КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 16-14-10084

НазваниеАнализ микроРНК, участвующих в регуляции самообновления плюрипотентных клеток крысы и процесса репрограммирования к плюрипотентному состоянию.

Руководитель Закиян Сурен Минасович, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук" , Новосибирская обл

Конкурс №13 - Конкурс 2016 года на получение грантов по приоритетному направлению деятельности РНФ «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-205 - Клеточная биология, цитология, гистология

Ключевые слова эмбриональные стволовые клетки, индуцированные плюрипотентные стволовые клетки, лабораторная крыса, микроРНК, miRNA-seq, репрограммирование.

Код ГРНТИ34.15.23


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Одним из наиболее перспективных объектов современной биомедицины являются плюрипотентные клетки. Способность бесконечно поддерживаться в культуре и дифференцироваться в любой тип клеток взрослого организма делает данный объект широко используемым в различного рода исследованиях таких как: фундаментальные исследования процессов, происходящих в ходе эмбрионального развития, получение клеточных моделей наследственных заболеваний, поиск новых фармацевтических препаратов, а также в заместительной клеточной терапии. В настоящее время широко проводятся исследования геномов, транскриптомов, эпигеномов и протеомов плюрипотентных клеток. Также, известно, что в регуляции экспрессии генов участвуют малые некодирующие РНК, среди которых особо выделяют класс микроРНК (миРНК). Данный тип РНК влияет на поддержание самообновления плюрипотентных клеток и регулирует их дифференцировку. При этом значительная часть исследований проводится на человеке и мыши, в то время как система поддержания самообновления плюрипотентных клеток лабораторной крысы, изучена недостаточно, в частности участвующие в данном процессе миРНК. В последнем выпуске базы данных (http://www.mirbase.org), содержащей последовательности всех известных миРНК, от июля 2014 года количество известных зрелых миРНК у человека и мыши составляет 2588 и 1915 штук соответственно, в то время как у крысы аннотировано всего лишь 765 зрелых миРНК. Кроме того, в настоящее время отсутствуют данные по паттерну экспрессии миРНК в плюрипотентных клетках крысы на полногеномном уровне. Таким образом, участие миРНК в регуляции поддержания самообновления плюрипотентных клеток крысы практически не изучено. Данный проект направлен на изучение миРНК, участвующих в поддержании самообновления плюрипотентных клеток крысы, поиск новых, ранее не аннотированных миРНК крысы, и выявление миРНК, влияющих на эффективность процесса репрограммирования соматических клеток к плюрипотентному состоянию. В ходе выполнения проекта будет определен паттерн экспрессии миРНК в плюрипотентных клетках крысы, а также выявлены новые, ранее не аннотированные миРНК крысы. Функциональный анализ влияния миРНК на эффективность репрограммирования будет осуществлен путем делеции соответствующих миРНК в геноме крысы с использованием современной высокоэффективной системы геномного редактирования CRISPR/Cas9. Данная информация откроет новые возможности применения крысы как модельного объекта в трансляционных биомедицинских исследованиях и позволит определить общие закономерности участия миРНК в регуляции процессов самообновления и репрограммирования клеток млекопитающих и ее видоспецифичные особенности.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

 

Публикации

1. Шерстюк В.В., Медведев С.П., Закиян С.М. Noncoding RNAs in the Regulation of Pluripotency and Reprogramming Stem Cell Reviews and Reports (год публикации - 2017)
10.1007/s12015-017-9782-9

2. Шерстюк В.В.,Медведев С.П.,Елисафенко Е.А.,Васькова Е.А.,Ри М.Т.,Вяткин Ю.В.,Сайк О.В.,Штокало Д.Н.,Покушалов Е.А.,Закиян С.М. Genome-wide profiling and differential expression of microRNA in rat pluripotent stem cells Scientific Reports, V. 7, № 1, P. 2787 (год публикации - 2017)
10.1038/s41598-017-02632-0

3. Давлетшина Г.И., Шерстюк В.В., Закиян С.М. Направленное внесение делеций в геном фибробластов крысы для изучения функций микроРНК в процессе перепрограммирования к плюрипотентному состоянию Гены и Клетки, Т. XII, №3, Материалы III Национального Конгресса по Регенеративной Медицине, С. 79 (год публикации - 2017)

4. Шерстюк В.В., Медведев С.П., Ри М.Т., Вяткин Ю.В., Сайк О.В., Штокало Д.Н., Закиян С.М. The search for microRNAs potentially involved in the self-renewal maintaining of laboratory rat pluripotent stem cells Вавиловский журнал генетики и селекции (год публикации - 2017)


 

Публикации

1. Давлетшина Г.И.,Шерстюк В.В., Закиян С.М. Анализ вклада микроРНК в процесс репрограммирования соматических клеток крысы Гены и Клетки, Т. XIII, №2, Материалы Международного конгресса CRISPR‑2018, C. 63-64 (год публикации - 2018)

2. Давлетшина Г.И., Шерстюк В.В. Получение делеций в геноме с использованием системы CRISPR/Cas9 на примере фибробластов крысы Редактирование генов и геномов: Том 3, Новосибирск: Издательство СО РАН (год публикации - 2018)

3. Шерстюк В.В., Давлетшина Г.И., Вяткин Ю.В., Штокало Д.Н., Власов В.В., Закиян С.М. A new microRNA cluster involved in the reprogramming to a pluripotent state Acta Naturae, Т. 11, № 2, С. 92-97 (год публикации - 2019)
10.32607/20758251-2019-11-2-92-97