КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 17-76-30016
НазваниеНаучные основы создания эффективной технологии стабилизации роста и развития растений в многокомпонентной растительно-микробной системе
Руководитель Тихонович Игорь Анатольевич, Доктор биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии" , г Санкт-Петербург
Конкурс №25 - Конкурс 2017 года по мероприятию «Проведение исследований научными лабораториями мирового уровня в рамках реализации приоритетов научно-технологического развития Российской Федерации» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными
Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки; 06-104 - Агробиотехнологии
Ключевые слова многокомпонентные растительно-микробные системы, бобово-ризобиальный симбиоз, микориза, рост-стимулирующие ризосферные бактерии, рецепторы, транскрипционные факторы, NCR-пептиды, окислительно-восстановительный статус, защитные реакции, авторегуляция
Код ГРНТИ68.03.03 68.03.07
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Актуальность выполнения проекта связана с необходимостью создание эффективных, экологически обоснованных технологий стабилизации роста и развития растений перед современными вызовами, которые связаны с изменением климата, его нестабильностью, необходимостью для растений адаптироваться к чрезвычайно разнообразным условиям окружающей среды. Современные сорта сельскохозяйственных растений часто имеют показатели урожайности, которые приближаются к возможному биологическому максимуму, однако главной проблемой отрасли является нестабильность количества и качества получаемой продукции, что снижает инвестиционную привлекательность отрасли и ее конкурентоспособность. Диспаритет цен на современные средства производства, в частности удобрения и пестициды, делают их малодоступными для российских производителей, кроме того, применение агрохимикатов является достаточно рискованным, чтобы искать способы их обоснованной замены на природные механизмы противостояния стрессорным факторам. Современная селекция остро нуждается в генетических факторах устойчивости, однако их выбор за счет генотипа растений достаточно ограничен, поэтому эксперты ФАО, в их числе и руководитель проекта, отмечают необходимость поиска генов устойчивости к засухам, наводнениям, болезням и вредителям, а также создания технологий, снижающих экологический риск, предотвращающих генетическую эрозию. Приходится констатировать, что среди генетических коллекций растений набор требуемых генов и их аллелей весьма ограничен, что делает весьма проблематичным возможность решения поставленной задачи только при учете генетической составляющей самих растений. В соответствии с этим руководителем проекта был сформулирован принцип дополнительности ограниченного по ресурсам и малоподвижного генома растений за счет неограниченного по объему генетической информации и изменчивого генома симбиотических микроорганизмов путем создания функционально единых генетических систем (симбиогенома).
Применение технологий использования потенциала микробиома растений и, в частности, ризосферной микрофлоры отвечает современным требованиям сельскохозяйственного производства, однако создание таких технологий требует понимания фундаментальных основ взаимодействия и конкуренции за экологические ниши на корнях растений различных микроорганизмов. Не известны механизмы формирования единой генетической растительно-микробной системы, объединяющей несколько геномов представителей микробиома, конкурирующих за места поселения и подчиняющихся системному контролю со стороны растения в зависимости от условий окружающей среды.
Предлагаемый проект направлен на решение проблемы повышения адаптационного потенциала растений в сельскохозяйственном производстве на основе дополнения генетических ресурсов растений комплементарными геномами симбиотических микроорганизмов. Целью проекта является комплексное изучение формирования многокомпонентных растительно-микробных систем и молекулярно-генетических механизмов создания функционально единого симбиогенома, который по набору генов, их разнообразию и возможностям адаптации многократно превосходит генетический потенциал растений как таковых. В проекте будут решены следующие задачи:
I. Анализ эффектов совместной инокуляции в многокомпонентной системе на ранних стадиях.
II. Анализ эффектов совместной инокуляции в многокомпонентной системе в динамике.
III. Детальный анализ развития защитных реакций растения как фактора совместимости различных симбионтов в многокомпонентной системе.
IV. Исследование молекулярных механизмов локального и системного контроля развития симбиотических структур у растения при различных вариантах инокуляции.
V. Оценка эффективности формируемых многокомпонентных растительно-микробных систем (МРМС).
Успешное выполнение данного проекта позволит создать эффективные технологии подбора симбиотических партнеров, регулирования реакции растений на их поселение и проникновение как на локальном, так и на системном уровне. Такие многокомпонентные системы практически не изучены, хотя потенциально они способны обеспечить растению многочисленные полезные функции и тем самым сделать производство сельскохозяйственной продукции экологически сбалансированным и конкурентоспособным.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Сафронова В.И.., Белимов А.А., Сазанова А.Л., Чирак Е.Р., Верхозина А.В., Кузнецова И.Г., Андронов Е.Е., Пухальский Я.В., Тихонович И.А.
Taxonomically different co-microsymbionts of a relict legume Oxytropis popoviana have complementary sets of symbiotic genes and together increase the efficiency of plant nodulation
Molecular Plant-Microbe Interactions, V. 31. N 8. P. 833-841 (год публикации - 2018)
10.1094/MPMI-01-18-0011-R
2.
Здыб А., Сальгадо М.Г., Демченко К.Н., Бреннер В.Г., Пласчица М., Штамп М., Херрфурт К., Фойснер И., Павловски К.
