КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 21-46-00001

НазваниеГенетическая характеристика племенного материала и механизмов адаптации к экстремальным природно-климатическим условиям у китайских и российских пород овец

Руководитель Доцев Арсен Владимирович, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный исследовательский центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста" , Московская обл

Конкурс №52 - Конкурс 2020 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований международными научными коллективами» (NSFC)

Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки; 06-204 - Животноводство

Ключевые слова овцы, гены-кандидаты, SNP-маркеры, адаптация к холодному и жаркому климату, высокогорье

Код ГРНТИ68.39.31


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Овцеводство является важной отраслью сельского хозяйства, обеспечивающей человека уникальной продукцией: шерстью, смушкой, меховой и шубной овчиной, мясом, молоком, салом. В России и на территории бывшего СССР, разведению овец всегда уделялось много внимания. Благодаря этому увеличивалось количество поголовья, создавались новые породы, повышалась продуктивность. До кризиса 1990-х годов на территории России численность овец составляла около 60 млн. голов, однако к 1999 году резко сократилось до 14,8 млн голов. В настоящее время поголовье овец растет и составляла 24,5 млн. голов в 2018 году. Одомашнивание овец произошло приблизительно 11 тысяч лет назад на территории современного Ирана, а предком домашней овцы считают азиатского муфлона. Овцы оказывали существенное влияние на развитие человечества и вследствие этого, вместе с человеком распространились по всему миру. В настоящее время страной лидером по поголовью овец является Китай (около 144 млн. голов). Также овцеводство популярно в Австралии, Индии, Великобритании, Новая Зеландии, Судане, Турции, Иране, Испании, Марокко, Бразилии, России и некоторых других странах. Большим преимуществом овец являются их скороспелость, неприхотливость к условиям содержания, а их широкие адаптационные возможности позволяют заниматься овцеводством в экстремальных природно-климатических условиях, неприемлемых для содержания крупного рогатого скота. Так, различные породы овец приспособлены к жизни в зонах степей, пустынь и полупустынь, гор и высокогорий всех континентов мира. В настоящее время в животноводстве существует тенденция вытеснения локальных пород более продуктивными коммерческими породами. При этом следует учитывать тот факт, что в новых условиях продуктивность ввозимых пород может понижаться, животные могут быть более подвержены заболеваниям. Также существует риск потерять уникальные гены, отвечающие за адаптацию, которые несут в себе локальные породы. Таким образом, желательно усовершенствовать или даже создавать новые породы на основе продуктивных и аборигенных, приспособленных к местным условиям. Новые породы должны быть с одной стороны конкурентоспособными с точки зрения продуктивности, а с другой сохранить все адаптационные способности. С помощью традиционной селекции этот процесс займет большое количество времени. Интенсивное развитие методов молекулярной генетики в последние два десятилетия, в частности на основе NGS технологии, позволило секвенировать полный геном овец, создать ДНК-чипы, содержащие 50 тысяч и 600 тысяч маркеров – однонуклеотидных полиморфизмов (SNP). Изучение генетических основ адаптивности, поиск "следов селекции" позволит создавать новые и совершенствовать существующие породы, что в свою очередь приведет к повышению продуктивности овец, выращиваемых в экстремальных природно-климатических условиях. Сравнительный анализ генома домашних и различных видов диких баранов будет иметь важное значение в двух основных аспектах. Во-первых, наше понимание генетических особенностей, лежащих в основе механизмов адаптации к различным природно-климатическим условиям у домашних овец, будет значительно расширено. Мы рассмотрим протекают ли эволюционные процессы у домашних и диких представителей одного и того же рода в схожих направлениях. Во-вторых, мы считаем, что сравнительный анализ домашних и диких видов может выявить некоторые новые геномные районы, которые находились под давлением естественного отбора у диких видов, но не обнаруживаются у домашних овец. В случае выявления значимых генов-кандидатов в соответствующих регионах эти гены могут быть использованы в качестве мишеней для дальнейшего редактирования генома, что позволит увеличить пределы адаптации у домашних овец. Таким образом, вклад в фундаментальные и прикладные исследования будет сделан в следующих областях: 1) Овцеводство (информация для геномной селекции, выведения новых и улучшения существующих пород); 2) Генетика (изучение интрогрессии на уровне генома); 3) Филогенез (изучение взаимосвязей внутри и между субпопуляциями основных локальных пород овец и диких представителей рода Ovis); 4) Экология (сохранение приоритетов); Для достижения этих целей за счет дополнительного использования методологий и материалов, оба коллектива исследователей проведут отбор проб у пород овец, которых разводят в различных природно-климатических условиях (умеренный климат, холодный климат, жаркий климат, высокоргорье), а также диких представителей рода Ovis (архар, снежный баран и т.д.). Благодаря полногеномному генотипированию с помощью ДНК-чипов высокой плотности (600K), полному секвенированию митохондриального генома, будут: - идентифицированы гены или генетические варианты, связанные с адаптацией к экстремальным природно-климатическим условиям у домашних овец и их диких сородичей; - выявлены гены, связанные с адаптацией к экстремальным природно-климатическим условиям при конвергентной эволюции между домашними овцами и их дикими сородичами; - изучены количественная оценка генетической интрогрессии от диких сородичей у домашних пород овец и связи между генетическими сигнатурами интрогрессии и адаптации к экстремальным природно-климатическим условиям; - проведены комплексные исследования филогении и генетической структуры пород овец Евразии и популяций диких баранов (архары, снежные бараны) на основе проведения полногеномного SNP генотипирования и секвенирования; - отобраны локусы для создания панели SNP маркеров, с помощью которой можно будет выявлять животных с адаптацией к различным природно-климатическим условиям. Наши результаты будут востребованы в разных сферах животноводства, экологических программах, а также для общества, в частности, для людей, живущих в экстремальных природно-климатических условиях. Селекционеры по всему миру заинтересованы в информации по генам адаптации к экстремальным природно-климатическим условиям с целью создания и усовершенствования существующих пород овец.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

