КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-25-00354

НазваниеИзучение механизма терапевтического действия внеклеточных везикул, полученных из глиальных производных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека

РуководительГольдштейн Дмитрий Вадимович, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова", г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2022 г. - 2023 г. 

Конкурс№64 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-405 - Регенеративная медицина

Ключевые словаИндуцированные плюрипотентные стволовые клетки, ноотропная и нейропротективная терапия, регенерации нервной ткани, глиальная дифференцировка, заболевания центральной нервной системы, черепно-мозговая травма мозга, секретом, клеточная терапия, экзосомы, внеклеточные везикулы

Код ГРНТИ76.03.33


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
В данном исследовании впервые будет изучена роль внеклеточных везикул глиальных клеток, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека, в регуляции репаративных процессов нервной ткани. Будет проведено количественное исследование широкого спектра сигнальных молекул секретируемых глиальными клетками-предшественниками в составе экзосом. Планируется исследовать механизм взаимодействия внеклеточных везикул глиальных клеток-предшественников с первичной культурой мозжечковых нейронов. Будет проведена оценка терапевтической эффективности внеклеточных везикул на модели черепно-мозговой травмы и оценено иммуномодулирующие, противовоспалительные, нейропротективные и ангиогенные свойства. Результаты позволят более углубленно понять взаимодействие между глиальными и нерональными клетками. Полученные данные могут быть экспериментальным обоснованием использования внеклеточных везикул, выделенных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, дифференцированных в глиальном направлении, и создания на их основе персонализированных ноотропных лекарственных препаратов. Данная терапия будет иметь многоцелевую направленность, поскольку обусловлена наличием большого количество мишеней находящихся во внеклеточных везикулах, способствующих регенерации ткани мозга и обладающих нейропротективными свойствами. Также данный подход будет иметь ряд преимуществ по сравнению c клеточной терапией, поскольку лишена многих недостатков, связанных с эмболией, иммунным отторжением, а также со способностью клеток к злокачественным трансформациям.

Ожидаемые результаты
В результате будет изучен состав внеклеточных везикул, секретируемых глиальными клетками. Биоинформатический анализ данных протеомного исследования позволит классифицировать выявленные белки в составе внеклеточных везикул по функциональным и биологическим процессам. Секвенирование и последующий биоинформатический анализ позволят установить микроРНК и другие типы РНК в составе внеклеточных везикул. Будет установлено нейропротективное действие внеклеточных везикул в модели глутаматной эксайтотоксичности и установлены сигнальные пути и молекулы, направленные на репаративные процессы мозжечковых нейронов. По завершению исследований будут получены данные о терапевтическом действии внеклеточных везикул глиальных клеток-предшественников, включающим в себя способность снижать гибель животных и уменьшать тяжесть неврологического дефицита. Будут определены молекулярно-генетические и клеточные механизмы, лежащие в основе терапевтического действия внеклеточных везикул. Полученные данные будут опубликованы в высокорейтинговых рецензируемых журналах (не менее 4 статей).