Allene oxide synthase, allene oxide cyclase and jasmonic acid levels in Lotus japonicus nodules
PLOS ONE, V. 13. N 1, e0190884 (год публикации - 2018)
10.1371/journal.pone.0190884
3. Цыганова А.В., Селиверстова Е.В., Цыганов В.Е. Влияние мутации в гене гороха (Pisum sativum L.) cdt (cadmium tolerance) на гистологическую и ультраструктурную организацию клубеньков Экологическая генетика (год публикации - 2019)
4. Долгих А.В., Долгих Е.А. Роль универсальных регуляторов роста и развития растений DELLA-белков в контроле симбиозов. Экологическая генетика (год публикации - 2019)
5. Леппянен И.В., Кириенко А.Н., Долгих Е.А. Agrobacterium rhizogenes - mediated transformation of Pisum sativum L. roots PeerJ (год публикации - 2019)
6. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Тихонович И.А. Эндофитные микроорганизмы в фундаментальных исследованиях и сельском хозяйстве Экологическая генетика (год публикации - 2019)
7. Зорин Е.А., Кулаева О.А., Афонин А.М., Жуков В.А., Тихонович И.А. Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L. Экологическая генетика (год публикации - 2019)
8. Жернаков А.И., Штарк О.Ю., Кулаева О.А., Федорина Я.В., Афонин А.М., Китаева А.Б., Цыганов В.Е., Ф. Афонсо-Грунц, К. Хофмеиер, Б. Ротте, П. Винтер, Тихонович И.А., Жуков В.А. Mapping-by-sequencing using NGS-based 3’-MACE-Seq reveals a new mutant allele of the essential nodulation gene Sym33 (IPD3) in pea (Pisum sativum L.) PeerJ (год публикации - 2018)
9. Штарк О.Ю., Пузанский Р.К., Авдеева Г.С., Смоликова Г.Н., Емельянов В.В., Клюкова М.С., Шаварда А.Л., Кирпичникова А.А., Жернаков А.И., Афонин А.М., Тихонович И.А., Жуков В.А., Шишова М.Ф. The effect of symbiotic interaction of pea (Pisum sativum L.) with arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis on the photochemical activity and metabolite profile of leaves. PeerJ (год публикации - 2019)
10.
Магне К., Козигу Ж., Шиссль К., Лю С., Джордж Я., Жуков В.А., Заль Л., Бойе Ф., Янчева А., Мизоре К.С., Вен Я., Ситерне С., Олдроит Ж., Рате П.
MtNODULE ROOT1 and MtNODULE ROOT2 are essential for indeterminate nodule identity
Plant Physiology, V. 178. N.1. P. 295-316. (год публикации - 2018)
10.1104/pp.18.00610
11.
Сафронова В., Белимов А., Сазанова А., Чирак Е., Кузнецова И., Андронов Е., Пинаев А., Цыганова А., Селиверстова Е., Китаева А., Цыганов В., Тихонович И.
Two broad host range rhizobial strains isolated from relict legumes have various complementary effects on symbiotic parameters of co-inoculated plants
Frontiers in Microbiology, 10, 514 (год публикации - 2019)
10.3389/fmicb.2019.00514
12.
Серова Т.А.,Цыганова А.В., Тихонович И.А., Цыганов В.Е.
Gibberellins inhibit nodule senescence and stimulate nodule meristem bifurcation in pea (Pisum sativum L.)
Frontiers in Plant Science, 10, 285 (год публикации - 2019)
10.3389/fpls.2019.00285
13.
Сулима А.С., Жуков В.А., Кулаева О.А., Васильева Е.Н., Борисов А.Ю., Тихонович И.А.
New sources of Sym 2A allele in the pea (Pisum sativumL.) carry the unique variant of candidate LysM-RLK geneLykX.
PeerJ., 7: e8070 (год публикации - 2019)
10.7717/peerj.8070
14.
Dolgikh A.V., Kirienko A.N., Tikhonovich I.A., Foo E., Dolgikh E.A.
The DELLA Proteins Influence the Expression of Cytokinin Biosynthesis and Response Genes During Nodulation.
Frontiers in Plant Science, 10:432 (год публикации - 2019)
10.3389/fpls.2019.00432
15. Леппянен И.В., Штарк О.Ю., Кириенко А.Н., Павлова О.А., Бовин А.Д., Долгих Е.А. Анализ эффектов совместной инокуляции грибами арбускулярной микоризы и ризобиями на рост и развитие растений гороха Pisum sativum L. Sel'skokhozyaistvennaya biologiya (год публикации - 2020)
16. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Афонин А.М., Борисов А.Ю., Тихонович И.А., Жуков В.А. Культивируемые эндофитные бактерии стеблей и листьев гороха посевного (Pisum sativum L.) Экологическая генетика (год публикации - 2020)
17. Кулаева О.А., Клюкова М.С., Афонин А.М., Сулима А.С., Жуков В.А., Тихонович И.А. The role of plant antimicrobial peptides (AMPs) in response to biotic and abiotic environmental factors BIOLOGICAL COMMUNICATIONS (год публикации - 2020)
18.
Цыганов В.Е., Цыганова А.В., Горшков А.П., Сливёрстова Е.В., Ким В.Е., Чижевская Е.П., Белимов А.А., Серова Т.А., Иванова К.А., Кулаева О.А., Кусакин П.Г., Китаева А.Б., Тихонович И.А.
