КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 23-14-00028

НазваниеСообщества микроэукариот в водохранилищах Ангарского каскада

Руководитель Лихошвай Елена Валентиновна, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение науки Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук , Иркутская обл

Конкурс №80 - Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-107 - Экология биосистем

Ключевые слова водные экосистемы, микробные сообщества, микроэукариоты, таксономическое разнообразие, динамика, антропогенные факторы, высокопроизводительное секвенирование, электронная микроскопия, мониторинг

Код ГРНТИ34.35.25


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Экосистемы водохранилищ отличаются от экосистем рек, в результате зарегулирования которых они сформированы, и претерпевают естественные изменения с течением времени. Важным компонентом пресноводных экосистем, как по таксономическому разнообразию, так и по численности, являются одноклеточные эукариоты (микроэукариоты). К микроэукариотам относятся различные группы фитопланктона (основные первичные продуценты), простейшие (консументы фитопланктона и бактерий) и грибы (паразиты микроэукариот). Маркером экологического состояния пресноводных экосистем считается видовой состав и численность фитопланктона, индикаторные виды есть среди диатомовых водорослей, чутко реагируют на изменение окружающей среды хризофитовые. Разные таксоны микроэукариот в водной среде формируют сообщества, в состав которых входят и бактерии. Структуру и динамику микробных сообществ в целом определяют жизненные циклы отдельных видов, межвидовые взаимодействия, локальные и сезонные физико-химические факторы и региональные условия. В основном, оценка экологического состояния водоемов ограничивается результатами исследований фитопланктона с применением световой микроскопии, что не дает полной картины об экосистеме. Электронная микроскопия позволяет более точно идентифицировать виды диатомовых водорослей, делает доступным для анализа широкий круг других кремний-зависимых микроэукариот. В последнюю пару десятков лет в практику анализа таксономического разнообразия и структуры микробных сообществ стали активно внедряться методы высокопроизводительного секвенирования (ВПС). Анализ состава сообществ с помощью ВПС суммарной ДНК, выделенной из природных проб, выявляет значительно более высокое таксономическое разнообразие, чем традиционные методы микроскопии, что дает более полное представление об экологическом состоянии исследуемого водоема, а анализ отобранных через определенные промежутки проб позволяет наблюдать за динамикой сообществ. В качестве географического объекта исследований мы выбрали крупную пресноводную экосистему, объединяющую озеро, вытекающую из него крупную реку, сеть водохранилищ на ней и мелкие реки, впадающие в русло основной реки по ходу ее течения (Байкал-Ангара, водохранилища Ангарcкого каскада, расположенные на территории Иркутской области). Рабочая гипотеза состоит в следующем: таксономический состав микроэукариот реки Ангара «наследуется» из озера Байкал, обогащается видами по мере ее течения и впадения притоков, часть видов сохраняется в водохранилищах; по ходу течения с изменением параметров среды обитания микробные сообщества претерпевают изменения таксономического состава. С целью проверки этой рабочей гипотезы и получения более полной информации об исследуемой крупной пресноводной экосистеме в ходе проекта будут решены следующие задачи: (1) Выявление таксономического разнообразия микроэукариот методами ВПС в сопоставлении с данными микроскопии; (2) анализ динамики микробных сообществ и корреляционных связей между микроэукариотами, бактериями и факторами среды обитания в разновременном масштабе; (3) Создание методологической основы для мониторинга микроэукариот в пресноводных экосистемах в перспективе их возможных изменений.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

Публикации

1. Фирсова А.Д., Галачьянц Ю.П., Бессудова А.Ю., Титова Л.А., Сакирко М.В., Марченков А.М., Хилханова Д.В., Налимова М.А., Бузевич В.В., Михайлов И.С., Лихошвай Е.В. Environmental Factors Affecting Distribution and Diversity of Phytoplankton in the Irkutsk Reservoir Ecosystem in June 2023 Diversity, 15, 1070. (год публикации - 2023)
10.3390/d15101070

2. Бессудова А.Ю., Фирсова А.Д., Хилханова Д.В., Налимова М.А., Марченков А.М., Михайлов И.С., Сакирко М.В., Лихошвай Е.В. Changes in the Diversity of Silica-Scaled Chrysophytes during the Lake–River–Reservoir Transition (Baikal–Angara–Irkutsk Reservoir) Life, 13, 2052 (год публикации - 2023)
10.3390/life13102052

3. Бессудова А.Ю., Лихошвай Е.В. New observations on Mallomonas getseniae comb. et stat. nov. (Chrysophyceae, Synurales) Phytotaxa, 626 (3): 213-218 (год публикации - 2023)
10.11646/phytotaxa.626.3.8

