КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 19-14-00134

НазваниеРазработка гибридного метода биофизического моделирования электромеханической функции миокарда и машинного обучения для повышения эффективности диагностики и лечения хронической сердечной недостаточности

РуководительСоловьева Ольга Эдуардовна, Доктор физико-математических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт иммунологии и физиологии Уральского отделения Российской академии наук, Свердловская обл

Период выполнения при поддержке РНФ 2022 г. - 2023 г. 

Конкурс Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами» (35).

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-204 - Биофизика

Ключевые словаМатематическое моделирование, хроническая сердечная недостаточность, сердечная ресинхронизирующая терапия, моделирование сердца, клеточные модели, машинное обучение

Код ГРНТИ27.35.43


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Сердечная ресинхронизирующая терапия (СРТ), т.е. имплантация кардиостимуляторов, синхронизирующих возбуждение желудочков сердца, является эффективным способом лечения пациентов с хронической сердечной недостаточностью (ХСН), сопряженной с аномалиями проведения возбуждения по проводящей системе Гиса-Пуркинье (СГП). Вместе с тем действующие клинические рекомендации для отбора кандидатов для СРТ имеют низкую точность прогноза эффективности терапии, так по разным литературным данным от 30% до 50% пациентов не улучшают своего состояния после имплантации кардиостимуляторов данного типа. Частично эта проблема обусловлена недостатком фундаментальных знаний о различных фенотипах реализации ХСН и нарушений проведения по СГП в заведомо разнородной когорте пациентов. В то же время остаются нерешенные проблемы клинического исполнения имплантации и настройки стимулирующих электродов, не всегда обеспечивающих оптимальный вариант процедуры для конкретного пациента. Поэтому несмотря на многочисленные исследования в этой области, задачи повышения качества дооперационной стратификации пациентов и разработки оптимизированного персонифицированного протокола ресинхронизации желудочков остаются актуальными задачами фундаментальной и практической кардиологии. В завершенном Проекте 2019 мы выполнили масштабное комплексное мультидисциплинарное исследование факторов, влияющих на процессы ресинхронизации возбуждения желудочков сердца, и получили новые значимые результаты. Впервые, опираясь на собранный нами обширный клинический материал, мы разработали и применили гибридный подход для исследования эффективности СРТ при помощи биофизического моделирования электромеханической функции миокарда и методов машинного обучения. Мы разработали методику построения персонифицированных электрофизиологических моделей желудочков сердца на основе мультимодальных клинических данных ЭКГ, ЭХОКГ, КТ, МРТ и создали уникальную коллекцию из 62 таких моделей. В рамках популяции моделей мы проанализировали чувствительность активации желудочков и ЭКГ к вариации биофизических параметров миокарда и разработали процедуры персонализации параметров проводимости миокарда по индивидуальным записям ЭКГ, в том числе при помощи методов машинного обучения. Мы объединили клинические данные с модельными показателями электрической активности желудочков сердца на естественном ритме при блокаде левой ножки пучка Гиса (ЛНПГ) и при бивентрикулярной (БиВ) стимуляции желудочков, имитирующей процедуру СРТ, для машинного обучения классификаторов, предсказывающих вероятность улучшения сократительной функции желудочков в ответ на терапию. Нам удалось увеличить точность дооперационного прогноза вероятности успеха СРТ до 80%, что значительно превышает точность существующих моделей прогноза, основанных только на клинических данных. Мы разработали новый подход для построения и применения редуцированных моделей взамен детализированных трехмерных моделей механики левого желудочка (ЛЖ), который открывает дополнительные возможности и значительно облегчает использование компьютерных моделей для исследовательских целей и практических приложений в биомедицине. Результаты Проекта 2019 образуют солидный фундамент для продолжения исследований. Мы сформулировали пять новых задач для продолжения проекта в 2022-2023 гг. Они объединены общей проблемой исследования нарушений возбуждения и сокращения желудочков сердца у пациентов при ХСН с аномалиями проведения по СГП, а также поиском значимых биофизических параметров миокарда и проводящей системы, которые влияют на возможность восстановления функции при искусственной синхронизации возбуждения желудочков. Научные подходы и инструментарий, разработанные в рамках Проекта 2019, будут использованы при решении этих новых задач. Задача 1 связана с изучением роли структурных нарушений миокарда при ХСН, в том числе постинфарктных рубцовых зон и миокардиального фиброза, в процессах активации желудочков при нарушениях