Efficacy of a plant-microbe system: Pisum sativum (L.) cadmium-tolerant mutant and Rhizobium leguminosarum strains, expressing pea metallothionein genes PsMT1 and PsMT2, for cadmium phytoremediation
Frontiers in Microbiology, Vol. 11. Article 15. (год публикации - 2020)
10.3389/fmicb.2020.00015
19.
Цыганов В.Е., Цыганова А.В.
Symbiotic regulatory genes controlling nodule development in Pisum sativum L
Plants, 9, 1741 (год публикации - 2020)
10.3390/plants9121741
20. Проворов Н.А., Тихонович И.А. Symbiogenetics underway: from genetic analysis to genetic synthesis Biological Communications (год публикации - 2020)
21.
Афонин А.М., Грибченко Э.С., Сулима А.С., Жуков В.А.
Complete Genome Sequence of an Efficient Rhizobium leguminosarum bv. viciae Strain, A1
Microbiology Resource Announcements., V. 9, №. 19. (год публикации - 2020)
10.3390/mps3020036
22.
Гладчук А.С, Шумилина Ю.С, Кузнецова А., Бурейко К., Биллиг С., Царев А., Александрова И., Леонова Л., Жуков В.А., Тихонович И.А., Биркенмейер С., Подольская Е.П., Фролов А.А.
High-Throughput Fingerprinting of Rhizobial Free Fatty Acids by Chemical Thin-Film Deposition and Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry.
Methods and Protocols, Volume 3, Issue 2 (36) (год публикации - 2020)
10.3390/mps3020036
23.
Смоликова Г.Н , Горбач Д.А , Лукашева Е.М , Маврополо-Столяренко Г.Р , Билова Т.Е., Соболева А.В., Царев А.А , Романовская Е. В., Подольская Е.П., Жуков В.А., Тихонович И.А. Медведев С.С. , Хохенвартер В., Фролов А. А.
Bringing New Methods to the Seed Proteomics Platform: Challenges and Perspectives.
International Journal of Molecular Sciences, Volume 21, Issue 23, 9162 (год публикации - 2020)
10.3390/ijms21239162
24. Долгих А.В., Долгих Е.А. Поиск регуляторов, взаимодействующих с транскрипционным фактором BELL1 и необходимых для контроля развития бобово-ризобиального симбиоза. Экологическая генетика (год публикации - 2020)
25. O. A. Pavlova, I. V. Leppyanen, D. V. Kustova, A. D. Bovin, E. A. Dolgikh Phylogenetic and structural analysis of annexins in pea (Pisum sativum L.) and their role in legume–rhizobial symbiosis development Vavilov Journal of Genetics and Breeding (год публикации - 2020)
26. A. V. Dolgikh, E. S. Rudaya, E. A. Dolgikh Identification of BELL transcription factors involved in nodule initiation and development in the legumes Pisum sativum L. and Medicago truncatula Plants (год публикации - 2020)
27.
Янг Д.П.В, Москьер С., Афонин А.М., Рахи П., Малук М. и др.
Defining the Rhizobium Leguminosarum Species Complex.
GENES, Preprints (год публикации - 2020)
10.20944/preprints202012.0297.v1
28. Иванова К.А., Цыганов Анализ экспрессии генов синтеза полиаминов в эффективных и неэффективных клубеньках гороха посевного (Pisum sativum L.) и влияние экзогенной обработки полиаминами на их развитие Экологическая генетика (год публикации - 2021)
Публикации
1.
Сафронова В.И.., Белимов А.А., Сазанова А.Л., Чирак Е.Р., Верхозина А.В., Кузнецова И.Г., Андронов Е.Е., Пухальский Я.В., Тихонович И.А.
Taxonomically different co-microsymbionts of a relict legume Oxytropis popoviana have complementary sets of symbiotic genes and together increase the efficiency of plant nodulation
Molecular Plant-Microbe Interactions, V. 31. N 8. P. 833-841 (год публикации - 2018)
10.1094/MPMI-01-18-0011-R
2.
Здыб А., Сальгадо М.Г., Демченко К.Н., Бреннер В.Г., Пласчица М., Штамп М., Херрфурт К., Фойснер И., Павловски К.
Allene oxide synthase, allene oxide cyclase and jasmonic acid levels in Lotus japonicus nodules
PLOS ONE, V. 13. N 1, e0190884 (год публикации - 2018)
10.1371/journal.pone.0190884
3. Цыганова А.В., Селиверстова Е.В., Цыганов В.Е. Влияние мутации в гене гороха (Pisum sativum L.) cdt (cadmium tolerance) на гистологическую и ультраструктурную организацию клубеньков Экологическая генетика (год публикации - 2019)
4. Долгих А.В., Долгих Е.А. Роль универсальных регуляторов роста и развития растений DELLA-белков в контроле симбиозов. Экологическая генетика (год публикации - 2019)
5. Леппянен И.В., Кириенко А.Н., Долгих Е.А. Agrobacterium rhizogenes - mediated transformation of Pisum sativum L. roots PeerJ (год публикации - 2019)
6. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Тихонович И.А. Эндофитные микроорганизмы в фундаментальных исследованиях и сельском хозяйстве Экологическая генетика (год публикации - 2019)
7. Зорин Е.А., Кулаева О.А., Афонин А.М., Жуков В.А., Тихонович И.А. Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L. Экологическая генетика (год публикации - 2019)
8. Жернаков А.И., Штарк О.Ю., Кулаева О.А., Федорина Я.В., Афонин А.М., Китаева А.Б., Цыганов В.Е., Ф. Афонсо-Грунц, К. Хофмеиер, Б. Ротте, П. Винтер, Тихонович И.А., Жуков В.А. Mapping-by-sequencing using NGS-based 3’-MACE-Seq reveals a new mutant allele of the essential nodulation gene Sym33 (IPD3) in pea (Pisum sativum L.) PeerJ (год публикации - 2018)
9. Штарк О.Ю., Пузанский Р.К., Авдеева Г.С., Смоликова Г.Н., Емельянов В.В., Клюкова М.С., Шаварда А.Л., Кирпичникова А.А., Жернаков А.И., Афонин А.М., Тихонович И.А., Жуков В.А., Шишова М.Ф. The effect of symbiotic interaction of pea (Pisum sativum L.) with arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis on the photochemical activity and metabolite profile of leaves. PeerJ (год публикации - 2019)
10.
