КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 23-15-00060
НазваниеРазработка методики персонализированной диагностики начальных стадий кариеса и уровня кариесрезистентности зубов на основе спектроскопически-регистрируемых в биологических жидкостях ротовой полости и зубной биопленке маркеров
Руководитель Ипполитов Юрий Алексеевич, Доктор медицинских наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Воронежский государственный университет" , Воронежская обл
Конкурс №80 - Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-216 - Стоматология и хирургическая стоматология
Ключевые слова твердые ткани зуба; зубная биопленка; кариес; биологические жидкости ротовой полости; персонализированная экспресс-диагностика; структурно-спектроскопический подход;
Код ГРНТИ76.29.55
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект направлен на разработку методики персонализированной ранней диагностики заболеваний ротовой полости кариозного характера и уровня кариесрезистентности на основе спектроскопически-регистрируемых в биологических жидкостях ротовой полости и зубной биопленке маркеров.
Повышение качества условий жизни – одно из приоритетных направлений национального развития в России. В рамках этого направления доминантой является профилактика социально значимых заболеваний, среди которых предупреждение стоматологических заболеваний кариесогенного характера имеет наибольшее значение ввиду влияния на все сферы социальной деятельности человека.
При этом устоявшейся концепцией является тот факт, что снизить распространенность кариеса среди населения возможно за счет ранней диагностики и профилактики заболевания. Поэтому актуальность данного проекта, связанная разработкой нового подхода обнаружения начальных и клинически не регистрируемых патологий ротовой полости кариозного характера, и перехода к персонализированному высокотехнологичному здравоохранению, не вызывает сомнений и является вызовом для развития фундаментальной медицины, а также лидирующим направлением исследований и коммерциализации.
Выдвинутая в последние годы современная гипотеза развития кариеса, рассматривает его как многофакторное заболевание, связанное как с нарушением баланса динамического равновесия процессов де/реминерализации твердой ткани, так и с особенностями состава зубной биопленки и биологических жидкостей ротовой полости у индивидуума (Journal of Dental Research 2019, DOI: 10.1177/0022034519830686).
В свете развития этой теории контроль за рядом модулирующих факторов риска развития патологии у человека и их маркерами будет стимулировать развитие персонализированного управления заболеваниями полости рта. При этом качество и точность скрининга начальных и скрытых форм заболеваний ротовой полости может быть выведено на абсолютно новый уровень за счет расширения круга объектов анализа одновременно с учетом индивидуальных характеристик пациентов.
Поэтому абсолютной новизной предлагаемого научного исследования является разработка из собственных данных основ экспресс-диагностики состояния ротовой полости и уровня кариесрезистентности твердых тканей зуба на основе комплексного анализа результатов исследований ротовой, десневой, дентинной жидкостей и зубной биопленки, полученных с применением структурно-спектроскопических методов диагностики и модельных биомиметических сред, а также с учетом персонализированных данных пациентов.
Предварительные результаты наших последних исследований (см. к примеру EPMA Journal, doi: 10.1007/s13167-018-0135-9; Biomedical Optics Express, doi: 10.1364/BOE.10.004050; Pharmaceutics, doi: 10.3390/pharmaceutics14071355), уже продемонстрировали уникальную перспективу предлагаемого нами метода.
Комплексность и инновационный подход в решении научной проблемы проекта будет обеспечиваться:
- вовлечением в процесс скрининга новых объектов диагностики (ротовой/дентинной/десневой жидкостей и биопленки зубов);
- использованием широкого ряда структурно-спектроскопических методов анализа;
- разработкой алгоритмов анализа/моделирования вторичной структуры амидной полосы белков в молекулярных спектрах;
- учетом индивидуальных характеристик пациентов (пол, возраст, персонализированная клиническая картина: анамнез, строение и морфология зубов, состояние тканей пародонта, уровень саливации итд);
- задействованием биомиметических сред, что также определяет научную значимость исследования.
Принимая во внимание уже имеющийся у нашего авторского коллектива научный задел, а также многолетнюю тесную и плодотворную коллаборация с ведущими зарубежными научными центрами в области тематики проекта, не вызывает сомнений успешное выполнение и решение всех поставленных в заявке задач.
Планируемый результат не будет иметь аналогов или сопоставимых прототипов в России и частично за рубежом.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Середин Павел, Голощапов Дмитрий, Кашкаров Владимир, Лукин Анатолий, Пешков Ярослав, Ипполитов Иван, Ипполитов Юрий, Литвинова Татьяна, Вонгсвивут Джитрапорн, Че Бокнам, Фрейтас Рауль О.
