Модуляция индуктивных свойств внеклеточного матрикса мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток при «физиологической» гипоксии in vitro

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 23-15-00062

НазваниеМодуляция индуктивных свойств внеклеточного матрикса мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток при «физиологической» гипоксии in vitro

Руководитель Андреева Елена Ромуальдовна, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр Российской Федерации - Институт медико-биологических проблем Российской академии наук , г Москва

Конкурс №80 - Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-101 - Экспериментальная медицина

Ключевые слова Мультипотентные мезенхимальные стромальные клетки, локальное микроокружение, «физиологическая» гипоксия, внеклеточный матрикс, матрисом, децеллюляризация, рецеллюляризация, компетенции ВКМ, микроскопия, иммуноферментный анализ, ОТ-ПЦР, высокопроизводительное РНК секвенирование, биоинформатический анализ

Код ГРНТИ34.19.21

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Мультипотентные мезенхимальные стромальные клетки (МСК) рассматриваются как наиболее перспективный инструмент в клеточной и регенеративной медицине медицине (Pittenger … Caplan et al., 2019). До недавнего времени внимание исследователей было сфокусировано на растворимых медиаторах, продуцируемых МСК, как фундаментальной основе, обеспечивающей возможность их эффективного применения (Caplan, Correa, 2011). Однако все больший интерес с точки зрения регенеративной медицины привлекает другой продукт секреторной активности МСК - внеклеточный матрикс (ВКМ) ) (Yi et al., 2017). В настоящее время ВКМ рассматривается как динамичный и многофункциональный комплекс – «матрисом», включающий как белки ВКМ, так и ремоделирующие ВКМ молекулы и депонированные в ВКМ биологически активные медиаторы. Баланс активности всех компартментов матрисома необходим как при физиологическом, так и репаративном ремоделировании тканей. Это определяет интерес к матрисому с точки зрения исследования механизмов функционирования различных тканевых ниш in vivo, а также в связи с востребованностью полученных ex vivo ВКМ для нужд тканевой инженерии и регенеративной медицины. In vivo свойства МСК определяются различными факторами микроокружения, в том числе - концентрацией О2 ( Buravkova et al., 2014; Yusoff et al., 2022). Информация о составе продуцируемого при этом внеклеточного матрикса (ВКМ) и его репаративном потенциале практически отсутствует. Ранее в нашей лаборатории был проведен предварительный полногеномный анализ дифференциальной транскрипции генов в МСК, постоянно культивируемых при уровне О2, близком к тканевому - 5% О2 («физиологическая гипоксия) по сравнению с МСК при 20% О2 (нормоксия). Обнаружены значительные изменения в профиле транскрипции генов, кодирующих белки основных фибриллярных и аморфных компонентов ВКМ, а также ферментов, вовлеченных в ремоделирование матрикса. Мы предполагаем, что такие изменения ведут к структурной и функциональной модификации формирующегося ВКМ и, соответственно, его индуктивных свойств. Рабочей гипотезой настоящего проекта является предположение о том, что ВКМ от МСКпри «физиологической» гипоксии сохраняет «гипоксические» компетенции и способен модулировать активность МСК и других типов клеток при рецеллюляризации, стимулируя усиление пролиферации,продукции растворимых медиаторов, замедление дифференцировки, т.е. усиление регенеративных свойств клеточных препаратов. В связи с этим целью настоящего проекта станет анализ модификации активности различных компартментов матрисома МСК при «физиологической» гипоксии in vitro, а также модуляции индуктивных свойств получаемого ВКМ, что определяет новизну предлагаемого проекта. Кроме того, использование «гипоксического» ВКМ даст возможность смоделировать эффекты матрикса в областях повреждений на функциональную активность МСК и других типов клеток, что необходимо для понимания механизмов взаимодействия клеточных и неклеточных компонентов тканевых ниш. Предлагаемый проект имеет и очевидный прикладной аспект. Полученные и охарактеризованные в ходе выполнения проекта децеллюляризированные(дц) ВКМ могут быть использованы для направленной модификации свойств МСК и других типов клеток, а также создания биосовместимых носителей. В работе будут использованы культивирование в гипоксических газовых средах, световая, лазерная конфокальная, сканирующая, атомно-силовая микроскопии, проточная цитометрия, иммуноферментный анализ, зимография, иммуноблотинг, протеомное профилирование, полногеномное секвенирование РНК, ОТ-ПЦР в реальном времени и др. Изучение механизмов поддержания тканевого гомеостаза и ремоделирования за счет взаимодействия клеточных и неклеточных составляющих тканевых ниш является необходимым элементом в системе формирования знаний о роли малодифференцированных предшественников в организме, что определяет научный масштаб задач, которые предполагается решить.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Матвеева Д.К., Буравков С.В., Андреева Е.Р., Буравкова Л.Б. Hypoxic Extracellular Matrix Preserves Its Competence after Expansion of Human MSCs under Physiological Hypoxia In Vitro MDPI, 2023, 8, 476. (год публикации - 2023)
10.3390/biomimetics8060476