Магне К., Козигу Ж., Шиссль К., Лю С., Джордж Я., Жуков В.А., Заль Л., Бойе Ф., Янчева А., Мизоре К.С., Вен Я., Ситерне С., Олдроит Ж., Рате П.
MtNODULE ROOT1 and MtNODULE ROOT2 are essential for indeterminate nodule identity
Plant Physiology, V. 178. N.1. P. 295-316. (год публикации - 2018)
10.1104/pp.18.00610
11.
Сафронова В., Белимов А., Сазанова А., Чирак Е., Кузнецова И., Андронов Е., Пинаев А., Цыганова А., Селиверстова Е., Китаева А., Цыганов В., Тихонович И.
Two broad host range rhizobial strains isolated from relict legumes have various complementary effects on symbiotic parameters of co-inoculated plants
Frontiers in Microbiology, 10, 514 (год публикации - 2019)
10.3389/fmicb.2019.00514
12.
Серова Т.А.,Цыганова А.В., Тихонович И.А., Цыганов В.Е.
Gibberellins inhibit nodule senescence and stimulate nodule meristem bifurcation in pea (Pisum sativum L.)
Frontiers in Plant Science, 10, 285 (год публикации - 2019)
10.3389/fpls.2019.00285
13.
Сулима А.С., Жуков В.А., Кулаева О.А., Васильева Е.Н., Борисов А.Ю., Тихонович И.А.
New sources of Sym 2A allele in the pea (Pisum sativumL.) carry the unique variant of candidate LysM-RLK geneLykX.
PeerJ., 7: e8070 (год публикации - 2019)
10.7717/peerj.8070
14.
Dolgikh A.V., Kirienko A.N., Tikhonovich I.A., Foo E., Dolgikh E.A.
The DELLA Proteins Influence the Expression of Cytokinin Biosynthesis and Response Genes During Nodulation.
Frontiers in Plant Science, 10:432 (год публикации - 2019)
10.3389/fpls.2019.00432
15. Леппянен И.В., Штарк О.Ю., Кириенко А.Н., Павлова О.А., Бовин А.Д., Долгих Е.А. Анализ эффектов совместной инокуляции грибами арбускулярной микоризы и ризобиями на рост и развитие растений гороха Pisum sativum L. Sel'skokhozyaistvennaya biologiya (год публикации - 2020)
16. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Афонин А.М., Борисов А.Ю., Тихонович И.А., Жуков В.А. Культивируемые эндофитные бактерии стеблей и листьев гороха посевного (Pisum sativum L.) Экологическая генетика (год публикации - 2020)
17. Кулаева О.А., Клюкова М.С., Афонин А.М., Сулима А.С., Жуков В.А., Тихонович И.А. The role of plant antimicrobial peptides (AMPs) in response to biotic and abiotic environmental factors BIOLOGICAL COMMUNICATIONS (год публикации - 2020)
18.
Цыганов В.Е., Цыганова А.В., Горшков А.П., Сливёрстова Е.В., Ким В.Е., Чижевская Е.П., Белимов А.А., Серова Т.А., Иванова К.А., Кулаева О.А., Кусакин П.Г., Китаева А.Б., Тихонович И.А.
Efficacy of a plant-microbe system: Pisum sativum (L.) cadmium-tolerant mutant and Rhizobium leguminosarum strains, expressing pea metallothionein genes PsMT1 and PsMT2, for cadmium phytoremediation
Frontiers in Microbiology, Vol. 11. Article 15. (год публикации - 2020)
10.3389/fmicb.2020.00015
19.
Цыганов В.Е., Цыганова А.В.
Symbiotic regulatory genes controlling nodule development in Pisum sativum L
Plants, 9, 1741 (год публикации - 2020)
10.3390/plants9121741
20. Проворов Н.А., Тихонович И.А. Symbiogenetics underway: from genetic analysis to genetic synthesis Biological Communications (год публикации - 2020)
21.
Афонин А.М., Грибченко Э.С., Сулима А.С., Жуков В.А.
Complete Genome Sequence of an Efficient Rhizobium leguminosarum bv. viciae Strain, A1
Microbiology Resource Announcements., V. 9, №. 19. (год публикации - 2020)
10.3390/mps3020036
22.
Гладчук А.С, Шумилина Ю.С, Кузнецова А., Бурейко К., Биллиг С., Царев А., Александрова И., Леонова Л., Жуков В.А., Тихонович И.А., Биркенмейер С., Подольская Е.П., Фролов А.А.
