Персонифицированные математические модели в кардиологии

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 14-35-00005

НазваниеПерсонифицированные математические модели в кардиологии

Руководитель Соловьева Ольга Эдуардовна, Доктор физико-математических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н. Ельцина" , Свердловская обл

Конкурс №3 - Конкурс 2014 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований вновь создаваемыми научной организацией и вузом совместными научными лабораториями»

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-102 - Патологическая анатомия, патологическая физиология

Ключевые слова персонализированная медицина, сердечно-сосудистые заболевания, сердечные аритмии, сердечная недостаточность, ишемическая болезнь сердца, пороки сердца, дилатационная кардиомиопатия, левый желудочек сердца, электрофизиология, компьютерное моделирование, сопряжение возбуждения с сокращением, сердечная механо-электрическая обратная связь, кардиомиоцит, спиральная волна, фракция выброса

Код ГРНТИ34.03.23

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
В настоящее время наблюдается взрыв в развитии компьютерной медицины, которая уже становится одним из необходимых инструментов медицинской науки и практики, фармакологии и образования. Разработка ориентированных на пациента компьютерных моделей физиологических систем человека с целью выяснения механизмов патогенеза заболеваний, методов их ранней диагностики, прогноза и эффективного лечения является приоритетным направлением персонализированной медицины. Настоящий проект посвящен разработке компьютерных моделей сердечно-сосудистой системы (ССС) человека, которые можно будет использовать в клинике в качестве виртуального стенда, интегрирующего лабораторно-клинические данные об изменении структуры и функции ССС пациента от молекулярно-клеточного до органного уровня с целью прогноза возможных нарушений электрической и механической функции сердца у данного больного и выбора оптимального лечения. Благодаря развитию современных компьютеризованных средств диагностики, сложилась парадоксальная ситуация, при которой знания врача об индивидуальных особенностях изменений ССС конкретного пациента превосходят возможность понимания последствий этих изменений. Данный проект направлен на устранение этого парадокса. Приоритетная актуальность и социальная значимость этой амбициозной задачи определяются высокой частотой заболеваний ССС и их лидирующим положением в структуре смертности населения по сравнению с другими заболеваниями. Аналогичные проекты успешно реализуются в ряде стран мира, в том числе в США, Великобритании, Новой Зеландии, при весомой финансовой поддержке национальных фондов, включая Национальный институт здоровья США, интернациональные программы Европейского союза и другие авторитетные международные фонды. Несмотря на значительные успехи зарубежных научных групп в разработке компьютерных моделей ССС, их применимость в клинической практике ограничена. Наибольшие успехи достигнуты в области построения электрофизиологических моделей сердца в норме и при патологии, в то время как модели механической функции сердца разработаны существенно хуже. Особый дефицит наблюдается в моделях, интегрирующих электрические и механические процессы в миокарде на клеточном и тканевом уровне с учетом прямых и обратных связей между ними. Кроме этого, существующие модели плохо учитывают ключевую для морфофизиологии взаимосвязь между индивидуальной геометрией камер сердца и ходом волокон в их стенках. Настоящий проект основан на многолетнем опыте его участников в исследовании и моделировании электрической и механической функции миокарда на молекулярно-клеточном, тканевом и органном уровне. Следуя классическим методам исследований физиологических систем и подходам традиционной медицины, сначала описывающим типичное поведение системы (терапевтические протоколы) для некоторой заданной популяционной выборки, наши предварительные исследования также были направлены на разработку «популяционных» моделей миокарда, опирающихся на усредненные параметры, характерные для некоторой группы животных данного вида или человека в норме или при определенной патологии. На выходе такие модели описывают некоторое усредненное по данной популяции качественное поведение миокарда и сердца как органа. Благодаря этим исследованиям к настоящему времени нами разработаны базовые модели электрической и механической