КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-75-10120

НазваниеВосстановление сложноорганизованных комплексов тканей с использованием прототипа портативного биопринтера «Биоган»

РуководительШпичка Анастасия Иосифовна, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (Сеченовский Университет), г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2022 - 06.2025 

Конкурс№71 - Конкурс 2022 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-405 - Регенеративная медицина

Ключевые словаБиопринтер, биочернила, гидрогелевая система, кожа, матрикс-связанные везикулы, регенерация, незаживающие раны, язва

Код ГРНТИ76.13.19


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Незаживающие раны являются одним из распространенных осложнений у пациентов с сахарным диабетом и венозной недостаточностью и могут стать причиной развития сепсиса и, как следствие, летального исхода, а их терапия требует значительного времени и финансовых затрат. Использование современных методов, включая эпидермальные эквиваленты, позволило достигнуть значительных успехов в восстановлении поврежденной ткани и снижении рисков рецидивов. Тем не менее, применение раневых покрытий не позволяет точно повторить профиль раневой поверхности и учесть локальные особенности в состоянии тканей. В связи с этим целью представленного проекта является разработка подходов к восстановлению сложноорганизованных комплексов тканей с использованием прототипа портативного биопринтера «Биоган». Разрабатываемое устройство позволит реализовать такие подходы к восстановлению сложноорганизованных комплексов тканей, как фотобиомодуляция, применение биоактивных материалов и клеточная терапия. Так, в рамках реализации проекта будут впервые установлены эффекты воздействия низкоинтенсивного излучения в красном и ближнем инфракрасном диапазонах в трехмерных клеточных структурах при формировании тканевых эквивалентов с помощью биопечати. Будут впервые разработаны биочернила, включающие матрикс-связанные везикулы и клеточные сфероиды. Будет впервые разработан прототип портативного биопринтера «Биоган» с возможностью с воздействия низкоинтенсивным излучением в красном и ближнем инфракрасном диапазонах с целью восстановления сложноорганизованных комплексов тканей, проведены предварительные испытания по установлению безопасности и эффективности разработанных подходов in vivo на модели незаживающих ран и сформированы рекомендации для проведения доклинических исследований. Результаты реализации проекта соответствуют мировому уровню и будут опубликованы в виде не менее 10 статей в ведущих профильных международных журналах 1-го квартиля (включая Biofabrication, Acta Biomaterialia, Bioprinting, International Journal of Bioprinting, Nature Communications и др.) и представлены на основных международных конференциях (TERMIS Congress, ESAO Congress, World Congress on Biomaterials и др.). Междисциплинарный характер представленного проекта и достижимость указанных результатов обуславливает участие специалистов высокого уровня из разных областей знаний, работающих в Институте регенеративной медицины, Институте бионических технологий и инжиниринга и Клинике кожных и венерических болезней имени В.А. Рахманова Сеченовского университета: дерматологии, регенеративной медицины, тканевой инженерии, материаловедения, биомедицинского инжиниринга, клеточной биологии. Участники проекта имеют большой опыт проведения исследований, что подтверждается публикациями в таких ведущих профильных международных журналах 1-го квартиля, как Scientific Reports, Drug Discovery Today, Soft Matter, Journal of Biomedical Optics, International Journal of Bioprinting и др.

Ожидаемые результаты
В рамках реализации проекта будут установлены эффекты воздействия низкоинтенсивного излучения в красном и ближнем инфракрасном диапазонах в трехмерных клеточных структурах при формировании тканевых эквивалентов с помощью биопечати. Будет разработана гидрогелевой системы в качестве основы биочернил с оптимальными физико-химическими, механическими, реологическими и биологическими свойствами, обеспечивающими осуществление процесса биопечати. Будет создан прототип портативного биопринтера «Биоган». Будут выделены и охарактеризованы матрикс-связанных везикул мезенхимных стромальных клеток. Будет разработан протокол иммобилизации этого типа везикул в составе разработанной гидрогелевой системы в качестве иммуномодулирующего компонента. Будут разработаны биочернила, содержащие клеточные сфероиды и/или матрикс-связанные везикулы для стимулирования регенерации в месте повреждения. Будет разработан и оптимизирован протокол восстановления сложноорганизованных комплексов тканей с использованием прототипа портативного биопринтера. Будут проведены предварительные испытания по установлению безопасности и эффективности разработанных подходов in vivo на модели незаживающей раны и сформированы рекомендации к доклиническому исследованию. Полученные результаты лягут в основу нового способа восстановления сложноорганизованных комплексов тканей при незаживающих ранах с помощью портативного биопринтера «Биоган» с возможностью с воздействия низкоинтенсивным излучением в красном и ближнем инфракрасном диапазонах, что даст возможность снизить экономический и социальный ущерб и значительно улучшить качество жизни пациентов. Результаты реализации проекта соответствуют мировому уровню и будут опубликованы в виде не менее 12 статей в ведущих профильных международных журналах 1-го квартиля (включая Biofabrication, Acta Biomaterialia, Bioprinting, International Journal of Bioprinting, Nature Communications и др.) и представлены на основных международных конференциях (TERMIS Congress, ESAO Congress и др.).


