КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 21-76-00040

НазваниеИзучение метаболомного профиля новых перспективных штаммов бактерий родов Bacillus и Pseudomonas для биологического контроля фитопатогенных грибов

РуководительТомашевич Наталья Сергеевна, Кандидат сельскохозяйственных наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный научный центр биологической защиты растений", Краснодарский край

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2021 - 06.2023 

Конкурс№60 - Конкурс 2021 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки, 06-104 - Агробиотехнологии

Ключевые словаштамм, бактерия, метаболит, метаболом, хроматография, биоавтография, ТСХ, ESI-Q-TOF масс-спектрометр, хромато-масс-спектры

Код ГРНТИ68.03.07


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Проект посвящен изучению метаболомного профиля новых перспективных штаммов бактерий для биологического контроля фитопатогенных грибов. Научная новизна проекта заключается в том, что впервые с использованием стандартных и оригинальных методов будет изучен антигрибные метаболиты четырех новых штаммов бактерий рода Bacillus и двух штаммов бактерий рода Pseudomonas. Исследование природы активных метаболитов, определяющих биоконтрольные свойства ризосферных микроорганизмов, необходимо для создания исчерпывающих генетических паспортов и понимания механизмов действия штаммов родов Bacillus и Pseudomonas. В дальнейшем это будет способствовать управлению биоконтрольными свойствами микроорганизмов в процессе получения биопрепаратов нового поколения на их основе. Работы, направленные на изучение биологически активных микробных метаболитов, обладающих защитными свойствами и индуцирующих устойчивость растений к болезням, позволяют понять уровень потенциала изучаемых штаммов для дальнейшего научного обоснования перспектив их применения в биологической защите растений от фитопатогенных микроорганизмов. В связи с комплексным подходом к научной проблеме и разнообразием методических приемов, в том числе самых современных, ожидаемые результаты будут соответствовать мировому уровню.

