КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-75-00084

НазваниеПолифенолы маакии амурской как противовирусные и нейропротективные агенты

РуководительТарбеева Дарья Владимировна, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Тихоокеанский институт биоорганической химии им. Г.Б. Елякова Дальневосточного отделения Российской академии наук, Приморский край

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2022 - 06.2024 

Конкурс№70 - Конкурс 2022 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 03-103 - Синтез, строение и свойства природных и физиологически активных веществ; медицинская химия и прогнозирование различных видов биоактивности

Ключевые словаРастительные полифенольные метаболиты, нейропротективные свойства, вирус герпеса, противовирусная активность, молекулярный докинг

Код ГРНТИ31.23.00


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Герпетические инфекции – группа широко распространенных и плохо контролируемых инфекций человека, течение которых происходит в виде скрытых субклинических и клинически манифестных форм, вызываемых вирусами простого герпеса (ВПГ). В организме с нормальной иммунной системой герпетические вирусы могут циркулировать бессимптомно, но у людей с иммуносупрессией они вызывают тяжелые заболевания с летальным исходом. Типичным представителем ВПГ является вирус простого герпеса 1 типа (ВПГ-1) – ДНК-содержащий вирус семейства Herpesviridae подсемейства Alphaherpesvirinae, который вызывает орофациальный герпес. Этот вирус вызывает инфекционные заболевания человека различной степени тяжести от характерных везикулезных высыпаний на коже и слизистых до поражений центральной нервной системы. Широкая распространенность, тяжесть осложнений и возникновение лекарственной устойчивости делают герпетическую инфекцию глобальной проблемой здравоохранения. До настоящего времени единственными клинически одобренными антигерпетическими препаратами для лечения ВПГ-1 инфекции остаются ацикловир (синтетический аналог пуринового нуклеозида) и его аналоги, являющиеся ингибиторами ферментов, участвующих в репликации ДНК вируса (тимидинкиназы, ДНК-полимеразы). В последнее время возросло количество сообщений об устойчивости ВПГ против многих антигерпетических препаратов на основе аномальных нуклеозидов. Кроме того, ясно прослеживается связь между герпетической инфекцией и последующим развитием нейродегенеративных заболеваний, что в немалой степени обусловлено вирус-индуцированным накоплением активных форм кислорода в клетке. Поэтому крайне актуальным представляется поиск биологически активных соединений, обладающих как противовирусными, так и нейропротективными свойствами. Так как поиск и создание новых лекарственных препаратов является длительным, дорогостоящим и рискованным процессом, с точки зрения упрощения процесса разработки и регистрации препарата, очень привлекательным является исследование возможности использования уже известных лекарственных средств по новому назначению. В рамках данного проекта предлагается провести исследование противовирусных и нейропротективных свойств полифенолов маакии амурской. Это растение внесено в Государственный реестр лекарственных препаратов и является сырьевым источником фармацевтической субстанции «Маакии амурской экстракт сухой», получаемой из ядровой древесины маакии амурской для производства зарегистрированного Российской Федерации препарата Максар®. Маакия амурская содержит как широко распространенные в семействе Бобовые соединения (генистеин, формононентин), так и редкие полифенолы с уникальными структурами (в частности, димерные стильбены и лигнаны), биологическая активность которых на сегодняшний практически не изучена. В рамках проекта впервые будет дана оценка способности полифенолов маакии амурской целенаправленно воздействовать на разные этапы репродукции вируса герпеса, а методом молекулярного докинга in silico будут определены сайты их связывания с поверхностными белками вируса gB, gD, gHgL, участвующими во взаимодействии вируса с клеточными рецепторами, и способность ингибировать вирусную ДНК-полимеразой. Впервые будет оценен нейропротективный потенциал полифенольных соединений маакии амурской на модели болезни Паркинсона, вызванной 6-гидроксидофамином и паракватом, а также проведены эксперименты по изучению способности полифенолов маакии амурской снижать вирус-индуцированную продукцию АФК. Будут получены новые знания о механизме антигерпетического действия полифенолов маакии амурской. Таким образом, в рамках проекта впервые будут найдены полифенольные соединения, обладающие как противовирусными, так и нейропротективными свойствами, что позволит предложить наиболее эффективные средства для лечения герпетической инфекции.