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
В ходе выполнения работ в 2022/23 году в рамках проекта № 22-75-10120 были установлены эффекты воздействия низкоинтенсивного излучения в красном и ближнем инфракрасном диапазонах в трехмерных клеточных структурах – сфероидах из мезенхимных стромальных клеток (МСК) слизистой оболочки десны человека. Показано, что метаболическая активность сфероидов и продукция АТФ во всех группах (контроль, облучение при длинах волн 633 нм и 840 нм) находилась на одном уровне. Однако пролиферативная активность в группе, где сфероиды облучали при 840 нм, оказалась незначительно ниже, но нормализованная на концентрацию ДНК метаболическая активность, напротив, была примерно на 10% выше, чем в других группах. Схожая тенденция отмечалась и для динамики реактивации сфероидов, которая происходила в основном за счет миграции групп клеток единым фронтом на относительно большие расстояния. Разработана гидрогелевая система с реологическими свойствами, оптимальными для осуществления экструзионной биопечати. В качестве основы нами были использованы ранее синтезированные конъюгаты ПЭГ-фибрина. С помощью реометра были получены кинетические зависимости модуля сдвига для гидрогелевых систем на их основе и оценены соответствующие значения модуля Юнга. Так, расчетные константы полимеризации составили τ = 42,75 ± 0,29, 31,26 ± 0,18, 35,09 ± 0,19 мин для нативного фибрина и конъюгатов 5:1 и 10:1, соответственно. Установлена высокая вариабельность между образцами и показано, что в отличие от измерений АСМ система на основе 5:1 ПЭГилированного фибрина была немного более жесткой, чем на основе нативного с самой низкой гетерогенностью результатов модуля Юнга: 596,74 ± 15,91 (5:1) против 490,26 ± 208,55 (нативный) и 274,93 ± 96,99 (10:1). Тест амплитудной развертки показал, что все образцы имеют одинаковое деформационное поведение. Частотный тест в области линейной вязкоупругости выявил лишь слабое увеличение модуля накопления и слабое уменьшение модуля потерь. С целью оптимизации свойств гидрогелевой системы был расширен компонентный состав и подобраны концентрации фибрина и желатина, обеспечивающие наилучшую печатуемость, а также способы сшивки для обеспечения механической прочности и стабильности при последующем культивировании. Было показано, что через 5-7 минут после добавления сшивающего агента значения модулей сохранения и потерь выходят на плато; при этом максимальные значения (модуль сохранения – около 90 Па, модуль потерь – около 18 Па) наблюдаются для образцов, подвергавшихся двойной сшивке (ферментативной и фотоиндуцируемой). Модуль Юнга поверхности конструкта составил 1,4 кПа при макро- и 0,6 кПа при наноиндентировании. Были определены характерное время релаксации и гелирования. Оптимальные параметры печати с помощью разработанной гидрогелевой системы, при которых различия между формируемом конструктом и 3D моделью были минимальны, а сходства – максимальны, составили 30-45 кПа и 22-24°С. Выявлено, что при инкапсулировании в разработанной гидрогелевой системе (смешивание и биопечать) сфероиды из МСК оставались жизнеспособны и метаболически активны. Через 7 суток появлялось большое количество отростков, клетки были жизнеспособны и активно заполняли прилегающий объем гидрогеля; через 14 суток они сохраняли жизнеспособность и мигрировали от исходного