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
На данный отчетный период получены внеклеточные везикулы от трех культур глиальных клеток-предшественников (ВВ-ГКП) и выполнена их характеристика по наличию трансмембранных белков СD63, CD81 и CD9. Изучена морфология внеклеточных везикул путем проведения электронной микроскопии и их размера с применением анализа траекторий наночастиц (NTA анализ). Общая концентрация частиц для культур глиальных клеток-предшественников, полученных от трех разных доноров, варьируется незначительно 1,58-3,28*10^11 частиц/мл. Оценен мкРНКовый состав внеклеточных везикул с использованием NGS-технологий. Было идентифицировано 133 мкРНК, функциональная значимость которых направлена на предотвращение развития различных патологических состояний головного мозга, таких как отек, ишемия. Исследовано терапевтическое действие интраназального шестидневного введения ВВ-ГКП на модели черепно-мозговой травмы (модель падающего груза). Произведена оценка в изменении объема очага повреждения с помощью МРТ диагностики и неврологического статуса животных (тесты "Цилиндр", "Постановка конечности на опору", "Ротарод"). Терапия ВВ-ГКП показала значительное восстановление функций головного мозга животных, улучшая общий неврологический статус и моторные функции поврежденного полушария по сравнению с контрольной группой. При этом в экспериментальной группе не наблюдали выраженного уменьшения объема очага повреждения. Выполнено гистологическое исследование головного мозга крыс. Изучено противовоспалительное действие (выполнена количественная оценка фагоцитирующих и активированных макрофагов/микроглии по М1 или М2 фенотипу) и оценена степень глиоза головного мозга животных. Введение ВВ-ГКП способствовало снижению уровня воспаления как в области травмы за счет уменьшения количества моноцитарных макрофагов (СD68+) и увеличения количества макрофагов М2-фенотипа (CD206+), так и в области гиппокампа за счет уменьшения клеток микроглии (CD11b+). В области травмы наблюдали снижение количества астроцитов, которые потенциально могут тормозить процессы репарации аксонов и дендритов нейронов. Проведено молекулярно-генетического исследования тканей мозга и оценена экспрессия генов-маркеров апоптоза (Bax и Bcl2), воспаления (IL1b, IL6, IL10, IL12, TNFa), матричных металлопротеиназ и их ингибиторов (Mmp2, Mmp9, Timp1 и Timp2). При введении ВВ-ГКП в области травмы, гиппокампа, а также стриатума, наблюдали уменьшение экспрессии генов провоспалительных цитокинов IL6, IL12b и IL1b и только в области травмы увеличение экспрессии гена противовоспалительного цитокина IL10. Данная терапия способствовала уменьшению экспрессии гена Mmp9 на 7 сутки и гена Mmp2 на 14 сутки эксперимента в области травмы. Соотношение генов Bax/Bcl2, при котором клетки будут более чувствительны к апоптозу, было значительно ниже при введении ВВ-ГКП в области травмы и гиппокампа. Изучен уровень белков-маркеров нейродегенерации: APP, Тау-белка и его фосфорилированных форм. В группе с введением ВВ-ГКП в области стриатума и гиппокампа количество Тау-белка было выше, чем в контроле. При этом в опытной группе по сравнению с контрольной соотношение pTau(Ser396)/Tau было ниже в зоне травмы коры головного мозга и стриатума, а соотношение pTau(Thr205)/Tau ниже в стриатуме и гиппокампе. Таким образом, ВВ-ГКП способны улучшать сенсомоторную функцию животных при черепно-мозговой травме, стимулируя процессы нейровосстановления. Терапевтическое действие везикул направлено на несколько мишеней: подавление воспалительного ответа, уменьшение реактивного глиоза в области травмы, повышение пластичности мозга.

 

