КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-73-10184

НазваниеГетероаннелирование как инструмент синтеза новых азотсодержащих биоактивных молекул

РуководительРостовский Николай Витальевич, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет", г Санкт-Петербург

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2022 - 06.2025 

Конкурс№71 - Конкурс 2022 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 03 - Химия и науки о материалах, 03-101 - Синтез, строение и реакционная способность органических соединений

Ключевые словаОрганический синтез, гетероциклические соединения, 2Н-азирины, азиридины, нитрены, карбены, триазолы, оксазолы, индолы, пирролы, диазосоединения, сульфонамиды

Код ГРНТИ31.21.27


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Инфекционные заболевания и рак входят в лидирующую группу болезней, являющихся причиной смерти людей по всему миру. Увеличение количества резистентных микроорганизмов является одной из важнейших проблем современного здравоохранения, которая требует безотлагательного решения. Наиболее известными примерами являются метициллин-резистентный золотистый стафилококк (MRSA), ванкомицин-устойчивые энтерококки и туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ-ТБ). Рак является одной из основных причин смерти во всем мире, на его долю пришлось почти 10 миллионов смертей в 2020 году, или почти каждый шестой случай смерти. Наиболее распространенными причинами смерти от онкологических заболеваний в 2020 г. были рак легких, рак толстой и прямой кишки, рак печени, рак желудка, рак молочной железы. Резистентность к лекарствам вырабатывается и у раковых клеток. Причиной этого является то, что онкогенез может возникнуть вследствие появления драйверных мутаций генов нормальных клеток. В связи с этим поиск новых соединений, обладающих антибактериальной и противораковой активностью, среди природных веществ и их аналогов и разработка новых синтетических антибиотиков и противоопухолевых препаратов, являются актуальной проблемой химии и фармацевтики. Научная новизна исследования заключается в выявлении новых классов соединений, перспективных для применения в качестве антибактериальных и противораковых препаратов. В рамках проекта будет вестись комплексная разработка, заключающаяся в синтезе гетероциклических соединений различных классов, в первую очередь неизвестных ранее или малоизученных, и изучении их антибактериальной и цитотоксической активности in vitro. Основное внимание будет уделено новым типам конденсированных оксазолов, моноциклическим и конденсированным пирролам, спирогетероциклам, оксазинам и оксазепинам, пиридонам, аналогам индольных и пиррольных алкалоидов. Такое разнообразие целевых соединений позволяет рассчитывать на получение прорывных результатов по биоактивности. В основе планируемых синтезов лежат разнообразные типы формирования гетероциклического фрагмента (гетероаннелирования): трансформации напряженных циклических молекул (азиридинов, 2Н-азиринов, циклопропанов), реакции карбенов и нитренов, реакции циклоприсоединения и каскадные реакции. Исследование включает разработку оригинальных, удобных и масштабируемых методов синтеза указанных соединений с использованием современных достижений органического синтеза - металлокатализа, фотолиза, органокатализа, и изучение антибактериальной активности полученных новых продуктов в комплексе с цитотоксической активностью. Планируется синтезировать и изучить биоактивность более 200 соединений. Исследование будет проводиться с привлечением квантово-химических расчетных методов (для изучения механизмов неизвестных реакций и проведения молекулярного докинга). Результаты проекта будут соответствовать мировому уровню исследований, осуществление данного проекта станет весомым вкладом в синтетическую органическую химию, химию гетероциклических соединений и напряженных малых циклов. Выполнение проекта имеет большую общественную значимость, так как позволит разработать новые удобные и эффективные методы синтеза перспективных соединений для борьбы с бактериями и раком, что крайне важно для современного здравоохранения. Как и предыдущие работы авторов, результаты работы по данному проекту будут опубликованы в международных высокорейтинговых научных журналах.