проведения по СГП и при искусственной стимуляции желудочков. Впервые в рамках популяции персонифицированных моделей с детализированным описанием фиброза мы планируем изучить зависимость паттернов активации миокарда и диссинхронии желудочков от размера, положения, фрактальности области фиброза, а также серой зоны, пограничной с нормальным миокардом. Впервые мы изучим влияние неоднородности проводимости и клеточных свойств миокарда на процессы активации и ответ на стимуляцию желудочков. Для количественной оценки значимости параметров для эффективности стимуляции желудочков мы будем использовать разработанные нами классификаторы ответа на СРТ на гибридных данных. Задача 2 дает начало новому направлению фундаментального исследования различных форм блокады ЛНПГ и их влияния на паттерны активации желудочков, показатели диссинхронии возбуждения и ЭКГ. Различные уровни блокады ЛНПГ, проксимальный или дистальный, предполагают принципиально различные способы лечения, в одном случае эффективной может быть селективная стимуляция пучка Гиса, в другом случае селективная стимуляция ЛНПГ в ее определенной области. В настоящее время не разработан неинвазивный метод классификации различных уровней блокады ЛНПГ. В связи с этим пилотные исследования особенностей возбуждения желудочков при различных уровнях блокады ЛНПГ на реалистичных моделях желудочков являются превосходной альтернативой экспериментальным и клиническим исследованиям. Такое исследование будет нами проведено впервые. Мы также изучим особенности электрофизиологического ответа моделей на стимуляцию различного типа и покажем, какие способы в лучшей степени минимизируют диссинхронию возбуждения миокарда при различных уровнях блокады ЛНПГ. Результаты модельных исследований мы сравним с клиническими данными, которые мы планируем получить в группе пациентов с ятрогенной блокадой ЛНПГ преимущественного проксимального уровня. Задача 3 связана с оптимизацией выбора положения стимулирующих электродов для БиВ стимуляции желудочков при помощи интегративных персонифицированных электрофизиологических моделей желудочков с учетом визуализации коронарного синуса и детализированной информации о фиброзе миокарда. Здесь в отличие от ранее предлагаемых подходов мы будем использовать разработанные нами классификаторы машинного обучения для оценки вероятности эффективности СРТ при различных положениях электродов с учетом анатомии коронарного синуса, определяющей доступную область для имплантации левожелудочкого электрода, и близости структурных повреждений миокарда, нарушающих проведение возбуждения. В результате мы разработаем алгоритм определения целевой вены и ее сегмента для имплантации электрода и выбора активного полюса для стимуляции. Предсказания модели мы планируем использовать в помощь врачу при планировании и проведении имплантации устройств СРТ. Задача 4 связана с разрабатываемой нами концепцией функциональной геометрии левого желудочка (ЛЖ) сердца, в рамках которой динамическое изменение формы ЛЖ в сократительном цикле, являясь отражением процессов электромеханического сопряжения в миокарде, несет в себе информацию о нарушениях этих процессов при сердечных патологиях. Мы планируем оценить характеристики пространственно-временной неоднородности сокращения ЛЖ сердца пациентов с ХСН и нарушениями проведения по СГП по данным динамических деформаций миокарда (стрейна), регистрируемых в ЭХОКГ исследовании сердца. Мы проанализируем связи между электрофизиологическими характеристиками возбуждения сердца и сокращения ЛЖ до и после СРТ. При помощи персонифицированных моделей и классификаторов ответа на СРТ мы оценим значимость характеристик функциональной геометрии ЛЖ для прогноза успешности СРТ. Задача 5 посвящена усовершенствованию разрабатываемых нами классификаторов ответа на СРТ на основе гибридных клинических и модельных данных за счет расширения набора данных и привлечения новых прогностических признаков, обнаруженных при решении задач 1-4. Кроме этого, мы построим модели для количественной оценки степени улучшения функции сердца, в том числе для прогноза величины увеличения фракции выброса или снижения конечно-диастолического объема ЛЖ. Все поставленные новые задачи продолжения проекта основываются на результатах Проекта 2019, при этом являются новыми и имеют масштабный комплексный мультидисциплинарный характер. Мы видим перспективу широкого применения разрабатываемого нами гибридного подхода с использованием клинических данных, персонифицированных моделей сердца и машинного обучения. Его можно будет использовать не только для прогноза эффективности СРТ, но и в будущем для решения других актуальных задач фундаментальной и клинической кардиологии. Мы считаем, что результаты планируемой работы откроют новые направления использования персонифицированных моделей и для фундаментальной науки, и для клинической медицины и будут иметь разнообразные приложения в биомедицине.

