка, 1.7% мышьяка, 28% железа, 33.2% сульфидной серы. Основными минералами концентрата были халькопирит, теннантит, сфалерит, пирит и кварц. Исследовали влияние источников углерода на процесс биовыщелачивания меди и цинка, добавляя в пульпу мелассу или CO2 при разных температурах биоокисления (45 и 55°С) При 45°C в непрерывном режиме различие в выщелачивании меди и цинка было малозначительным. Извлечение меди в контроле, при использовании CO2 и мелассы в непрерывном режиме составило 27.3, 28.1 и 25.1 %, а цинка - 53.2, 64 и 54.9%. При 45°C во всех вариантах эксперимента активность процесса биовыщелачивания была высокой. Микробные популяции в реакторах также различались в незначительной степени. В непрерывном режиме при 45°C во всех реакторах была высока доля архей рода Cuniculiplasma и Ferroplasma. Среди бактерий доминировали Sulfobacillus во всех экспериментах. А доли бактерий рода Acidithiobacillus в реакторах значительно различалась от 0.5% (контроль) до 9.9% (меласса). При 55°C влияние дополнительных источников углерода на процесс биовыщелачивания отличалось от эффекта, который наблюдался при 45°C. При этом степень извлечение металлов во всех вариантах было выше, чем при 45°C, что может говорить о влиянии температуры на процесс окисления минералов. При 55°C различие в выщелачивании меди и цинка было более значительным. Извлечение меди в контроле, при использовании CO2 и мелассы в непрерывном режиме составило 43.1, 36.0 и 52.2 %, а цинка составило 58.3, 91.4 и 57.6%, соответственно. При 55°C во всех вариантах эксперимента активность процесса биовыщелачивания была ниже: поддержание pH во всех реакторах требовало внесения серной кислоты, Eh жидкой фазы пульпы во всех вариантах был выше 730 мВ при использовании CO2 и в остальных 600-630 мВ. Общие концентрации ионов железа были примерно в 2 раза ниже, чем при 45°C. Таким образом, активность биоокисления пирита при 55°C была ниже, тогда как выщелачивание меди и цинка происходило активно несмотря снижение активности микробных популяций, что возможно за счет повышения температуры. Микробные популяции в реакторах также различались в незначительной степени. В непрерывном режиме при 55°C во всех реакторах была высока доля архей рода Ferroplasma. Среди бактерий доминировали рода Sulfobacillus и Leptospirillum . Доля архей рода Cuniculiplasma в реакторах значительно различалась от 0,96% (CO2) до 7.7% (контроль). В результате метагеномного анализа ацидофильного микробного консорциума осуществляющего биоокисление при 45С были собраны геномы основных микроорганизмов и реконструированы пути их метаболизма. В рамках направления «Разработка биотехнологий для нефтедобывающей промышленности» были выполнены исследования микробных сообществ с использованием метагеномных подходов. Показано, что в пластовой воде из добывающей скважины 15500, доминирует бактерия рода Desulfovibrionales. В пробе нагнетаемой воды 1, представленной пластовой водой, отделенной от нефти, состав сообщества был близок к составу прокариот в воде из добывающей скважины. В исследуемом образце доминировали бактерии рода Halanaerobium, способные вызывать коррозию нефтепромыслового оборудования. В целом, было собрано 72 генома бактерий и архей, имеющих полноту сборки более 80% и загрязнение менее 10%. Выявлены прокариоты, осуществляющие в нефтяном пласте ключевые микробные процессы и реконструирован их метаболизм. Из нефтяных пластов получены консорциумы анаэробных бактерий, включающие бродильные и сульфатвосстанавливающие бактерии, и определен их состав. Биоинформатический анализ показал потенциальную способность бактерий, входящих в консорциумы, осуществлять брожение ряда сахаров и белковых субстратов и участвовать в метаболизме серных соединений. Консорциумы, продуцирующие наибольшие количества спиртов и летучих кислот, были использованы для подбора субстратов роста, позволяющих получить максимальное количество нефтевытесняющих метаболитов и для выделения чистых культур. Из анаэробных консорциумов выделено и идентифицировано 20 чистых культур анаэробных бродильных и сероредуцирующих бактерий, а также бактерий родов Mesobacillus, Cytobacillus и Bacillus, растущих аэробно на н-алканах нефти. Выделенные штаммы бродильных бактерий восстанавливали сульфит и/или тиосульфат с образованием сульфида и являются потенциальными агентами коррозии нефтепромыслового оборудования, а также могут снижать качество нефти и газа. Показана принадлежность трех штаммов к новому виду рода Sphaerochaeta. Выделены два штамма 5S69 и 9FUS сульфатвосстанавливающих бактерий, секвенированы и депонированы в GenBank их геномы. Сравнительный филогеномный анализ показал принадлежность штаммов к двум новым видам рода Pseudodesulfovibrio.