Ожидаемые результаты
Научная новизна исследования заключается в выявлении новых классов соединений, перспективных для применения в качестве антибактериальных и противораковых препаратов. В рамках проекта будет вестись комплексная разработка, заключающаяся в синтезе гетероциклических соединений различных классов, в первую очередь неизвестных ранее или малоизученных, и изучении их антибактериальной и цитотоксической активности in vitro. Основное внимание будет уделено новым типам конденсированных оксазолов, моноциклическим и конденсированным пирролам, спирогетероциклам, оксазинам и оксазепинам, пиридонам, аналогам индольных и пиррольных алкалоидов. Такое разнообразие целевых соединений позволяет рассчитывать на получение прорывных результатов по биоактивности. В основе планируемых синтезов лежат разнообразные типы формирования гетероциклического фрагмента (гетероаннелирования): трансформации напряженных циклических молекул (азиридинов, 2Н-азиринов, циклопропанов), реакции карбенов и нитренов, реакции циклоприсоединения и новые каскадные реакции. Исследование включает разработку оригинальных, удобных и масштабируемых методов синтеза указанных соединений с использованием современных достижений органического синтеза - металлокатализа, фотолиза, органокатализа, и изучение антибактериальной активности полученных новых продуктов в комплексе с цитотоксической активностью. Планируется синтезировать и изучить биоактивность более 200 соединений. Исследование будет проводиться с привлечением квантово-химических расчетных методов (для изучения механизмов неизвестных реакций и проведения молекулярного докинга). Результаты проекта будут соответствовать мировому уровню исследований, осуществление данного проекта станет весомым вкладом в синтетическую органическую химию, химию гетероциклических соединений и напряженных малых циклов. Полученные данные могут быть использованы в научных целях, в лекционных курсах для подготовки студентов и для разработки промышленных методик синтеза биологически активных соединений. Выполнение проекта имеет большую общественную значимость, так как позволит разработать новые удобные и эффективные методы синтеза перспективных соединений для борьбы с бактериями и раком, что крайне важно для современного здравоохранения. При успешном прохождении последующих этапов биологических испытаний полученные соединения могут стать основой новых антибиотиков и противораковых препаратов. Как и предыдущие работы членов научного коллектива (например, Org. Lett. 2021, 23, 6998; Org. Lett. 2019, 21, 3615; Org. Lett. 2015, 17, 4148; Org. Chem. Front. 2021, 8, 1474; J. Org. Chem., 2018, 83, 13473; J. Org. Chem. 2017, 82, 256), результаты работы по данному проекту будут опубликованы в международных научных журналах, входящих в первый квартиль (Q1) по импакт-фактору. Будет сделан ряд докладов на всероссийских и международных конференциях по органической и медицинской химии.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
За первый этап реализации проекта были выполнены исследования по всем запланированным направлениям. За отчетный период по результатам выполнения проекта опубликованы две статьи в журналах Q1: Karcev, D.D.; Efremova, M.M.; Molchanov, A.P.; Rostovskii, N.V.; Kryukova, M.A.; Bunev, A.S.; Khochenkov, D.A. Selective and Reversible 1,3-Dipolar Cycloaddition of 2-(2-Oxoindoline-3-ylidene)acetates with Nitrones in the Synthesis of Functionalized Spiroisoxazolidines. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 12639. https://doi.org/10.3390/ijms232012639 Titov, G. D.; Antonychev, G. I.; Novikov, M. S.; Khlebnikov, A. F.; Rogacheva, E. V.; Kraeva, L. A.; Rostovskii, N. V. Gold vs Light: Chemodivergent Reactivity of Diazoesters toward 2H‑Azirine-2-carboxylic Acids. Org. Lett. 2023, 25, 2707. https://doi.org/10.1021/acs.orglett.3c00823 Одна статья находится на рецензировании в журнале Molecules: Zakharov, T. N.; Sakharov, P. A.; Novikov, M. S.; Khlebnikov, A. F.; Rostovskii, N. V. Triethylamine-promoted oxidative cyclodimerization of 2H-azirine-2-carboxylates to pyrimidine-4,6-dicarboxylates: experimental and DFT study. С помощью золото(I)-катализируемой реакции азирин-2-карбоновых кислот с диазосоединениями был разработан новый метод синтеза 1,3-оксазин-6-онов. Было проведено исследование антибактериальной активности полученных 1,3-оксазин-6-онов в отношении возбудителей группы ESKAPE. В целом оксазиноны оказались активными, при этом наибольшая антибактериальная активность наблюдалась у оксазинона, содержащего атом хлора при С5: МИК 0,16 мкг/мл для E. faecium и S. Aureus, что значительно ниже, чем у сульфаметоксазола. Также была изучена цитотоксическая активность некоторых оксазинонов в отношении клеток NCI-H1975, NCI-H460, MCF7, SW620 и WI-26 VA4. Эти соединения оказались более цитотоксичными для здоровых клеток (линия WI-26 VA4), чем для раковых. Была исследована каскадная окислительная димеризация 2Н-азирин-2-карбоксилатов в пиримидин-4,6-дикарбоксилаты, проходящая при нагревании с триэтиламином в присутствии воздуха. Предложен механизм реакции, основанный на экспериментальных данных и квантовохимических расчетах методом DFT. Реакция проходит через раскрытие цикла первой молекулы 2H-азирина по связи C-C, последующее 