Публикации


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
С помощью протеомного анализа во внеклеточных везикулах (ВВ) глиальных клеток-предшественников, полученных из ИПСК, было выявлено 1357 белков. 60% идентифицированных белков принадлежат к категориям "везикулы" и "внеклеточные везикулы", что подразумевает о получении препарата, обогащенного внеклеточными везикулами. Были выявлены белки, относящиеся к компартментам «секреторные гранулы» (17% идентифицированных белков) и «секреторные везикулы» (17%). Были определены белки, относящиеся к группам «мембрана»- 69%, «белковый мембранный комплекс» - 13% и «везикулярное окаймление» - 3%. Было обнаружено 56,5% белков, относящихся к категории «цитозоль», что дает возможность предположить, что эти белки локализованы в люмине везикул. Кроме того, 53%, 15% и 5% идентифицированных белков было отнесено к категории «внеклеточный регион», «фокальная адгезия» и «внеклеточный матрикс», соответственно. Кроме того, 8%, 6,5% и 3% белков были отнесены к категориям «люмен секреторных гранул», «мембрана Гольджи» и «поздняя эндосома», соотвественно, что позволяет предположить пути образования и внутриклеточной миграции внеклеточных везикул через Аппарат Гольджи и поздний эндосомный компартмент. Согласно категории «биологические процессы» 60% проанализированных белков вовлечены в метаболические процессы, 38% - процессы развития, 27,5% - процессы иммунной системы, 25% - образование клеточных компонентов и 9% - клеточную коммуникацию. Также обнаруженные белки были отнесены к группе «окислительно-восстановительные процессы» (8% идентифицированных белков) и «ответ на снижение уровня кислорода» (6%). Более того, 9% идентифицированных белков было отнесено к группе «негативная регуляция клеточной гибели», при этом 4% белков было выделено в группу «негативная регуляция гибель нейронов». Также 2,5% белков были отнесены к категории «NIK-Nf-kappaB сигналинг», среди которых были обнаружены белки: субъединицы Nf-kappaB комплекса и активаторы NIK-Nf-kappaB сигналинга (например, DDX1). Эти данные позволяют предположить, что белки внеклеточных везикул активируют пути выживаемости клеток, а также стабилизации внутриклеточного гомеостаза. Кроме того, 8% белков было отнесено как к категории «дифференцировка нейронов», так и к «позитивная регуляция клеточной дифференцировки»; 4% белков были отнесены к группам «позитивная регуляция дифференцировки нейронов» и «позитивная регуляция развития нервной системы». Небольшая часть белков была отнесена к группе «позитивная регуляция нейрогенеза» (5%), «развитие аксонов» (4%) и «удлинение аксона» (1%). Среди белков, отвечающих за молекулярные функции, были выделены группы «связывание белков клеточной адгезии» (14%), «связывание лигазы убиквитин-подобного протеина» и «связывание лигазы белка убиквитина» (по 4%), «связывание протеаз» и «связывание шаперонов» (по 1,5%), «связывание убиквитина» и «связывание тау белка» (по 1%). Также были выделены белки с различными активностями, такие как «активность структурных молекул» (10%), «оксидредуктазная активность» (6%), «антиоксидантная активность» (1,5%) и «пероксидазная активность» (1%), что указывает на роль внеклеточных везикул в клеточной коммуникации, передаче сигнала, правильном компактизации белков и выживаемости клеток. Для оценки нейропротективного действия была выбрана модель глутаматной эксайтотоксичности. Добавление 100 мкМ глутамата приводило к снижению числа жизнеспособных кортикальных нейронов на 37,5±4,03% по сравнению с группой контроля. При этом добавление ВВ в концентрации 3 мкг/мл достоверно повышало выживаемость кортикальных нейронов на 20%±5,56% (p=0,046). Более того, присутствие ВВ с концентрацией 10 мкг/мл достоверно увеличивало количество жизнеспособных клеток до контрольных значений (p<0,001). Основным путем выживания нейронов является PI3K сигнальный путь. Для установки влияния ВВ на этот сигнальный путь был выбран ингибитор AS605240. Для этого одновременно добавляли ВВ с ингибитором AS605240 до конечной концентрации 1 мкг/мл. Благодаря полученным данным было установлено, что присутствие данного ингибитора вместе с ВВ с концентрацией (10 мкг/мл) достоверно снижало нейропротекторный эффект внеклеточных везикул до значений группы с воздействием глутаматной эксайтотоксичности. Это позволяет предположить, PI3K-Akt является основным путем выживания нейронов, активируемым ВВ. Также на данной модели был оценен уровень экспрессии генов-маркеров апоптоза, окислительного стресса и нейритогенеза. Анализ ПЦР в реальном времени показал, что воздействие глутаматной эксайтотоксичности (Глу) повышает уровень экспрессии гена Bax (позитивный регулятор апоптоза) и снижает экспрессию гена Bcl2 (негативный регулятор апоптоза) в культуре кортикальных нейронов. Инкубация ВВ с кортикальными нейронами повышала уровень экспрессии гена Bcl2 в 7,5 раз, а Bax - снижала в 25,5 раза. Также было показано, что добавление ВВ повышает уровень экспрессии генов NFE2L2 и HMOX1, связанных с антиоксидантной защитой клеток, в культуре кортикальных нейронов. Добавление ВВ значительно увеличивало экспрессию генов NFE2L2 и HMOX1 в 7,56 и 9,31 раза соответственно по сравнению с группой, обработанной глутаматом. Также была исследована относительная экспрессия генов-маркеров нейритогенеза GAP43, SYN1, TUBB3 и MAP2. Добавление ВВ увеличивало экспрессию генов GAP43, TUBB3, SYN1, MAP2 в 2; 1,6; 1,6; 3 раза, соответственно. В работе проводили оценку влияния ВВ на изменение внутриклеточного кальция и функционирование митохондрий мозжечковых нейронов при глутаматной эксайтотоксичности. Измерения с помощью флуоресцентной микроскопии показали, что инкубация с ВВ в течение суток до проведения эксперимента не изменяла уровень внутриклеточного кальция в покоящихся нейронах. Добавление глутамата (100 мкМ, 15 мин) вызывало повышения уровня яркости в сомах нейронов, что свидетельствует об увеличении уровня внутриклеточного кальция и развития замедленной дерегуляции кальция как в контрольной группе, так и в группе с ВВ. Для определения динамики замедленной дерегуляции кальция используется площадь под кривой (AUC) после начала действия глутамата, поскольку она отражает процесс поступления ионов кальция в цитоплазму при активации глутаматных рецепторов. Этот параметр был достоверно выше в нейронах контрольных культур, чем в нейронах культур, которые были проинкубированы с ВВ. Также не менее важным параметром является площадь под кривой на стадии удаления ионов кальция и глутамата и инкубировании с EGTA (100 мМ) и Mg2+ (2 мМ) в течение 30 минут – стадия «отмывки». Она свидетельствует об снижении уровня свободного цитоплазматического кальция в условиях отсутствия глутамата и восстановлении гомеостаза данного иона. Удаление глутамата и ионов кальция из буфера привело к снижению уровня кальция и в контрольной, и группе с ВВ, однако параметр площади под кривой был достоверно ниже у группы с ВВ относительно контрольной группы. Последним проанализированным параметром является площадь под кривой при деполяризации мембран митохондрий под действием протонофора карбонилцианид-4-(трифторметокси)фенилгидразона (FCCP, 1 мкМ). Так как митохондрии являются внутриклеточным депо кальция, при деполяризации мембраны депонированный кальций выходит в цитоплазму. Изменения сигнала Rh123 может быть вызвано либо изменением ΔΨm (снижением митохондриальной деполяризации) и захватом или отдачей зонда митохондриями, либо утечкой Rh123 из клеток. Для нивелирования этого эффекта измеряли отношение AUC Rh123 после полной деполяризации митохондрий протонофором FCCP (AUCFCCP) к AUC Rh123 в глутаматный период (AUCGlutamate(100mkM)) и в постглутаматный период (AUC-Ca2+,-Glutamate,+EGTA). Высокие концентрации глутамата вызывают кальциевую дизрегуляцию, которая происходит синхронно с сильной митохондриальной деполяризаций при глутаматной эксайтотоксичности. Добавление ВВ не вызывало падение митохондриального потенциала (ΔΨm), при этом снижало долю нейронов, в которых происходила сильная митохондриальная деполяризация.

