КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-22-00724

НазваниеВлияние диффузионного ограничения на фотокислотные свойства флуоресцеина при физиологических значениях pH

РуководительСлюсарева Евгения Алексеевна, Доктор физико-математических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Сибирский федеральный университет", Красноярский край

Период выполнения при поддержке РНФ 2022 г. - 2023 г. 

Конкурс№64 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 02 - Физика и науки о космосе, 02-304 - Спектроскопия

Ключевые словаФлуоресценция, флуоресцеин, флуоресцентная метка, протолитическое равновесие, ратиометрия, pH, фотоиндуцированный перенос протона, молекулярная динамика, ионная сила, микровязкость, белок, ФИТЦ, молекулярный ротор

Код ГРНТИ29.31.26


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Проект направлен на повышение информативности флуоресцентных наномаркеров и эффективности их использования в функционально значимых биологических и химических системах. Флуоресцеин и его гомологи находят свое применение как в качестве флуоресцентных маркеров, так и для индикации показателя pH. Ратиометрический сигнал флуоресценции, получаемый при возбуждении на характерных длинах волн возбуждения позволяет реализовывать эту индикацию для локальных, в том числе внутриклеточных измерений. Более детальное изучения ионного равновесия флуоресцеина в возбужденном состоянии свидетельствует о важной роли фотоиндуцированного переноса протона. Задачей проекта является выявление роли фактора микровязкости, определяющего диффузионно-контролируемую эффективность фотоиндуцированного переноса протона, в формировании результирующего ратиометрического флуоресцентного сигнала флуорецеина. Научная новизна проекта заключается в выявление связи между дифузионно-контролируемой эффективностью фотоприсоединения протона в дианион-анионной ступени диссоциации возбужденного состояния флуоресцеина и ратиометрическим сигналом флуоресценции, а также использование этой связи для изучения микровязкости окружения биомолекул (белков, разветвленных полисахаридов). Такая связь до настоящего времени никем не была исследована, хотя открывает широкие возможности для повышения информативности сигналов флуоресцентных зондов. Будут исследованы флуоресцентно-меченые объекты, полученные специально в настоящей работе (белки различного размера коньюгированные с FITS) и коммерчески доступные декстраны разной молекулярной массы коньюгированные с FITS. В качестве параметров, ограничивающих диффузию, будут использованы вязкие низкомолекулярные агенты и температурный фактор. Для выявления роли микровязкости в наблюдаемые спектральные изменения будет использован флуоресцентный зонд – молекулярный ротор CCVJ. Исследование будет проведено методами стационарной флуоресцентной спектроскопии и молекулярной динамики.

