КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 19-15-00110

НазваниеЭпигенетическая регуляция дормантного состояния клеток меланомы

РуководительРукша Татьяна Геннадьевна, Доктор медицинских наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого" Министерства здравоохранения Российской Федерации, Красноярский край

Период выполнения при поддержке РНФ 2022 г. - 2023 г. 

Конкурс Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами» (35).

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-208 - Онкология

Ключевые словадормантность, меланома, микроРНК, miR-204-5p

Код ГРНТИ76.29.49


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Дормантное состояние опухоли представляет биологический феномен выхода опухолевых клеток из клеточного цикла в фазу покоя, G0. Индуцированное различными факторами, данное состояние характеризуется сниженным метаболизмом клеток и обратимостью при условии прекращения действия факторов, вызывающих ограничение нутриентов и факторов роста. Дормантные (дремлющие) опухолевые клетки характеризуются высокой резистентностью к апоптоз-индуцирующим стимулам, в том числе, противоопухолевым средствам. Последнее делает дорматные клетки одними из важных эффекторов развития лекарственной устойчивости. Нами было показано, что алкилирующий агент дакарбазин, в равной степени как и BRAFV600E ингибитор вемурафениб обладают способностью изменять уровень G0-положительных клеток меланомы , характеризующихся специфичным для дремлющих клеток профилем экспрессии, что сопровождается изменением уровня микроРНК miR-204-5p, осуществляющей регуляцию пролиферации посредством воздействия на транскрипционный фактор FOXC1. Нами было определено, что переход доли клеток меланомы в G0 сопровождается изменением экспрессии генов фокальной адгезии. Таким образом, клетки в G0 могут характеризоваться специфичным паттерном адгезивных молекул, в равной степени, как и специфичным характером взаимодействия с внеклеточным матриксом, микроокружением. В этой связи, целью данного проекта является осуществление механистических исследований для определения особенностей адгезии дормантных клеток меланомы и эпигенетической регуляции данного процесса. Разъяснение этого является важным для преодоления лекарственной устойчивости опухолевых клеток, совершенствования терапевтических подходов диссеминированных форм злокачественных новообразований.

Ожидаемые результаты
Результатом данного исследования будет являться разъяснение характера адгезии G0-позитивных, непролиферирующих опухолевых клеток, особенностей их взаимодействия с микроокружением. В данном исследовании также будет определено значение адгезивных молекул в поддержании дормантного состояния клеток меланомы, в равной степени как будет установлено, связано ли снижение их уровня с развитием апоптоза или переходом дормантных клеток в состояние пролиферации. Помимо этого, в данном исследовании будет выявлено, как взаимодействуют медленно пролиферирующие опухолевые клетки с микроокружением, каким образом микроРНК участвуют в эпигенетическом контроле дормантного состояния клеток . Полученные результаты составят основы для формирования новых терапевтических подходов, направленных на воздействие на дормантные опухолевые клетки, что должно способствовать повышению эффективности терапии онкологических заболеваний.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
В результате выполнения исследования нами обнаружено, что повышение в популяции клеток меланомы доли покоящихся клеток сочетается повышением с адгезивных свойств клеток. На основе применения метода центрифугирования для оценки клеточной адгезии выявлено, что среди адгезивных клеток повышается доля G0-положительных клеток (находящихся в фазе покоя клеточного цикла). На основе спектрофотометрического/колориметрического анализа нами выявлено, что G0-положительные клетки характеризуются повышенной адгезией к фибронектину и ламинину, что сопряжено со снижением уровня экспрессии ITGB8, изменением уровня экспрессии ITGAV. Далее нами осуществлялась трансфекция имитатора микроРНК miR-204-5p в клетки меланомы, подвергнутые воздействию дакарбазина. Ранее нами было показано, что микроРНК miR-204-5p принимает участие в регуляции пролиферации клеток меланомы посредством взаимодействия с несколькими мишеневыми молекулами, в том числе, с транскрипционным фактором FOXC1. На данном этапе работ определено, что трансфекция имитатора miR-204-5p в клетки меланомы, подвергнутые воздействию дакарбазином, снижает в них выраженность апоптоза, снижает долю покоящихся клеток, а также вызывает снижение доли G0-положительных клеток среди клеток меланомы с адгезивными свойствами. Таким образом, микроРНК miR-204-5p повышает пролиферацию клеток меланомы и, возможно, индуцирует переход клеток из фазы покоя в клеточный цикл. При исследовании in vivo нами было определено, что системное введение имитатора микроРНК miR-204-5p или сочетанное введение имитатора miR-204-5p и дакарбазина мышам линии C57Bl6/B16 вызывает повышение уровня miR-204-5p в дистантных органах – легких и печени, в то время сочетанное введение имитатора miR-204-5p и дакарбазина вызывает повышение уровня miR-204-5p также и в опухолевой ткани. Эффективность трансфекции имитатора miR-204-5p как в опухолевой ткани, так и во внутренних органах – легких и печени была подтверждена посредством определения повышенного уровня как самой miR-204-5p, так и снижения в них уровня ее гена-мишени SIRT1. Сочетанное введение имитатора miR-204-5p и дакарбазина мышам линии C57Bl6/B16 приводит к усилению роста опухоли, но снижению выраженности метастазирования в легочной ткани Таким образом, микроРНК miR-204-5p, уровни которой по нашим первоначальным результатам были снижены при меланоме по сравнению с доброкачественными меланоцитарными новообразованиями, демонстрирует участие в регуляции пролиферации клеток меланомы in vitro и in vivo, обеспечивая потенцирующее действие на пролиферацию опухолевых клеток. G0-положительные клетки меланомы характеризуются повышенными адгезивными свойствами, что опосредуется ITGB8, ITGAV.

