КАРТОЧКА
ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер 19-75-10062
НазваниеНовые подходы к терапии пациенток с BRCA1-ассоциированными карциномами яичника
РуководительКотив Христина Богдановна, Кандидат медицинских наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова" Министерства здравоохранения Российской Федерации, г Санкт-Петербург
| Период выполнения при поддержке РНФ | 07.2022 - 06.2024 |
Конкурс Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по мероприятию «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными (41).
Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-208 - Онкология
Ключевые словаРак яичника, мутация BRCA1, неоадъювантная терапия, клинический ответ, патоморфоз, химиотерапия, клиническое испытание, митомицин Ц, «BRCAness»
Код ГРНТИ76.29.49
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Поиск подходов, позволяющих осуществлять эффективное лечение метастатического рака яичника (РЯ), является крайне актуальной задачей. Проект 2019 был направлен на самую перспективную категорию пациенток – женщин с BRCA1/2-ассоциированными карциномами. Мы инициировали несколько испытаний, целью которых является изучение эффективности митомицина Ц в комбинации с цисплатином (MP) у пациенток с наследственными мутациями BRCA1/2. Для сравнения использовался «золотой стандарт» системной предоперационной терапии – схема «паклитаксел и цисплатин» (TCbP). В ходе Проекта 2019 мы продемонстрировали преимущество схемы MP в отношении частоты объективных клинических ответов у носителей мутаций BRCA1. Для завершения этого испытания необходимо оценить такие конечные точки, как продолжительность бесплатинового интервала и безрецидивную выживаемость.
У носителей мутаций BRCA2, по-видимому, обе используемые платиносодержащие схемы системной терапии, и с митомицином Ц, и с паклитакселом, высокоэффективны. У половины привлеченных в испытание пациенток были зарегистрированы полные морфологические регрессы в яичнике и сальнике. В продолжение Проекта 2019 мы намерены развить эти исследования и привлечь дополнительные коллекции BRCA2-ассоциированных опухолей.
Мы продолжим инициированное в 2022 году клиническое испытание схемы MP у пациенток со спорадическим РЯ, опухоли которых развиваются по сходному патогенетическому механизму (BRCAness).
Наши исследования по наследственному РЯ были выполнены на группах больных, которые проходили лечение в НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова. Особенностью российских пациенток является относительно узкий спектр мутаций BRCA1/2, которые представлены преимущественного т.н. повторяющимися аллелями BRCA1. Благодаря сотрудничеству с профессором Анной Фаготти (Anna Fagotti) из университетской клиники Агостино Джемелли (Рим), мы получили доступ к новой коллекция наследственных карцином яичника. В отличие от российской коллекции наследственных РЯ, у итальянских пациенток наблюдается более широкий спектр мутаций в генах BRCA1/2, при этом имеется достаточно большое количество BRCA2-ассоциированных опухолей.
В продолжение Проекта 2019 мы выполним исследования по нескольким клиническим и фундаментальным направлениям:
I. Клинические испытания (отдаленные результаты лечения в испытании MP vs. TCbP у носительниц мутаций BRCA1 и непосредственные результаты у пациенток с феноменом BRCAness)
II. Восстановление функции гомологичной рекомбинации как механизм адаптации BRCA1/2-дефицитных карцином к производным платины
1) Вторичные соматические мутации, восстанавливающие «рамку считывания»
Появление таких мутаций продемонстрировано для карцином, подвергавшихся длительному лечению производными платины. Мы установим, причастен ли подобный механизм к формированию остаточных опухолей в процессе краткосрочного воздействия неоадъювантной химиотерапии.
2) Феномен «восстановления гетерозиготности» в локусе BRCA1/2
Одним из достижений российского коллектива является идентификация нового механизма возникновения лекарственной резистентности для BRCA1-ассоциированных РЯ – селекции предсуществующих опухолевых клеток, которые демонстрируют сохранность второго аллеля данного гена. Эти наблюдения нуждаются в валидации на независимой выборке РЯ – именно анализ «реверсии LOH (loss-of-heterozygosity)» в резидуальных опухолях являлся основной мотивацией для получения итальянской коллекции парных опухолевых образцов. Мы установим, характерен ли подобный механизм для мутаций BRCA2.
3) Инактивирующие мутации в гене TP53BP1 и другие соматические мутации, ассоциированные с чувствительностью к платине
III. Сравнение BRCA1- и BRCA2-ассоциированных карцином яичника
Мы оценим, есть ли различия в клинико-биологических особенностях BRCA1- и BRCA2-ассоциированных карцином, в том числе в чувствительности к платине, а также сравним эффективность терапии у носителей мутаций BRCA1 в пределах ovarian cluster region и вне его.