сфероида на расстояния более чем 1000 мкм. При этом клетки активно пролиферировали. В длинных отростках из сфероидов обнаруживался виментин, а также установлено наличие фибронектина и коллагена I типа – основных белков de novo синтезируемого внеклеточного матрикса, что свидетельствует о протекании начальных этапов формирования ткани в сформированном конструкте. Создан прототип портативного биопринтера «Биоган». При изготовлении деталей корпуса с помощью 3Д-принтера элементы, не испытывающие нагрузки при работе, были напечатаны с коэффициентом заполнения 15%, что позволило уменьшить вес устройства. В стенках были сделаны направляющие прямоугольного сечения, что привело к уменьшению веса и ширины устройства без потери надежности работы. Центр масс устройства смещен таким образом, чтобы он проходил через суставы, соединяющие пястные кости и проксимальные фаланги для обеспечения удобства работы. Для осуществления требуемого функционала были использованы две независимые передачи «винт-гайка» для регулируемой возможной подачи двух компонентов (например, биочернил / гидрогелевой системы / сшивающего агента). Для приведения системы в действие были выбраны шаговые двигатели. Передача крутящего момента на винт (однозаходная резьба с шагом 2 мм) осуществляется при помощи ременной системы и шкивов с передаточным отношением 1:1, что обеспечивает линейное перемещение при одном микрошаге 5 мкм, что позволяет подавать компоненты с точностью 0,5 мкл. Система управления представляет собой два драйвера шаговых двигателей, микроконтроллер ATmega328P и аналоговые ключи для управления системой, а также контролем за ее состоянием. Реализация системы облучения представляет собой отдельный блок и включает фотодиодную матрицу с тремя типами светодиодов, пики излучения которых находятся на 365, 630 и 840 нм. Расчетная область облучения без применения теневых масок и диаграфм составляет 250 мм2. Данный вариант выполнения позволяет сократить вес и габариты биопринтера, а также увеличить эффективность и скорость проведения операций за счет увеличения области облучения. В рамках реализации проекта в 2022/23 году была опубликована 1 статья в зарубежном журнале, индексируемом в Scopus и Web of Science и относящемся к Q1. Результаты работы были представлены в форме устных докладов на 2 научных мероприятиях в России и за рубежом. В 2023/24 году планируется подобрать оптимальный режим воздействия низкоинтенсивным излучением в красном и ближнем инфракрасном диапазонах для модулирования состояния клеток в сформированных с помощью биопечати трехмерных эквивалентах, оптимизировать протокол выделения нановезикул (в том числе матрикс-связанных везикул) и их комплексно охарактеризовать, разработать биочернила, содержащие клеточные сфероиды и/или нановезикулы и подходящие для использования в прототипе портативного биопринтера «Биоган», выполнить анализ их биосовместимости при подкожной имплантации у мышей. Будет опубликовано не менее 3 статей в международных журналах, индексируемых в Scopus и/или WoS. По результатам выполнения проекта будет разработан новый подход к восстановлению сложноорганизованных комплексов тканей, основанный на применении разработанных прототипа портативного биопринтера «Биоган» и биочернил, и будет опубликовано не менее 10 статей в международных журналах, индексируемых в Scopus и/или WoS.