 

Публикации

1. Леонов Г.Е., Салихова Д.И., Шеденкова М.О., Бухарова Т.Б., Фатхутдинов Т.Х., Гольдштейн Д.В. Comparative study of the protective and neurotrophic effects of neuronal and glial progenitor cells-derived conditioned media in a model of glutamate toxicity in vitro Biomolecules, 2023, 13 (год публикации - 2023)

2. Салихова Д.И., Тимофеева А.В., Головичева В.В., Фатхудинов Т.Х., Шевцова Ю.А., Соболева А.Г., Силачев Д.Н., Гольдштейн Д.В. Extracellular vesicles of human glial cells exert neuroprotective effects via brain miRNA modulation in a rat model of traumatic brain injury Scientific Reports, 13, 20388, 2023 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1038/s41598-023-47627-2


Возможность практического использования результатов
Применение внеклеточных везикул (ВВ) в персонализированной медицине предоставляет уникальную возможность использовать их в качестве инструмента для терапии многих заболеваний. ВВ могут быть загружены биологически активными молекулами, такими как белки, РНК или лекарственные вещества. Это создает возможность использовать ВВ для доставки терапевтических агентов прямо в целевые клетки, что может увеличить эффективность лечения и снизить побочные эффекты. Хотя применение ВВ в персонализированной медицине все еще находится в стадии исследований, их потенциал предоставляет перспективы для развития новых подходов к лечению различных неврологических заболеваний.