функции сердечной клетки, ткани, левого желудочка (ЛЖ), опираясь на которые, мы готовы перейти к решению более специфических и амбиционных задач, которые впервые поставлены в данном проекте и непосредственно относятся к области персонифицированной медицины. Мы будем адаптировать (настраивать) разрабатываемые нами популяционные модели ССС человека к конкретному пациенту с учетом индивидуальных особенностей патогенеза заболевания и персональных структурно-функциональных параметров его ССС. Эти параметры будут определяться на основе персональных клинических данных пациента и передаваться в качестве входных параметров в соответствующие модели молекулярно-клеточного и органного уровня. Такая персонифицированная интегративная модель позволит провести исследование индивидуальных особенностей нарушений функции ССС этого пациента при различных испытаниях, которым можно подвергать виртуальную ССС, а не самого пациента. В рамках данного проекта персонифицированные модели будут формироваться на основе разрабатываемой трехмерной (3D) интегративной модели ЛЖ сердца человека, сопряженной с упрощенной моделью сосудистой системы, позволяющей имитировать влияние сосудистого импеданса (постнагрузку) и венозного возврата (преднагрузку). В основу 3D модели ЛЖ будет положен разработанный нами альтернативный большинству известных моделей аналитический принцип описания морфологии, при котором параметры геометрии ЛЖ напрямую связаны с расположением хода волокон в нем и могут легко настраиваться в соответствии с персональными изменениями геометрии ЛЖ пациента. Модель миокарда ЛЖ будет основана на оригинальных, известных в нашей стране и за рубежом моделях электрической и механической функции сердечных клеток. Учтенные в них молекулярные механизмы электро-механического сопряжения позволят воспроизвести нарушения ряда механизмов, лежащих в основе различных патологий сердечной мышцы. В представленном проекте интегративная 3D модель будет использована в качестве интеллектуального инструмента для индивидуальной диагностики, прогноза и лечения заболевания сердца. Предполагается следующий дизайн исследования. Современными неинвазивными методами (эхокардиография (УЗИ), магнито-резонансная томография (МРТ)) у данного пациента будут определены характерные динамические показатели функциональной геометрии ЛЖ в течение сократительного цикла: линейные размеры, толщина стенки, индексы формы (сферичность, коничность, индекс Фурье), сегментарная кинетика стенки, показатели неоднородности движения стенки и т.д. У пациентов с нарушениями ритма будут также определены активационные карты возбуждения миокарда. Эти показатели будут использованы в качестве входных параметров 3D модели. В рамках персонифицированных моделей будут всестороннее изучены возможности насосной функции сердца (контрактильный резерв и глобальные энергетические затраты), а также определены возможные риски нарушений электрической функции для данного пациента. В персонифицированной модели ССС на молекулярно-клеточном уровне будут исследованы различные фармакологические воздействия, способные оптимизировать механическую и электрическую функцию сердца в конкретных условиях. В случае конструкционных нарушений ЛЖ, как это может иметь место при инфарктах миокарда, модель будет способна предсказать варианты хирургического пособия для восстановления функции ЛЖ. Исключительная сложность структуры и функций камер сердца, влияние многочисленных параметров, определяющих эти функции, в том числе патологических изменений на молекулярном уровне, обусловливает трудности в постановке количественно обоснованного, объективного диагноза и в прогнозе последствий заболевания. Поэтому разработка диагностических систем нового типа, основанных на персонифицированных математических моделях, представляется исключительно своевременной. Эта работа является по сути мультидисциплинарной, что обусловливает участие в проекте специалистов из разных областей науки – физиологии и медицины, биофизики и биомеханики, математики и компьютерных наук. Продуктивное многолетнее международное сотрудничество научного коллектива с рядом ведущих специалистов в области физиологии и моделирования ССС также поможет выполнить поставленные задачи.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Епанчинцев Т., Зверев В. Parallel Left Ventricle Simulation Using the FEniCS Framework Ceur Workshop Proceedings, V. 1729, p. 29-37. (год публикации - 2016)

