КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 19-75-30032

НазваниеЦитокины - медиаторы физиологических процессов и терапевтические мишени

РуководительНедоспасов Сергей Артурович, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук, г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2023 г. - 2025 г. 

Конкурс Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по мероприятию «Проведение исследований научными лабораториями мирового уровня в рамках реализации приоритетов научно-технологического развития Российской Федерации» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными (33).

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-108 - Иммунология

Ключевые словацитокины, рецепторы, воспаление, аутоиммунные заболевания, неоплазии, анти-цитокиновая терапия, регуляция экспрессии

Код ГРНТИ34.15.33


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Природные функции большинства цитокинов направлены на поддержание гомеостаза разных систем организма, а также на его защиту от неблагоприятных воздействий, но в случае неправильной регуляции те же сигнальные каскады могут приводить к патологическим состояниям. В ходе реализации Проекта-2019 были установлены некоторые новые физиологические функции двух родственных цитокинов - TNF и лимфотоксина-альфа, в том числе, связанные с их ролью в органогенезе лимфоидных органов. Кроме того, в модели химически-индуцированного рака показана разнонаправленность фенотипа мышей с нокаутом по этим цитокинам. Основным инструментарием лаборатории заявителя остаются уникальные линии генетически-модифицированных мышей с нокаутом цитокинов в конкретном типе клеток, панель которых создается и расширяется в течение длительного времени. Отметим, что благодаря высокоимпактным публикациям, эти модели хорошо известны в мире и используются в десятках лабораторий. В ходе реализации Проекта-2019 была убедительно продемонстрирована патогенетическая роль TNF из миелоидных клеток в экспериментальном артрите. В другом оригинальном исследовании на молекулярном уровне охарактеризован особый иммунометаболический фенотип, который приобретают макрофаги и дендритные клетки при первой встрече с аллергеном, определяя дальнейший ход иммунного ответа и тяжесть течения астмы. Также сразу в нескольких параллельных исследованиях были изучены свойства биспецифичных антител, которые несут в своем составе TNF-нейтрализующий модуль и домен, связывающий рецептор на поверхности миелоидных клеток. Проведена сравнительная оценка таких биспецифичных антител, избирательно таргетирующих TNF из конкретного типа клеток, в сравнении с системным блокатором в нескольких экспериментальных моделях, что по сути является частью доклинических исследований терапевтического антитела нового типа. Наконец, обоснована применимость комбинированной нейтрализации IL-6 и TNF в модели аллерген-индуцированной астмы. Несмотря на успешное применение анти-TNF терапии при воспалительных заболеваниях кишечника, детальная роль TNF и его рецепторов в контексте этих патологий до сих пор однозначно не установлена. В 2022 г. завершено и опубликовано многолетнее исследование механизма действия блокаторов TNF при воспалении кишечника с использованием уникальной линии мышей, гуманизированных по TNF. Результаты лаборатории имеют первостепенное значение для перспективных клинических исследований и для медицины будущего с целью оптимизации и персонализации антицитокиновой терапии, а также поиска более эффективных методов лечения аутоиммунных, нейроиммунных и воспалительных заболеваний и рака. Как было отмечено выше, коллективом опубликованы работы, раскрывающие роль цитокинов из определенных клеточных источников в развитии заболеваний. Вместе с этим, образовался значимый экспериментальный задел для продолжения работы: были подняты новые вопросы о функциях цитокинов в таких процессах, как метаболизм, контроль симбиотической микробиоты и поддержка других регуляторных систем организма – нервной, эндокринной. Так, в случае продления Проекта предполагается показать, во-первых, роль лимфотоксина в развитии и функционировании клеток миелоидного ряда – моноцитов и нейтрофилов – и, таким образом, его влияние на нейровоспаление. Затем, требуют подтверждения предварительные данные о том, что IL-6 из дендритных клеток необходим для развития популяции иммунных клеток кишечника, контролирующих микробиоту, которые также задействованы в аутоиммунных патологиях и развитии рака. Наконец, в лаборатории активно развиваются подходы к изучению актуальной темы иммунометаболизма – влияния путей и источников энергетического обмена на функции иммунных клеток. Исследования в данном направлении уже продемонстрировали новые функции TNF, и в случае продления Проекта ожидается более детальное рассмотрение механизмов вовлечения цитокинов в метаболические изменения клеток, а также «память» врожденного иммунитета.