 

Публикации

1. Есимбекова А.Р., Палкина Н.В., Зинченко И.С., Беленюк В.Д., Савченко А.А., Сергеева Е.Ю., Рукша Т.Г. Focal adhesion alterations in G0‐positive melanoma cells Cancer medicine, - (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1002/cam4.5510

2. Зинченко И.С., Палкина Н.В., Рукша Т.Г. MicroRNA Profiling in Melanoma Cells That Are Resistant to Dacarbazine Cell and Tissue biology, 16(3): 203-212 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1134/S1990519X22030117

3. Лапкина Е.З., Есимбекова А.Р., Зинченко И.С., Рукша Т.Г. Снижение уровня циклинзависимой киназы-4 в популяции Ki-67-негативных клеток меланомы Молекулярная медицина, 6:39-43 (год публикации - 2022)

4. Палкина Н.В., Аксененко М.Б., Земцов Д.С., Лаврентьев С.Н., Зинченко И.С., Беленюк В.Д., Савченко А.А., Рукша Т.Г. miR-204-5p in vivo inhibition cause diminished CD45RO cells rate in lungs of melanoma B16-bearing mice Non-coding RNA research, 7(3): 133-141 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1016/j.ncrna.2022.06.001

5. Палкина Н.В., Сергеева Е.Ю., Рукша Т.Г. miR 204-5p inhibits apoptosis in dacarbazine-treated melanoma cells Oncology Research, 29(6): 393-400 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.32604/or.2022.025816