Ожидаемые результаты
В продолжении Проекта в 2022-2023 гг. будет решен ряд задач, результаты которых будут иметь и фундаментальное, и научно-прикладное значение. Используя популяцию персонифицированных электрофизиологических моделей желудочков сердца, мы оценим влияние биофизических параметров повреждений миокарда (инфаркта/фиброза): размера, пространственного распределения, фрактальности, неоднородности параметров проводимости и клеточного ремоделирования миокарда на характеристики возбуждения миокарда желудочков при ХСН с аномалиями проведения по системе Гиса-Пуркинье, а также характер ресинхронизации возбуждения желудочков при стимуляции. Впервые значимость этих параметров будет определена в прогностической модели ответа на СРТ. Будет построена усовершенствованная модель системы Гиса-Пуркинье, описывающая естественную анатомическую вариабельность проводящей системы. Впервые будет проведено моделирование блокады ЛНПГ на различных уровнях глубины и выявлены специфические характеристики активации и диссинхронии желудочков и их проявления на ЭКГ для проксимальной и дистальной блокады ЛНПГ. Будет проведено сравнение модельных результатов с клиническими данными при ятрогенной блокаде ЛНПГ, в результате которого будет оценена точность прогноза проксимальной блокады ЛНПГ при помощи модельных признаков. Будет оценена эффективность различных типов стимуляции желудочков (стимуляция проводящей системы или бивентрикулярная стимуляция) при различных уровнях блока ЛНПГ. Будет отработана методика совместной визуализации геометрии желудочков с зонами фиброза и коронарного синуса и интеграции этих мультимодальных данных в единую модель. Это позволит определить целевую вену для установки ЛЖ электрода и оценить вероятность успеха СРТ при оптимизированном выборе положения стимулирующих электродов. Будет проведено расширенное исследование пространственно-временной неоднородности сокращения левого желудочка пациентов с ХСН при блокаде ЛНПГ. Будут найдены связи между характеристиками активации и реполяризации желудочков по ЭКГ, данным неинвазивного электрокардиографического картирования и характеристиками локальной и глобальной деформации и изменения формы ЛЖ в течение сердечного цикла у пациентов до и после СРТ. На основе клинических данных и результатов персонифицированных моделей возбуждения желудочков будут определены значимые параметры пространственно-временной неоднородности деформации ЛЖ для прогноза успешности СРТ. С помощью методов машинного обучения будут определены фенотипы пациентов и проведена оценка связи полученных фенотипов с результативностью СРТ. Прогностические модели ответа на СРТ будут обучены на расширенных наборах с новыми данными, что должно увеличить точность классификации. Новая модель классификации впервые будет использована для исследования влияния различных параметров миокарда на эффективность стимуляции желудочков в рамках задач 1-4, а также для разработки алгоритма оптимизации местоположения стимулирующего ЛЖ электрода в интегративных моделях желудочков и коронарного синуса. На основе ретроспективных и проспективных данных будут построены регрессионные модели, которые позволят предсказать количественные характеристики ответа на СРТ: величину прироста фракции выброса и величину снижения конечно-систолического объема ЛЖ. Будет оценена их точность и возможность применения в клинических приложениях. Ожидаемые результаты проекта не только расширят фундаментальные знания по биофизике и физиологии сердца, но и создадут основу для разработки новых перспективных технологий для персонифицированной медицины.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Все запланированные на отчетный период исследования проведены и получены ожидаемые результаты. 1. На основе сегментации данных МРТ с отсроченным контрастированием построены 26 детализированных моделей миокардиального фиброза и интегрированы в персонифицированные геометрические модели желудочков. Проведено сравнение моделей детализированного фиброза с моделями упрощенной аннотации зон фиброза, построенными по схематической разметке поврежденных сегментов врачом радиологом. Показано, что точность детализации фиброза влияет на его объемные характеристики и частоту встречаемости сегментов желудочка с фиброзными включениями. Вместе с тем средние электрофизиологические характеристики диссинхронии активации миокарда значимо не отличаются в моделях с различной точностью описания фиброза и при собственный ритме с БЛНПГ, и при бивентрикулярной (БиВ) стимуляции желудочков. Выявлена высокая корреляция признаков в моделях с разной точностью фиброза. Результаты говорят в пользу возможности использования относительно грубых оценок положения и размеров фиброза для прогнозирования эффектов стимуляции желудочков. Проведена оценка возможности прогнозировать наличие постинфарктного рубца и определить его положение и размеры на основе ЭКГ. Построен датасет из 20000 модельных сигналов ЭКГ при различных вариантах расположения и размера постинфарктного рубца в персонифицированных моделях желудочков. На основе этих данных проведено машинное обучение классификатора, прогнозирующего наличие фиброза, и регрессионных моделей, предсказывающих его положение и размер. Построенные прогностические модели успешно выявляют рубцы размером более 5% объема миокарда. Точность определения рубцов на задней стенке ЛЖ -- низкая. Мы продолжим искать возможности уточнения прогностических моделей с учетом дополнительных данных. 