Ожидаемые результаты
Проект 2019 был сосредоточен в большей степени на изучении роли цитокинов TNF, LT и IL-6 в патологии, а именно, в заболеваниях человека, смоделированных на мышах. Важной частью проекта являлось изучение возможности влияния на эти заболевания при помощи антицитокиновой терапии. Результаты Проекта 2019, а также огромный пласт работ других исследователей последних лет, подсветили неполноту знаний о роли этих молекул в гомеостазе, процессе поддержания нормальных функций организма. Поэтому в продолжении проекта будет критически важно установить роль TNF, LT и IL-6 в таких процессах как регуляция соотношения различных иммунных клеток во внутренних средах (крови), на слизистых (в кишечнике) и в центральной нервной системе, а также показать вклад цитокинов в регуляцию состава микробиоты, и, наконец, метаболизма на организменном и клеточном уровнях. Предполагается, что лимфотоксин важен для развития и функционирования клеток миелоидного ряда. Ожидается, что в крови Lta-дефицитных мышей будет происходить накопление неклассических моноцитов, в связи с чем деплеция миелоидных клеток в ходе развития экспериментального аутоиммунного энцефаломиелита (ЕАЕ) у Lta-дефицитных мышей приведет к ухудшению симптомов заболевания (Рисунок 1). Предполагается, что дифференцировка моноцитов будет опосредована лимфотоксином из ILC3 или В-клеток (Рисунок 2). Также ожидается, что в отсутствие Ltbr нарушается функциональность нейтрофилов, поэтому деплеция таких клеток при индукции ЕАЕ приведет к улучшению симптомов заболевания. Согласно другой нашей гипотезе, IL-6 важен для развития клеток, контролирующих микробиоту, которая, в свою очередь, может вносить вклад в патологии кишечника и мозга. Ожидается, что у мышей с полным и дендритно-клеточным удалением IL-6 будет снижена доля RORgt+ клеток, и изменена экспрессия RORgt-зависимых генов в кишечнике по сравнению с мышами дикого типа (Рисунок 3). Таким образом, будет показано, что дендритные клетки являются необходимым для дифференцировки RORgt+ клеток источником IL-6. Кроме того, ожидается, что у CD11c IL-6 KO мышей будет повышено содержание сегментированной нитчатой бактерии (SFB), что будет отражаться на балансе популяций регуляторных Т-клеток и Th17-клеток в ходе развития ЕАЕ. Предполагается, что при удалении IL-6 в CX3CR1+ тканерезидентных макрофагах будет происходить изменение поляризации Т-клеток только в ЦНС (Рисунок 4). В последние годы на пике актуальности находятся исследования иммунометаболизма, в том числе, миелоидных клеток. В ходе проекта будут изучены метаболические профили макрофагов при поляризации, либо в условиях генетической инактивации или фармакологической блокировки цитокинов и их рецепторов для определения механизмов регуляции метаболических адаптаций этих клеток. Предполагается, что передача сигнала через TNFR2, который, в отличие от TNFR1, как правило, отвечает за «гомеостатический» сигнал от TNF, будет важен в контексте LPS-индуцированной метаболической адаптации макрофагов. Предполагается, что эффективность комбинированной блокировки цитокинов в экспериментальной аллергической астме (Рисунок 5) объясняется, в том числе, изменением метаболического профиля макрофагов в модели HDM-индуцированного тренированного иммунитета. Предложенный план работ и ожидаемые результаты соответствуют мировому уровню исследований и отражают такие актуальные темы как иммунометаболизм, "тренированный" иммунитет и роль взаимодействия с микробиотой в развитии иммунных клеток и их способности контролировать различные заболевания. Исследование комплексной роли цитокинов в этих процессах несомненно расширит понимание применимости персонализированной антицитокиновой терапии. Рисунки к пункту 1.3 размещены в разделе с дополнительными материалами (пункт 1.17).