1,3-диполярное циклоприсоединение азометин-илида ко второй молекуле азирина и разрыв связи С-N бициклического азиридина. Разрыв связи С-С в молекуле азирина промотируется нуклеофильным присоединением N,N-диэтилгидроксиламина, образующегося в результате окисления триэтиламина кислородом воздуха. Была проверена применимость данной реакции для синтеза пиримидин-2,4-дикарбоксилатов, которые были получены с умеренными выходами. Также была изучена цитотоксическая активность некоторых синтезированных пиримидинов в отношении клеток NCI-H1975, NCI-H460, MCF7, SW620 и WI-26 VA4. Пиримидин, содержащий два бифенильных фрагмента, показал довольно высокую цитотоксичность к раковым клеткам, при этом оказывая гораздо меньшее воздействие на здоровые клетки. Была проверена антипролиферативная активность новых синтезированных спироиндолинизоксазолидинов, а также аминоспиртов, полученных их восстановлением, в отношении раковых клеток A549, MCF7, MDA-MB-231, Caki-2 и T98G. Значительная цитотоксичность (в отношении линий MCF7 и A549) наблюдалась лишь у одного спироиндолинизоксазолидина. Были начаты исследования по синтезу бициклических оксазолов через спироазиридины. Реакции азиридинирования 4-арилиденизоксазол-5-онов и 3-арилиденфуран-2,4-дионов в системе N-аминофталимид - ацетат свинца(IV) оказались неуспешными: азиридины оказывались нестабильными и разлагались с образованием гидразонов. По той же методике удалось получить спироциклический азиридин, содержащий в своём составе индольный фрагмент и сложноэфирную группу. Были начаты эксперименты по превращению полученного азиридина в оксазол в термических условиях. В качестве новых объектов для азиридинирования и последующего потенциального аннелирования были опробованы 2-азабута-1,3-диены. Продуктом реакции в этом случае является производное 2,5-дигидро-1H-имидазола, которое было выделено с хорошим выходом. Поиск подхода к синтезу бициклических оксазолов через гетероциклические диазосоединения был начат с реакций 3-диазооксиндолов, 3-диазоиндолин-2-иминов и диазотетрамовой кислоты. В качестве партнеров диазосоединений были опробованы ацетонитрил, бензонитрил и диметилцианамид в различных условиях, однако ни в одном из случаев не удалось получить конденсированные оксазолы (имидазолы). Для получения производных оксазоло[4,5-c]изоксазола были осуществлены попытки синтеза 4-диазо-3-фенилизоксазол-5-она из 3-фенилизоксазол-5-она с использованием тозилазида и хлорида 2-азидо-1,3-диметил-4,5-дигидро-1H-имидазолия в качестве диазопереносчиков, однако эти попытки не увенчались успехом. Был исследован подход к синтезу конденсированных производных 2-пиридона из 2Н-азиринов и диазосоединений. Для сокращения числа хроматографических очисток, реакции проводили в однореакторном режиме из 4-циклопентилизоксазолов, которые с превращаются в соответствующие азирин-2-карбоксилаты при нагревании с Rh2(OAc)4. Последующая реакция с диазосоединением приводит к 4-циклопентил-2-азабутадиенам, которые под действием основания претерпевают каскадную циклизацию в циклопента[c]пиридины. Оптимизация условий реакции не позволила на данный момент увеличить выходы целевых продуктов (18-22%). Одним из побочных процессов, снижающим выход пиридона, является образование 1-азетина из 2-азабута-1,3-диена. Было выяснено, что реакция носит довольно ограниченный характер в плане заместителей: в ряде случаев пиридон получить не удалось. Был предложен механизм образования 2-пиридонов. Было замечено, что при смешении азирина с карбоксилатом родия(II) происходит образование розовой окраски. Нами были синтезированы комплексные соединения Rh2(OAc)4 с 2Н-азиринами. По данным ЯМР было зафиксировано образование комплексов состава 1:2 в пользу азирина. Для комплекса с 3-(4-метоксифенил)-2Н-азирином был выполнен рентгеноструктурный анализ. Для поиска подходов к алкалоидоподобным полициклическим производным индола были синтезированы 1,2,3-триазолы, связанные через метиленовую группу с индолами. Катализируемые Rh2(OAc)4 реакции триазольных диад, полученных из карбазола и 2-метилиндола, проводились в различных условиях и во всех случаях протекали сложным образом, желаемых полигетероциклов получить не удалось. В результате реакции диады, полученной из 2-фенилиндола, была выделена смесь продуктов, содержащая пентациклическое производное (дигидроиндол) и тетрациклический альдегид. Последний образовался при гидролизе тозилимина при хроматографии на силикагеле. Наличие тозилимина было подтверждено при действии цианоборгидрида на реакционную смесь: в результате был выделен продукт восстановления C=N связи. Для поиска новых подходов к азотистым гетероциклам были синтезированы 1,2,3-триазолы, связанные через метиленовую группу с изоксазолом. Дальнейшая Rh2(OAc)4-катализируемая реакция привела к получению редкого класса гетероциклов - 1,3-диазепинов. Для понимания механизма реакции из изоксазол-триазольной диады была синтезирована азирин-триазольная диада. Rh2(OAc)4-катализируемая реакция этой диады не привела к образованию 1,3-диазепина, из чего следует, что изомеризация изоксазола в азирин не является первым этапом каскадной реакции, приводящей к 1,3-диазепинам. Для изучения границ применимости реакции на данный момент уже синтезирован ряд 4-пропаргилизоксазолов.