2. Андреева Е.Р., Матвеева Д.К., Буравкова Л.Б. Физиология клеточного микроокружения: инструктивная роль соединительнотканного матрикса Сборник тезисов XXIV съезда физиологического общества им. И. П. Павлова 11-16 сентября 2023 (год публикации - 2023)

3. Андреева Е.Р., Матвеева Д.К., Жидкова О.В., Буравкова Л.Б. ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ МАТРИКС КАК ФАКТОР РЕГУЛЯЦИИ ФИЗИОЛОГИЧЕСКОГО МИКРООКРУЖЕНИЯ КЛЕТКИ Успехи физиологических наук (год публикации - 2024)

4. Д.К. Матвеева, Е.Р. Андреева, Л.Б. Буравкова ТКАНЕВОЙ УРОВЕНЬ О2 IN VITRO КАК МОДУЛЯТОР ИНДУКТИВНЫХ СВОЙСТВ ВНЕКЛЕТОЧНОГО МАТРИКСА МУЛЬТИПОТЕНТНЫХ МЕЗЕНХИМАЛЬНЫХ СТРОМАЛЬНЫХ КЛЕТОК Гены и клетки, Гены и Клетки, Том XVIII, Приложение, 2023, стр 76. (год публикации - 2023)

5. Горностаева А.Н., Бобылёва П.И., Буравкова Л.Б. Экспрессия молекул адгезии и уровень растворимых медиаторов при взаимодействии мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток и активированных т-лимфоцитов в условиях «физиологической» гипоксии in vitro Сборник тезисов XXIV съезда физиологического общества им. И. П. Павлова 11-16 сентября 2023, Сборник тезисов XXIV съезда физиологического общества им. И. П. Павлова 11-16 сентября 2023, с.107 (год публикации - 2023)