4. Фирсова А.Д., Галачьянц Ю.П., Бессудова А.Ю., Михайлов И.С., Титова Л.А., Марченков А.М., Хилханова Д.В., Налимова М.А., Бузевич В.В., Лихошвай Е.В. Summer phytoplankton species composition and abundance in the southern basin of Lake Baikal and Irkutsk Reservoir Limnology and Freshwater Biology, 6: 204 (год публикации - 2023)
10.31951/2658-3518-2023-A-6-204


Аннотация результатов, полученных в 2024 году
Введение в практику работы методов электронной микроскопии, метабаркодинга и корреляционного анализа в исследование крупной водной системы: озеро Байкал – река Ангара – водохранилища, существенно расширили круг выявляемых микроскопических организмов, позволили определить структуру сообществ про- и микроэукариот и проследить их динамику. Впервые проведенные одновременные исследования Южной части Байкала и Иркутского водохранилища с применением современных методов анализа в течение трех сезонов 2023 г. и в истоке р. Ангара ежемесячно в период открытой воды позволили охарактеризовать пространственно-временную структуру фитопланктона и оценить влияние параметров среды на распределение и развитие его качественных и количественных показателей. Выявлен 151 вид, по разнообразию преобладали хризофитовые (57), зеленые (41) и диатомовые (24) водоросли. Массового цветения цианобактерий не наблюдали. В истоке р. Ангара максимальная численность клеток фитопланктона показана в июне и в октябре; и выявлены ежемесячные изменения состава доминирующих видов и структуры сообществ фитопланктона в целом. Ограниченная ординация профилей численности видов показала температуру воды как основной фактор в разделении сообществ фитопланктона. С помощью электронной микроскопии вскрыто высокое разнообразие наиболее чувствительных к изменениям среды обитания организмов – чешуйчатых хризофитовых. В течение трех сезонов 2023 г. их обнаружено 38 видов, наибольшие различия в видовом составе наблюдались в июне, причем в более прогретых водах крупного залива Иркутского водохранилища было обнаружено 23 вида, а в холодных водах Южного Байкала, в этот же период до 7 видов, что не согласуется с устоявшемся мнением о приуроченности этой группы организмов к холодным олиготрофным водам. Получены новые сведения о структуре чешуйчатых хризофитовых и их стоматоцист, установлен период и температура, при которой происходит переход в покоящуюся стадию, проведена ревизия рода Spiniferomonas, в результате которой выявлен 21 морфологически подтвержденный вид, из них 17 обитают в водоемах Восточной Сибири, в том числе в Южном Байкале и в Иркутском водохранилище. Такие результаты важны и с точки зрения интерпретации палеоклиматических изменений, поскольку кремнистые чешуйки и стоматоцисты встречаются в палеолетописях северного полушария начиная с эоцена. Метод метабаркодирования сообществ микроэукариот подтвердил данные микроскопии и существенно дополнил представление о структуре сообществ микроэукариот, в следствие большей чувствительности метода и более широкого охвата таксонов, выявляемых при анализе. Метабаркодирование бактериальных сообществ показало сезонные изменения в таксономическом составе и выявило особенности весеннего периода, существенные отличия в повышенной доле прочтений Alphaproteobacteria на станциях Иркутского водохранилища по сравнению с Южным Байкалом, повышенную долю прочтений цианобактерий в августе и октябре, как в озере, так и в водохранилище. Результаты кластерного анализа и ординации показали общие черты в группировках сообществ бактериопланктона и микроэукариот, что свидетельствует о связи про- и эукариотической части сообществ. За 2024 г. проведено несколько экспедиций: по Южному Байкалу и Иркутскому водохранилищу в конце мая и в августе; по р. Ангаре и устьям впадающих в нее малых рек (Иркут, Куда, Китой, Белая и Ида) в мае; по Братскому, Усть-Илимскому и Богучанскому водохранилищам в июне и в августе. Анализ с помощью микроскопии проб, отобранных 22-26 мая 2024 г., выявил различия, как по обилию, так и по видовому составу фитопланктона в Южном Байкале и в Иркутском водохранилище, что не согласуется с ранее высказанным мнением о «наследовании» водохранилищем вместе с водами озера и его фитопланктона. С целью выяснения вклада малых рек, впадающих в р. Ангара, в биоразнообразие фитопланктона ангарских водохранилищ, проведен микроскопический анализ проб, отобранных в мае 2024 г. в р. Ангара перед устьями малых рек, составлен видовой список. В устьях малых рек показано высокое разнообразие микроводорослей, выявлены различия в видовом составе и определены доминирующие виды. Исследования проб, отобранных в июне 2024 г. на 26 станциях из водохранилищ Ангарского каскада: Братском, Усть-Илимском и Богучанском, с помощью микроскопии показали, что фитопланктон исследованных водохранилищ разнообразен и представлен диатомовыми, зелеными водорослями, хризофитовыми, а также динофитовыми, криптофитовыми и цианобактериями. Во всех водохранилищах преобладали диатомовые водоросли, занимая от 68 до 94 % от общей численности фитопланктона. В целом, в весенний период 2024 г. (май-июнь) самые высокие показатели численности микроэукариот наблюдались в Южном Байкале, а биомассы – в Иркутском водохранилище. Самые низкие значения количественных показателей фитопланктона отмечены в Усть-Илимском водохранилище. Пространственно-временная структура сообществ микроэукариот водохранилищ Ангарского каскада при низких концентрациях биогенов формируется высоким разнообразием видов, наличием холодноводных видов и видов с широким диапазоном температурных предпочтений. Результаты проекта важны для понимания механизмов формирования флоры искусственных водоемов, для их мониторинга с учетом сезонной динамики и особенностей аутэкологии и жизненных циклов видов, а также для рассмотрения сценариев расселения видов микроэукариот в контексте глобальных изменений климата.

