Метагеномный анализ кишечной микробиоты людей с депрессивными расстройствами для выявления маркерных композиций генов.

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 20-14-00132

НазваниеМетагеномный анализ кишечной микробиоты людей с депрессивными расстройствами для выявления маркерных композиций генов.

Руководитель Аверина Ольга Викторовна, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук , г Москва

Конкурс №45 - Конкурс 2020 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-201 - Структурная, функциональная и эволюционная геномика

Ключевые слова Депрессия, кишечная микробиота человека, метагеномный анализ, генетические маркеры

Код ГРНТИ34.27.21

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Депрессия признана ВОЗ четвертой по значимости причиной потери трудоспособности населения; болезнь существенно снижает качество жизни пациентов, служит одной из наиболее частых причин суицида и относится к социально-значимым заболеваниям. Сложность этиопатогенеза депрессии требует изучения проблемы в междисциплинарном ключе. В числе прочих приобретает актуальность направление, объединяющее психиатрию и микробиологию. В последние годы было сформулировано и доказано существование оси микробиота-кишечник-мозг. В многочисленных опытах на животных и отдельных работах на людях было показано, что существует двунаправленное взаимодействие – нейроиммунное, нейроэндокринное, невральное - между кишечной микробиотой (т.е. совокупностью микроорганизмов, населяющих кишечно-желудочный тракт) и мозгом, в частности при заболевании депрессией. Новым и перспективным направлением исследования возникновения, развития и лечения депрессии является изучение связи заболевания с микробиотой ЖКТ. Целью данной работы является выявление потенциальных бактериальных биомаркеров депрессии человека путем сравнительного метагеномного анализа микробиоты ЖКТ больных депрессией и здоровых людей. В отличие от известных работ по исследованию микробиоты пациентов, больных депрессией, в данном исследовании предполагается провести полногеномный анализ микробиоты когорт больных и здоровых пациентов, а не только секвенирование генов 16S рибосомальной РНК. Это позволит осуществить не только значительно более полный и точный анализ филогенетического состава микробиоты, но оценить ее метаболическую активность и выделить гены-биомаркеры, характерные для микробиоты больных пациентов. Поиски биомаркеров, коррелирующих с заболеванием, будут осуществлены с использованием ранее разработанных авторами проекта алгоритмов и подходов, использованных ранее для анализа кишечной микробиоты детей с расстройством аутического спектра.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Аверина О.В., Зоркина Я.А., Юнес Р.А., Ковтун А.С., Ушакова В.М., Морозова А.Я., Костюк Г.П., Даниленко В.Н., Чехонин В.П. Bacterial Metabolites of Human Gut Microbiota Correlating with Depression International Journal of Molecular Sciences (год публикации - 2020)
10.3390/ijms21239234

2. Ковтун А.С., Аверина О.В., Полуэктова Е.У., Костюк Г.П. , Даниленко В.Н. СТРУКТУРА И НЕЙРОМЕТАБОЛИЧЕСКИЙ ПОТЕНЦИАЛ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА У ЗДОРОВЫХ ДЕТЕЙ РАЗНОГО ВОЗРАСТА ВЕСТНИК РГМУ (год публикации - 2020)
10.24075/vrgmu.2020.0

3. Полуэктова Е,У. Юнес Р. А.Даниленко В.Н. The Putative Antidepressant Mechanisms of Probiotic Bacteria: Relevant Genes and Proteins. Nutrients, 13:1591 (год публикации - 2021)
10.3390/nu13051591

4. Аверина О.В., Полуэктова Е.У., Марсова М.В., Даниленко В.Н. Utility of the Antioxidant Potential of Probiotic Lactobacilli and Bifidobacteria as Representatives of the Human Gut Microbiota. Biomedicines, 9, 1340,1-33 (год публикации - 2021)
10.3390/biomedicines9101340

5. Полуэктова Е.У., Даниленко В.Н. Бактерии-пробиотики в коррекции признаков депрессии, их активные гены и белки. Генетика, Т.57, № 9, стр.1011-1020 (год публикации - 2021)
10.31857/S0016675821090095

6. Я.А. Зоркина, Т.С. Сюняков, О.В. Абрамова, Р.А. Юнес, Д.А. Суслопарова, Е.Б. Хобта, А.В. Павличенко, Г.Ю. Царапкин, O.А. Карпенко, Д.С. Андреюк, В.Н. Даниленко, К.А. Павлов, О.И. Гурина, Г.П. Костюк, А.Ю. Морозова Содержание нейроторофических факторов в плазме крови не ассоциировано с тяжестью депрессии: проспективное пилотное исследование Consortium Psychiatricum, №1 (год публикации - 2022)
10.17816/CP110

7. Зоркина Я.А., Сюняков Т.С.,,Абрамова О.В., Юнес Р.А., Аверина О.В., Ковтун А.С.,Ангелова И.Ю., Хобта Е.Б., Суслопарова Д.А., Павличенко А.В., Карпенко О.А., Андреюк Д.С., Товмасян А.С., Даниленко В.Н., Гурина О.И., Костюк Г.П., Морозова А.Ю. Влияние диеты на микробиом кишечника у пациентов с депрессией. Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова, №1, том 122, выпуск. 2, стр. 59–64 (год публикации - 2022)
10.17116/jnevro202212201259

8. Ковтун А.С., Аверина О.В., Ангелова И.Ю., Юнес Р.А., Зоркина Я.А., Морозова А.Ю., Павличенко А.В., Сюняков Т.С., Карпенко О.А., Костюк Г.П., Даниленко В.Н. Alterations of the Composition and Neurometabolic Profile of Human Gut Microbiota in Major Depressive Disorder Biomedicines, 10, 2162 (год публикации - 2022)
10.3390/biomedicines10092162

Публикации