Ожидаемые результаты
Результаты данной работы будут иметь как фундаментальное, так и прикладное значение. В ходе выполнения проекта будет наиболее полно изучен химический состав полифенолов ядровой древесины маакии амурской. Методом молекулярного докинга впервые будут определены центры связывания полифенольных соединений ядровой древесины маакии амурской с поверхностными белками ВПГ-1 gB, gD, gHgL, участвующими во взаимодействии вируса с клеточными рецепторами, и вирусной ДНК-полимеразой. Впервые будет изучена способность полифенолов маакии амурской подавлять развитие ДНК-содержащего вируса ВПГ-1 на разных стадиях жизненного цикла, что позволит определить механизм их антигерпетического действия. Впервые будет оценен нейропротективный потенциал полифенольных соединений маакии амурской на модели болезни Паркинсона, вызванной 6-гидроксидофамином и паракватом, а также проведены эксперименты по изучению способности полифенолов маакии амурской снижать вирус-индуцированную продукцию АФК. В результате выполнения работ по проекту будут найдены наиболее перспективные полифенольные соединения, которые в конечном итоге позволят снизить потери от таких социально значимых заболеваний как вирусные инфекции и нейродегенеративные заболевания. В результате выполнения проекта будет опубликовано не менее 2 статей в журналах, индексируемых системами Web of Science и Scopus, а также результаты проекта будут представлены в виде тезисов докладов на российских или международных конференциях. Все исследования будут выполнены на мировом уровне, так как включают в себя передовые методы и подходы и направлены на решение социально-значимых проблем – повышение уровня и качества жизни населения.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
В рамках проекта из ядровой древесины маакии амурской были выделили новый изофлаваностильбен маакиапицевеститол (1), а также ряд ранее известных димерных и мономерных стильбенов: резвератрол (2), пицетаннол (3), маакин (4), сцирпусин А (5), маакиазин (6) и мааколин (7). Структура маакиапицевеститола (1) была установлена помощью методов одномерной (1H и 13С) и двумерной (COSY, HSQC, HMBC, ROESY) спектроскопии ЯМР, масс-спектрометрии высокого разрешения и спектроскопии кругового дихроизма (КД). Было установлено, что в структуру маакиапицевеститола (1) входят фрагменты веститола и пицеатаннола. Сравнение экспериментально полученных и теоретически рассчитанных констант спин-спинового взаимодействия и КД-спектров позволило определить конфигурацию асимметрических центров в молекуле маакиапицевеститола (1) как 3R,4S. Детальный анализ спектров ЯМР показал, что маакиапицевеститол (1) был выделен в виде смеси двух устойчивых конформеров 1а и 1b, конформационный переход между которыми затруднен из-за высокого энергетического барьера (ΔЕ ≥ 20 ккал/моль). Соединения 2–7 идентифицированы путем сравнения их спектров ЯМР и ВЭЖХ-МС с ранее опубликованными в литературе данными. Абсолютная конфигурация асимметрических центров в соединениях 3 и 6 была определена сравнением экспериментально полученных и теоретически рассчитанных КД-спектров как 2S,3S и 3S,3aS,8R,8aS соответственно. Методами молекулярного докинга изучено взаимодействие полифенольных соединений маакии амурской (1-7) с поверхностными гликопротеинами ВПГ-1 gD, gHgL и gB, а также с тимидинкиназой ВПГ-1. Показано, что исследуемые соединения могут связываться непосредственно с gD, конкурируя за сайты связывания этого белка с клеточным рецептором нектин-1 (3-SKU) и предотвращая адсорбцию вируса. Молекулярный докинг с поверхностным гликопротеином ВПГ-1 gHgL был выполнен в два сайта связывания антител, блокирующих образование комплекса gHgL-gB. Анализ контактов полифенолов с гликопротеином gHgL показал, что наиболее эффективное связывание наблюдалось для соединений 1-3 и 6 (табл. 5 и 6, рис. 8-13) в сайте, содержащем Glu86. Молекулярный докинг с поверхностным гликопротеином ВПГ-1 gB показал, что наиболее эффективно с этим белком связывается маакиазин (6), взаимодействуя одновременно с тремя доменами. Проведенный молекулярный докинг c тимидинкиназой ВПГ-1 показал, что мономерные стильбены резвератрол (2) и пицеатаннол (3) способны связываться с вирусной тимидинкиназой в том же сайте, что и ацикловир (рис. 16). Однако димерные стильбены такой способностью не обладали В рамках проекта была охарактеризована способность полифенольного комплекса (ПФК) маакии