2. Разработана усовершенствованная модель проводящей системы Гиса-Пуркинье. Для каждой из построенных нами 57 анатомических моделей желудочков протестировано несколько конфигураций левой и правой ножек пучка Гиса (ЛНПГ и ПНПГ): 10 моделей ПНПГ; 10 -- ЛНПГ с удаленной передней ветвью; 10 -- ЛНПГ с удаленной задней ветвью; 10 -- ЛНПГ без обеих ветвей; 10 моделей с несколькими уровнями блокады проводящей системы от дистального до проксимального блокада ЛНПГ. Всего проведено более 4000 вычислительных экспериментов. Показано монотонное увеличение полного времени активации желудочков (TAT), ширины QRS комплекса (QRSd), индекса межжелудочковой диссинхронии (AT_RVLV)) при изменении уровня блокады проводящей системы от дистального к проксимальному. Индекс внутрижелудочковой диссинхронии (mAT_STLV) меняется немонотонно в связи с особенностями активации межжелудочковой перегородки. На основе результатов моделирования построена прогностическая модель, предсказывающая уровень БЛНПГ на основе значений индексов диссинхронии активации. Наиболее значимыми предикторами уровня блокады оказались величины QRSd и TAT. Проанализировано влияние блокады различных ветвей ЛНПГ на параметры активации в рамках моделей. Построена прогностическая модель, с высокой точностью 0.94 (чувствительность 0.96, специфичность 0.95, площадь под ROC кривой 0.99) разделяющая варианты либо полной БЛНПГ или парной блокады 2-х ветвей ЛНПГ, либо блокаду единичной ветви ЛНПГ. Полученные результаты моделирования будут валидированы на клинических данных. В отчетный период проанализированы клинические данные ЭКГ 57 пациентов когорты, для которых были построены персонифицированные модели. БЛНПГ определяли при помощи различных клинических критериев, в том числе при помощи собственного критерия проксимальной БЛНПГ, предложенного на основе анализа данных ЭКГ пациентов после миоэктомии, приводящей к блокаде проксимальных отделов пучка Гиса и, как следствие, ПБЛНПГ. Показано, что модельные признаки диссинхронии активации желудочков значимо различаются в группах с выявленными признаками БЛНПГ и без них. При этом характер активации ЛЖ при выполнении критерия проксимальной БЛНПГ существенно отличается от случаев, где этот критерий не выполняется. Совместный анализ клинических и модельных данных будет продолжен с учетом новых результатов с целью получения высокоточной прогностической модели для определения характера и уровня блокады ЛНПГ. 3. Разработано 19 интегративных моделей, включающих данные о фиброзе, анатомии вен коронарного синуса и желудочков. С помощью разработанного нами ранее классификатора ответа на СРТ, обученного на клинических данных и результатах персонифицированного моделирования, протестирована зависимость оценки вероятности ответа на СРТ от выбора положения ЛЖ стимулирующего электрода в доступных венах коронарного синуса. Показано, что ML балл классификатора, дающий оценку вероятности успеха СРТ, может существенно изменяться при варьировании позиции электрода в целевых венах. Приведен пример возможной оптимизации позиции ЛЖ электрода для нереспондера на СРТ, у которого через год после имплантации устройств не наблюдалось улучшения фракции выброса ЛЖ при клиническом выборе расположения ЛЖ электрода. Вместе с тем наша модель предсказывает положительный ответ на стимуляцию для этого пациента при установке ЛЖ электрода в альтернативную вену. Разработанные нами модели позволяют до операции указать оптимальное местоположение ЛЖ электрода, оптимизирующее ответ на бивентрикулярную стимуляцию с учетом анатомии вен коронарного синуса и фиброза миокарда. В следующем году мы проверим эту гипотезу и построим алгоритм определения оптимального положения ЛЖ электрода, который можно будет применять в клинике. 4. Собраны и проанализированы клинические данные стандартного протокола ЭХОКГ и видео-записей изображений сердца в течение сердечного цикла у пациентов контрольной группы без сердечно-сосудистой патологии (n=34) и группы пациентов с ХСН, кандидатов на СРТ до (n=30) и после (n=23) имплантации устройств СРТ. Разработан новый метод морфометрического анализа динамики изменения формы ЛЖ в течение сердечного цикла в пространстве форм и пространстве траекторий. Показано, что морфометрические параметры значимо отличаются в контрольной группе и у пациентов с ХСН, ряд характеристик обладают прогностической значимостью и входят в классификаторы, со 100% точностью разделяющие норму и патологию. С помощью логистической регрессии на параметрах морфометрического анализа построен классификатор острого ответа на СРТ, определяемого по > 10% снижению конечно-систолического объема ЛЖ. Точность классификатора составила 87% (чувствительность 86% и специфичность 89%). Морфометрические признаки, характеризующие динамические деформации и кинематику стенки ЛЖ в сердечном цикле, демонстрируют корреляции с величинами глобального и локального стрейна и предложенными нами ранее характеристиками неоднородности движения стенки ЛЖ и индексами формы ЛЖ (индекс сферичности, конусности и сложности формы) до и сразу после СРТ, а также признаками ЭКГ (шириной QRS, QT комплекса). Начатый анализ будет продолжен по мере набора клинического материала для пациентов, обследуемых через год после установки СРТ устройств. 5. Новые результаты моделирования, полученные в рамках усовершенствованных моделей желудочков с детализированным описанием зон фиброза (п.1), были использованы для построения усовершенствованных классификаторов ответа на СРТ, прогнозирующих вероятность улучшения фракции выброса ЛЖ на 10% и более. Мы выяснили, что хотя расстояние от ЛЖ электрода до зоны фиброза (зависит от точности представления фиброза) является одним из наиболее значимых признаков в предсказательной модели, точность классификатора ответа на СРТ и его результаты практически не изменяются при обучении на данных с сегментированной зоной фиброза по сравнению с классификатором, обученном на результатах упрощенных моделей. Разница в точности классификаторов составляет всего 0.5%. Этот результат поддерживает гипотезу о возможности использовать упрощенные модели фиброза для надежного предсказания эффективности СРТ при отборе пациентов и планировании процедуры.