Changes in Dental Biofilm Proteins’ Secondary Structure in Groups of People with Different Cariogenic Situations in the Oral Cavity and Using Medications by Means of Synchrotron FTIR-Microspectroscopy
International Journal of Molecular Sciences, Том 24, Выпуск 20, Номер статьи 15324 (год публикации - 2023)
10.3390/ijms242015324
2.
Середин П.В., Голощапов Д.Л., Кашкаров В.М., Буйлов Н.С., Ипполитов Ю.А., Ипполитов И.Ю., Вонгсвивут Дж.
Features of the molecular composition of dental biofilm in patients depending on the degree of caries and the method of its prevention: synchrotron FTIR spectroscopic studies
Condensed Matter and Interphases, Том 25, Выпуск 3, Страницы 398 - 405 (год публикации - 2023)
10.17308/kcmf.2023.25/11264
3.
ИППОЛИТОВ Ю.А., СЕРЕДИН П.В., ГОЛОЩАПОВ Д.Л., ИППОЛИТОВ И.Ю., ЛЕЩЕВА Е.А. РАССКАЗОВА Ю.С., АЛЕШИНА Е.О., МИХАЙЛОВА С.А.
Visualization Of Initial And Clinically Unrecorded Fissure Enamel Caries Using Laser-Induced Contrast Fluorescence And Micro Raman Spectroscopy In The Laboratory
Journal of New Medical Technologies, e-edition, N 6, стр. 1-7 (год публикации - 2023)
10.24412/2075-4094-2023-6-1-3
Аннотация результатов, полученных в 2024 году
- Дана математическая оценка изменений, происходящих в молекулярном составе зубной биопленки, выполненная на основе расчётов минерал/органического, фосфат/протеин/липидного, углерод/фосфатного, эфиро/белкового, карбогидрат/фосфатного, липид/фосфатного соотношений исходя из данных молекулярной спектроскопии, в т.ч. с использованием синхротронного излучения;
Обнаружены изменения величин фосфат/протеин/липидного, фосфат/минерального и фосфолипид/липидного соотношений, а также наличие статистически-значимых внутри и межгрупповых различий в этих коэффициентах свидетельствуют о том, что у пациентов в норме и при развитии кариеса различаются механизмы адсорбации ионов, соединений и комплексов, пришедших из ротовой жидкости в зубную биопленку на этапе экзо/эндогенной профилактики.
- Выполнена разработка алгоритмов и определение конформационных особенностей/изменений в амидной конфигурации белков зубной биопленки на наиболее ранних стадиях развития патологических процессов ротовой полости кариозного характера, исходя из анализа результатов синхротронной ИК-микроспектроскопии и моделирования вторичной структуры амидных полос протеинов (модовый состав, положение полос, полная ширина на половине максимума FWHM и форма спектрального профиля полосы) с учетом персонализированных данных пациентов; Отработан оптимальный алгоритм аппроксимации FTIR-спектральных профилей с использованием программных пакетов обработки данных и моделирования нелинейных кривых.
Анализ результатов деконволюции амидных профилей на компоненты, а в частности соотнесение максимумов с компонентами вторичной структуры белков, выполнено исходя из имеющихся литературных данных, известных работ, в которых изучались белки, в том числе в составе биопленок. В связи с этим в составе Amid I и Amid II полос ИК-спектрах согласно устоявшейся номенклатуры, выделены следующие фундаментальные вторичные структурные элементы: регулярная вторичная структура α-спираль, β-лист, β-виток, аминокислотные боковые цепи.
- Проведен анализ результатов деконволюции амидных профилей в ИК-спектрах зубной биопленки и определение конформационных особенностей в конфигурации белковой фракции биопленки.
- Выполнен поиск взаимосвязей между составом, пространственным и конформационным положением компонент во вторичной структуре белков зубной биопленки с развитием кариозного процесса. Определение влияния влияние модулирующего фактора (таблетка, содержащая минеральный комплекс с глицерофосфатом кальция) на сдвиги во вторичной структуре белков зубной биопленки;
Расчеты, проведенные при выполнении второго этапа проекта показывают, что с учетом модулирующего фактора (использование таблетированного комплекса для минерализации зубной ткани человека) в случае без кариозной активности (первая группа пациентов) предложенное маркерное соотношение α-helix/β-sheet лежит в пределах R~2.5–2.9, в тоже время как у пациентов с кариесом (вторая группа) R~3.9–4.2, т.е. увеличено более чем в 1.5 раза.
