Разработка системы полигенных шкал риска развития депрессии в российской популяции на основе полногеномного исследования с клинической валидацией

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 20-15-00132

НазваниеРазработка системы полигенных шкал риска развития депрессии в российской популяции на основе полногеномного исследования с клинической валидацией

Руководитель Незнанов Николай Григорьевич, Доктор медицинских наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр психиатрии и неврологии имени В.М. Бехтерева» Министерства здравоохранения Российской Федерации , г Санкт-Петербург

Конкурс №45 - Конкурс 2020 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-226 - Психиатрия

Ключевые слова депрессия, генетический риск, полигенные шкалы риска, полногеномное ассоциативное исследование, популяционные исследования, профилактика, превентивная медицина

Код ГРНТИ76.00.00

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Депрессия — хроническое рецидивирующее психическое заболевание с существенным уровнем генетического влияния, которое поражает до 5% населения. Депрессия развивается чаще всего в молодом и среднем возрасте и существенно снижает качество жизни и социальное функционирование пациентов, а также является одной из ведущих причин инвалидизации, смертности и сокращения продолжительности жизни. В рамках превентивной медицины профилактика депрессии становится персонализированной и научной, что позволяет не только повысить ее эффективность, но и существенно сэкономить ресурсы. Для достижения задач профилактики необходимы возможности выявления в популяции групп риска - индивидуумов с высоким уровнем генетического риска развития депрессии. Предлагаемый проект направлен на разработку генетической тест-системы на основе полигенных шкал риска (PRS) развития депрессии с учетом полиэтничности российской популяции, клинической валидации этой тест-системы и адаптации для проведения популяционного скрининга для выявления групп высокого генетического риска развития депрессии. Задача предлагаемого проекта масштабна - предполагается изучение 5 800 участников из разных регионов России с применением мультицентрового дизайна исследования. Исследование планируется как мультицентровое (8 Центров исследования по всей стране), что обеспечивает, с одной стороны, высокие темпы набора клинической выборки, с другой стороны, дает возможность реальной оценки специфических особенностей российской популяции с учетом географического фактора, исторической полиэтничности и мультикультурального характера. Исследование планируется как комплексное: применяются методы и методологии нескольких научных дисциплин - психиатрии, психологии, генетики и биоинформатики. В результате выполнения исследования будут впервые получены данные о генетической архитектуре депрессии (методом GWAS) и выявлены полигенные шкалы риска (PRS) развития депрессии в популяции России с учетом ее полиэтничности. Данный факт крайне важен с учетом известной гетерогенности генетических структур разных популяций, особенно с учетом отсутствия на сегодняшний день генетических данных в отношении депрессии в популяции России. Будет проведено первое в России полногеномное ассоциативное исследования (GWAS) депрессии в популяционной выборке, сформированы полигенные шкалы риска для отдельных симптомов депрессии с последующей валидацией на клинической выборке пациентов и группе психически здоровых лиц с применением идентичной процедуры фенотипирования. Будет разработана генетическая тест-система на основе комплекса валидных маркеров (PRS) для выявления групп высокого генетического риска развития депрессии в популяции. Предлагаемое исследование обладает высоким уровнем научной новизны и научного приоритета. Впервые будет проведен анализ связи геномных данных с двумя типами фенотипических характеристик: качественными и категориальными (диагноз, наличие симптомов) и количественных (балльных оценок выраженности симптомов). Впервые будет проведен сравнительный анализ PRS для отдельных симптомов заболевания, выявленных на основе самооценок участников, что имеет решающее значение для популяционного скрининга без осмотра врача. Впервые будет проведена процедура валидации и оценки предиктивной мощности полигенных шкал риска для симптомов в популяционной выборке на качественно описанной выборке пациентов с применением современных международных клинических и психометрических инструментов. Впервые будет проведена оценка влияния психотравмирующих факторов детства как модификаторов генетического эффекта PRS с учетом пола, возраста и симптомов заболевания. Впервые будет применен подход оценки “минимальной достаточности фенотипа” на основании биоинформатического анализа геномных и клинических данных, что позволит разработать “минимальный фенотип” депрессии для проведения популяционного скрининга. Впервые будет использован подход комплексной оценки нескольких полигенных шкал риска с различными фенотипическими дефинициями в виде “системы PRS” для построения генетической тест-системы для использования в скрининговых исследованиях. Генетическая тест-система позволит позволит проводить эффективный скрининг населения после проведения масштабной валидации на независимых выборках (вне рамок данного проекта). Появление генетической тест-системы, разработанной при изучении российской популяции и в условиях постоянного снижения стоимости генетических исследований позволит осуществить эффективный переход к развитию превентивной медицины в области психического здоровья.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Шмуклер А.Б., Кибитов А.О., Мазо Г.Э., Рукавишников Г.В., Незнанов Н.Г. Сетевой анализ как перспективный метод изучения генетической архитектуры депрессии Социальная и клиническая психиатрия, том 30, выпуск 4, стр. 69 - 76 (год публикации - 2020)