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
В 2023 г. основные усилия этого комплексного проекта были направлены на изучение роли цитокинов в гомеостазе тканей и в индукции и поддержании острого и хронического воспаления в различных экспериментальных моделях. ЦИТОКИНЫ В ВОСПАЛЕНИИ И РЕГУЛЯЦИИ ГОМЕОСТАЗА КИШЕЧНИКА Широко применяемая в терапии аутоиммунных заболеваний блокировка TNF в ряде случаев не вызывает положительного эффекта, а иногда может даже усугублять клинические симптомы заболеваний. В связи с этим изучение модальностей передачи сигнала через рецепторы TNF при различных патологиях представляет большой интерес. Оказалось, что при индукции хронического колита у мышей с нарушением передачи сигнала через TNFR2 наблюдается более значительное повреждение кишечника. При этом на клеточном уровне отсутствие адекватной передачи сигнала через TNFR2 приводит к нарушению баланса патогенных Th17-клеток. Полученные результаты могут объяснять отсутствие положительного эффекта от анти-TNF терапии у некоторых пациентов. Другим критически важным цитокином, необходимым для обеспечения целостности кишечного барьера в условиях воспаления, является IL-6. За отчетный период установлено, что IL-6 важен для поддержания гомеостаза двух популяций, экспрессирующих транскрипционный фактор RORgt, – относительно недавно описанных MHCII+ RORgt+ антиген-презентирующих клеток, а также RORgt+ регуляторных Т-клеток. Скорее всего, нарушение гомеостаза этих клеточных популяций отражается и на функциональности ткани: дефицит IL-6 приводит к снижению экспрессии RORgt-ассоциированных генов, а именно Il17, Il23, Il22 в кишечнике. Эти факторы поддерживают пролиферацию эпителиальных клеток и являются патогенными в контексте колоректального рака. Для дальнейшего изучения роли IL-6 в поддержании гомеостаза кишечника были сконструированы новые линии мышей с тканеспецифичным удалением IL-6 в Т-клетках и В-клетках. ЦИТОКИНЫ В ГОМЕОСТАЗЕ ЦНС И НЕЙРОВОСПАЛЕНИИ Разработка терапевтических подходов, направленных на модуляцию симптомов нейровоспалительных заболеваний, в том числе рассеянного склероза, является актуальной задачей. Известно, что цитокины играют ключевую роль в нейровоспалении, в связи с чем изучается роль IL-6, продуцируемого различными типами миелоидных клеток, в модели экспериментального аутоиммунного энцефаломиелита. За отчетный период были установлены клеточные механизмы, объясняющие частичную устойчивость мышей с инактивацией IL-6 в микроглии к индукции ЕАЕ. Кроме того, у мышей с удалением LTa происходит экспансия популяции миелоидных клеток, обладающих супрессорными функциями. В то же время сигнальный путь, опосредуемый LTbR, является патогенным в контексте ЕАЕ за счет экспансии нейтрофилов и повышения продукции ими активных форм кислорода. ЦИТОКИНЫ И ИММУНОМЕТАБОЛИЗМ МАКРОФАГОВ Одним из механизмов действия цитокинов в контексте воспаления является иммунометаболическое ремоделирование различных клеток, в основном миелоидного происхождения. За отчетный период было установлено, что дисфункция TNFR1 приводит к снижению показателей гликолиза и дыхания в ответ на про- и противовоспалительные стимулы. Это сопровождалось изменениями как в состоянии митохондрий, так и в продукции других цитокинов, а именно в снижении продукции IL-10 и NO и увеличении продукции IL6 в ответ на активацию LPS и IFNg. Системная комбинированная фармакологическая блокировка TNF и IL-6 может рассматриваться в качестве терапевтического подхода в лечении аллергической астмы. За отчетный период были изучены изменения метаболического профиля макрофагов на фоне нейтрализации TNF и IL-6 в ответ на активацию аллергеном. Установлено, что макрофаги имеют более гликолитический фенотип в ответ на аллерген, что согласуется с отсутствием изменений мембранного потенциала митохондрий, характерного для митохондриального дыхания. Итаконат – иммунорегуляторный метаболит, продуцируемый миелоидными клетками и играющий ключевую роль в регуляции иммунного ответа. За отчетный период показано, что итаконат влияет на продукцию цитокинов в модели ЛПС-индуцированного воспаления за счет ингибирования активности сукцинатдегидрогеназы. За отчетный период были установлены видоспецифичные особенности поляризации и иммунометаболического профиля макрофагов голого землекопа, которые могут быть связаны с механизмами поддержания необычной продолжительности жизни и резистентности к опухолеобразованию. ЦИТОКИНОВОЕ ПРОФИЛИРОВАНИЕ В ГОМЕОСТАЗЕ И В КОНТЕКСТЕ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНО ИНДУЦИРОВАННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ Одно из новых направлений исследований лаборатории касается изучения системной и/или локальной (в тканях или в отдельных клетках) продукции широкого спектра цитокинов. За отчетный период были изучены особенности продукции цитокинов у мышей с гуманизацией гена ACE2 в ответ на иммунизацию цельновирионной инактивированной вакциной КовиВак. Было показано образование в ответ на иммунизацию полифункциональных популяций вирус-специфичных Т-клеток, продуцирующих TNF и IFNg. Эксперименты по адоптивному переносу таких Т-клеток не вакцинированным мышам с гуманизацией гена АСЕ2 и последующим заражением продемонстрировали защитный эффект против штамма Омикрон. Парадоксально, что необходимым фактором защиты являются не нейтрализующие антитела против S белка SARS-CoV-2.