- Выявлены взаимосвязи процессов деминерализации/минерализации, происходящих в твердых тканях зуба, с изменениями в белковой фракции биологических жидкостей и зубной биопленки, а также определение потенциально-значимых спектроскопических маркеров этих процессов;
Учитывая выявленные особенности во вторичной структуре белковой сети зубной биопленки в норме, при кариозной патологии, а также с учетом применения таблетированного минерального комплекса с глицерофосфатом кальция, можно убедиться в том, что идеальным кандидатом для скрининга развития заболевания является компонента Parallel β-strands (VIII). Изменение частоты и процентного содержания этой компоненты в спектрах зубной биопленки являются следствием присутствия в ней кариесогенных бактерий Mutans streptococci, ответственных за возникновение кариеса, а также продуктов их метаболизма - glucan polymers. Расчет важного для белков соотношения R=(α-helix (V))/(β-strands (VIII) ) будет отражать изменения во вторичной структуре протеинов биопленки, наблюдаемые при развитии кариозной патологии.
- Определен диагностический потенциал десневой жидкости для превентивного скрининга патологий ротовой полости с применение методов Рамановской и ИК-микроспектроскопии;
С использованием метода инфракрасной спектроскопии, в том числе с использованием синхротронного излучения, определены особенности в инфракрасных спектрах ротовой жидкости, а также рассчитаны минерал-органическое, углерод-фосфатное, Амид II/Амид I и протеин/тиоцианатное соотношения для группы больных множественным кариесом и пациентов контрольной группы.
Обнаруженные нами особенности в инфракрасных спектрах смешанной слюны, а также найденные изменения в ее молекулярном составе могут выступить в роли биомаркеров кариесогенной ситуации.
- Установлены фундаментальные взаимосвязи между биомеханическими, оптическими, морфологическими характеристиками, составом/структурой твердых тканей человеческих зубов в норме/патологии и особенностями молекулярного состава десневой жидкости и зубной биопленки пациентов с учетом кариесогенной ситуации;
Во время экспериментов в твердой зубной ткани (эмали) при развитии кариозного процесса были зарегистрированы изменения, происходящие в неорганической составляющей апатита. Эти изменения являются следствием процессов аморфизации и процессов пере-осаждения кислых фосфатов кальция, происходящих под воздействием изменений в микробиоме зубной биоплёнки. Выявленные на основе анализа ИК-спектров особенности и неоднородности химического состава в области кариозной фиссуры являются ответом как на кислотное, так и на бактериальное воздействие со стороны патогенной микрофлоры зубной биопленки и ее метаболитов.
- Подготовлены публикации в международных рецензируемых журналах, в т.ч. из первого или второго квартилей;
Опубликованы 4 работы, из которых 3 входят в первый квартиль WOS/Scopus.
- Представлены полученные в ходе реализации второго года выполнения проекта научные результаты на общероссийских и международных конференциях.
Публикации
1.
Середин П.В., Голощапов Д.Л., Пешков Я.А., Буйлов Н.С., Ипполитов Ю.А., Кашкаров В.М., Вонгсвивут Джитрапорн , Фрейтас Рауль О.
Identification of chemical transformations in enamel apatite during the development of fissure caries at the nanoscale by means of synchrotron infrared nanospectroscopy: A pilot study
Nano-Structures and Nano-Objects, Том 38 May 2024 Номер статьи 101205 (год публикации - 2024)
10.1016/j.nanoso.2024.101205
2.
Середин П.В.; Литвинова Т.А.; Ипполитов Ю.А.; Голощапов Д.Л.; Пешков Я.А.; Кашкаров В.М.; Ипполитов И.Ю.; Че, Б.
A Study of the Association between Primary Oral Pathologies (Dental Caries and Periodontal Diseases) Using Synchrotron Molecular FTIR Spectroscopy in View of the Patient’s Personalized Clinical Picture (Demographics and Anamnesis)
International Journal of Molecular Sciences, 2024, 25(12), 6395; (год публикации - 2024)
10.3390/ijms25126395
3.
Середин П.В., Голощапов Д.Л, Литвинова Т.А.
Biomaterials and Agents: Pharmaceutical and Biomedical Applications in Dental Research
Pharmaceutics, 16(7):894 (год публикации - 2024)
10.3390/pharmaceutics16070894
4.