Ожидаемые результаты
Реализация проекта направлена на развитие нового для научного коллектива направления – флуоресцентного зондирования микровязкости сложносоставных, негомогенных биологических сред с перспективой определения базовых физико-химических характеристик (рН, ионная сила, вязкость) внутри живых клеток. Решение задачи позволит сделать вывод о степени корректности традиционной трактовки ратиометрического сигнала флуоресценции в терминах pH-зависимости, и определит возможность использования этого сигнала для оценки микровязкости сред, как гомогенных (растворов низкомолекулярных соединений), так и гетерогенных (суспензий высокомолекулярных соединений и (био)полимерных гелей). Сделанные выводы будут обладать универсальностью по отношению к широкому классу ксантеновых флуоресцентных зондов с выраженными фотокислотными свойствами.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Флуоресцеин проявляет свойства фотокислоты в физиологическом диапазоне рН (5÷8), что обусловлено переходом электронно-возбужденной анионной формы этого красителя в дианионную форму посредством переноса протона к растворителю (pKa 6,68). Исследования первого этапа реализации проекта были направлены на выяснение вопроса, является ли данная реакция переноса протона в возбужденном состоянии диффузионно контролируемым процессом. Для этого была изучена зависимость спектрально-люминесцентных свойств флуоресцеина от двух основных факторов, влияющих на скорость диффузии молекул в растворе – вязкости и температуры среды. Были изучены спектры поглощения и испускания флуоресценции флуоресцеина в растворах с варьируемой вязкостью (1-3 сП) и температурой (10-80 С) при трех значениях рН (6, 6.5, 12). Измеряли спектры флуоресценции на двух длинах волн возбуждения – 488 и 435 нм, соответствующих преимущественному поглощению дианионной и анионной форм красителя соответственно. В качестве аналитического ратиометрического сигнала, чувствительного к смещению ионного равновесия и не зависящего от концентрации красителя и геометрии возбуждения, использовали отношение интегральных сигналов флуоресценции, полученных при двух длинах волн возбуждения. Вязкость растворов варьировали путём добавления разных концентраций сорастворителей (этиленгликоль, глицерин, глюкоза, сахароза). Вариацию температуры проводили с помощью темостатированной ячейки приборов. Предварительное исследование влияния концентрации фосфат ионов (акцепторов протонов) в составе фосфатного буфера на ратиометрический сигнал флуоресцеина показало, что оптимальной концентрацией для наблюдения эффектов, связанных с фотопереносом протона, является 1 М. Эта концентрация была использована во всех дальнейших экспериментах. Было получено, что ратиометрический сигнал флуоресцеина в вязких средах проявляет зависимость от типа сорастворителя. По амплитуде изменения ратиометрического сигнала при pH 6,5 с ростом вязкости от 1 до 3 сП использованные сорастворители располагаются в следующий ряд: сахароза=глюкоза < глицерин < этиленгликоль. Вязкие среды с сахаридами не оказывали эффекта на ратиометрический сигнал, в то время как в растворах полиолей зависимость от вязкости имела вид кривой с насыщением (максимальное увеличение – на 80% в случае этиленгликоля). Измерение квантового выхода другого флуоресцентного зонда – молекулярного ротора 9-(2-карбокси-2-циановинил)юлолидина (CCVJ) в тех же условиях показало, что его сигнал зависит линейно от вязкости раствора в исследованном диапазоне и не определяется химической природой сорастворителя. Таким образом, был сделан вывод о том, что в отличие от CCVJ, флуоресцеин не может быть использован в качестве универсального зонда на микровязкость, однако его ратиометрический сигнал флуоресценции может быть информативен в отношении специфического взаимовоздействия с вязким сорастворителем, приводящего к нарушению диффузионного контроля реакции переноса протона. Была выявлена линейная связь ратиометрического флуоресцентного сигнала флуоресцеина с температурой среды в диапазоне 10-80С, которая воспроизводится и в цикле охлаждения. Было установлено, что угол наклона зависимости (чувствительность на 1 С) составляет: 0,0027 (pH 6,5) и 0,0042 (pH 6,0). Контрольный эксперимент, выполненный для монораствора дианиона флуоресцеина при рН 12, показал отсутствие зависимости от температуры. На основе этих результатов сделано предположение, что температурозависимый ратиометрический сигнал флуоресцеина при физиологических значениях pH может быть использован в аналитических целях для определения температуры в гомогенных растворах (с фиксированным значением pH и концентрации фосфат ионов). Для оценки эффективности переноса протона, зависящей от температуры и концентрации протонакцепторных добавок (молярности фосфатного буфера), была создана кинетическая модель фотопроцессов, реализованная в виде программы ЭВМ (Св-во 2022669602 от 21.10.2022). По результатам исследований в 2022 году опубликованы 3 статьи (одна из них в входит в базу данных Scopus) и сделано три доклада на конференциях.

 

Публикации

1. Боргоякова А.В., Суржикова Д.П., Слюсарева Е.А. Влияние вязких агентов на испускание флуоресцеина «Проспект Свободный – 2022 Материалы XVIII Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых Красноярск, 25–30 апреля 2022 г.», БИК Сибирского федерального университета, Красноярск, с. 2604-2606 (год публикации - 2022)

2. Лях Д.А., Суржикова Д.П., Слюсарева Е.А. Влияние температуры на ратиометрический флуоресцентный сигнал флуоресцеина «Проспект Свободный – 2022 Материалы XVIII Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых Красноярск, 25–30 апреля 2022 г., БИК Сибиского федерального университета, Красноярск, С.2631–2633 (год публикации - 2022)

3. Суржикова Д.П., Герасимова М.А., Слюсарева Е.А. Effect of Phosphate Ions on the Dianion–Anion Equilibrium of Fluorescein Excited State Bulletin of the Russian Academy of Sciences: Physics, Springer, 86(10), pp. 1203–1206 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.3103/S1062873822100215