 

Публикации

1. Альборс С, Ллуч Э, Гомес Дж.Ф., Седильник Н., Монтрис К.А., Манси Т., Хамзин С., Докучаев А., Соловьева О., Пуэйо Э., Сермесант М., Себастьян Р., Моралес Х.Г., Камара О. Meshless electrophysiological modeling of cardiac resynchronization Therapy—Benchmark analysis with finite-element methods in experimental data. Applied Sciences (Switzerland), 2022;12(13) (год публикации - 2022) https://doi.org/10.3390/app12136438

2. Бажутина А.,Зубарев С.,Буданова М. Accuracy of cardiac scar and fibrosis geometry in ventricular models affects electrical dyssynchrony biomarkers and ML prediction score of CRT response. 2022 Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2022, pp. 280-283. (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1109/CSGB56354.2022.9865443

3. Хамзин С. Population Based Approach for Detection Myocardial Scar Based on 12-lead ECG: Simulation Study. 2022 Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2022, pp. 80-83. (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1109/CSGB56354.2022.9865264

4. Чумарная Т.В., Любимцева Т.А., Лебедева В.К., Гасымова Н.З., Лебедев Д.С., Соловьева О.Э. Оценка межжелудочковой электрической задержки при сердечной ресинхронизирующей терапии у пациентов с квадриполярными системами в долгосрочном послеоперационном наблюдении. Российский кардиологический журнал, 022;27(7):5121.с.60-69 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.15829/1560-4071-2022-5121