High-Throughput Fingerprinting of Rhizobial Free Fatty Acids by Chemical Thin-Film Deposition and Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry.
Methods and Protocols, Volume 3, Issue 2 (36) (год публикации - 2020)
10.3390/mps3020036
23.
Смоликова Г.Н , Горбач Д.А , Лукашева Е.М , Маврополо-Столяренко Г.Р , Билова Т.Е., Соболева А.В., Царев А.А , Романовская Е. В., Подольская Е.П., Жуков В.А., Тихонович И.А. Медведев С.С. , Хохенвартер В., Фролов А. А.
Bringing New Methods to the Seed Proteomics Platform: Challenges and Perspectives.
International Journal of Molecular Sciences, Volume 21, Issue 23, 9162 (год публикации - 2020)
10.3390/ijms21239162
24. Долгих А.В., Долгих Е.А. Поиск регуляторов, взаимодействующих с транскрипционным фактором BELL1 и необходимых для контроля развития бобово-ризобиального симбиоза. Экологическая генетика (год публикации - 2020)
25. O. A. Pavlova, I. V. Leppyanen, D. V. Kustova, A. D. Bovin, E. A. Dolgikh Phylogenetic and structural analysis of annexins in pea (Pisum sativum L.) and their role in legume–rhizobial symbiosis development Vavilov Journal of Genetics and Breeding (год публикации - 2020)
26. A. V. Dolgikh, E. S. Rudaya, E. A. Dolgikh Identification of BELL transcription factors involved in nodule initiation and development in the legumes Pisum sativum L. and Medicago truncatula Plants (год публикации - 2020)
27.
Янг Д.П.В, Москьер С., Афонин А.М., Рахи П., Малук М. и др.
Defining the Rhizobium Leguminosarum Species Complex.
GENES, Preprints (год публикации - 2020)
10.20944/preprints202012.0297.v1
28. Иванова К.А., Цыганов Анализ экспрессии генов синтеза полиаминов в эффективных и неэффективных клубеньках гороха посевного (Pisum sativum L.) и влияние экзогенной обработки полиаминами на их развитие Экологическая генетика (год публикации - 2021)
Публикации
1.
Сафронова В.И.., Белимов А.А., Сазанова А.Л., Чирак Е.Р., Верхозина А.В., Кузнецова И.Г., Андронов Е.Е., Пухальский Я.В., Тихонович И.А.
Taxonomically different co-microsymbionts of a relict legume Oxytropis popoviana have complementary sets of symbiotic genes and together increase the efficiency of plant nodulation
Molecular Plant-Microbe Interactions, V. 31. N 8. P. 833-841 (год публикации - 2018)
10.1094/MPMI-01-18-0011-R
2.
Здыб А., Сальгадо М.Г., Демченко К.Н., Бреннер В.Г., Пласчица М., Штамп М., Херрфурт К., Фойснер И., Павловски К.
Allene oxide synthase, allene oxide cyclase and jasmonic acid levels in Lotus japonicus nodules
PLOS ONE, V. 13. N 1, e0190884 (год публикации - 2018)
10.1371/journal.pone.0190884
3. Цыганова А.В., Селиверстова Е.В., Цыганов В.Е. Влияние мутации в гене гороха (Pisum sativum L.) cdt (cadmium tolerance) на гистологическую и ультраструктурную организацию клубеньков Экологическая генетика (год публикации - 2019)
4. Долгих А.В., Долгих Е.А. Роль универсальных регуляторов роста и развития растений DELLA-белков в контроле симбиозов. Экологическая генетика (год публикации - 2019)
5. Леппянен И.В., Кириенко А.Н., Долгих Е.А. Agrobacterium rhizogenes - mediated transformation of Pisum sativum L. roots PeerJ (год публикации - 2019)
6. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Тихонович И.А. Эндофитные микроорганизмы в фундаментальных исследованиях и сельском хозяйстве Экологическая генетика (год публикации - 2019)
7. Зорин Е.А., Кулаева О.А., Афонин А.М., Жуков В.А., Тихонович И.А. Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L. Экологическая генетика (год публикации - 2019)
8. Жернаков А.И., Штарк О.Ю., Кулаева О.А., Федорина Я.В., Афонин А.М., Китаева А.Б., Цыганов В.Е., Ф. Афонсо-Грунц, К. Хофмеиер, Б. Ротте, П. Винтер, Тихонович И.А., Жуков В.А. Mapping-by-sequencing using NGS-based 3’-MACE-Seq reveals a new mutant allele of the essential nodulation gene Sym33 (IPD3) in pea (Pisum sativum L.) PeerJ (год публикации - 2018)
9. Штарк О.Ю., Пузанский Р.К., Авдеева Г.С., Смоликова Г.Н., Емельянов В.В., Клюкова М.С., Шаварда А.Л., Кирпичникова А.А., Жернаков А.И., Афонин А.М., Тихонович И.А., Жуков В.А., Шишова М.Ф. The effect of symbiotic interaction of pea (Pisum sativum L.) with arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis on the photochemical activity and metabolite profile of leaves. PeerJ (год публикации - 2019)
10.
Магне К., Козигу Ж., Шиссль К., Лю С., Джордж Я., Жуков В.А., Заль Л., Бойе Ф., Янчева А., Мизоре К.С., Вен Я., Ситерне С., Олдроит Ж., Рате П.