6. - И снова РНФ поддержан наш грант! Официальный сайт Красноярского государственного медицинского университета, - (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
Адгезия и клеточный цикл являются связанными процессами. Таким образом, клетки с дормантным фенотипом, находящиеся в фазе G0 клеточного цикла, могут иметь специфичный паттерн адгезивных контактов по сравнению с делящимися клетками. В этой связи нами был осуществлен анализ экспрессии молекул адгезии в клетках меланомы BRO, SK-MEL-2, A375 после воздействия на них химиотерапевтическим агентом дакарбазином, который переход опухолевых клеток в фазу покоя клеточного цикла, G0. По результатам ПЦР в режиме реального времени в клетках меланомы А375 зарегистрировано снижение экспрессии молекул интегринов ITGB1, ITGB3, ITGB5 в 4,7, 38,3, и 5,9 раз соответственно (p=0,0495 во всех случаях), а также увеличение экспрессии PLXNA2 в 5,4 раза после воздействия дакарбазином в сравнении с негативным контролем. В клетках меланомы SK-MEL2 экспрессия ITGA6 снижалась в 9,4 раза (p=0,0495), возрастала в клетках меланомы BRO в 4,2 раза (p=0,0495). Помимо этого, после воздействия дакарбазином в клетках SK-MEL2 выявлено изменение уровня молекул, согласно биоинформатическому анализу отнесенных к сигнальному каскаду «Фокальная адгезия»: снижение экспрессии белков FPGS в 4,2 раза и HIPK1 в 2,5 раза, увеличение экспрессии PLXNA2 в 2,9 раз соответственно (p=0,0495). В 3D сфероидах, сформированных клетками меланомы после воздействия дакарбазином, также регистрировалось изменение уровня адгезивных молекул: в BRO отмечалось повышение экспрессии ITGB8 в 2,4 раза в сравнении с уровнем экспрессии в клетках сфероидов, на которых оказывалось воздействие ДМСО. В клетках меланомы линии SK-MEL2 при воздействии дакарбазином с последующим культивированием в виде сфероидов обнаружено повышение экспрессии молекул ITGB8 в 2,8 раза, ITGAV в 2,3 раза и ITGB5 в 2,6 раза (p=0,0495). Далее в клетки меланомы, подвергнутые воздействию дакарбазином, осуществлялась трансфекция малых интерферирующих РНК к плексину А2. Плексин А2 является корецептором семафоринов, опосредующим пролиферацию, миграцию и инвазию опухолевых клеток. В клетках меланомы с нокдауном плексина А2 оценивались распределение по фазам клеточного цикла, адгезивные свойства, определялась доля апоптотических/некротических клеток. Выявлено, что при нокдауне плексина А2 повышается проапоптотический эффект дакарбазина без изменения распределения клеток по фазам клеточного цикла, без изменения их адгезивных свойств. Таким образом, нами показано, что нокдаун молекулы адгезии плексина А2 не вызывает изменения фенотипа опухолевых клеток, но усиливает в них развитие апоптоза, что может быть рассмотрено в качестве возможного подхода для целенаправленного воздействия на популяцию дормантных клеток. Помимо этого, в другой серии экспериментов в клетки меланомы после воздействия дакарбазином нами была осуществлена трансфекция миметика микроРНК miR-155, геном-мишенью которой является NFE2L2, кодирующий редокс-чувствительный транскрипционный фактор NRF2. Вне зависимости от редокс-статуса клетки миметик miR-155 индуцировал снижение уровня NRF2, что сопровождалось угнетением жизнеспособности клеток меланомы и соответствующим повышением доли апоптотических клеток в 9,5 раз. Супрессия NRF2, опосредуемая miR-155, может быть рассмотрена в качестве еще одного подхода для направленного воздействия на популяцию дормантных клеток. Механизмы устойчивости клеток меланомы к химиотерапевтическому агенту дакарбазину анализировались в экспериментах in vivo. Было выполнено профилирование транскриптома первичных опухолей меланомы В16 после воздействия дакарбазином на основе технологии секвенирования нового поколения. Выявлено 34 дифференциально экспрессируемых гена, которые относятся к генам репарации ДНК, активации апоптоза, белков цитоскелета, компонентов сигнальных каскадов МАРК, АКТ/mTOR. Дифференциально экспрессируемыми транскриптами были насыщены механизмы внутриклеточной сигнализации «Сигнальный путь NF-каппа B», «Сигнальная система фосфатидилинозитола», «Сигнальный путь P53», «Сигнальный путь IL-17», отражающие реакцию опухолевых клеток на генотоксический стресс и повреждение. https://nauka.tass.ru/nauka/16712623 https://scientificrussia.ru/articles/odin-iz-osnovnyh-preparatov-ot-melanomy-okazalsa-vinovnikom-lekarstvennoj-ustojcivosti-raka https://polit.ru/news/2022/12/30/ps_rnf/ https://indicator.ru/medicine/odin-iz-osnovnykh-preparatov-ot-melanomy-okazalsya-vinovnikom-lekarstvennoi-ustoichivosti-raka-29-12-2022.htm https://inscience.news/ru/article/russian-science/11318 https://poisknews.ru/themes/medicine/odin-iz-osnovnyh-preparatov-ot-melanomy-okazalsya-vinovnikom-lekarstvennoj-ustojchivosti-raka/ https://gostonomica.ru/lekarstvo-ot-melanomy-sposobno-dat-rakovym-kletkam-ustojchivost/ https://colab.ws/news/464 https://news.ivest.kz/175196896-lekarstvo-ot-melanomy-sposobno-dat-rakovym-kletkam-ustoychivost https://news.rambler.ru/science/49956642-odin-iz-osnovnyh-preparatov-ot-melanomy-okazalsya-vinovnikom-lekarstvennoy-ustoychivosti-raka/