амурской целенаправленно воздействовать на разные этапы жизненного цикла ДНК-содержащего вируса (ВПГ-1). Наиболее высокая противовирусная активность ПФК была зарегистрирована при одновременном воздействии на клетки Vero ВПГ-1. Установлено, что механизмы, лежащие в основе противовирусного действия ПФК, связаны с блокированием прикрепления вирусов к клеткам, прямой инактивацией вирусных частиц и ингибированием ранней стадии репликации вирусов. Противовирусную активность полифенолов маакии амурской в отношении ВПГ-1 оценивали с помощью анализа ингибирования цитопатогенногтдействия вируса. На ранней стадии вирусной инфекции полифенолы добавляли к клеткам Vero одновременно с вирусом. Стильбены 1, 3–5 проявляли значительную противовирусную активность (значения ИК50 варьировали от 27 до 90 мкМ). Маакиазин (6) и мааколин (7) проявляли умеренную активность (значения ИС составили 6,6 и 6,4, а ИК50 45,0 и 88,9 соответственно). ПФК маакии амурской также эффективно ингибировал репликацию вируса (значения ИК50 и ИС составили 13,9 мкг/мл и 87 соответственно). Активность полифенольных соединений из маакии амурской против ВПГ-1 также оценивали методом ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ). Клетки Vero одновременно инфицировали ВПГ-1 и обрабатывали полифенольными соединениями в концентрациях 50 и 5 мкг/мл. После двухдневной инкубации клеток из супернатантов экстрагировали ДНК вируса и с помощью ПЦР-РВ определяли относительный уровень вирусной нагрузки по пороговому циклу реакции амплификации (Ct). Влияние тестируемых соединений на снижение содержания в образцах ДНК ВПГ-1 оценивали по изменению порогового цикла ΔCt, ИК50 и индексу селективности (ИС) соединения. Установлено, что полифенольные соединения маакии амурской значительно ингибировали репликацию ВПГ-1 в концентрации 50 мкг/мл, когда клетки Vero одновременно обрабатывали этими соединениями и инфицировали ВПГ-1. В этой концентрации соединения 1, 3–5 и ПФК снижали количество циклов амплификации в среднем на 14 циклов (ΔCt) и полностью (до 100%) ингибировали репликацию вируса. Однако в концентрации 5 мкг/мл только соединения 1, 5 и ПФК снижали относительный уровень ДНК ВПГ-1 в среднем на 30% по отношению к вирусному контролю (p < 0,05). Полученные результаты показали, что полифенольные соединения маакии амурской ингибировали инфекцию ВПГ-1 дозозависимым образом. Мы обнаружили, что соединения 1, 3–5 и ПФК маакии амурской были наиболее эффективны при их добавлении одновременно с инфицированием клеток. В рамках проекта было оценено влияние полифенолов маакии амурской на выживаемость клеток Neuro-2a после их обработки паракватом (ПВ). ПФК маакии амурской показал высокую нейропротекторную активность и повысил жизнеспособность клеток на 18% при концентрации 10 мкг/мл по сравнению с клетками Neuro-2a, обработанными ПВ. Мааколин (7) в концентрации 10 мкМ также эффективно повышал жизнеспособность обработанных ПВ клеток (на 16%). Маакиапицевеститол (1) и сцирпусин А (5) в концентрации 10 мкМ (5,1 и 4,9 мкг/мл соответственно), а также ПФК (10 мкг/мл) снижали уровень внутриклеточных АФК в клетках Neuro-2a, обработанных ПВ, на 17%, 7% и 12%. соответственно. Маакин (4) в минимальной изучаемой концентрации 0,1 мкМ ингибировал уровень АФК на 17%. Мааколин (6) не снижал уровень АФК в клетках Neuro-2a, обработанных ПВ. Изучено влияние стильбенов и ПФК маакии амурской на митохондриальный мембранный потенциал в клетках Neuro-2a, обработанных ПВ. Все исследуемые полифенолы были способны предотвращать деполяризацию и восстанавливать потенциал митохондриальной мембраны. Таким образом, в рамках проекта была охарактеризована способность ПФК маакии амурской целенаправленно воздействовать на разные этапы жизненного цикла ДНК-содержащего вируса (ВПГ-1). Показано, что антигерпетическое действие ПФК маакии амурской в значительной степени обусловлено активностью входящих в его состав полифенольных метаболитов. В рамках проекта полифенолы, обладающие антигерпетическим действием, были выделены в индивидуальном состоянии, а их структуры установлены с применением современных физико-химических методов. Противогерпетическая активность ПФК и индивидуальных полифенолов маакии амурской обусловлена их способностью, с одной стороны, взаимодействовать с поверхностными белками ВПГ-1, а с другой стороны ‒ снижать уровень внутриклеточных АФК, повышенный при герпетической инфекции.