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
Все задачи, запланированные на отчетный период 2023 г., выполнены. Основным результатом проекта является разработка технологии оценки эффективности и оптимизации СРТ на дооперационном этапе с применением прогностической модели ответа на СРТ, предварительно обученной на клинических данных, результатах персонифицированного моделирования активации миокарда желудочков на собственном ритме и при бивентрикулярной стимуляции и данных послеоперационного обследования группы пациентов. Алгоритм предсказывает оптимальное расположение ЛЖ электрода на доступной поверхности ЛЖ, максимизирующее вероятность ответа на терапию данного пациента. В случае положительного прогноза алгоритм предоставляет карту поверхности ЛЖ с предпочтительными местами для стимуляции ЛЖ, включая оптимальное расположение. Показано, что установка ЛЖ электрода в близкой позиции к предсказанному оптимальному расположению, существенно увеличивает частоту положительных исходов кардиостимуляции и повышает ее качество. На способ оптимизации СРТ получен патент (4). Результаты исследования опубликованы в статье [1], Q1 в системе цитирования WoS и УБС1 согласно рейтингу Белого списка. Результаты доложены на нескольких всероссийских конференциях, включая конференции с международным участием. Согласно плану работ на этапе 2023 г. проведены следующие работы и получены результаты: 1.Проведено исследование влияния на характеристики диссинхронии активации положения в стенке ЛЖ и размера зоны структурно-функциональных нарушений миокарда (фиброза/постинфарктного рубца/пограничной зоны). Для решения этой задачи построена популяция персонифицированных моделей желудочков сердца с варьируемыми параметрами модельных зон повреждения миокарда. Протестированы различные варианты активации миокарда: собственный ритм пациента с блокадой левой ножки пучка Гиса (БЛНПГ) и бивентрикулярной (БиВ) стимуляцией. Показано, что наибольшее влияние на индексы диссинхронии активации желудочков оказывает размер структурного повреждения. Показано, что расстояние между ЛЖ электродом и зоной повреждения миокарда существенно увеличивая электрические индексы диссинхронии при малых расстояниях (<10 мм). Полученные результаты подтверждают важность определения локализации зоны структурных повреждений для предотвращения установки ЛЖ электрода вблизи этой зоны. Результаты опубликованы в статье [2], и доложены на конференции. 2. В серии клинических исследований показано, что в отличие от правожелудочковой миокардиальной стимуляции (без захвата проводящей системы сердца), при стимуляции проводящей системы сердца (стимуляция пучка Гиса, стимуляция ЛНПГ) у пациентов с сохранной проводящей системой сердца наблюдается узкий QRS комплекс, а также морфология ЭКГ и паттерн активации миокарда, близкие к нативному при нормальном синусовом ритме. У пациентов с БЛНПГ имплантация электрода в ЛНПГ затруднена в связи со сложность картирования целевой области для имплантации. Результаты позволяют предположить, что для пациентов с блокадой ЛНПГ результат стимуляции проводящей системы зависит от уровня блокады ЛНПГ и расположения стимулирующего электрода, указывая на необходимость дооперационной оценки уровня блокады ЛНПГ. Результаты представлены в статье [3], принятой в печать, а также доложены на X съезде аритмологов. Проведен набор клинических данных пациентов с ятрогенной блокадой ЛНПГ, вызванной миоэктомией при гипертрофии ЛЖ. Определены значимые признаки ЭКГ, свидетельствующие о наличии полной БЛНПГ. Данные визуализации сердца пациентов находятся в обработке, строятся персонифицированные модели, которые будут использованы для оценки паттерна активации миокарда у данных пациентов. С использованием персонифицированной модели желудочков проведено пилотное in-silico исследование влияния различных типов стимуляции миокарда, в том числе стимуляции проводящей