Аннотация результатов, полученных в 2023 году
В ходе выполнения проекта в рамках направления «Разработка микробных биотехнологий очистки сточных вод от соединений азота и фосфора» были получены следующие основные результаты. На двух типах реакторов с плавающим и стационарным носителями прикрепленного биоценоза, работающими в циклически-периодическом режиме, экспериментально апробированы подходы по инженерии анаммокс-сообществ путем воздействия физических и химических факторов. Анализ метатранскриптомных данных, полученных при эксплуатации реактора в режиме нормальной и повышенной аэрации показал, что через сутки после воздействия изменялось количество транскриптов генов метаболизма аминокислот, углеводов, ко-факторов и витаминов, ксенобиотоков, энергетического метаболизма, сигнальной трансдукции, трансляции и др. У анаммокс-бактерий при повышенной аэрации возрастала экспрессия генов, кодирующих шапероны и белки теплового шока, кислород-связывающий белок гемеритин, мультимедные оксидазы, трансмембранные рецепторы хемотаксического ответа, нитрит/нитрат оксидоредуктазы (NXR); нитритредуктазы (NirB) диссимиляционного восстановления нитрата в аммоний, гидроксиламиноксидоредуктазы (Hao). В условиях повышенной аэрации происходило переключение процесса нитритации/анаммокс на циркуляцию окисленных форм азота – продуктов окисления аммония. Также продемонстрировано, что эффективность удаления азота в зависимости от концентрации сульфида. Выявлено, что чувствительность к сульфиду обусловлена воздействием на нитрификаторов I стадии, у которых ниже порог чувствительности, чем у анаммокс-бактерий. Метатранскриптомный анализ ответа микробного сообщества на возрастание концентрации сульфида выявил снижение транскрипции ключевых генов анаммокс-реакции – нитрит редуктаз и гидразин синтаз. При этом уровень транскрипции гидразин дегидрогеназы не изменяется. Добавление сульфида привело к значительному снижению транскрипции генов аммоний-монооксигеназы у нитрификаторов порядка Nitrosomonodales. Транскрипция большинства генов цикла серы после добавления сульфида увеличилась в два и более раза. Выявлено полное ингибирование процесса анаммокс через 24 ч после повышения рН до 9. Сравнение трех видов плавающих носителей прикрепленного биоценоза выявило более быстрое накопление массы активного ила при запуске реакторов на новых ЭТЕК-биочипсах по сравнению с известными носителями (БФ33 и MutagBioChip), более высокую удельную активность при использовании ЭТЕК-биочипсов. Проведены исследования по определению спектра органических веществ, используемых Ca. accumulibacter. С этой целью определены скорости поглощения кислорода (СПК) обогащенной Ca. accumulibacter культурой после добавления 17 органических субстратов. Показано, что все указанные субстраты вызывают циклирование фосфатов, а в результате анализа генома Ca. Accumulibacter были обнаружены гены их транспортных систем. Расширение спектра используемых Ca. Accumulibacter субстратов позволит оптимизировать технологию удаления биогенных элементов из сточных вод. В рамках направления «Разработка биогидрометаллургических технологий извлечения цветных и благородных металлов» были получены следующие основные результаты: 1. В модельных экспериментах было изучено биоокисление сульфидных минералов типичных для золотосодержащих концентратов: пирита, арсенопирита, а также пирротина, и полиметаллических медно-цинковых руд и концентратов: халькопирита и сфалерита выделенным штаммом Acidiplasma sp. и умеренно-термофильныи сероокисляющим автотрофным штаммом Acidithiobacillus caldus MBC-1. Штамм A. сaldus практически не выщелачивал пирит, что объясняется тем фактом, что данный штамм не способен к биоокислению двухвалентного железа. Исследуемый штамм Acidiplasma sp. окислял пирит в чистой культуре с достаточно низкой скоростью, во всех вариантах эксперимента несмотря на то, что штамм способен окислять двухвалентное железо, что является наиболее важным для биоокисления пирита. Самые высокие степени