2. Кибитов А.О., Мазо Г.Э., Ракитько А.С., Каьянов Е.Д., Рукавишников Г.В., Ильинский В.В., Голимбет В.Е., Шмуклер А.Б., Незнанов Н.Г. Полигенные шкалы риска развития депрессии на основе GWAS с клинической валидацией: методология и дизайн исследования в российской популяции Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова, Т. 120, N. 11. C. 103-112 (год публикации - 2020)
10.17116/jnevro2020120111103

3. Касьянов Е.Д., Ракитько А.С., Рукавишников Г.В., Голимбет В.Е., Шмуклер А.Б., Ильинский В.В., Незнанов Н.Г., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. Современные GWAS исследования депрессии: критическая роль фенотипирования Журнал психиатрии и неврологии им. С.С. Корсакова (год публикации - 2021)

4. Касьянов Е.Д., Николишин А.Е., Рукавишников Г.В.,Шмуклер А.Б.,Голимбет В.Е., Незнанов Н.Г., Мазо Г.Э., Кибитов А.О. Семейная отягощенность расстройствами настроения и клинические характеристики депрессии: значительный эффект пола Журнал психиатрии и неврологии им. С.С. Корсакова (год публикации - 2021)

5. Касьянов Е.Д., Николишин А.Е., Рукавишников Г.В., <...> Голимбет В.Е., Незнанов Н.Г., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. КЛИНИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ДЕПРЕССИИ С РАННИМ МАНИФЕСТОМ: ФОКУС НА НЕЙРОВЕГЕТАТИВНЫЕ СИМПТОМЫ Российский психиатрический журнал, 2021. № 2. С. 43-53. (год публикации - 2021)
10.47877/1560-957X-2021-10205

6. Касьянов Е.Д., Рукавишников Г.В., Кибитов А.А., Малышко Л.В., Незнанов Н.Г., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ИЗУЧЕНИЮ ГЕНЕТИКИ ДЕПРЕССИИ: ВОЗМОЖНОСТИ И ОГРАНИЧЕНИЯ Журнал неврологии и психиатрии им. C.C. Корсакова, Т. 121. № 5-2. С. 61-66. (год публикации - 2021)
10.17116/jnevro202112105261

7. Рукавишников Г.В., Ракитько А.С., Касьянов Е.Д., Ильинский В.В., Кибитов А.О., Мазо Г.Э., Незнанов Н.Г. Correlation of DSM-5-based and HADS self-reported depression phenotypes: Preliminary results of on-line survey in Russian population cohort European psychiatry, Vol. 64 (S1), S332-S333. (год публикации - 2021)
10.1192/j.eurpsy.2021.892

8. Кибитов А.А., Ракитько А.С., Касьянов Е.Д., Рукавишников Г.В., Козлова К.А., Ильинский В.В., Незнанов Н.Г., Мазо Г.Э., Кибитов А.О. Screening of Depressive Symptoms in a Russian General Population Sample: A Web-based Cross-sectional Study Clinical Practice & Epidemiology in Mental Health (год публикации - 2021)

9. Рукавишников Г.В., Ракитько А.С., Касьянов Е.Д., Ильинский В.В., Незнанов Н.Г., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. Different phenotypic assessment of depression prevalence in Russian population: DSM-criteria vs HADS European Psychiatry, Vol.65(S1):S556 (год публикации - 2022)
10.1192/j.eurpsy.2022.1424