 

Публикации

1. Тарбеева Д.В., Бердышев Д.В., Пислягин Е.А., Менчинская Е.С., Ким Н.Ю., Калиновский А.И., Крылова Н.В., Иунихина О.В., Персиянова Е.В., Щелканов М.Ю., Григорчук В.П., Аминин Д.Л., Федореев С.А. Neuroprotective and antiherpetic properties of polyphonic compounds from Maackia amurensis heartwood Molecules, Molecules 2023, Vol. 28, P. 2593. (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/molecules28062593

2. Крылова Наталья Владимировна, Федореев Сергей Александрович, Иунихина Ольга Викторовна, Мищенко Наталья Петровна, Потт Анастасия Борисовна, Тарбеева Дарья Владимировна, Щелканов Михаил Юрьевич Средство, обладающее противовирусным действием в отношении герпесвируса человека I типа и энтеровируса В -, 2022128372 (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
На втором году реализации проекта из ядровой древесины маакии амурской были выделены изофлавоноиды генистеин (2), ретузин (3), маакиаин (4), текторигенин (5), медикарпин (7), формононентин (8) и (±)-3-гидроксивеститон (12), а также флавоноид ликвиритигенин (6). Были наработаны дополнительные количества мономерных стильбенов ресвератрола (1) и пицеатаннола (11), димерных стильбенов маакина (9) и сцирпусина А (13), а также изфлавоностильбенов маакиазина (10) и маакиапицевеститола (14). Для структурной идентификации выделенных полифенолов использовались методы одномерной спектроскопии ЯМР (1H и 13C ЯМР), а также хроматомасс-спектрометрия. Сравнение экспериментально полученных и теоретически рассчитанных констант спин-спинового взаимодействия и КД-спектров позволило определить конфигурацию асимметрических центров в молекулах маакиазна (10) и сцирпусина А (13) как 1''S,2''S и 7R,8R соответственно. В рамках проекта была оценена нейропротективная активность полифенолов маакии амурской на модели нейротоксичности, индуцированной 6-гидроксидофамином (6-ОГДА) и паракватом (ПК) в клетках нейробластомы мыши Neuro-2a. Ликвиритигенин (6) и сцирпусин А (13) в концентрации 10 мкМ, а также ПФК маакии амурской (10 мкг/мл) повышали жизнеспособность обработанных 6-ОГДА клеток Neuro-2a на 12%, 9% и 11%. % соответственно. С помощью флуоресцентного анализа с применением зонда DCF-DA изучено влияние полифенольных соединений из ядровой древесины маакии амурской на уровень АФК в клетках Neuro-2a, обработанных 6-ОГДА. Сцирпусин А (13), маакиазин (10) и ликвиритигенин (6) обладали высокой активностью в этом тесте и в концентрации 1 мкМ/мл снижали уровень АФК в обработанных 6- ОГДА клетках Neuro-2a на 43%, 20%, и 15% соответственно. Ресвератрол (1), хотя и не повышал выживаемость клеток Neuro-2a, обработанных 6-ОГДА, в концентрации 1 мкМ/мл снижал уровень внутриклеточных АФК на 15%. С помощью флуоресцентного зонда TMRM изучено влияние полифенольных соединений из ядровой древесины маакии амурской на митохондриальный мембранный потенциал в клетках Neuro-2a. Наблюдался значительный эффект увеличения митохондриального мембранного потенциала на 8-12%, когда клетки Neuro-2a инкубировали с ресвератролом (1), пицеатаннолом (11), ликвиритигенином (6), медикарпином (7) и маакином (9) в концентрации 10 мкМ. На втором году реализации проекта на модели нейротоксичности, индуцированной ПК, был оценен нейропротективный потенциал стильбена 1, флавоноида 6 и изофлавоноидов 2-5, 7, 12. Ресвератрол (1) и ликвиритигенин (6) в концентрации 10 мкМ продемонстрировали значительную активность и увеличили жизнеспособность клеток, обработанных ПК, на 17% и 15% соответственно. Изофлавоноиды генистеин (2), медикарпин (7) и маакиаин (4) в этой концентрации показали гораздо менее значительный эффект и увеличили жизнеспособность клеток на 5%, 7% и 2% соответственно. Ликвиритигенин (6) эффективно снижал уровень АФК в клетках Neuro-2a, обработанных ПК. Методом проточной цитометрии с использованием флуоресцентного красителя аннексина V исследовано влияние полифенольных