2. Викулова Н., Хохлова А., Соловьева О., Кацнельсон Л.Б. Effects of Enhanced Sodium Current in Mathematical Model of Heterogeneous Myocardium Computing in Cardiology, Nice, France, September 6-9, 2015, p. 120 (год публикации - 2015)

3. Зорин Н.М., Рывкин А.М., Москвин А. Cooperation of membrane and calcium oscillators in sinoatrial node cells Experimental and Computational Biomedicine. Abstract book., с. 44 (год публикации - 2016)

4. Кошелев А., Правдин С., Ушенин К.С., Бажутина А.Е. An improved analytical model of the cardiac left ventricle Experimental and Computational Biomedicine. Abstract book., с. 22 (год публикации - 2016)

5. Япаров Б.Я., Москвин А., Соловьева О.Э. Electron-Conformational Transformations Govern the Temperature Dependence of the RyR2 Gating Experimental and Computational Biomedicine. Abstract book., с. 54-55 (год публикации - 2016)

6. Хохлова А.Д., Ирибе Г., Соловьева О. Transmural Differences in Preload-Dependency of Ca2+ Transients in Isolated Cardiomyocytes Biophysical Journal, V.110(3), p.99a (год публикации - 2016)

7. Япаров Б.Я., Москвин А.С., Рывкин А.М., Соловьёва О.Э. Влияние температуры на активность и проводимость рианодинового рецептора сердечной клетки Материалы докладов V Съезда биофизиков России. Ростов-на-Дону, 4-10 октября 2015 г., Т. 1, с. 241 (РИНЦ: http://elibrary.ru/item.asp?id=24553944) (год публикации - 2015)

8. Пименов В.Г., Хенди А.С. Численные методы для дробного уравнения диффузии с наследственностью (Numerical methods for the fractional diffusion equation with heredity) Ceur Workshop Proceedings, V. 1662, p. 276-283 (год публикации - 2016)

9. Кошелев А.А., Бажутина А.Е., Ушенин К.С. Personalized simulation based on the modified analytical model of the left ventricle of the human heart International Conference on the Mathematical Modeling and High-Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology. Abstracts., с. 64 (год публикации - 2016)

10. Викулова Н., Хохлова А., Кацнельсон Л.Б., Соловьева О. Effects of Enhanced Sodium Currents in Mathematical Model of Heterogeneous Myocardium Computing in Cardiology, V. 42, p. 445-448 (РИНЦ http://elibrary.ru/item.asp?id=26962552) (год публикации - 2016)

11. Солодушкин С.И., Юманова И.Ф. Parallel Numerical Methods for Ordinary Differential Equations: a Survey Ceur Workshop Proceedings, V. 1729, p. 1-10 (год публикации - 2016)

12. Коновалов П.В., Правдин С., Соловьева О.Э., Панфилов А.В. Influence of myocardial heterogeneity on scroll wave dynamics in an axisymmetrical anatomical model of the left ventricle of the human heart Experimental and Computational Biomedicine. Abstract book., с. 21 (год публикации - 2016)

13. Зверев В., Курсанов А., Кацнельсон Л.Б., Соловьева О. Extension of a one-dimensional model of the heart muscle strand to the simple three-dimensional domain Cardiac Physiome Workshop Proceedings. Auckland, New Zealand, April 8-10, 2015., http://cardiacphysiome.org/files/2014/08/program-FINAL_2015_.pdf (год публикации - 2015)

14. Васильева А., Викулова Н., Соловьева О., Мархасин В.С. Effects of Acute Myocardial Ischemia in Mathematical Models of Heterogeneous Myocardium Computing in Cardiology, V. 41, р. 881-884. (год публикации - 2014)