10. Касьянов Е.Д., Рукавишников Г.В., Николишин А.Е., Гареева А.Э., Савицкая К., Казанцева А, Крецу А., Солдаткин В., Лежейко Т., Голимбет В.Е., Незнанов Н.Г., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. Early-Onset Depression Is Associated With Specific Neurovegetative Symptoms European Psychiatry, Vol.65(S1):S145-S146 (год публикации - 2022)
10.1192/j.eurpsy.2022.392

11. Кибитов А.А., Ракитько А.С., Касьянов Е.Д., Ермакович Д., Кибитов А.О., Рукавишников Г.В., Ильинский В.В., Голимбет В.Е., Шмуклер А.Б., Незнанов Н.Г., Мазо Г.Э. Genome-wide association study of depression symptoms using online self-questionnaires in the Russian population cohort: preliminary results European Psychiatry, Vol. 65(S1):S327 (год публикации - 2022)
10.1192/j.eurpsy.2022.832

12. Кибитов А.А., Касьянов Е.Д., Николишин А.Е. и соавт. Влияние семейной отягощенности расстройствами настроения на ассоциацию детской травмы и суицидальности у пациентов с депрессией Социальная и клиническая психиатрия, 31(4):5-14 (год публикации - 2021)

13. Кибитов А.А., Касьянов Е.Д., Рукавишников Г.В., Шмуклер А.Б., Незнанов Н.Г., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. Семейная отягощенность расстройствами настроения ассоциирована с выраженностью ангедонии и симптомов расстройств пищевого поведения у пациентов с депрессией Социальная и клиническая психиатрия, 32(2):5-11 (год публикации - 2022)

14. Кибитов А.А., Касьянов Е.Д., Николишин А.Е., Рукавишников Г.В., Малышко Л.В., Попович У.О., Голимбет В.Е., Незнанов Н.Г., Шмуклер А.Б., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. Связь семейной отягощенности расстройствами настроения с неблагоприятным детским опытом и суицидальностью у пациентов с депрессией Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова, 122(6‑2):56‑63 (год публикации - 2022)
10.17116/jnevro202212206256

15. Касьянов Е.Д., Вербицкая Е.В., Ракитько А.С., Ильинский В.В., Рукавишников Г.В., Незнанов Н.Г., Кибитов А.О., Мазо Г.Э Валидация скринингового теста, основанного на критериях DSM-5 методом цифрового фенотипирования на российской популяции Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова, 122(6‑2):64‑70 (год публикации - 2022)
10.17116/jnevro202212206264

16. Мазо Г.Э., Касьянов Е.Д., Кибитов А.О. МЕРЦАЮЩАЯ ГРАНЬ МЕЖДУ ДЕПРЕССИЕЙ И ТРЕВОГОЙ: КЛИНИЧЕСКИЕ И ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ Социальная и клиническая психиатрия, 32(4):50-58 (год публикации - 2022)

17. Касьянов Е.Д., Ковалёва Я.В., Мазо Г.Э. Цифровое фенотипирование как новый метод скрининга психических расстройств Обозрение психиатрии и медицинской психологии им. В.М. Бехтерева, 56:4:96-100 (год публикации - 2022)
10.31363/2313-7053-2022-4-96-100

18. Пинахина Д.В., <...>, Касьянов Е.Д., Рукавишников Г.В., <...>, Ильинский В.В., Незнанов Н.Г., Мазо Г.Э., Кибитов А.О., Ракитько А.С., Артемов М. Q1GWAS of depression in 4,520 individuals from the Russian population highlights the role of MAGI2 (S-SCAM) in the gut-brain axis Frontiers in Genetics (год публикации - 2022)
10.3389/fgene.2022.972196

19. Рукавишников Г.В., Ракитько А.С., Касьянов Е.Д., Ильинский В.В., Малышко Л.В., Незнанов Н.Г., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. Связь депрессии и тревоги с соматическими заболеваниями: роль негативных внешних факторов Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова (год публикации - 2023)

20. Касьянов Е.Д., Пинахина Д.В., Ракитько А.С., <....>, Рукавишников Г.В., Малышко Л.В., <...>, Незнанов Н.Г., Ильинский В.В., Кибитов А.О., Мазо Г.Э. Связь расстройств настроения и соматических заболеваний с ангедонией: результаты разведочного менделевского рандомизационного анализа Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова (год публикации - 2023)

Публикации