Середин П.В., Ипполитов Ю.А., Пешков Я.А., Голощапов Д.Л., Ипполитов И.Ю., Авраамова О.Г.
Distinctions in molecular composition of the dental biofilm in a dependence of method of exo/endogeneous caries prevention and cariogenic condition of a patient
Stomatology, Stomatology. 2024;103(5):5‑12. (год публикации - 2024)
10.17116/stomat20241030515
Аннотация результатов, полученных в 2025 году
1. Создана биомиметическая модельная среда, имитирующая in-vitro состав, структуру и морфологию, и органоминеральное взаимодействие в эмали/дентине и дана оценка ее стабильности на основе смоделированной кариозной атаки.
Синтезированы биомиметические среды, воспроизводящие ключевые характеристики зубных тканей. Неорганическая фаза представлена нанокристаллическим карбонат-замещенным гидроксиапатитом, аналогичным апатиту эмали. Органическая фаза включает смесь аминокислот (L-аргинин, L-лизин), сцементированную полидофамином. Соотношения фаз (10/90 и 40/60) моделируют состав эмали и дентина. Системы близки к нативной эмали по морфомеханическим свойствам.
Оценка стабильности при кислотной атаке (H₃PO₄, лимонная, молочная, муравьиная кислоты) показала: кратковременное воздействие умеренно увеличивает шероховатость, сохраняя основные характеристики; длительная экспозиция вызывает значимое снижение твердости и жесткости, требующее реминерализации, что аналогично процессам in vivo.
2. Выявлены взаимосвязи между наблюдаемыми структурно-спектроскопическими характеристиками и изменениями, происходящими в органоминеральном комплексе зубов человека на этапе формирования патологий, полученных с использованием классических методов μFTIR и современной широкополосной synchrotron infrared nanospectroscopy (SINS):
Сканирование SINS границы кариозной фиссуры с нанометровым разрешением выявило трансформацию фазового состава апатита эмали. В зоне деминерализации обнаружены переходные формы фосфатов кальция (β-TCP, OCP, DCPD, ACP), что свидетельствует о растворении и аморфизации апатита с переосаждением кислых фосфатов. Обнаружены спектральные полосы, указывающие на бактериальное воздействие (~1230, 1080, 1170-1160 см⁻¹).
Расчет коэффициента кристалличности (CI) и доли кислотных фосфатов показал: CI здоровой эмали ~1.1-1.2, снижаясь до ~0.7 у фиссуры, что указывает на рост дефектности решетки. Доля кислых фосфатов резко возрастает в зоне ~250-300 нм от стенки фиссуры, маркируя область активной деминерализации.
3. Найдены корреляции между особенностями молекулярного состава зубной биопленки, развитием патологических процессов в ротовой полости и экзо/эндогенным способом поступления минеральных веществ в организм (типом профилактики) у пациентов с различной кариесогенной ситуацией:
Многомерный анализ спектрального датасета десневой жидкости выявил комплексные взаимосвязи: демографические данные - кариес – заболевания пародонта ; множественный кариес и пародонтит – сопутствующие заболевания.
Спектральный анализ подтвердил, что патологии вызывают конформационные изменения белков, трансформацию липидного профиля и сдвиги в содержании фосфатов и углеводов в десневой жидкости.
4. Выполнена апробация разрабатываемой в проекте методики персонализированной экспресс-диагностики состояния ротовой полости и уровня кариесрезистентности пациентов на основе исследований их ротовой, десневой, дентинной жидкостей, зубной ткани и зубной биопленки.
Апробация подтвердила эффективность предлагаемого диагностического подхода. Установлены статистически значимые корреляции (p<0.05) между специфическими спектральными сигнатурами биологических жидкостей и клинически диагностируемым уровнем кариесрезистентности/глубиной кариеса. Разработана и апробирована алгоритмическая схема для классификации пациентов по группе риска на основе интеграции спектроскопических данных и анамнеза. Результаты легли в основу подготовки заявки на патент.
5. Подготовлены публикации в международных рецензируемых журналах, в т.ч. из первого или второго квартилей.
Опубликованы 5 научных работ, из которых 3 входят в первый квартиль Q1 журналов Web of Science/Scopus.
6. Представлены полученные в ходе реализации второго года выполнения проекта научные результаты на общероссийских и международных конференциях.