15. Япаров Б.Я., Москвин А.С. Анализ влияния температуры на активность и проводимость рианодин-чувствительного кальциевого канала сердечной клетки в рамках электронно-конформационной теории Методы компьютерной диагностики в биологии и медицине-2014: материалы Всерос. школы-семинара., с. 121-122 (год публикации - 2014)

16. Правдин С.Ф. A mathematical spline-based model of the cardiac left ventricle anatomy and morphology Computation, V.4(4), 42 (год публикации - 2016)
10.3390/computation4040042

17. Правдин С.Ф., Диркс Х., Панфилов А.В. Динамика филаментов с нулевым натяжением в трехмерной модели левого желудочка сердца Труды 46-й международной молодежной школы-конференции "Современные проблемы математики и ее приложений". Екатеринбург, ИММ УрО РАН. 25 - 31 января 2015 г., c. 166-168 (РИНЦ: http://elibrary.ru/item.asp?id=25380380) (год публикации - 2015)

18. Ушенин К.С., Правдин С., Чумарная Т.В., Алуева Ю.С., Соловьева О.Э. Dynamics of scroll wave filaments in personalized models of the left ventricle of the human heart Proceedings of 7th International Workshop on Cardiac Mechano-Electric Coupling and Arrhythmias. Freiburg, Germany., p. p26 (год публикации - 2016)

19. Курсанов А.Г., Хамзин С.Ю., Соловьева О.Э. Влияние механической нагрузки на электрическую и механическую активность кардиомиоцитов в одномерной модели волокна сердечной мышцы Материалы докладов V Съезда биофизиков России. Ростов-на-Дону, 4-10 октября 2015 г., Т. 1, с. 232 (РИНЦ: http://elibrary.ru/item.asp?id=24553944) (год публикации - 2015)

20. Япаров Б., Москвин А. Modeling the temperature effect on the cardiac ryanodine receptor gating 23 международная конференция «Математика. Компьютер. Образование». Сборник тезисов., с. 90 (год публикации - 2016)

21. Кошелев А., Правдин С., Соловьева О., Мархасин В., Панфилов А. Mathematical model of the basal and apical regions of the left ventricle of the heart Cardiac Physiome Workshop Proceedings. Auckland, New Zealand, April 8-10, 2015., http://cardiacphysiome.org/files/2014/08/program-FINAL_2015_.pdf (год публикации - 2015)

22. Рывкин А.М., Зорин Н.М., Москвин А.С., Соловьева О.Э., Мархасин В.С. Interaction of Membrane and Calcium Oscillators in Cardiac Pacemaker Cells: Mathematical Modeling Биофизика, Т.60(6), С. 1138-1145 (русс. вар.) (год публикации - 2015)
10.1134/S0006350915060214

23. Таширова Е.Е. Сеточные схемы для решения уравнения гиперболического типа с запаздыванием в производной (Grid schemes for solving hyperbolic equation with delay in derivative) Ceur Workshop Proceedings, V. 1662, p. 335-343 (год публикации - 2016)

24. Правдин С., Диркс Х., Мархасин В.С., Панфилов А.В. Drift of scroll wave filaments in an anisotropic model of the left ventricle of the human heart BioMed Research International, V. 2015, Article ID 389830, 13 pages (год публикации - 2015)
10.1155/2015/389830

25. Москвин А.С., Япаров Б.И., Рывкин А.М., Соловьева О.Е. The Temperature Effect on Cardiac Ryanodine Receptor Gating and Conductance: Mathematical Modeling Biophysics, V.61(4), p. 614-621 (год публикации - 2016)
10.1134/S0006350916040175

26. Зорин Н., Рывкин А., Москвин А., Соловьева О. Interplay of Membrane and Calcium Oscillators in Cardiac Pacemaker Cells Biophysical Journal, V.110(3), p.259a (год публикации - 2016)

27. Чумарная Т., Соловьева О., Алуева Ю., Михайлов С.П., Кочмашева В.В., Мархасин В.С. Left Ventricle Functional Geometry in Cardiac Pathology Computing in Cardiology, V. 42, p. 353-356 (РИНЦ http://elibrary.ru/item.asp?id=26962552) (год публикации - 2016)

