КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 22-24-00390
НазваниеРазвитие открытой базы данных метаболомов тканей позвоночных животных и анализ факторов, влияющих на состав метаболитов в тканях
Руководитель Яньшоле Вадим Владимирович, Кандидат физико-математических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт "Международный томографический центр" Сибирского отделения Российской академии наук , Новосибирская обл
Конкурс №64 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-207 - Системная биология; биоинформатика
Ключевые слова метаболомика, масс-спектрометрия, ЯМР-спектроскопия, биохимические процессы, ткани, модельные животные, экология, эволюция, базы данных, большие данные, машинное обучение
Код ГРНТИ34.05.25
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Метаболомика является одной из наиболее быстро развивающихся современных пост-геномных отраслей науки и применяется при исследовании широкого спектра патологий человека, животных и растений. Предлагаемый проект является продолжением первой обширной работы по созданию открытой базы данных и по системному метаболомному исследованию тканей различных животных подтипа позвоночные (Vertebrata). На текущий момент в базе содержится информация по концентрациям (в молях на грамм ткани) наиболее представленных метаболитов в хрусталиках различных позвоночных животных. Планируется изучить ткани позвоночных пяти классов – рыбы, земноводные, пресмыкающиеся, птицы и млекопитающие, – животных очень разных по строению и физиологическим особенностям, с целью прояснения механизмов эволюции биохимических процессов в тканях, обусловленной как общим развитием животного мира, так и адаптацией к конкретной среде обитания, в том числе к экологической обстановке. Установление метаболомных профилей планируется провести для таких тканей, как кровь, печень, сердце, мозг, хрусталик. Для решения задач проекта будут применены самые современные методы аналитической химии для количественного метаболомного анализа, включая 2 вида хроматографии, масс-спектрометрию высокого разрешения, спектроскопию ядерного магнитного резонанса высокого разрешения, спектрофотометрию. В научной литературе почти полностью отсутствуют количественные данные о метаболомном составе тканей животных, что гарантирует новизну и высокую востребованность предполагаемых результатов. Полученные результаты могут быть использованы в широком спектре биологических отраслей, включая системную и эволюционную биологию, экологию и биохимию, а также в ветеринарии и медицине.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Центалович Ю.П., Зеленцова Е.А., Савина Е.Д., Яньшоле В.В., Сагдеев Р.З.
Influence of Ecological Factors on the Metabolomic Composition of Fish Lenses
Biology, 11(12), 1709 (год публикации - 2022)
10.3390/biology11121709
2.
Шаршов К.А.
Avian Pathogens: Editorial and the Perspectives of Research
Microorganisms, 10(3), 543 (год публикации - 2022)
10.3390/microorganisms10030543
3.
Яньшоле В.В., Мельников А.Д., Яньшоле Л.В., Зеленцова Е.А., Снытникова О.А., Осик Н.А., Фоменко М.Ф., Савина Е.Д., Калинина А.В., Шаршов К.А., Дубовицкий Н.А., Кобцев М.С., Зайковский А.А., Марьясина С.С., Центалович Ю.П.
Animal Metabolite Database: Metabolite Concentrations in Animal Tissues and Convenient Comparison of Quantitative Metabolomic Data
Metabolites, 13(10), 1088 (год публикации - 2023)
10.3390/metabo13101088
Публикации
1.
Центалович Ю.П., Зеленцова Е.А., Савина Е.Д., Яньшоле В.В., Сагдеев Р.З.
Influence of Ecological Factors on the Metabolomic Composition of Fish Lenses
Biology, 11(12), 1709 (год публикации - 2022)
10.3390/biology11121709
2.
Шаршов К.А.
Avian Pathogens: Editorial and the Perspectives of Research
Microorganisms, 10(3), 543 (год публикации - 2022)
10.3390/microorganisms10030543
3.
Яньшоле В.В., Мельников А.Д., Яньшоле Л.В., Зеленцова Е.А., Снытникова О.А., Осик Н.А., Фоменко М.Ф., Савина Е.Д., Калинина А.В., Шаршов К.А., Дубовицкий Н.А., Кобцев М.С., Зайковский А.А., Марьясина С.С., Центалович Ю.П.
Animal Metabolite Database: Metabolite Concentrations in Animal Tissues and Convenient Comparison of Quantitative Metabolomic Data
Metabolites, 13(10), 1088 (год публикации - 2023)
10.3390/metabo13101088