выщелачивания пирита были достигнуты в экспериментах со смешанными культурами, при этом степень выщелачивания зависела от концентрации ДЭ в среде. Окисление пирита, арсенопирита и пирротина в разных условиях показало, что зависимость степени выщелачивания от состава микробной культуры, температуры, присутствия ДЭ, различались, что может объясняться различиями кристаллического строения данных минералов и механизмов их окисления. При биоокислении сфалерита и халькопирита изучаемым штаммом было выщелочено 4,8 и 7,0% цинка и меди соответственно. При этом на 8-10 сут эксперимента происходило замедление скорости извлечения металлов, что свидетельствует о снижении активности штамма. Биоокисление минералов сопровождалось активным ростом штамма. Был проведен транскриптомный анализ в процессе окисления сульфидных минералов культурой Acidiplasma sp. E1. Полученные данные о механизмах биовыщелачивания являются основой для дальнейших работ в области генной инженерии, направленной на улучшение бивыщелачивания. Было проведено исследование влияния разных концентраций органического источника углерода на биоокисление золотосодержащего пирит-арсенопиритного флотоконцентрата, а также на состав микробных популяций, которые сформировались в процессе биоокисления. Активность биоокисления повышалась с повышением концентрации мелассы в среде. Таким образом, результаты работы на данном этапе указывают на то, что активность биоокисления пирит-арсенопиритного концентрата зависела от концентрации мелассы в среде, при этом в большей степени зависело окисление пирита. В непрерывном режиме концентрация мелассы в значительной степени влияла на общую численность микроорганизмов, тогда как относительная численность микроорганизмов различных групп была близкой. Результаты данной работы показали, что можно повысить эффективность биогидрометаллургических процессов за счет применения дешевых органических субстратов. В рамках направления «Разработка биотехнологий для нефтедобывающей промышленности» были выполнены исследования микробных сообществ из нефтяных пластов с использованием микробиологических и метагеномных подходов и физического моделирования вытеснения нефти. Выделены накопительные и чистые культуры бродильных бактерий, образующих значимые количества нефтевытесняющих соединений – летучих кислот, спиртов и углекислоты. На моделях нефтяных пластов, имитирующих условия карбонатных нефтяных коллекторов, проверено влияние микробных композиций на вытеснение нефти. Нагнетание культуральной жидкости штамма Sphaerochaeta sp. 1S37 в модели приводило к дополнительному вытеснению от 10.4% до 16% нефти по сравнению с заводнением. Это свидетельствует о перспективности использования штамма для дальнейших исследований, а также возможности применения на нефтяных пластах с высокой минерализацией закачиваемых и пластовых вод. Исследованы морфология, физиология и спектр используемых субстратов трех штаммов (1S37, 1S48 и 4SSU) бродильных бактерий рода Sphaerochaeta. Штаммы характеризуются высокой скоростью роста при повышенной солености среды, образуют этанол, ацетат, пропионат, и углекислоту в процессе сбраживания ряда сахаров. Геномный анализ штаммов 1S37 и 1S48 показал их принадлежность к новому виду рода Sphaerochaeta. С использованием метагеномных подходов показано, что сульфатвосстанавливающие бактерии родов Desulfoplanes, Desulfotignum и Pseudodesulfovibrio доминируют в составе микробных сообществ нефтяных пластов с высокой соленостью пластовой воды и высоким содержанием сульфатов и сероводорода. Анализ фенотипических признаков и филогеномный анализ умеренно галофильной сульфатвосстанавливающей бактерии, позволяет отнести штамм 5S69 к новому виду рода Pseudodesulfovibrio. Штаммы сульфатвосстанавливающих бактерий могут быть использованы для определения их коррозионной активности и оценки эффективности биоцидов, применяемых при добыче нефти. Выделена из нефтяных пластов и описана новая углеводородокисляющая бактерия Ensifer oleiphilus sp. nov.