28. Правдин С.Ф., Диркс Х., Панфилов А. Drift of scroll waves of electrical excitation in an isotropic model of the cardiac left ventricle Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling, V.31(5), p.293-304 (год публикации - 2016)
10.1515/rnam-2016-0028

29. Марков Н.С., Ушенин К.С., Хенди А.С. Performance Evaluation of Space Fractional FitzHugh-Nagumo Model: an Implementation with PETSc Library Ceur Workshop Proceedings, V.1729, p. 66-77 (год публикации - 2016)

30. Курсанов А.Г., Кацнельсон Л.Б., Викулова Н.А., Соловьева О.Э., Мархасин В.С. Functional heterogeneity arising due to electrical and mechanical interactions between cardial myocytes in a mathematical model of homogeneous myocardial fiber cardiomyocytes Mathematical Biology and Bioinformatics, V. 10, № 2, P. 436–454 (год публикации - 2015)
10.17537/2015.10.436

31. Соловьева О.Э. Навстречу персонифицированными моделям в кардиологии Физиология кровообращения. VI Всероссийская с международным участием школа-конференция. Тезисы докладов., с. 148-149 (год публикации - 2016)

32. Рывкин А.М., Москвин А. Probabilistic Theory of Ions Binding to RyR-channel Within the Improved Electron-Conformational Model Experimental and Computational Biomedicine. Abstract book., с. 56-67 (год публикации - 2016)

33. Семин Ф., Цатурян А.К. A simple model of cardiac muscle for multiscale simulation: passive mechanics, crossbridge kinetics and calcium regulation Journal of Theoretical Biology (год публикации - 2016)

34. Правдин С., Ушенин К., Созыкин А., Соловьева О. Human heart simulation software for parallel computing system Procedia Computer Science, V. 66, P. 402–411 (год публикации - 2015)
10.1016/j.procs.2015.11.046

35. Сёмин Ф.А., Цатурян А.К. Простая модель насосной функции левого желудочка сердца Доклады академии наук, Т.462(2), с.233-273 (год публикации - 2015)
10.7868/S0869565215140261

36. Кошелев А.А., Бажутина А.Е., Ушенин К.С., Незлобинский Т.В. Персонифицированное моделирование на основе модифицированной аналитической модели левого желудочка сердца человека Математическая биология и биоинформатика: VI Международная конференция. Доклады, с. 30-31 (год публикации - 2016)

37. Чумарная Т.В., Соловьева О.Э., Алуева Ю.С., Михайлов С.П., Остерн О.В., Кочмашева В.В., Сопов О.В., Ревишвили А.Ш., Мархасин В.С. Функциональная геометрия левого желудочка при дилатационной кардиомиопатии до и после ресинхронизирующей терапии Кардиоваскулярная терапия и профилактика/Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation), Т.15(1), c. 31-39 (год публикации - 2016)
10.15829/1728-8800-2016-1-31-39

38. Правдин С.Ф., Диркс Х., Панфилов А.В., Бердышев В.И., Кацнельсон Л.Б., Соловьева О., Мархасин В.С. Simulation of the cardiac left ventricle electromechanical activity based on a computational analytical anatomical model Abstracts of the Second Soft Tissue Modelling Workshop. Glasgow, UK, June 10-12, 2015, p. 41 (год публикации - 2015)

39. Кошелев А.А., Правдин С.Ф., Ушенин К.С., Бажутина А.Е., Кацнельсон Л.Б., Соловьева О.Э. A Modified Mathematical Model of the Anatomy of the Cardiac Left Ventricle Biophysics, Vol. 61, No. 5, pp. 986–995. (год публикации - 2016)
10.1134/S0006350916050134