Публикации

1. Доцев А.В., Элизабет Кунц Э., Харзинова В.Р., Охлопков И.М., Лв Ф.-Х., Ли М.-Х., Родионов А.Н., Шахин А.В., Сипко Т.П., Медведев Д.Г., Гладырь Е.А., Багиров В.А., Брем Г., Медугорак И., Зиновьева Н.А. Mitochondrial DNA Analysis Clarifies Taxonomic Status of the Northernmost Snow Sheep (Ovis nivicola) Population Life, 11, 252. (год публикации - 2021)
10.3390/life11030252

2. Доцев А.В., Денискова Т.Е., Петров С.Н., Рейер Х., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А. Genetic characteristics of Karachaev sheep inferred from genome-wide SNP analysis Journal of Animal Science, Volume 99, Issue Supplement_3, Page 243 (год публикации - 2021)
10.1093/jas/skab235.443


 

Публикации

1. Денискова Т.Е., Эсмализаде А., Доцев А.В., Кошкина О.А., Фарахваши М.А., Мохтари М., Хабиси М.М., Лв Ф.-Х., Зиновьева Н.А. A Search for Eurasian Sheep Relationships: Genomic Assessment of the Autochthonous Sheep Breeds in Russia and the Persian Plateau Diversity, 14(6), 445 (год публикации - 2022)
10.3390/d14060445


 

Публикации

1. Доцев А.В., Кошкина О.А., Харзинова В.Р., Денискова Т.Е., Рейер Х., Кунц Э., Месарош Г., Шахин А.В., Петров С.Н., Медведев Д.Г., Куксин А.Н., Бат-Эрдене Г., Мунхцог Б., Багиров В.А., Виммерс К., Сёлькнер Й., Медугорац И., Зиновьева Н. А. Genome-Wide Insights into Intraspecific Taxonomy and Genetic Diversity of Argali (Ovis ammon) Diversity, 15, 5: 627 (год публикации - 2023)
10.3390/d15050627

2. Денискова Т.Е., Доцев А.В., Селионова М.И., Зиновьева Н.А. Изучение генетического разнообразия и популяционной структуры осетинской породы в сравнении с другими породами грубошерстных жирнохвостых овец на основе данных SNP-генотипирования Генетика, 59,11:1270–1281 (год публикации - 2023)
10.31857/S0016675823110048

3. Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Доцев А.В., Кунц Э., Селионова М.И., Медугорак И., Зиновьева Н.А. Phylogenetic Analysis of Russian Native Sheep Breeds Based on mtDNA Sequences Genes, 14,9:1701 (год публикации - 2023)
10.3390/genes14091701