Основные результаты, полученные в отчетном периоде, были представлены в форме устных / приглашенных докладов на международных и всероссийских конференциях. Доклады вызвали профессиональный интерес и дискуссию среди специалистов в области стоматологии и биомедицинской спектроскопии.
Публикации
1.
ИППОЛИТОВ Ю.А., СЕРЕДИН П.В., ГОЛОЩАПОВ Д.Л., ИППОЛИТОВ И.Ю., БЕРКОВИЧ М.В., ФОЛОМЕЕВА Д.М.
On the origin of gingival crevicular fluid
Parodontologiâ, Parodontologiâ 2025, doi:10.33925/1683-3759-2025-1019. (год публикации - 2025)
10.33925/1683-3759-2025-1019
2.
Середин П.В.; Голощапов Д.Л.; Пешков Я.А.; Потапов А.Ю.; Грибанова Ю.; Шихалиев Х.С.; Ипполитов Ю.А.; Фрейтас, Р.О.; Махди, И.А.; Махди, М.А.
Biomimetic Organomineral Layers with Antibacterial Properties Based on Di/Tetrahydroquinolinediol and Nanocrystalline Hydroxyapatite Deposited on Enamel Surface
BIOMATERIALS SCIENCE, 2025, 13, 2444–2461 (год публикации - 2025)
10.1039/D5BM00070J
3.
Литвинова Т. А., Ипполитов Ю.А., Середин П.В
From STM to GPT: A Comparative Study of Topic Modeling Methods for AI in Dentistry
Research result. Theoretical and Applied Linguistics, 11 (3), 85–121. (год публикации - 2025)
10.18413/2313-8912-2025-11-3-0-5
4.
Середин П.В., Литвинова Т.А., Ипполитов Ю.А., Голощапов Д.Л., Пешков Ю.А. , Че Бокнам, Фрейтас Рауль О., Майя Франциско С.Б.
Multivariate Spectroscopic Analysis of Protein Secondary Structures in Gingival Crevicular Fluid: Insights from FTIR Amide III Band Across Oral Disease Stages
International Journal of Molecular Sciences, Seredin, P.; Litvinova, T.; Ippolitov, Y.; Goloshchapov, D.; Peshkov, Y.; Chae, B.; Freitas, R.O.; Maia, F.C.B. Multivariate Spectroscopic Analysis of Protein Secondary Structures in Gingival Crevicular Fluid: Insights from FTIR Amide III Band Across Oral Disease Stages. Int. J. Mol. Sci. 2025, 26, 4693. https://doi.org/10.3390/ijms26104693 (год публикации - 2025)
10.3390/ijms26104693
5.
Середин П. В. , Голощапов Д. Л., Пешков Ю. А. , Буйлов Н. С. , Потапов А. Ю. , Шихалиев Х. С. , Ипполитов Ю.А., Рауль О. Фрейтас, Франциско К. Б. Майя
Infrared synchrotron nanovisualization of a biomimetic layer composed of trimethyldihydroquinoline and nanocrystalline hydroxyapatite
Condensed Matter and Interphases, 2025;27(3): 483–489 (год публикации - 2025)
10.17308/kcmf.2025.27/13021
Возможность практического использования результатов
Результаты проекта формируют научно-технологический задел для создания в Российской Федерации новой высокотехнологичной отрасли персонализированной превентивной стоматологии. Практическое применение разработок обеспечит значимый социально-экономический эффект:
В социальной сфере:
Внедрение методики позволит осуществить переход от лечения последствий кариеса к его раннему прогнозированию и индивидуальной профилактике. Это приведет к радикальному снижению заболеваемости, сохранению здоровья зубного ряда населения на протяжении всей жизни, повышению качества жизни и сокращению временных затрат на лечение. Метод соответствует стратегии развития высокотехнологичного здравоохранения и здоровьесбережения.
В экономике и технологическом развитии:
На основе полученных результатов могут быть разработаны и коммерциализированы:
-Отечественные диагностические приборы нового поколения (спектрометрические анализаторы биожидкостей) для кабинетов стоматолога, что обеспечит импортозамещение и потенциал для экспорта.
-Экспресс-тест-системы для массового скрининга и домашнего мониторинга группы риска.
- Программное обеспечение с алгоритмами анализа данных для формирования индивидуальных профилактических рекомендаций.
Это создаст основу для развития малых инновационных предприятий в сфере медицинского приборостроения и IT-медицины, будет способствовать росту добавленной стоимости в экономике за счет производства наукоемкой продукции и интеллектуальных услуг.