40. Чумарная Т., Алуева Ю., Кочмашева В.В., Соловьева О. Functional geometry of the left ventricle in heart transplant patients European Heart Journal - Cardiovascular Imaging, V. 16, Issue suppl 2P., p. S213 - S239 (год публикации - 2015)
10.1093/ehjci/jev270

41. Соловьева О.Э., Кацнельсон Л.Б., Коль П., Панфилов А.В., Цатурян А.К., Цывьян П.Б. Mechano-electric heterogeneity of the myocardium as a paradigm of its function Progress in Biophysics & Molecular Biology, V.120(1–3), p.249-254. (РИНЦ http://elibrary.ru/item.asp?id=26854364) (год публикации - 2016)
10.1016/j.pbiomolbio.2015.12.007

42. Ушенин К.С., Правдин С.Ф., Алуева Ю.С., Чумарная Т.В., Соловьева О.Э. The study of scroll wave dynamics in personalized models of the left ventricle of the human heart Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling, V.31(5), p.305-316. (год публикации - 2016)
10.1515/rnam-2016-0029

43. Чумарная Т., Алуева Ю., Кочмашева В.В., Михайлов С.П., Остерн О.В., Соловьева О.Э., Ревишвили А., Мархасин В.С. Functional geometry of the left ventricle in cardiac pathology European Heart Journal - Cardiovascular Imaging, V. 15, suppl 2, p.ii154-ii160 (P916) (год публикации - 2014)
10.1093/ehjci/jeu263

44. Япаров Б.Я., Москвин А.С. Влияние температуры на функционирование рианодинового канала сердечной клетки «Физика — наукам о жизни». Тезисы докладов Первой Российской конференции., с. 48 (год публикации - 2016)

45. Семин Ф.А., Зберия М.В., Кубассова Н.А., Цатурян А.К. Mathematical Modelling of the Dependence of the Performance of the Left Ventricle of the Heart on Preload and Afterload Биофизика, Т. 60(6), c. 1180–1185 (русск. вар.) (год публикации - 2015)
10.1134/S0006350915060226

46. Незлобинский Т.В., Правдин С.Ф., Кацнельсон Л.Б., Соловьева О.Э. Effect of the architecture of the left ventricle on the speed of the excitation wave in muscle fibers JETP Letters, V. 104(2), p. 124-129. (год публикации - 2016)
10.1134/S0021364016140101

47. Краснобаев А., Созыкин А. An Overview of Techniques for Cardiac Left Ventricle Segmentation on Short-Axis MRI ITM Web of Conferences, V.8, 01003, p.1-7 (год публикации - 2016)
10.1051/itmconf/20160801003

48. Хохлова А., Ирибе Г., Соловьева О., Нарусе К., Мархасин В. Influence of stretch on transmural gradient in mechanical properties of single ventricular cardiomyocytes Physiology 2015. Abstract book. 6 - 8 July, 2015, Cardiff, UK, p. 180P-181P (год публикации - 2015)

49. Хохлова А.Д., Сюняев Р.А., Рывкин А.М., Шмарко Д.В., Гонотков М.А., Лебедева Е.А., Головко В.А., Москвин А.С., Соловьёва O.Э., Алиев Р.Р. The Effects of Intracellular Calcium Dynamics on the Electrical Activity of the Cells of the Sinoatrial Node Biophysics, V.61, No. 5, pp. 765–772 (год публикации - 2016)
10.1134/S0006350916050109

50. Коновалов П.В., Правдин С.Ф., Соловьева О., Панфилов А.В. Scroll Wave Dynamics in a Model of the Heterogeneous Heart JETP Letters, V. 104(2), p.130-134 (год публикации - 2016)
10.1134/S0021364016140034

51. Незлобинский Т., Правдин С., Кацнельсон Л.Б. In silico comparison of the electrical propagation wave along myocardium fibers in the left ventricle wall vs. isolation Experimental and Computational Biomedicine. Abstract book., с. 23 (год публикации - 2016)