 

Публикации

1. Бессудова А. Genus Spiniferomonas (Chrysophyceae, Chromulinales) in Eastern Siberian reservoirs Acta Biologica Sibirica, 10: 859–881 (год публикации - 2024)
10.5281/zenodo.13626825

2. Бессудова А., Фирсова А., Лихошвай Е. New data on the stomatocysts of Spiniferomonas septispina Nicholls (Chrysophyceae, Chromulinales) Phytotaxa, 670 (1): 072–076 (год публикации - 2024)
10.11646/phytotaxa.670.1.7

3. Бессудова А., Галачьянц Ю., Фирсова А., Хилханова Д., Марченков А., Налимова М., Сакирко М., Лихошвай Е. Seasonal dynamics of the silica-scaled chrysophytes as potential markers of climate change in natural model: deep cold lake–shallow warmer reservoir Sustainability, 16, 7299 (год публикации - 2024)
10.3390/su16177299

4. Фирсова А., Галачьянц Ю., Бессудова А., Хилханова Д., Титова Л., Налимова М., Бузевич В., Марченков А., Сакирко М., Лихошвай Е. The Influence of waters of Lake Baikal on the spatiotemporal dynamics of phytoplankton in the Irkutsk Reservoir Water, 16, 3284 (год публикации - 2024)
10.3390/w16223284

5. Бессудова А., Фирсова А., Лихошвай Е. New data on the ultrastructure of stomatocysts, plate and spines scales of Chrysosphaerella coronacircumspina (Chrysophyceae, Chromulinales) Acta Biologica Sibirica, 10: 1259–1267 (год публикации - 2024)
10.5281/zenodo.14027780

6. Бессудова А., Фирсова А., Лихошвай Е. Redescription of Chrysosphaerella baikalensis (Chrysophyceae, Chromulinales) with new data on the ultrastructure of its stomatocysts Phytotaxa, 669 (1): 067–074 (год публикации - 2024)
10.11646/phytotaxa.669.1.7