Ожидаемые результаты
Получение отдалённых результатов клинического испытания MP vs. TCbP у пациенток с распространенным BRCA1-ассоциированным раком яичника позволит обосновать или опровергнуть необходимость включения схемы «митомицин Ц и цисплатин» в клинические рекомендации по лечению наследственного РЯ.
Пилотное испытание эффективности этой схемы у пациенток с феноменом BRCAness позволит уточнить, имеет ли митомицин-содержащая BRCA-специфическая терапия преимущество перед стандартной терапией в лечении этой категории опухолей. Мы оценим частоту морфологических регрессов, частоту регрессов перитонеального канцероматоза и объективного клинического ответа.
Ранее нами был продемонстрирован принципиально новый механизм адаптации BRCA1-ассоциированных опухолей к терапии препаратами платины, заключающийся в селекции предсуществующих клеток с сохранным оставшимся аллелем данного гена. Чрезвычайно важно валидировать эти наблюдения на независимой коллекции образцов РЯ – карциномах яичника высокой степени злокачественности (high grade serous ovarian cancer, HGSOCs), предоставленных в наше распоряжение университетской клиникой Агостино Джемелли (Рим). Кроме того, мы установим, причастна ли «реверсия LOH» к формированию лекарственной резистентности для BRCA2-ассоциированных РЯ. Появление «вторичных» мутаций в генах BRCA1/2, восстанавливающих «рамку считывания», продемонстрировано для РЯ, подвергавшихся терапии производными платины на протяжении многих лет. В рамках проекта будет установлено, причастен ли этот механизм к формированию резидуальных опухолей в процессе краткосрочного воздействия НАПХТ. Будут изучены на клиническом материале механизмы приобретённой лекарственной резистентности, ранее продемонстрированные в экспериментах на клеточных культурах. Будут выполнены сравнительные исследования предиктивной значимости различных мутаций в генах BRCA1 и BRCA2.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Проект направлен на изучение клинических и биологических аспектов предоперационной (неоадъювантной) химиотерапии (НАХТ) при BRCA1- и BRCA2-ассоциированном раке яичника. В 2022-2023 году работы по проекту были посвящены решению двух задач: 1) анализу эффективности новой химиотерапевтической схемы «митомицин Ц и цисплатин» (MP) в рамках проспективного рандомизированного клинического испытания; 2) молекулярному анализу коллекции наследственных карцином яичника, полученной из клиники Джемелли (коллекция Фаготти).
Мы продолжили наблюдение за пациентками из проспективного исследования NCT04747717, направленного на анализ эффективности неоадъювантной схемы «митомицин Ц 10 мг/м2 + цисплатин 100 мг/м2» (MP) при первичном распространенном BRCA1-ассоциированном РЯ в сравнении со стандартным режимом «паклитаксел 175 мг/м2 и карбоплатин (6 AUC)» (TCbP). На сегодня набор больных в исследование уже завершен. Всего в испытание привлечено 40 носительниц патогенных аллелей BRCA1: 22 пациентки рандомизированы в группу MP, 18 – в группу сравнения. В этих группах мы сопоставили непосредственные результаты терапии (выраженность патоморфологического регресса, снижение индекса перитонеального канцероматоза, возможность выполнения полной циторедукции после 3-4 циклов терапии, клинический ответ по критериям RECIST) и продемонстрировали последовательное преимущество схемы MP относительно стандартного режима. Значимое различие было обнаружено для индекса перитонеального канцероматоза (PCI). Индекс перитонеального канцероматоза отражает распространенность опухолевых отсевов по брюшине в брюшной полости и полости малого таза. Наиболее благоприятным исходом НАХТ при РЯ является снижение этого индекса до 0. В группе MP полный регресс перитонеального канцероматоза был достигнут в 6/20 (30%), в контрольной группе – 3/13 (23%) (p = 0.09). Средняя величина PCI после НАХТ составила 3.4+/-0.66 и 6.31+/-1.48 в группе MP и TCbP, соответственно (p = 0.05, t-test). Достижение полной циторедукции (CC-0: нет видимых опухолевых очагов в результате резекции) было возможным 16/21 (76%) в экспериментальной группе и 9/18 (50%) в группе стандарта (p = 0.09, точный критерий Фишера). В группе MP частота объективных ответов (полный и частичный ответ) составила 19/21 (91%), еще в двух случаях зарегистрирована стабилизация. В контрольной группе у двух из 18 пациенток (11%) было зарегистрировано прогрессирование на фоне НАХТ, а частота объективных ответов составила (72%). Однако это численное различие было статистически недостоверным. В отношении патоморфологического регресса различий между экспериментальной группой и пациентками, которые получали стандартную терапию, выявлено не было. Так, в группе MP CRS3 (выраженный регресс, соответствующий суммарному размеру остаточных опухолевых фокусов не более 2 мм, или полная элиминация опухолевых клеток) был достигнут в 6/18 случаев (33%), из которых в 3 был зарегистрирован полный регресс очагов в сальнике. В группе TCbP частота достижения CRS3 была сходной (5/16 [31%]). Мы также провели предварительную оценку отдаленных результатов: на сегодня длительность бесплатинового интервала и время до прогрессирования (PFS) в группах MP и TCbP достоверно не отличаются. Эти данные будут обновлены на завершающем этапе проекта. Опухолевые образцы пациенток из проспективного испытания по мере завершения оперативного этапа лечения подвергаются молекулярно-генетическому исследованию: анализу соматических мутаций в известных онкоассоциированных генах, анализу потерь гетерозиготности BRCA1, а также анализу вторичных соматических мутаций BRCA1, восстанавливающих рамку считывания. Одним из наблюдений, которое было сделано на этом этапе, стала ассоциация типа мутаций TP53 (миссенс-мутаций, т.е. мутаций, приводящих к аминокислотным заменам, или не-миссенс мутаций) с достижением продолжительности бесплатинового интервала более 12 месяцев. Так, длительность клинической ремиссии более года была зарегистрирована у 10/10 (100%) пациенток, в опухолях которых были обнаружены не-миссенс мутации, и только у 3/12 (25%) пациенток с аминокислотными заменами (p<0.001).