соединений из ядровой древесины маакии амурской на апоптоз в клетках Neuro-2a, обработанных 6-ОГДА. Полифенолы 3, 6 и 13 уменьшали нейротоксический эффект от обработки клеток 6-OГДА. Эти соединения значительно увеличили процент живых клеток Neuro-2a и уменьшили количество ранних апоптотических клеток. Антигерпетическую активность полифенолов маакии амурской оценивали по ингибированию цитопатогенного действия вируса (ЦПД) с помощью МТТ-теста и методом ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ). На втором году реализации проекта была изучена способность полифенолов 1–14 напрямую взаимодействовать с вирусными частицами (вирулицидная активность). Маакин (9) и сцирпусин А (13) ингибировали репликацию вируса более эффективно, чем другие исследуемые полифенолы (значения ИК50 составили 2,4 и 2,6 мкг/мл соответственно). Полифенольные соединения 1, 7, 10, 11, 14 также проявляли значительную противовирусную активность со значениями ИК50 в диапазоне от 6,7 до 9,6 мкг/мл. Генистеин (2) и мааккиаин (4) проявили умеренную активность (ИК50 16,7 и 28,3 мкг/мл соответственно). Методом ПЦР-РВ показано, что маакин (9) и сцирпусин А (13) в концентрации 10 мкг/мл вызывали максимальное снижение содержания вирусной ДНК среди исследуемых соединений. Соединения 10, 11 и 14 также значительно снижали уровень вирусной ДНК. Соединения 1, 2, 4 и 7 обладали умеренной вирулицидную активностью. Только соединения 9, 11 и 13 ингибировали репликацию ВПГ-1 в концентрации 1 мкг/мл. Изучение вирулицидной активности полифенольных соединений маакии амурской показало, что маакин (9) и сцирпусин А (13) проявляют наибольшую ингибирующую активность в отношении вируса ВПГ-1 среди тестируемых соединений. Однако обработка клеток Vero маакином (9) и сцирпусином А (13) перед инфицированием (предварительная обработка клеток) оказывала слабое влияние на репликацию ВПГ-1. Обработка клеток этими полифенолами после проникновения вируса в клетки (обработка инфицированных клеток) оказывало умеренный эффект на репликацию ВПГ-1. В рамках проекта методами молекулярного докинга с применением программы МОЕ 2020.09 изучено взаимодействие полифенольных соединений маакии амурской с поверхностными гликопротеинами ВПГ-1 gD, gHgL и gB, а также с вирусной тимидинкиназой. Среди изофлавоноидов и флавоноидов только соединения 2, 4, и 7 были способны связываться с gD. В отличие от стильбенов 1, 9, 10, 11, 13, 14, эти взаимодействия были слабыми и параметры докинга не превышали 1.1 ккал/моль. Эти данные коррелировали со значениями ИС и ИК50, полученными при экспериментальном изучении противовирусной активности полифенолов маакии амурской. Изофлавоноиды и флавоноиды маакии амурской не показали способности связываться с гликопротеинами gHgL, gB и вирусной тимидинкиназой. Антиоксидантные свойства стильбенов 9, 10, 11, 13, 14 были исследованы на модели неферментативного Fe2+-индуцированного окисления гомогената мозга мыши. Стильбены 9, 10, 11, 13, 14 проявили высокую антиоксидантную активность и в концентрации 10 мкМ/мл полностью ингибировали образование продуктов взаимодействия с тиобарбитуровой кислотой. Таким образом, установлено, что полифенольные соединения вносят вклад в антигерпетическую и нейропротекторную активность экстракта маакии амурской. Димерные стильбены маакин (9) и сцирпусин А (13) обладали самой высокой противовирусной активностью среди исследованных полифенолов, главным образом, за счет их прямого вирулицидного действия. Это может быть обусловлено их способностью взаимодействовать с поверхностными гликопротеинами ВПГ-1. Флавоноид ликвиритигенин (6) и димерный стильбен сцирпусин А (13) проявили наиболее высокую нейропротекторную активность среди исследуемых полифенолов маакии амурской. Сцирпусин А (13) оказался наиболее перспективным соединением, так обладал как высокой антигерпетической активностью, так и нейропротекторным потенциалом.