системы, гисиальной стимуляции, БиВ стимуляции, на индексы диссинхронии миокарда. С применением нейронных сетей решена задача отыскания среди модельных ЭКГ, полученных при варьировании уровня блокады ЛНПГ, наиболее близких к клиническим данным. Этот алгоритм позволяет найти модель, описывающую экспериментальные данные, и предсказать результаты различных способов СРТ для конкретного пациента. Разработанная технология будет в последующем использована для идентификации блока проведения в проводящей системе и выбора оптимального варианта стимуляции. Представлен доклад на Конгрессе “Кардиостим 2023”, который награжден дипломом «Лучший доклад конгресса». 3. Разработанный нами алгоритм оптимизации положения ЛЖ электрода при помощи классификатора успешности СРТ применен для решения задачи выбора оптимальной вены коронарного синуса при имплантации устройств СРТ. Для группы пациентов из 19 человек построены персонифицированные модели желудочков с детализированными моделями постинфарктных или фиброзных повреждений миокарда, совмещенные с анатомическими моделями вен коронарного синуса. Для большинства пациентов в рассмотренной когорте наш алгоритм предсказывает негативный ответ на бивентрикулярную стимуляцию при любом трансвенозном расположении ЛЖ электрода, что соответствует отсутствию клинического ответа. В то же время, для нескольких пациентов из рассмотренной группы, алгоритм предсказывает положительный ответ при смене целевой вены. В последующем требуется валидация разработанного подхода на более широкой когорте пациентов. По результатам исследования опубликована статья [5], представлен доклад на конференции. 4. Собраны клинические данные пациентов до и после имплантации устройств СРТ, содержащие эхокардиографические записи нескольких сердечных циклов. На их основе разработан новый подход для анализа динамики изменения формы ЛЖ пациентов, опирающийся на методы обработки изображений. Морфометрические признаки, описывающие деформацию формы ЛЖ в течение сердечного цикла, оказались более информативными для прогноза эффективности ресинхронизирующей терапии по сравнению с клиническими данными и ранее предложенными нами характеристиками функциональной геометрии ЛЖ. На основе выявленных морфометрических признаков построены прогностические модели эффективности СРТ, позволяющие с точностью 81% (специфичность 77%, чувствительность 85%) разделить ответчиков и неответчиков на СРТ. Алгоритмы нахождения индексов динамики формы ЛЖ представлены в работе [6] и доложены на конференции. 5. Проведен анализ возможности построения регрессионных моделей для предсказания количественных характеристик ответа на СРТ с использованием клинических и модельных данных. Показано, что прогностические модели, учитывающие результаты моделирования электрической активации миокарда, способны предсказывать величину увеличения ФВ в результате бивентрикулярной стимуляции. При этом точность предсказания изменения КСО оказалась неудовлетворительно низкой. Эти результаты указывают на потребность включения дополнительных информативных индексов, характеризующих диссинхронию желудочков для более состоятельного прогноза количественного ответа на терапию. Проведено исследование прогностической значимости показателей векторной электрокардиограммы для прогноза эффективности СРТ. Показано, что индексы планарности векторограммы имеют высокую диагностическую значимость и могут быть включены в гибридный датасет клинических и модельных данных для построения более точных прогностических моделей эффективности СРТ. Результаты пилотного исследования опубликованы в работе [7] и представлены на конференции. Всего по материалам исследований, проведенных в рамках проекта в отчетный период опубликовано 7 работ, в том числе 2 статьи в журналах из УБС1, получены 4 свидетельства интеллектуальной собственности и представлено 16 докладов на высокоуровневых конференциях.