4. Суржикова Д.П., Герасимова М.А., Слюсарева Е.А. Влияние фосфат-ионов на дианион-анионное равновесие флуоресцеина в возбужденном состоянии Енисейская Фотоника – 2022. Всероссийская научная конференция с международным участием. Тезисы докладов.Изд-во Института физики им. Л.В. Киренского СО РАН, Красноярск, Том 2, с. 159-160 (год публикации - 2022)

5. Суржикова Д.П., Слюсарева Е.А., Шамшурин А.В. Программа расчета равновесной концентрации ионных форм органического флуорофора с учетом влияния термодинамического и кинетического факторов на трехступенчатую диссоциацию -, RU 2022669602 (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
Проведен сравнительный анализ спектрально-люминесцентных характеристик флуоресцеина в растворах при рН 6,50 в свободном состоянии и ковалентно-связанного с белком флуоресцеина-5-изотиацианата (FITC) с белками разного размера: лизоцимом белка куриных яиц (Lys, 14,3 кДа), карбоксиангидразой Б быка (BCA, 29 кДа), бычьим сывороточным альбумином (BSA, 67 кДа) и бактериальной люциферазой (Luc, 79 кДа). Выявлено различия между спектрами поглощения флуоресцеина в свободном и связанном состояниях, а также между характеристиками зонда, связанного с разными белками, на основе чего сделан вывод о смещении дианион-анионного равновесия флуоресцеина в приповерхностных областях белков по сравнению с таковым в объемном растворителе. По спектрам поглощения были рассчитаны фактические концентрации ионных форм и вычислены локальные значения рНlocal для белков: 7,05 для FITC-Lys, 6,25 для FITC-BCA, 6,35 для FITC-BSA и 6,01 для FITC-Luc. Был сделан вывод о том, что эффекты, оказываемые белками на сигнал флуоресцентного зонда, обусловлены электростатическими свойствами их поверхности: при рН 6,50 положительно заряженный Lys отталкивает протоны буфера, а отрицательно заряженные BCA, BSA и Luc – притягивают. В контрольных экспериментах установлено отсутствие влияния тех же белков, но без ковалентного связывания, на спектральные характеристики флуоресцеина в буфере с рН 6,50. Методами молекулярного моделирования установлено образование стабильных водородных связей атомов кислорода гидроксильной (О1) и карбонильной (О3) групп ксантенового кольца флуоресцеина с молекулами воды, как для флуоресцеина в свободном состоянии, так и для красителя, связанного с белками. Присутствие глицерина и сахарозы не изменяет заселённость водородных связей О1 (центра протонирования) и О3 с водой, хотя молекулы сорастворителей способны приближаться к О1 и О3 на достаточное расстояние и образовывать нестабильные связи, чаще всего одновременно с молекулами воды. Состояние гидратной оболочки флуоресцеина оценили по профилю функции распределения минимального расстояния (MDDF) для воды относительно поверхности красителя. Анализ выявил разное соотношение пиков первого и второго гидратного слоя (при 1,8 и 2,7 А соответственно) для моноанионной и дианионной форм флуоресцеина в свободном состоянии, а также снижение присутствия воды в гидратной оболочке FITC, связанного с белками, по сравнению с зондом в свободном состоянии, что наиболее сильно выражено для FITC-Lys. Исследована температурная зависимость ратиометрического pH-чувствительного сигнала флуоресцеина I488/I435 и получено, что в диапазоне 10-80 oС в буферном растворе pH 6,00 и 6,50 I488/I435(Т) носит линейный характер. Сочетанием экспериментальных и расчетных методов проведена оценка эффективности и направления влияния на величину углового коэффициента зависимости I488/I435(T) следующих механизмов: I. изменение ионного равновесия в основном состоянии; II. изменение ионного равновесия в возбужденном состоянии; III. изменение вероятности поглощения при длинах волн возбуждения 488 и 435 нм; IV. изменение квантового выхода флуоресценции. Установлено, что наибольшее влияние на температурную чувствительность I488/I435 оказывает механизм I: (константа равновесия смещается на 0,25 в сторону дианионов), а учет механизмов I-III позволяет получить зависимость, близкую к экспериментально наблюдаемой. Выявлено, что линейная зависимость I488/I435(T) сохраняется и в вязких средах (в буферных растворах с добавлением вязких агентов). Определены механизмы, обеспечивающие различающееся влияние растворов глицерина и сахарозы на угловой коэффициент I488/I435(T) флуоресцеина. В целом, установлено, что чувствительность ратиометрического сигнала к концентрации вязких агентов имеет опосредованный характер, напрямую не связанный с вязкостью раствора. Получена линейная корреляция температурной чувствительности ратиометрического сигнала с изменением молярной энтальпии реакции депротонирования флуоресцеина в присутствии вязких агентов.