 

Публикации

1. Бакулина А.А., Мусина Г.Р, Гавдуш А.А., Ефремов Ю.М., Командин Г.А., Восух М., Шпичка А.И., Зайцев К.И., Тимашев П.С. PEG-fibrin conjugates: the PEG impact on the polymerization dynamics Soft Matter, 19, 2430 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1039/d2sm01504h


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
В ходе выполнения работ в 2023/24 году в рамках проекта №22-75-10120 был выбран оптимальный режим воздействия низкоинтенсивным излучением в красном (633 нм) и ближнем инфракрасном (840 нм) диапазонах для модулирования состояния клеток в сформированных с помощью биопечати трехмерных эквивалентах. Для этого предварительно нами было установлено влияние фотобиомодуляции (ФБМ) на жизнеспособность культуры мезенхимных стромальных клеток (МСК) при воздействии ингибиторами (нитропруссид натрия, цисплатин и ротенон) в разных концентрациях. Показано, что при низкой концентрации нитропруссида натрия (25мкМ) и цисплатина (15 мкМ) облучение клеток имело положительный эффект на их жизнеспособность, что выражалось в снижении доли клеток в стадии апоптоза; при этом для высоких концентраций (100 мкМ и 30 мкМ, соответственно) значимого эффекта выявлено не было. При воздействии ротеноном (0,1 и 0,01 мкМ) облучение в красном и ближнем инфракрасном диапазонах способствовало снижению доли клеток в раннем апоптозе примерно на 3%. Оптимизация режима ФБМ при ингибировании культуры клеток ротеноном позволила установить интенсивность излучения (2,2 Дж/см2), которая способствовала повышению жизнеспособности на 20-40% и являлась безопасной в условиях сильного стресса. Установленный режим был использован для ФБМ состояния клеток в составе напечатанных конструктов на основе сфероидов из МСК. Наиболее выраженные эффекты отмечены для группы, подвергшейся облучению при длине волны 840 нм: уже спустя 24 часа после биопечати концентрация АТФ была выше примерно на 50% по сравнению с контролем, а через 14 дней установлено повышение метаболической активности на 20%, концентрации АТФ на 60% и ДНК на 50% и миграционной активности на 20% по сравнению с контрольной группой. Был оптимизирован протокол выделения нановезикул (экзосом и матрикс-связанных везикул (МСВ)), которые были комплексно охарактеризованы (включая протеомный анализ). В частности, нами было предложено исключить стадию децеллюляризации из стандартного ранее описанного нами протокол (Peshkova et al. 2024), так как было показано, что добавление 0,5% Тритона X-100 может в том числе нарушать целостность везикул и таким образом изменять состав их белков и микроРНК. В качестве источника нановезикул нами была использована культура клеток МСК пуповины человека. По результатам морфологического анализа выявлено, что выделенные экзосомы и МСВ, полученные по стандартному и оптимизированному протоколу, не имели отличий на микрофотографиях, полученных с помощью просвечивающей электронной микроскопии, а их размере лежал в диапазоне 55-178 нм. Установлено, что белки, содержащиеся в обоих типах везикул, значительно обогащают молекулярные пути, связанные с организацией внеклеточного матрикса, транспорта малых молекул, и вовлечены в иммунные процессы. Белковый состав экзосом по сравнению с МСВ больше обогащен протеинами, связанными с фактором роста эндотелия сосудов (VEGFA) и соответствующей тирозинкиназой VEGFR2, положительной регуляцией локомоции и заживлением ран, что свидетельствует об их более высоком потенциале к индукции васкулогенеза и клеточной миграции. Были разработаны биочернила, содержащие клеточные сфероиды и нановезикулы и подходящие для использования в прототипе портативного биопринтера «Биоган». Для их формирования нами была использована гидрогелевая система на основе фибрина и желатина, разработанная в рамках первого года выполнения проекта, трехдневные сфероиды из МСК и экзосомы. Показано, что введение экзосом в концентрации 50 мкг/мл в состав биочернил способствовало увеличению миграционной активности клеток и формированию более разветвленной сети отростков на 4-й день культивирования. При визуализации экзосом путем флуоресцентного мечения красителем PKH26 отмечено, их равномерное распределение в толще гидрогеля, а также выявлена способность МСК к их поглощению. Клетки в составе конструктов, сформированных с использованием биочернил с и без экзосом, сохраняли высокий уровень жизнеспособности. Анализ реологических свойств в эксплуатационных условиях показал, что вязкость материала сильно зависит от температуры и скачкообразно меняется при остывании, что выявило необходимость предусмотрения в конструкции биопринтера возможности термостатирования картриджей с компонентами биочернил и