Сравнительное исследование генетической архитектуры домашней и дикой форм северного оленя (Rangifer tarandus) на основе анализа ядерного и митохондриального геномов.

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 21-16-00071

НазваниеСравнительное исследование генетической архитектуры домашней и дикой форм северного оленя (Rangifer tarandus) на основе анализа ядерного и митохондриального геномов.

Руководитель Харзинова Вероника Руслановна, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный исследовательский центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста" , Московская обл

Конкурс №55 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки; 06-204 - Животноводство

Ключевые слова северный олень, породы оленей, дикая популяция, секвенирование, генотипирование, филогения, генетическая архитектура, генетическое разнообразие, полный митохондриальный геном, STR, SNP

Код ГРНТИ68.39.57

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Исследование архитектуры генома домашней и дикой форм северного оленя – представляет особый интерес. Одной из особенностей вида Rangifer tarandus L., 1758, является совместное существование домашней и дикой популяции, которые обитают на перекрывающейся территории практически в одинаковых условиях, и на протяжении десятков тысяч лет среда их обитания менялась незначительно. Несмотря на некоторые изменения в биологии одомашненных оленей, связанные с контролем человека (перемещение, размножение, половая и возрастная структура стад), приобретенное в процессе доместикации поведение не закреплено генетически: домашние олени, завезенные на острова, быстро приобретают повадки диких. Таким образом, исследование полных последовательностей митохондриального и ядерного геномов популяций северного оленя и изучение их различий и сходства является актуальным. Данные исследования откроют новые возможности для использования геномной информации, начиная от простого анализа происхождения до исследований ассоциаций всего генома и геномного прогнозирования. Настоящий проект предусматривает масштабное полногеномное секвенирование митохондриального генома и полногеноное генотипирование всех пород домашнего северного оленя, а также дикого северного оленя, обитающего на территории Таймырского Автономного округа, Красноярского края, Якутии и Амурской области. В результате проведенных исследований, впервые будет получена информация не только о геномных регионах дифференциации популяций северного оленя, но также будут выявлены геномные отпечатки инбридинга, локализация отдельных генов, древние эволюционные события и демографическая история домашней и дикой форм единственного представителя рода Rangifer. Полученные результаты позволят повысить эффективность селекционно-племенной работы в отрасли оленеводства, а также разработать рекомендации по обеспечению охраны и использования запасов дикого северного оленя, как важнейшего промыслового ресурса в системе традиционного природопользования коренных малочисленных народов Севера, Сибири и Дальнего Востока Российской Федерации.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Харзинова В.Р., Доцев А.В., Бардуков Н.В., Денискова Т.Е., Упадхяй М., Кребс С., Кунц Э., Медугорак И., Зиновьева Н.А. Mitochondrial DNA diversity within domestic reindeer in Russia Journal of Animal Science, Volume 99, Issue Supplement_3, 2021, Page 253 (год публикации - 2021)
10.1093/jas/skab235.462

Публикации

1. Полногеномный анализ SNP выявил генетическое разнообразие и популяционную структуру популяции домашнего северного оленя (Rangifer tarandus), обитающей на землях коренных тофаларов Южной Сибири Genome-Wide SNP Analysis Reveals the Genetic Diversity and Population Structure of the Domestic Reindeer Population (Rangifer tarandus) Inhabiting the Indigenous Tofalar Lands of Southern Siberia Diversity, 14(11), 900 (год публикации - 2022)
10.3390/d14110900

Публикации

1. О.А. Кошкина, А.Д. Соловьева, Т.Е. Денискова, В.Р. Харзинова, Н.А. Зиновьева Study of the genetic diversity of domestic and wild reindeer (Rangifer tarandus L., 1758) populations using nuclear and mitochondrial genomic markers Sel'skokhozyaistvennaya Biologiya [Agricultural Biology], Vol. 57, № 6, p. 1101-1116 (год публикации - 2023)
10.15389/agrobiology.2022.6.1101eng

2. В. Р. Харзинова, А. В. Кудрявцев, М. Н. Семерикова, Н. А. Зиновьева Изучение популяционной структуры и генетического разнообразия чукотской породы северного оленя на основе анализа микросателлитов Достижения науки и техники АПК, Т. 37. № 9. С. 72-78 (год публикации - 2023)
10.53859/02352451_2023_37_9_0

3. О. А. Кошкина, В. Р. Харзинова, Н. А. Зиновьева Исследования филогенетических связей популяций ненецкой породы северного оленя, основанные на системе анализа полиморфизма полных митохондриальных геномов Достижения науки и техники АПК, Т. 37. № 9. С.79-88 (год публикации - 2023)
10.53859/02352451_2023_37_9_0

4. Харзинова В.Р., Доцев А.В., Шимит Л.Д., Кочкарев А.П., Зиновьева Н.А Оценка генетического разнообразия малочисленных популяций домашнего и дикого северного оленя на основе полногеномного анализа материалы Второй конференции, г. Санкт-Петербург, 13–15 марта 2023 г. : научное текстовое электронное издание, стр. 31-32 (год публикации - 2023)
10.30901/978-5-907145-94-8

5. О.А. Кошкина, А.Д. Соловьева, Т.Е. Денискова, В.Р. Харзинова, Н.А. Зиновьева Изучение генетического разнообразия домашних и диких популяций северного оленя (Rangifer tarandus L., 1758) с использованием маркеров ядерного и митохондриального геномов Сельскохозяйственная биология, том 57, ¹ 6, с. 1101-1116 (год публикации - 2023)
10.15389/agrobiology.2022.6.1101rus

6. Харзинова В. Р., Кошкина О. А., Доцев А. В.,Зиновьева Н. А. Генетическое разнообразие региональных популяций северного оленя на основе анализа гена Cytb митохондриальной ДНК Известия Нижневолжского агроуниверситетского комплекса: наука и высшее образование, выпуск №4 (год публикации - 2023)