 

Публикации

1. Боргоякова А.В., Суржикова Д.П., Слюсарева Е.А. Роль вязкости в ионном равновесии флуоресцеина «Проспект Свободный - 2023 : Материалы XIX Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых. Красноярск, 24–29 апреля 2023 г.»., 3178-3180 (год публикации - 2023)

2. Суржикова Д.П., Романова Н.Ю., Слюсарева Е.А. Mechanisms of temperature dependence of the ratiometric signal of fluorescein Proceedings of SPIE, 12920,129200Z (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1117/12.3009717

3. Суржикова Д.П., Слюсарева Е.А. Влияние температуры на ионное равновесие флуоресцентного pH-зонда «Проспект Свободный - 2023 : Материалы XIX Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых. Красноярск, 24–29 апреля 2023 г.»., 3199-3201 (год публикации - 2023)

4. Суржикова Д.П., Суковатый Л.А., Немцева Е.В., Есимбекова Е.Н., Слюсарева Е.А. Functioning of a Fluorescein pH-Probe in Aqueous Media: Impact of Temperature and Viscosity Micromachines, 14(7),1442 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/mi14071442

5. Немцева Е.В., Лисица А.Е.,Суковатый Л.А., Гульнов Д.В., Кратасюк В.А. Кинетические особенности реакции, катализируемой бактериальной люциферазой, в вязких средах 13-ая Международная научная конференция "БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ"(БИОКАТАЛИЗ-2023), Суздаль, 2023, 104 (год публикации - 2023)

6. Немцева Е.В., Лисица А.Е.,Суковатый Л.А., Кратасюк В.А. Роль диффузионного ограничения в эффектах сред на биолюминесцентную реакцию бактерий X Съезд Российского фотобиологического общества Конференция «Современные проблемы фотобиологии» Материалы съезда. 10-17 сентября 2023 года, Шепси, Россия, 226-227 (год публикации - 2023)

7. Слюсарева Е.А. Органические люминофоры с фотоиндуцированным переносом заряда: оптические свойства и применение Материалы XIX международной молодежной конференции по люминесценции и лазерной физике, 184-185 (год публикации - 2023)

8. Суржикова Д.П., Слюсарева Е.А. Mechanisms of temperature dependence of the ratiometric signal of fluorescein PULSED LASERS AND LASER APPLICATIONS Materials of the 16th International Conference AMPL-2023. Tomsk, 2023, 213 (год публикации - 2023)

9. Суржикова Д.П., Слюсарева Е.А. Механизмы влияния на температурный флуоресцентный сигнал флуоресцеина Материалы XIX международной молодежной конференции по люминесценции и лазерной физике, 191-192 (год публикации - 2023)

10. - Вести с полей: с помощью флуоресценции молекула рассказала о своем окружении Научно-популярный портал InScience.News, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Результаты исследования способствуют повышению информативности флуоресцентных наномаркеров и эффективности их использования в функционально значимых биологических и химических системах. Они непосредственно могут быть применены для решения задач, где необходимо получать с высоким пространственным и временным разрешением локальные физико-химические характеристики (напр. рН, температура) сложных неоднородных сред, напр. белков. Различные виды биологических функций (например, передача сигналов, репликация и дупликация ДНК, дыхание), осуществляемые или опосредованные белками, начинаются с взаимодействия на поверхности белка. С другой стороны, сильное взаимодействие вызывает образование агрегатов, что приводит к таким фатальным заболеваниям, как болезнь Альцгеймера и болезнь Паркинсона.