Второй задачей данного этапа проекта являлся молекулярный анализ итальянской коллекции 45 наследственных РЯ, которая была предоставлена в наше распоряжение профессором Анной Фаготти. Эта коллекция представлена парными образцами опухолей, которые получены от пациенток с мутациями BRCA1/2 до начала и по завершении стандартной неоадъювантной терапии. Информативными для парного анализа были 30 случаев РЯ: 17 BRCA1- и 13 BRCA2-ассоциированных карцином. При анализе 30 парных образцов LOH в локусе BRCA1 или BRCA2 наблюдался во всех первичных (хемонаивных) опухолях. Анализ NGS-прочтений показал, что между фракцией мутации TP53 и избытком мутантных прочтений BRCA1 или BRCA2 (т.е. фракцией клеток с LOH) существует высокая достоверная корреляция как в первичных хемонаивных образцах, так и после НАХТ (r = 0.82, p < 0.0001 и r = 0.71, p < 0.0001, до и после терапии, соответственно). Изменение фракций мутаций TP53 и избытка мутантных прочтений BRCA1/2 до и после терапии также демонстрирует значимую корреляцию (r = 0.77, p < 0.0001). Одновременно, в парном t-тесте различия в изменении фракций мутаций TP53 и избытка мутантных прочтений BRCA1 (или BRCA2) относительно друг друга являются недостоверными. Эти наблюдения, очевидно, отражают тот факт, что основная популяция опухолевых клеток, элиминирующихся в ходе терапии, содержит оба молекулярных повреждения – мутации TP53 и потерю гетерозиготности BRCA1/2.
Образцы после НАХТ в целом содержат более низкие фракции и мутации TP53, и доли LOH (парный t-test для образцов до и после терапии p < 0.0001 для избытка мутантных прочтений BRCA1/BRCA2 и p < 0.0001 для фракции мутации TP53). Наиболее вероятным объяснением меньшего присутствия мутантных прочтений TP53 в образцах после НАХТ является истощение живых опухолевых клеток вследствие химиотерапевтического давления. При рассмотрении индивидуальных образцов в четырех случаях наблюдалась выраженная элиминация мутантных прочтений BRCA1/2 по сравнению с количеством мутантных прочтений TP53.
Кроме того, ожидалось, что объединение итальянской коллекции и собственных случаев наследственных РЯ позволит получить более достоверные результаты в отношении редких, но значимых с точки зрения чувствительности к платине, событий, таких как вторичные мутации BRCA1/2. На сегодня в проанализированных образцах обеих коллекций (из проспективного испытания и коллекции Фаготти) от 72 пациенток c мутациями BRCA1/2, которые получали НАХТ, не было обнаружено вторичных соматических мутаций, восстанавливающих рамку считывания. Таким образом, можно заключить, что этот механизм восстановления функции BRCA1/2 не является характерным при краткосрочной химиотерапии.
Публикации
1. А.П. Соколенко, А.О. Иванцов, Т.В. Городнова, Х.Б. Котив, И.В. Бизин, Е.Н. Имянитов Иммунное микроокружение в серозных карциномах яичника высокой степени злокачественности: ассоциация с молекулярными характеристиками и ответ на стандартную неоадъювантную терапию Вопросы онкологии, Том 69, №1, С:74-81 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.37469/0507-3758-2023-69-1-74-81
2. Х.Б. Котив, Т.В. Городнова, О.Е. Лавринович, И.В.Берлев Малигнизированные эндометриоз-ассоциированные овариальные и экстраовариальные неоплазии: обзор литературы Опухоли женской репродуктивной системы, - (год публикации - 2022)