52. Правдин С.Ф. Метод решения задачи реакции-диффузии на несимметричной модели миокарда левого желудочка сердца (A method of solving reaction-diffusion problem on a non-symmetrical model of the cardiac left ventricle) Ceur Workshop Proceedings, V. 1662. p. 284-296. (год публикации - 2016)

53. Хохлова А., Ирибе Г., Соловьева О. Load-dependency in mechanical properties of sub-epicardial and sub-endocardial cardiomyocytes Computing in Cardiology, V. 24, p.965-968 (РИНЦ http://elibrary.ru/item.asp?id=26962552) (год публикации - 2016)

54. Чумарная Т.В., Алуева Ю.С., Кочмашева В.В., Михайлов С.П., Ревишвили А.Ш., Цывьян П.Б., Соловьева О.Э. Особенности функциональной геометрии левого желудочка при миокардиальных заболеваниях с различной степенью нарушения систолической функции Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, Т. 162(7), с. 37-41 (год публикации - 2016)

55. Хохлова А.Д., Ирибэ Г., Соловьёва О.Э. Влияние механической нагрузки на кинетику ионов кальция в клетках неоднородного миокарда Физиология кровообращения: VI Всероссийская с международным участием школа-конференция. Тезисы докладов, с. 178-179 (год публикации - 2016)

56. Викулова Н.А., Кацнельсон Л.Б., Курсанов А.Г., Соловьева О.Э., Мархасин В.С. Mechano-electric feedback in one-dimensional model of myocardium Journal of Mathematical Biology, V. 73, pp. 335–366 (год публикации - 2016)
10.1007/s00285-015-0953-5

57. Бородин Н.В., Япаров Б.Я., Москвин А.С. Моделирование влияния кальмодулина на функционирование рианодинового канала сердечной клетки «Физика — наукам о жизни». Тезисы докладов Первой Российской конференции, c. 49 (год публикации - 2016)

58. Ушенин К.С., Правдин С.Ф., Чумарная Т.В., Алуева Ю.С., Соловьева О.Э. Dynamics of scroll wave filaments in personalized models of the left ventricle of the human heart Experimental and Computational Biomedicine. Abstract book., с. 28 (год публикации - 2016)

59. Москвин А.С., Япаров Б.Я., Рывкин А.М., Соловьева О.Э., Мархасин В.С. Electron-conformational transformations govern the temperature dependence of the cardiac ryanodine receptor gating JETP Letters, V. 102, Issiue 1, p. 62-68 (год публикации - 2015)
10.1134/S002136401513010X

60. Япаров Б.Я, Сулим К.И., Рывкин А.М., Москвин А.С. Electron-conformational model explains the temperature effects for cardiac calcium release channels Математика. Компьютер. Образование. Биофизика сложных систем. Анализ экспериментальных данных и моделирование процессов, вып. 22, с. 23 (РИНЦ: http://elibrary.ru/item.asp?id=24568812) (год публикации - 2015)

61. Япаров Б.Я., Кармацкий А.Н., Москвин А.С. CPU and GPU parallel Kramers-Klein calculations Ceur Workshop Proceedings, V. 1729, p. 17-21 (год публикации - 2016)

62. Рывкин А.М., Москвин А.С., Соловьева О.Э. Электронно-конформационная модель RyR-каналов и моделирование стохастической динамики ионов кальция в сердечных клетках сердца Материалы докладов V Съезда биофизиков России. Ростов-на-Дону, 4-10 октября 2015 г., Т. 1, с. 235 (РИНЦ: http://elibrary.ru/item.asp?id=24553944) (год публикации - 2015)

63. Незлобинский Т.В., Правдин С.Ф. Программный комплекс для сравнения электрофизиологических свойств волокон миокарда на одномерных и трехмерных моделях (Software complex for the comparison of electrophysiological properties of myocardial fibers in 1D and 3D models) Ceur Workshop Proceedings, V. 1662. p. 268-275 (год публикации - 2016)