смесителя. Была установлена биосовместимость разработанных биочернил при подкожной имплантации у мышей BALB/c nude. Нами было сформировано 4 группы животных (n=6 в каждой группе), которым было имплантировано 4 типа имплантов: разработанная гидрогелевая система, биочернила (гидрогелевая система со сфероидами), бесклеточный эквивалент (конструкт, напечатанный с использованием гидрогелевой системы без клеток и содержащий коллагеновую мембрану), биоэквивалент (конструкт, напечатанный с использованием биочернил (гидрогелевая система с клетками) и содержащий коллагеновую мембрану). Показано, что через 7 суток после имплантации в группе «Гидрогелевая система» присутствует выраженный папилломатоз, высокая лимфо-макрофагальная инфильтрация и большое количество тучных клеток. Присутствие сфероидов в составе биочернил оказывало положительный эффект, немного снижая лимфо-макрофагальную инфильтрацию и содержание тучных клеток, а также способствуя проникновению иммунных клеток в толщу имплантата и улучшая его резорбцию. Лучшие результаты были выявлены для групп «Бесклеточный эквивалент» и «Биоэквивалент», так как в обеих группах наблюдалось снижение выраженности папилломатоза, уровня лимфо-макрофагальной инфильтрации (лучше в первой случае) и содержания тучных клеток (лучше во втором случае); при этом отмечалась хорошая резорбция: имплантаты были разрыхлены и разволокнены, а в их толще выявлялись многочисленные очаги иммунных клеток. Через 14 суток во всех группах отмечалось снижение выраженности папилломатоза, лимфо-макрофагальной инфильтрации и содержания тучных клеток, а также усиливалась резорбция имплантатов с появлением множественных очагов иммунных клеток в их толще. Лучшие результаты были отмечены для группы «Биоэквивалент», в которой по сравнению с другими обнаруживалась самая слабая воспалительная инфильтрация и самая значимая резорбция имплантата. Анализ МР-томограмм животных на 7-е и 21-е сутки после имплантации подтвердил присутствие резорбтивного процесса, преобладающего в группах, где импланты содержали клеточные сфероиды. С целью оптимизации конструкции прототипа биопринтера нами были рассмотрены свойства и методы получения различных эластомерных матриц, подходящих для изготовления электроактивных полимерных актуаторов, использование которых потенциально способно снизить массу конечного изделия, что будет являться существенным достижением при создании устройства для нанесения биочернил на поверхность ран. В рамках реализации проекта в 2023/2024 году было опубликовано 3 статьи в зарубежных журналах, индексируемых в Scopus и Web of Science и относящихся к Q1-Q2. Результаты работы были представлены в форме устных и стендовых докладов на 3 научных мероприятиях. В 2024/25 году планируется оптимизировать конструкцию прототипа портативного биопринтера «Биоган» с учетом свойств разработанных биочернил и установленного оптимального режима воздействия низкоинтенсивным излучением в ближнем инфракрасном диапазоне, разработать протокол использования прототипа с целью восстановления сложноорганизованных комплексов тканей, установить безопасность и эффективность применения разработанного подхода in vivo на модели незаживающих ран у свиней. Будет опубликовано не менее 3 статей в международных журналах, индексируемых в Scopus и/или Web of Science. По результатам выполнения проекта будет разработан новый подход к восстановлению сложноорганизованных комплексов тканей, основанный на применении разработанных прототипа портативного биопринтера «Биоган» и биочернил, и будет опубликовано не менее 10 статей в международных журналах, индексируемых в Scopus и/или WoS.

 

Публикации

1. Бикмулина П.Ю., Кошелева Н.В., Ефремов Ю.М., Бакулина А.А., Курьянова А., Аксенова Н.А., Шавкута Б.С., Котова С.Л., Шпичка А.И., Тимашев П.С. Building a tissue: gingiva- and adipose-derived mesenchymal cell spheroids’ survivability and functionality after 3D extrusion bioprinting Bioprinting, 32, (2023), e00279 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1016/j.bprint.2023.e00279

2. Пешкова М.А., Корнеев А.А., Ревокатова Д.П., Смирнова О.А., Ключарев Т.О., Шендер В.О., Арапиди Г. П., Кошелева Н.В., Тимашев П.С. Four sides to the story: A proteomic comparison of liquid-phase and matrix-bound extracellular vesicles in 2D and 3D cell cultures Proteomics, e2300375 (год публикации - 2024) https://doi.org/10.1002/pmic.202300375

3. Филиппова О.В., Максимкин А.В., Дайюб Т., Ларионов Д.И., Телышев Д.В. Sustainable Elastomers for Actuators: “Green” Synthetic Approaches and Material Properties Polymers, Polymers 2023, 15, 2755 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/polym15122755