MtNODULE ROOT1 and MtNODULE ROOT2 are essential for indeterminate nodule identity
Plant Physiology, V. 178. N.1. P. 295-316. (год публикации - 2018)
10.1104/pp.18.00610
11.
Сафронова В., Белимов А., Сазанова А., Чирак Е., Кузнецова И., Андронов Е., Пинаев А., Цыганова А., Селиверстова Е., Китаева А., Цыганов В., Тихонович И.
Two broad host range rhizobial strains isolated from relict legumes have various complementary effects on symbiotic parameters of co-inoculated plants
Frontiers in Microbiology, 10, 514 (год публикации - 2019)
10.3389/fmicb.2019.00514
12.
Серова Т.А.,Цыганова А.В., Тихонович И.А., Цыганов В.Е.
Gibberellins inhibit nodule senescence and stimulate nodule meristem bifurcation in pea (Pisum sativum L.)
Frontiers in Plant Science, 10, 285 (год публикации - 2019)
10.3389/fpls.2019.00285
13.
Сулима А.С., Жуков В.А., Кулаева О.А., Васильева Е.Н., Борисов А.Ю., Тихонович И.А.
New sources of Sym 2A allele in the pea (Pisum sativumL.) carry the unique variant of candidate LysM-RLK geneLykX.
PeerJ., 7: e8070 (год публикации - 2019)
10.7717/peerj.8070
14.
Dolgikh A.V., Kirienko A.N., Tikhonovich I.A., Foo E., Dolgikh E.A.
The DELLA Proteins Influence the Expression of Cytokinin Biosynthesis and Response Genes During Nodulation.
Frontiers in Plant Science, 10:432 (год публикации - 2019)
10.3389/fpls.2019.00432
15. Леппянен И.В., Штарк О.Ю., Кириенко А.Н., Павлова О.А., Бовин А.Д., Долгих Е.А. Анализ эффектов совместной инокуляции грибами арбускулярной микоризы и ризобиями на рост и развитие растений гороха Pisum sativum L. Sel'skokhozyaistvennaya biologiya (год публикации - 2020)
16. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Афонин А.М., Борисов А.Ю., Тихонович И.А., Жуков В.А. Культивируемые эндофитные бактерии стеблей и листьев гороха посевного (Pisum sativum L.) Экологическая генетика (год публикации - 2020)
17. Кулаева О.А., Клюкова М.С., Афонин А.М., Сулима А.С., Жуков В.А., Тихонович И.А. The role of plant antimicrobial peptides (AMPs) in response to biotic and abiotic environmental factors BIOLOGICAL COMMUNICATIONS (год публикации - 2020)
18.
Цыганов В.Е., Цыганова А.В., Горшков А.П., Сливёрстова Е.В., Ким В.Е., Чижевская Е.П., Белимов А.А., Серова Т.А., Иванова К.А., Кулаева О.А., Кусакин П.Г., Китаева А.Б., Тихонович И.А.
Efficacy of a plant-microbe system: Pisum sativum (L.) cadmium-tolerant mutant and Rhizobium leguminosarum strains, expressing pea metallothionein genes PsMT1 and PsMT2, for cadmium phytoremediation
Frontiers in Microbiology, Vol. 11. Article 15. (год публикации - 2020)
10.3389/fmicb.2020.00015
19.
Цыганов В.Е., Цыганова А.В.
Symbiotic regulatory genes controlling nodule development in Pisum sativum L
Plants, 9, 1741 (год публикации - 2020)
10.3390/plants9121741
20. Проворов Н.А., Тихонович И.А. Symbiogenetics underway: from genetic analysis to genetic synthesis Biological Communications (год публикации - 2020)
21.
Афонин А.М., Грибченко Э.С., Сулима А.С., Жуков В.А.
Complete Genome Sequence of an Efficient Rhizobium leguminosarum bv. viciae Strain, A1
Microbiology Resource Announcements., V. 9, №. 19. (год публикации - 2020)
10.3390/mps3020036
22.
Гладчук А.С, Шумилина Ю.С, Кузнецова А., Бурейко К., Биллиг С., Царев А., Александрова И., Леонова Л., Жуков В.А., Тихонович И.А., Биркенмейер С., Подольская Е.П., Фролов А.А.
High-Throughput Fingerprinting of Rhizobial Free Fatty Acids by Chemical Thin-Film Deposition and Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry.
Methods and Protocols, Volume 3, Issue 2 (36) (год публикации - 2020)
10.3390/mps3020036
23.
Смоликова Г.Н , Горбач Д.А , Лукашева Е.М , Маврополо-Столяренко Г.Р , Билова Т.Е., Соболева А.В., Царев А.А , Романовская Е. В., Подольская Е.П., Жуков В.А., Тихонович И.А. Медведев С.С. , Хохенвартер В., Фролов А. А.
Bringing New Methods to the Seed Proteomics Platform: Challenges and Perspectives.