64. Соловьева О.Э. Моделирование миокарда: от клетки до органа Материалы докладов V Съезда биофизиков России. Ростов-на-Дону, 4-10 октября 2015 г., Т. 1, с.48 (РИНЦ: http://elibrary.ru/item.asp?id=24553944) (год публикации - 2015)

65. Шихалева Е., Сульман Т., Докучаев А., Никитина Л.В., Кацнельсон Л.Б. Mathematical Modeling of The Role of Cooperativity Between Contractile and Regulatory Proteins in The Mechano-Calcium Feedbacks in Myocardium Computing in Cardiology, V. 42, p. 321-324 (РИНЦ http://elibrary.ru/item.asp?id=26962552) (год публикации - 2016)

66. Семин Ф.А., Цатурян А.К. Применение простой кинетической модели миокарда для описания сокращений левого желудочка сердца Материалы докладов V Съезда биофизиков России. Ростов-на-Дону, 4-10 октября 2015 г., Т. 1, с. 237 (РИНЦ: http://elibrary.ru/item.asp?id=24553944) (год публикации - 2015)

67. Хохлова А., Ирибе Г., Соловьева О. Load-dependency in mechanical properties of subepicardial and subendocardial cardiomyocytes Computing in Cardiology, Nice, France, September 6-9, 2015, 263 (год публикации - 2015)

68. Япаров Б., Москвин А., Рывкин А., Соловьева О. Electron-Conformational Transformations Govern the Temperature Dependence of the RyR2 Gating Biophysical Journal, V.110(3), p. 262a-263a (год публикации - 2016)

69. Чумарная Т.В., Алуева Ю.С., Кочмашева В.В., Климушева Н.Ф., Иофин А.И., Быков А.Н., Соловьева О.Э. Функциональная геометрия левого желудочка у пациентов после ортотопической трансплантации сердца в раннем послеоперационном периоде Трансплантология, №2, с. 9-15 (год публикации - 2016)

70. Созыкин А., Правдин С., Кошелев А., Зверев В., Ушенин К., Соловьева О. LeVen – a Parallel System for Simulation of the Heart Left Ventricle 9th International Conference on Application of Information and Communication Technologies, AICT 2015 - Proceedings., p. 249-252 (РИНЦ http://elibrary.ru/item.asp?id=24647537) (год публикации - 2015)

71. Правдин С.Ф., Диркс Х., Панфилов А.В., Бердышев В.И., Кацнельсон Л.Б., Соловьева О.Э., Мархасин В.С. A model of the anatomy and electrophysiological and mechanical activity of the cardiac left ventricle Proceedings of the 4th International Conference on Computational and Mathematical Biomedical Engineering – CMBE2015, Cachan (Paris) France, 29 June-1 July 2015, p. 818-821 (год публикации - 2015)

72. Москвин А. Electron‐conformational model of the ligand‐activated ion channels Experimental and Computational Biomedicine. Abstract book., с. 22-23 (год публикации - 2016)

73. Курсанов А., Соловьева О., Кацнельсон Л., Мархасин В.С. Role of Mechanics in Rhythm Disturbances in 1D Mathematical Model of Myocardial Tissue with Local Ca2+-Overload Сardiomyocytes Computing in Cardiology, V. 42, p. 549-552 (РИНЦ http://elibrary.ru/item.asp?id=26962552) (год публикации - 2016)

Публикации

1. Епанчинцев Т., Зверев В. Parallel Left Ventricle Simulation Using the FEniCS Framework Ceur Workshop Proceedings, V. 1729, p. 29-37. (год публикации - 2016)

Публикации

1. Епанчинцев Т., Зверев В. Parallel Left Ventricle Simulation Using the FEniCS Framework Ceur Workshop Proceedings, V. 1729, p. 29-37. (год публикации - 2016)