 

Публикации

1. Анисов Д.Э., Друцкая М.С., Носенко М.А., Недоспасов С.А. Итаконат регулирует продукцию цитокинов за счет подавления сукцинатдегидрогеназы в модели ЛПС-индуцированного воспаления Медицинская иммунология, Т. 25, №3, стр. 477-482 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.15789/1563-0625-IMI-2841

2. Гоголева В.С., Друцкая М.С., Недоспасов С.А. Иммунобиология лимфотоксина: роль в мышиной модели рассеянного склероза Российский иммунологический журнал, Т. 26, №4, стр. 437-442 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.46235/1028-7221-13534-IOL

3. Горшкова Е.А., Губернаторова Е.О., Дворянинова Е.М., Юракова Т.Р., Марей М.В., Аверина О.А., Хольце С., Хильдебрандт Т.Б., Дмитриев А.А., Друцкая М.С., Высоких М.Ю., Недоспасов С.А. Macrophages from naked mole-rat possess distinct immunometabolic signatures upon polarization Frontiers in immunology, 14:1172467 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1172467

4. Круглов А.А., Бондарева М.А., Гоголева В.С., Семин Я.К., Астраханцева И.В., Зварцев Р., Лунин А.С., Аполохов В.Д., Шустова Е.Ю., Волок В.П., Устюгов А.А., Ишмухаметов А.А., Недоспасов С.А., Козловская Л.И., Друцкая М.С. Inactivated whole virion vaccine protects K18-hACE2 Tg mice against Omicron SARS-CoV-2 variant via cross-reactive T cells and non-neutralizing antibody responses European Journal of Immunology, e2350664 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1002/eji.202350664

5. Недоспасов С.А. Сложная иммунобиология фактора некроза опухолей и новая анти-TNF терапия Медицинская иммунология, Том 25, №3, стр. 435-440 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.15789/1563-0625-COI-2860

6. Юракова Т.Р., Горшкова Е.А., Носенко М.А., Губернаторова Е.О., Друцкая М.С. Иммунометаболические изменения макрофагов в ответ на экстракт пылевого клеща Медицинская иммунология, Т. 25, №3, стр. 617-624 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.15789/1563-0625-ICI-2827

7. Юракова Т.Р., Горшкова Е.А., Носенко М.А., Друцкая М.С. Взаимосвязь метаболических изменений и функций макрофагов в гомеостазе и при воспалении Биохимия, - (год публикации - 2024)

8. Недоспасов С.А., Друцкая М.С., Круглов А.А. Anti-Tumour Necrosis Factor and New Paradigms for Therapies Using Antibodies Molecular Biology of B cells, - (год публикации - 2024) https://doi.org/10.​1016/​B978-0-323-95895-0.​00008-8