Ожидаемые результаты
В результате реализации проекта впервые с использованием стандартных и оригинальных методов будет изучен метаболомный профиль четырех новых штаммов бактерий рода Bacillus и двух новых штаммов бактерий рода Pseudomonas, являющихся перспективными для разработки на их основе биопрепаратов против фитопатогенных грибов. В процессе изучения метаболомного профиля бактерий будет оценена не только антигрибная активность вторичных метаболитов новых бактерий, но и впервые получена их спектрометрическая характеристика. Большинство поставленных задач подразумевает получение приоритетных данных, имеющих научную новизну. Таким образом, исследования, направленные на анализ биологически активных метаболитов штаммов бактерий родов Bacillus и Pseudomonas, обладающих защитными свойствами и индуцирующих устойчивость растений к болезням, позволят оценить уровень потенциала изучаемых штаммов для дальнейшего научного обоснования перспектив их применения в биологической защите растений от фитопатогенных микроорганизмов. В связи с этим исследование природы и механизмов действия метаболитов в отношении вредных организмов является актуальной задачей в области агробиотехнологии. В связи с комплексным подходом к научной проблеме и разнообразием методических приемов, в том числе самых современных, ожидаемые результаты будут соответствовать мировому уровню. Выполнение поставленных задач в рамках проекта будет способствовать решению актуальных вопросов экологизации земледелия и получения экологически безопасных продуктов.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2021 году
Работа посвящена изучению антигрибных метаболитов новых штаммов бактерий рода Bacillus, перспективных для разработки на их основе биопрепаратов фунгицидного действия. Проведено культивирование штаммов B. siamensis BZR 86, B. amyloliquefaciens BZR 277, B. velezensis BZR 517, B. velezensis BZR 336g при оптимальных условиях. Методом экстракции, тонкослойной хроматографии, а также ВЭЖХ путем сравнительного анализа с использованием стандартных метаболитов (Sigma-Aldrich) из супернатантов жидких культур бактерий выделены метаболиты липопептидной природы. Изучение антигрибной активности метаболитов с применением метода биоавтографии позволило получить предварительные результаты о способности изучаемых штаммов бактерий продуцировать антигрибные липопептиды. Обнаружено, что соединения сурфактиновой, итуриновой и фенгициновой структур синтезируются всеми изучаемыми бактериями, но в различных количествах. Это можно констатировать по результатам, полученным при исследованиях методом ТСХ и биоавтографии по выявлению соответствующей хроматографической подвижности. На биоавтограмме с тест-культурой гриба F. oxysporum var. orthoceras BZR F6 наиболее выражена зона сурфактина (Rf 0,70) у штаммов B. velezensis BZR 336g и B. amyloliquefaciens BZR 277. Зона ингибирования гриба метаболитом итуриновой природы (Rf 0,21-0,25) наибольшая по площади у штамма B. amyloliquefaciens BZR 277, наименьшая – у штаммов B. siamensis BZR 86 и B. velezensis BZR 336g. Незначительная зона ингибирования тест-культуры гриба метаболитом фенгициновой природы отмечалась только у штамма B. siamensis BZR 86. На биоавтограммах с тест-культурой гриба F. oxysporum var. orthoceras BZR F6 обнаруживались также довольно значительные по площади зоны полного подавления роста тест-гриба (фунгицидность) (Rf 0,93-0,95) – неидентифицированные антигрибные соединения, которые нуждаются в дополнительной идентификации. На биоавтограмме с тест-культурой гриба Alternaria sp. BZR F12 у штаммов B. siamensis BZR 86, B. amyloliquefaciens BZR 277, B. velezensis BZR 517, B. velezensis BZR 336g отсутствует зона ингибирования метаболитом итуриновой природы, что может свидетельствовать о его низкой концентрации в образцах. Результаты, полученные на биоавтограммах с применением двух грибов, отличаются, вероятно, за счет различий в механизмах воздействия метаболитов на фитопатогенные грибы. Результаты тонкослойной хроматографии и биоавтографии, свидетельствующие о способности бактерий рода Bacillus синтезировать липопептиды сурфактиновой, итуриновой и фенгициновой структур, подтверждаются ВЭЖХ-МС анализом. Количественный анализ с применением ВЭЖХ-МС позволяет констатировать, что штаммы B. velenzensis BZR 336g и B. amyloliquefaciens BZR 277 продуцируют значительно больше сурфактина, чем B. siamensis BZR 86 и B. velezensis BZR 517. Содержание липопептидов итуриновой природы в жидкой культуре штаммов B. velezensis BZR 517 и B. velenzensis BZR 336g почти в 20 раз выше, чем в двух других. По способности продуцировать фенгицины штаммы B. velezensis BZR 517 и B. velenzensis BZR 336g также опережают штаммы B. siamensis BZR 86 и B. amyloliquefaciens BZR 277. В целом проведенные исследования с использованием двух аналитических методов позволяют обнаружить, что исследуемые штаммы бактерий рода Bacillus продуцируют все три антигрибных липопептида: сурфактин, фенгицин, итурин. Это весьма важно, поскольку идентифицированные метаболиты способны не только в отдельности подавлять фитопатогенные грибы, но и усиливать антигрибной эффект за счет их синергизма. Способность бактерий продуцировать значительное количество сурфактина и его гомологов является положительным фактом, поскольку данный липопептид может индуцировать устойчивость растений к фитопатогенам, а также усиливать биологическую активность других антигрибных метаболитов. Это позволяет сделать вывод о возможности рассматривать все четыре штамма рода Bacillus из Биоресурсной коллекции ФГБНУ ФНЦБЗР «Государственная коллекция энтомоакарифагов и микроорганизмов» в качестве возможных продуцентов эффективных биофунгицидов.

 