 

Публикации

1. Куценко В.А., Дашкова Д.А., Рукша Т.Г. miR-155-опосредованное угнетение экспрессии транскрипционного фактора NRF2 вызывает снижение жизнеспособности клеток меланомы вне зависимости от редокс-статуса Цитология, - (год публикации - 2024)

2. Лапкина Е.З., Есимбекова А.Р., Беленюк В.Д, Савченко А.А., Рукша Т.Г. The Distribution of B16 Melanoma Cells in Cell-Cycle Phases under the Influence of Dacarbazine Cell and Tissue Biology, 17(2), P. 161–168 (год публикации - 2023)

3. Васкулогенная мимикрия Vasculogenic mimicry | Vaskulogennaya mimikriya Arkhiv patologii, 2023, 85(6), P. 62–69 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.17116/patol20238506162

4. - Противораковый препарат дакарбазин переводит клетки меланомы в "спячку" ТАСС, - (год публикации - )

5. - ОДИН ИЗ ОСНОВНЫХ ПРЕПАРАТОВ ОТ МЕЛАНОМЫ ОКАЗАЛСЯ ВИНОВНИКОМ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ РАКА Информация взята с портала «Научная Россия» (https://scientificrussia.ru/) Научная Россия, - (год публикации - )

6. - 30 декабря 2022, 14:00 исследования медицина наука онкология Лекарство от меланомы способно дать раковым клеткам устойчивость ПолитРу, - (год публикации - )

7. - Один из основных препаратов от меланомы оказался виновником лекарственной устойчивости рака Indicator, - (год публикации - )

8. - Один из основных препаратов от меланомы оказался виновником лекарственной устойчивости рака InScience, - (год публикации - )

9. - Один из основных препаратов от меланомы оказался виновником лекарственной устойчивости рака ПОИСК, - (год публикации - )

10. - Лекарство от рака сделало опухоль устойчивой к терапии COLAB, - (год публикации - )

11. - Лекарство от меланомы способно дать раковым клеткам устойчивость ГОСТНОМИКА, - (год публикации - )

12. - Один из основных препаратов от меланомы оказался виновником лекарственной устойчивости рака Об этом сообщает "Рамблер" Рамблер Новости, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Выполненное исследование раскрывает новые механизмы формирования лекарственной устойчивости злокачественных новообразований. В работе показано, что при воздействии противоопухолевыми препаратами, опухолевые клетки могут обратимо переходить в фазу покоя, G0 клеточного цикла. Популяция покоящихся клеток может быть подвергнута целенаправленному воздействию с целью индукции их апоптоза. В работе продемонстрированы новые подходы для терапевтического воздействия на резистентные опухолевые клетки, находящиеся в фазе G0 клеточного цикла.