Аннотация результатов, полученных в 2025 году
В 2025 г. с целью определения межгодовой динамики изменений в структуре фитопланктона, смены доминирующих видов и обилия и биомассы фитопланктона на 17 станциях Южного Байкала (ЮБ) и Иркутского водохранилища (ИВ) в период с 24 по 28 мая 2025 г. проведен отбор проб в рамках научно-исследовательской экспедиции на НИС «Титов» (ЦКП «Центр комплексных судовых исследований Байкала» ЛИН СО РАН). Впервые после многолетнего перерыва проведены исследования фитопланктона в Братском (БрВ), Усть-Илимском (УИВ) и Богучанском (БгВ) водохранилищах. Значения биомассы фитопланктона БрВ, УИВ и БгВ указывали на олиготрофность исследованных районов в июне 2024 г. По сравнению с предыдущими исследованиями 30-10-летней давности произошла трансформация этих водохранилищ от мезотрофных к олиготрофным. Анализ проб фитопланктона, отобранных в ЮБ и в ИВ в 2023-2025 гг., выявил мезотрофные районы. Наибольшие значения биомассы фитопланктона установлены в озере на станции в 12 км от пос. Култук и в Ершовском заливе водохранилища. Оба эти района находятся под воздействием антропогенной нагрузки. В структуре сообществ весеннего фитопланктона БВ и УИВ обнаружено 62 таксона планктонных водорослей, среди которых преобладали диатомовые и золотистые. В БгВ сохраняется характерная для предыдущих лет тенденция доминирования диатомовых водорослей весной, а летнее сообщество характеризовалось сменой доминантов – в лидеры вышли представители зеленых водорослей, при этом существенно усилился вклад в доминирующий комплекс цианобактерий. Впервые в течение двух сезонов методами электронной микроскопии были исследованы видовое богатство, структура и сезонная динамика чешуйчатых золотистых водорослей, вовлечённых в круговорот кремния, в обширной системе, включающей ЮБ и каскад из четырех Ангарских водохранилищ. Выявлено 45 видов, около 25% из них относятся к гетеротрофной группе, не участвующей в производстве первичной продукции, 44% составляет фототрофная группа, а 31% — миксотрофная. Показана роль ИВ в качестве переходного экотона, которое не только является местом обитания эндемичных и бореальных видов озера Байкал, но и само служит источником видового разнообразия. Другим источником видового разнообразия микроводорослей в водохранилищах, расположенных ниже по течению – в БрВ, УИВ и БгВ, служат притоки р. Ангары. В них впервые выявлено 57 видов чешуйчатых золотистых водорослей. Описан 1 новый– Spiniferomonas sibirica sp. n. и 10 потенциально новых видов, 2 вида впервые зарегистрированные в водоемах России. В устье р. Ида впервые для Иркутской области зарегистрирована находка гаптофитовой водоросли (Haptophyta). Также выявлено 47 морфотипов кремнезёмных стоматоцист, из которых 5 описаны как новые для науки. С помощью электронной микроскопии описаны и соотнесены с образующими их видами морфотипы 4 стоматоцист чешуйчатых золотистых разных эволюционных линий, включающих миксотрофных (Spiniferomonas) и гетеротрофных (Paraphysomonas) представителей. Выявлены параметры температуры их образования, расширяющие возможности их использования при палеоклиматических реконструкциях. Составлен ключ к идентификации морфотипов стоматоцист рода Paraphysomonas. Методами статистического анализа выявлена положительная корреляция между видовым разнообразием чешуйчатых золотистых, температурой воды и концентрацией кремния, отрицательная корреляция с уровнем рН. Показано, что более прогретые притоки значительно увеличивают видовое богатство чешуйчатых золотистых холодноводной реки, повышая устойчивость ее экосистемы. В 2025 г. мы осуществили первый комплексный анализ методом метабаркодирования структуры микробных сообществ вдоль всего Ангарского каскада водохранилищ. Результаты выявили чёткую пространственную дифференциацию микробных сообществ, которые формируют два основных кластера: верхний (ЮБ и ИВ) и нижний, объединяющий северные водохранилища (БрВ, УИВ и БгВ). При этом для сообществ микроэукариот, в отличие от бактериопланктона, внутри «северной» группы наблюдается дополнительное разделение по гидроморфологическим признакам на сообщества основного русла и сообщества боковых притоков, заливов и расширений. Создана лаборатория для культивирования жгутиковых микроэукариот. Из залива ИВ в монокультуру был выделен штамм фаготрофных амебофлагеллят, относящихся к роду Thaumatomonas. Методами световой и электронной микроскопии описана ультраструктура клетки, включая стадию образования видоспецифических кремнеземных чешуек, проведен филогенетический анализ фрагмента гена 18S рРНК. Выявленные морфологические различия в тонком строении кремнистых чешуек, а также генетические дистанции внутри рода Thaumatomonas позволили описать новый вид — T. sibirica n. sp., а также стали предпосылкой для систематического пересмотра внутри рода. Полученные данные расширяют знания о роде Thaumatomonas, видовое разнообразие которого в водоемах мира с учетом нового насчитывает всего 7 видов. Создана коллекция проб фитопланктона, отобранных в разные сезоны наблюдений в 2023-2025 гг. из ЮБ, ИВ, БрВ, УИВ и БгВ, из р. Ангары и рек, в нее впадающих (рр. Иркут, Куда, Белая, Ида, Ока, Ия, Бардама, Пятая, Кова), всего 160 шт. Пробы хранятся в виде сконцентрированных на фильтрах и зафиксированных в объеме 50 мл формальдегидом до конечной концентрации 3.7% взвесей, а также на столиках, готовых для просмотра в СЭМ. Создана коллекция препаратов суммарной ДНК из проб фитопланктона, которая содержит 135 препаратов из проб, отобранных в разные сезоны 2023-2024 гг. на 43 станциях в ЮБ и водохранилищах Ангарского каскада ГЭС (ИВ, БрВ, УИВ и БгВ), и 17 препаратов ДНК за 2025 г. Всего 152 препарата ДНК. Полученные результаты и созданные коллекции важны для дальнейшего мониторинга экологического состояния водохранилищ, оценки их трофического статуса и разработки стратегий сохранения биоразнообразия в условиях трансформации, в том числе под возможным воздействием климатических и антропогенных факторов.

 

Возможность практического использования результатов
Мы показали согласованность методов микроскопии и метабаркодинга для оценки фитопланктона (а в широком понимании - микроэукариот) в пресноводных экосистемах. Мы рекомендуем метабаркодинг в качестве экспресс-метода. Рекомендуем применять высокоразрешающую электронную микроскопию для видовой идентификации. Эти два метода дают наиболее полную картину о разнообразии микроэукариот в водных пробах.