International Journal of Molecular Sciences, Volume 21, Issue 23, 9162 (год публикации - 2020)
10.3390/ijms21239162
24. Долгих А.В., Долгих Е.А. Поиск регуляторов, взаимодействующих с транскрипционным фактором BELL1 и необходимых для контроля развития бобово-ризобиального симбиоза. Экологическая генетика (год публикации - 2020)
25. O. A. Pavlova, I. V. Leppyanen, D. V. Kustova, A. D. Bovin, E. A. Dolgikh Phylogenetic and structural analysis of annexins in pea (Pisum sativum L.) and their role in legume–rhizobial symbiosis development Vavilov Journal of Genetics and Breeding (год публикации - 2020)
26. A. V. Dolgikh, E. S. Rudaya, E. A. Dolgikh Identification of BELL transcription factors involved in nodule initiation and development in the legumes Pisum sativum L. and Medicago truncatula Plants (год публикации - 2020)
27.
Янг Д.П.В, Москьер С., Афонин А.М., Рахи П., Малук М. и др.
Defining the Rhizobium Leguminosarum Species Complex.
GENES, Preprints (год публикации - 2020)
10.20944/preprints202012.0297.v1
28. Иванова К.А., Цыганов Анализ экспрессии генов синтеза полиаминов в эффективных и неэффективных клубеньках гороха посевного (Pisum sativum L.) и влияние экзогенной обработки полиаминами на их развитие Экологическая генетика (год публикации - 2021)
Публикации
1.
Сафронова В.И.., Белимов А.А., Сазанова А.Л., Чирак Е.Р., Верхозина А.В., Кузнецова И.Г., Андронов Е.Е., Пухальский Я.В., Тихонович И.А.
Taxonomically different co-microsymbionts of a relict legume Oxytropis popoviana have complementary sets of symbiotic genes and together increase the efficiency of plant nodulation
Molecular Plant-Microbe Interactions, V. 31. N 8. P. 833-841 (год публикации - 2018)
10.1094/MPMI-01-18-0011-R
2.
Здыб А., Сальгадо М.Г., Демченко К.Н., Бреннер В.Г., Пласчица М., Штамп М., Херрфурт К., Фойснер И., Павловски К.
Allene oxide synthase, allene oxide cyclase and jasmonic acid levels in Lotus japonicus nodules
PLOS ONE, V. 13. N 1, e0190884 (год публикации - 2018)
10.1371/journal.pone.0190884
3. Цыганова А.В., Селиверстова Е.В., Цыганов В.Е. Влияние мутации в гене гороха (Pisum sativum L.) cdt (cadmium tolerance) на гистологическую и ультраструктурную организацию клубеньков Экологическая генетика (год публикации - 2019)
4. Долгих А.В., Долгих Е.А. Роль универсальных регуляторов роста и развития растений DELLA-белков в контроле симбиозов. Экологическая генетика (год публикации - 2019)
5. Леппянен И.В., Кириенко А.Н., Долгих Е.А. Agrobacterium rhizogenes - mediated transformation of Pisum sativum L. roots PeerJ (год публикации - 2019)
6. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Тихонович И.А. Эндофитные микроорганизмы в фундаментальных исследованиях и сельском хозяйстве Экологическая генетика (год публикации - 2019)
7. Зорин Е.А., Кулаева О.А., Афонин А.М., Жуков В.А., Тихонович И.А. Анализ событий альтернативного сплайсинга в кончиках корней и клубеньках Pisum sativum L. Экологическая генетика (год публикации - 2019)
8. Жернаков А.И., Штарк О.Ю., Кулаева О.А., Федорина Я.В., Афонин А.М., Китаева А.Б., Цыганов В.Е., Ф. Афонсо-Грунц, К. Хофмеиер, Б. Ротте, П. Винтер, Тихонович И.А., Жуков В.А. Mapping-by-sequencing using NGS-based 3’-MACE-Seq reveals a new mutant allele of the essential nodulation gene Sym33 (IPD3) in pea (Pisum sativum L.) PeerJ (год публикации - 2018)
9. Штарк О.Ю., Пузанский Р.К., Авдеева Г.С., Смоликова Г.Н., Емельянов В.В., Клюкова М.С., Шаварда А.Л., Кирпичникова А.А., Жернаков А.И., Афонин А.М., Тихонович И.А., Жуков В.А., Шишова М.Ф. The effect of symbiotic interaction of pea (Pisum sativum L.) with arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis on the photochemical activity and metabolite profile of leaves. PeerJ (год публикации - 2019)
10.
Магне К., Козигу Ж., Шиссль К., Лю С., Джордж Я., Жуков В.А., Заль Л., Бойе Ф., Янчева А., Мизоре К.С., Вен Я., Ситерне С., Олдроит Ж., Рате П.
MtNODULE ROOT1 and MtNODULE ROOT2 are essential for indeterminate nodule identity
Plant Physiology, V. 178. N.1. P. 295-316. (год публикации - 2018)
10.1104/pp.18.00610
11.
Сафронова В., Белимов А., Сазанова А., Чирак Е., Кузнецова И., Андронов Е., Пинаев А., Цыганова А., Селиверстова Е., Китаева А., Цыганов В., Тихонович И.
Two broad host range rhizobial strains isolated from relict legumes have various complementary effects on symbiotic parameters of co-inoculated plants
Frontiers in Microbiology, 10, 514 (год публикации - 2019)
10.3389/fmicb.2019.00514
12.
Серова Т.А.,Цыганова А.В., Тихонович И.А., Цыганов В.Е.
Gibberellins inhibit nodule senescence and stimulate nodule meristem bifurcation in pea (Pisum sativum L.)
Frontiers in Plant Science, 10, 285 (год публикации - 2019)
10.3389/fpls.2019.00285
13.