 

Публикации

1. Карцев Д.Д., Ефремова М.М., Молчанов А.П., Ростовский Н.В., Крюкова М.А., Бунев А.С., Хоченков Д.А. Selective and Reversible 1,3-Dipolar Cycloaddition of 2-(2-Oxoindoline-3-ylidene)acetates with Nitrones in the Synthesis of Functionalized Spiroisoxazolidines International Journal of Molecular Sciences, том 23, выпуск 20, номер статьи 12639 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.3390/ijms232012639

2. Титов Г.Д., Антонычев Г.И., Новиков М.С., Хлеьников А.Ф., Рогачева Е.В., Краева Л.А., Ростовский Н.В. Gold vs Light: Chemodivergent Reactivity of Diazoesters toward 2H‑Azirine-2-carboxylic Acids Organic Letters, Org. Lett. 2023, 25, 2707−2712 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1021/acs.orglett.3c00823

3. Захаров Т.Н., Ростовский Н.В. ИССЛЕДОВАНИЕ ДИМЕРИЗАЦИИ МЕТИЛ 3-ФЕНИЛ-2H-АЗИРИН-2-КАРБОКСИЛАТА В ПРИСУТСТВИИ ТРИЭТИЛАМИНА Сборник тезисов докладов II Всероссийской конференции “Органические радикалы: фундаментальные и прикладные аспекты”, 15-16 декабря 2022, ИОХ РАН, г. Москва, Сборник тезисов докладов II Всероссийской конференции “Органические радикалы: фундаментальные и прикладные аспекты”, 15-16 декабря 2022, ИОХ РАН, г. Москва, стр. 85 (год публикации - 2022)

4. Титов Г.Д., Антонычев Г.И., Ростовский Н.В. Синтез 1,3-оксазин-6-онов с помощью золото-катализируемой реакции 2Н-азирин-2-карбоновых кислот с диазосоединениями Материалы Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов- 2023», секция «Химия». – М.: Издательство «Перо», 2023. – 121 МБ. [Электронное издание]., Материалы Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов- 2023», секция «Химия». Стр. 507 (год публикации - 2023)