 

Публикации

1. Тарбеева Д.В., Пислягин Е.А., Менчинская Е.С., Бердышев Д.В., Крылова Н.В., Иунихина О.В., Калиновский А.И., Щелканов М.Ю., Мищенко Н.П., Аминин Д.Л., Федореев С.А. Polyphenols from Maackia amurensis Heartwood Protect Neuronal Cells from Oxidative Stress and Prevent Herpetic Infection International Journal of Molecular Sciences, Int. J. Mol. Sci. 2024, 25, 4142 (год публикации - 2024) https://doi.org/10.3390/ijms25084142

2. Тарбеева Д.В., Федореев С.А., Крылова Н.В., Иунихина О.В., Бердышев Д.В. Биологически активные полифенолы Маакии амурской XX Всероссийская молодежная школа-конференция по актуальным проблемам химии и биологии, ТИБОХ ДВО РАН. Материалы конференции, XX Всероссийская молодежная школа-конференция по актуальным проб-лемам химии и биологии, Владивосток, 4–8 сентября 2023 г. : материалы конференции / ТИБОХ ДВО РАН. – Владивосток, 2023. – С. 61. (год публикации - 2023) https://doi.org/10.47471/20_2023_09_04_08_0

3. Тарбеева Д.В.,Федореев С.А., Бердышев Д.В., Пислягин Е.А., Менчинская Е.С., Крылова Н.В., Иунихина О.В. NEUROPROTECTIVE AND ANTIHERPETIC PROPERTIES OF POLYPHENOLIC COMPOUNDS FROM MAACKIA AMURENSIS HEARTWOOD «Фитофарм 2023», XXIV международный съезд, Фитофарм 2023», XXIV международный съезд (24 ; 2023; Санкт-Петербург) [электронное из- дание] : сборник тезисов съезда, C.107 (год публикации - 2023)


Возможность практического использования результатов
не указано