Сулима А.С., Жуков В.А., Кулаева О.А., Васильева Е.Н., Борисов А.Ю., Тихонович И.А.
New sources of Sym 2A allele in the pea (Pisum sativumL.) carry the unique variant of candidate LysM-RLK geneLykX.
PeerJ., 7: e8070 (год публикации - 2019)
10.7717/peerj.8070
14.
Dolgikh A.V., Kirienko A.N., Tikhonovich I.A., Foo E., Dolgikh E.A.
The DELLA Proteins Influence the Expression of Cytokinin Biosynthesis and Response Genes During Nodulation.
Frontiers in Plant Science, 10:432 (год публикации - 2019)
10.3389/fpls.2019.00432
15. Леппянен И.В., Штарк О.Ю., Кириенко А.Н., Павлова О.А., Бовин А.Д., Долгих Е.А. Анализ эффектов совместной инокуляции грибами арбускулярной микоризы и ризобиями на рост и развитие растений гороха Pisum sativum L. Sel'skokhozyaistvennaya biologiya (год публикации - 2020)
16. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Афонин А.М., Борисов А.Ю., Тихонович И.А., Жуков В.А. Культивируемые эндофитные бактерии стеблей и листьев гороха посевного (Pisum sativum L.) Экологическая генетика (год публикации - 2020)
17. Кулаева О.А., Клюкова М.С., Афонин А.М., Сулима А.С., Жуков В.А., Тихонович И.А. The role of plant antimicrobial peptides (AMPs) in response to biotic and abiotic environmental factors BIOLOGICAL COMMUNICATIONS (год публикации - 2020)
18.
Цыганов В.Е., Цыганова А.В., Горшков А.П., Сливёрстова Е.В., Ким В.Е., Чижевская Е.П., Белимов А.А., Серова Т.А., Иванова К.А., Кулаева О.А., Кусакин П.Г., Китаева А.Б., Тихонович И.А.
Efficacy of a plant-microbe system: Pisum sativum (L.) cadmium-tolerant mutant and Rhizobium leguminosarum strains, expressing pea metallothionein genes PsMT1 and PsMT2, for cadmium phytoremediation
Frontiers in Microbiology, Vol. 11. Article 15. (год публикации - 2020)
10.3389/fmicb.2020.00015
19.
Цыганов В.Е., Цыганова А.В.
Symbiotic regulatory genes controlling nodule development in Pisum sativum L
Plants, 9, 1741 (год публикации - 2020)
10.3390/plants9121741
20. Проворов Н.А., Тихонович И.А. Symbiogenetics underway: from genetic analysis to genetic synthesis Biological Communications (год публикации - 2020)
21.
Афонин А.М., Грибченко Э.С., Сулима А.С., Жуков В.А.
Complete Genome Sequence of an Efficient Rhizobium leguminosarum bv. viciae Strain, A1
Microbiology Resource Announcements., V. 9, №. 19. (год публикации - 2020)
10.3390/mps3020036
22.
Гладчук А.С, Шумилина Ю.С, Кузнецова А., Бурейко К., Биллиг С., Царев А., Александрова И., Леонова Л., Жуков В.А., Тихонович И.А., Биркенмейер С., Подольская Е.П., Фролов А.А.
High-Throughput Fingerprinting of Rhizobial Free Fatty Acids by Chemical Thin-Film Deposition and Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry.
Methods and Protocols, Volume 3, Issue 2 (36) (год публикации - 2020)
10.3390/mps3020036
23.
Смоликова Г.Н , Горбач Д.А , Лукашева Е.М , Маврополо-Столяренко Г.Р , Билова Т.Е., Соболева А.В., Царев А.А , Романовская Е. В., Подольская Е.П., Жуков В.А., Тихонович И.А. Медведев С.С. , Хохенвартер В., Фролов А. А.
Bringing New Methods to the Seed Proteomics Platform: Challenges and Perspectives.
International Journal of Molecular Sciences, Volume 21, Issue 23, 9162 (год публикации - 2020)
10.3390/ijms21239162
24. Долгих А.В., Долгих Е.А. Поиск регуляторов, взаимодействующих с транскрипционным фактором BELL1 и необходимых для контроля развития бобово-ризобиального симбиоза. Экологическая генетика (год публикации - 2020)
25. O. A. Pavlova, I. V. Leppyanen, D. V. Kustova, A. D. Bovin, E. A. Dolgikh Phylogenetic and structural analysis of annexins in pea (Pisum sativum L.) and their role in legume–rhizobial symbiosis development Vavilov Journal of Genetics and Breeding (год публикации - 2020)
26. A. V. Dolgikh, E. S. Rudaya, E. A. Dolgikh Identification of BELL transcription factors involved in nodule initiation and development in the legumes Pisum sativum L. and Medicago truncatula Plants (год публикации - 2020)
27.
Янг Д.П.В, Москьер С., Афонин А.М., Рахи П., Малук М. и др.
Defining the Rhizobium Leguminosarum Species Complex.
GENES, Preprints (год публикации - 2020)
10.20944/preprints202012.0297.v1
28. Иванова К.А., Цыганов Анализ экспрессии генов синтеза полиаминов в эффективных и неэффективных клубеньках гороха посевного (Pisum sativum L.) и влияние экзогенной обработки полиаминами на их развитие Экологическая генетика (год публикации - 2021)