 

Публикации

1. Бажутина А.Е., Ушенин К.С., Хамзин С.Ю., Кабак В.Ю., Зубарев С.В., Лебедев Д.С., Соловьева О.Э. Personalized cardiac computer models and machine-learning for target vein selection in cardiac resynchronisation therapy 2023 Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2023,Page(s):236 - 241 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1109/CSGB60362.2023.10329851

2. Докучаев А.Д., Зубарев С.В., Поздина В.А., Терегулов Ю.Э., Лебедев Д.С. Vectorcardiogram Planarity Index Predicts Response to Cardiac Resynchronisation Therapy 2023 Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2023,Page(s):128 - 132 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1109/CSGB60362.2023.10329822

3. Докучаев А.Д., Курсанов А.Г., Балакина-Викулова Н.А., Кацнельсон Л.Б., Соловьева О.Э. The importance of mechanical conditions in the testing of excitation abnormalities in a population of electro-mechanical models of human ventricular cardiomyocytes Frontiers in Physiology, 2023. — V. 14. — 1187956 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3389/fphys.2023.1187956

4. Докучаев А.Д., Чумарная Т.В., Бажутина А.Е., Хамзин С.Ю., Лебедева В.К., Любимцева Т.А., Зубарев С.В., Лебедев Д.С., Соловьева О.Э. Optimization of left ventricular pacing site in cardiac resynchronization therapy using combination of personalized computational modeling and machine-learning Frontiers in Physiology, 2023. ‒ V.14. 1162520 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3389/fphys.2023.1162520

5. Медведь М.С., Зубарев С.В., Бажутина А.Е., Чумарная Т.В., Соловьева О.Э., Лебедев Д.С. Неинвазивное активационное картирование при электрокардиостимуляции проводящей системы сердца Вестник аритмологии, - (год публикации - 2024)

6. Рокеах Р.О., Чумарная Т.В., Зубарев С.В., Лебедев Д.С., Соловьева О.Э. Statistical shape analysis reveals specific features of left ventricular wall motion in patients with chronic heart failure 2023 Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2023,Page(s):231- 235 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1109/CSGB60362.2023.10329847

7. Хамзин С.Ю., Бажутина А.Е., Макаров А.Е. Influence of Myocardial Fibrosis on Ventricular Activation in LBBB and during Biventricular Pacing: Simulation Study 2023 Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine (CSGB), 2023,Page(s):227 - 230 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1109/CSGB60362.2023.10329835

8. Зюзин В.В., Чумарная Т.В., Рокеах Р.О., Бабаков В.О., Поршнев С.В., Соловьева О.Э. LKLVS - Lukas Kanade Left Ventricle Segmentation -, 2023619715 (год публикации - )

9. Рокеах Р.О. LVSSA - Left Ventricle Statistical Shape Analysis -, 2023680889 (год публикации - )

10. Соловьева О.Э., Бажутина А.Е., Докучаев А.Д., Рокеах Р.О., Хамзин С.Ю., Чумарная Т.В., Зубарев С.В., Лебедева В.К., Лебедев Д.С., Любимцева Т.А.. Способ прогнозирования эффективности сердечной ресинхронизирующей терапии с использованием оптимизации расположения стимулирующих электродов -, 2806486 (год публикации - )

11. Чумарная Т.В., Рокеах Р.О., Соловьева О.Э. LVFG - Left Ventricle Function Geometry -, 2023665251 (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
В рамках проекта разработан новый подход в направлении цифровизации медицины - использование функциональных механистических моделей не только для проведения фундаментальных исследований и отыскания механизмов патогенеза социально-значимых заболеваний, но и для практического использования для диагностики и планирования терапии. Симуляции на персонифицированных моделях становятся источником синтетических данных, используемых для уточнения прогноза ответа на терапию и оптимизации самой процедуры. Разработанные и апробированные нами алгоритмы могут лечь в основу создания программных продуктов, например, калькулятора вероятности ответа на СРТ и визуальной модели желудочков с разметкой доступных зон для установки электродов электрокардиостимулятора, который будут использоваться в составе цифровой системы поддержки принятия врачебных решений.