Публикации


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Работа посвящена изучению антигрибных метаболитов новых штаммов бактерий рода Pseudomonas, перспективных для разработки на их основе биопрепаратов фунгицидного действия. Проведено культивирование штаммов P. chlororaphis BZR 245-F и P. fulva BZR 523-2 при оптимальных условиях. Методом экстракции, тонкослойной хроматографии, а также ВЭЖХ-МСВР путем сравнительного анализа с использованием стандартного метаболита (Sigma-Aldrich, США) из супернатантов жидких культур бактерий выделены метаболиты феназиновой природы. Изучение антигрибной активности метаболитов с применением метода биоавтографии позволило получить предварительные результаты о способности изучаемых штаммов бактерий продуцировать антигрибные метаболиты. Обнаружено, что соединения синтезируются всеми изучаемыми бактериями, но в различных количествах. Это можно констатировать по результатам, полученным при исследованиях методами ТСХ и биоавтографии. На биоавтограмме с тест-культурой гриба F. oxysporum var. orthoceras BZR F-6 наибольшей по площади зона феназиновой природы была у штамма P. chlororaphis BZR 245-F. На биоавтограмме с тест-культурой гриба Alternaria sp. BZR F-12 у штаммов зона феназиновой природы была слабо выраженной. Результаты, полученные на биоавтограммах с применением двух грибов, отличались, вероятно, за счет разного механизма действия метаболитов на фитопатогены. При количественной оценке синтезированных метаболитов по величине площади сигнала, следует отметить, общее содержание соединений феназиновой природы у бактерий штамма P. chlororaphis BZR 245-F было гораздо выше, чем штамма P. fulva BZR 523-2. Выявлена способность бактерий P. fulva BZR 523-2 продуцировать пиолютеорин, который ингибирует рост грибов, бактерий и нематод. Бактерии P. chlororaphis BZR 245-F и P. fulva BZR 523-2 продуцировали циклопептиды (дипептиды). Также было отмечено присутствие жирных кислот, причем их количество выше для штамма P. chlororaphis BZR 245-F. В целом проведенные исследования с использованием аналитических методов позволяют обнаружить, что исследуемые штаммы продуцируют метаболиты, способные подавлять рост фитопатогенных грибов. Это позволяет сделать вывод о возможности рассматривать штаммы из Биоресурсной коллекции ФГБНУ ФНЦБЗР «Государственная коллекция энтомоакарифагов и микроорганизмов» в качестве возможных продуцентов эффективных биофунгицидов в качестве возможных продуцентов эффективных биофунгицидов. https://vk.com/fncbzr?w=wall-213388145_548 – страница ФГБНУ ФНЦБЗР ВКонтакте https://t.me/fncbzr/212 – Телеграмм-канал ФГБНУ ФНЦБЗР

 

Публикации

1. Сидорова Т.М., Томашевич Н.С., Аллахвердян В.В., Туперцев Б.С., Костюкевич Ю.И., Асатурова А.М. The study of new promising bacteria-antagonists of Pseudomonas strains metabolites to increase the effectiveness of fungicidal biological preparations based on them Microorganisms, - (год публикации - 2023)

2. Сидорова Т.М., Томашевич Н.С., Аллахвердян В.В., Туперцев Б.С., Костюкевич Ю.И., Асатурова А.М. New Pseudomonas Bacterial Strains: Biological Activity and Characteristic Properties of Metabolites Microorganisms, 11(8), 1943 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/microorganisms11081943

3. Томашевич Н.С., Сидорова Т.М., Аллахвердян В.В., Асатурова А.М. Изучение метаболитов новых перспективных штаммов бактерий-антагонистов рода Bacillus для повышения эффективности биопрепаратов фунгицидного действия на их основе Юг России: экология, развитие, - (год публикации - 2023)

4. Томашевич Н.С., Сидорова Т.М., Аллахвердян В.В., Асатурова А.М. Изучение метаболитов новых перспективных штаммов бактерий‐антагонистов рода Bacillus для повышения эффективности биопрепаратов фунгицидного действия на их основе Юг России: экология, развитие, 18(2):70‐81 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.18470/1992-1098-2023-2-70-81

5. - Сотрудники лаборатории микробиологической защиты растений стали победителями гранта РНФ Телеграмм-канал ФГБНУ ФНЦБЗР, - (год публикации - )

6. - Сотрудники лаборатории микробиологической защиты растений стали победителями гранта РНФ Страница ФГБНУ ФНЦБЗР ВКонтакте, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Изученные в проекте штаммы бактерий родов Bacillus и Pseudomonas из Биоресурсной коллекции Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный научный центр биологической защиты растений» «Государственная коллекция энтомоакарифагов и микроорганизмов» являются перспективными для разработки на их основе биопрепаратов для защиты растений от фитопатогенных грибов. Результаты работы по проекту помогают понять механизмы действия исследуемых штаммов, что является важным для разработки технологий получения и применения средств защиты растений на их основе. Появление новых высокоэффективных биопрепаратов российского производства позволит снизить стоимость защитных мероприятий сельскохозяйственных культур, а также позволит повысить доступность технологий биологической защиты растений и органического земледелия для сельхозтоваропроизводителей. Это, в свою очередь, будет способствовать снижению негативных последствий для окружающей среды и здоровья человека.