Аннотация результатов, полученных в 2024 году
СВОЙСТВА ДЕЦЕЛЛЮЛЯРИЗИРОВАННОГО ВКМ (дцВКМ), ПРОДУЦИРУЕМОГО МУЛЬТИПОТЕНТНЫМИ МЕЗЕНХИМАЛЬНЫМИ СТРОМАЛЬНЫМИ КЛЕТКАМИ ПРИ РАЗЛИЧНОМ УРОВНЕ О2 В МИКРООКРУЖЕНИИ Основным направлением исследований 2-го года стало дальнейшее изучение дцВКМ, продуцируемых МСК при разном уровне О2, с фокусом на анализ состава белков и индуктивные свойства при последующей рецеллюляризации. Специальное внимание было уделено проверке гипотезы о сохранении «гипоксических» компетенций дцВКМ, полученного при физиологической гипоксии (5% О2). С помощью масс-спектрометрии в растворимых фракциях дцВКМ от МСК, которые постоянно культивировали при 20% или 5% О2, было идентифицировано 89 белков, среди которых 8 и 9 были уникальны только для 20% или 5% О2, соответственно. Большая часть одинаково представленных в дцВКМ-Норм и дцВКМ-Гип белков аннотированы как участвующие в организации и регуляции ВКМ, адгезии, миграции, дифференцировке стромальных клеток; ангиогенезе; биоминерализации, оссификациии хрящевой и костной тканей. Согласно Tissue expression database большая часть белков в обеих группах тканеспецифична для плаценты, соединительной и и скелетной тканей. При 20% О2 были более представлена группа белков, специфичных для дермы и костной ткани, а при 5% О2 выявлялись специфичные белки для хондроцитов и хрящевой ткани. Особый интерес представляли белки, специфичные для костной ткани, увеличенные или уникальные при 20% О2 (COL3A1, COL5A1, COL6A1, SPARC, CTSK) и для хрящевой – при 5% О2 (HAPLN1, CILP, GREM1, CTGF). Среди уникальных для дцВКМ-Гип обнаружены гликопротеины IGFBP5 и CLIP, для которых установлена связь с негативной регуляцией передачи сигналов через рецептор инсулино-подобного фактора роста, который влияет на пролиферацию хондроцитов. Мы предположили, что ВКМ, продуцируемые МСК при различном уровне О2, могут отличаться по способности регулировать функциональную активность рецеллюляризированных клеток. В экспериментах на этом этапе использовали МСК, постоянно культивируемые при 20% О2. После рецеллюляризации дальнейшие эксперменты выполняли также при 20% О2. Анализ прикрепления к дцВКМ и распластывания на нем подтвердил, что МCК чувcтвительны к cвойcтвам cубcтрата. Результаты по уникальным ткане-специфичным белкам в дцВКМ, полученным при различных уровнях О2, коррелируют с данными по снижению остео- и увеличению хондро- дифференцировки МСК при 5% О2 . Поэтому следующий этап работы заключался в исследовании может ли дцВКМ-Гип передавать свои «гипоксические» компетенции МСК при повторном заселении. ДцВКМ-Норм и дцВКМ-Гип cпоcобcтвовали дифференцировке МCК в оcтеонаправлении, а также изменению паракринного профиля по cравнению c теми же клетками на коллагене. При этом активноcть щелочной фосфатазы и транскрипция RUNX2 – маркерных событий оcтеодифференцировки, спонтанно уcиливалась на дцВКМ-Норм по cравнению c дцВКМ-Гип, что аналогично прямым эффектам уровня О2 на коммитирование МCК. Таким образом, in vitro возможно формирование ВКМ c определенными свойствами за cчет использования факторов микроокружения, таких как концентрация О2, характерная для каневых ниш МСК. Дальнейшие иccледования в этой облаcти будут направлены на выяснение реализации механизмов вклада физиологичеcкой гипокcии в ВКМ-опосредованную функциональную активность как МСК, так и других типов клеток, поcкольку от этого может зависеть их вовлечение в физиологичеcкие и репаративные процеccы in vivo, а также применение в протоколах регенеративной медицины и тканевой инженерии.

Публикации

1. Попов М.А., Андреева Е.Р. , Гуревич Л.Е., Зыбин Д.И., Ратушный А.Ю. , Матвеева Д.К. , Абдулаев С.А., Радченкова О.В., Буравкова Л.Б. , Шумаков Д.В. Гистологический и молекулярный анализ стенки аневризмы левого желудочка КЛИНИЧЕСКАЯ И ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ХИРУРГИЯ, ишемическая болезнь сердца, аневризма левого желудочка, ремоделирование левого желудочка, гибернирующий миокард, гистологический анализ, внеклеточный матрикс, дифференциальная экспрессия генов, полимеразная цепная реакции с обратной транскрипцией (год публикации - 2024)
10.33029/2308-1198-2024-12-1-118-126

2. Горностаева А., Буравкова Л., Лобанова М., Андреева Е. HIFs in hypoxic regulation of the extracellular matrix: focus on little-known player HIF-3 Biocell, 48(5): 677-692 (год публикации - 2024)
10.32604/biocell.2024.048873

3. Андреева Е.Р., Матвеева Д.К., Буравкова Л.Б. Направленная модификация свойств внеклеточного матрикса мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток in vitro Программа VI Национального конгресса по регенеративной медицине Санкт-Петербург, 13–15 ноября 2024 г. (год публикации - 2024)

4. Матвеева Д.К. , Андреева Е.Р. , Буравкова Л.Б. ТКАНЕВОЙ УРОВЕНЬ О2 IN VITRO КАК МОДУЛЯТОР ИНДУКТИВНЫХ СВОЙСТВ ВНЕКЛЕТОЧНОГО МАТРИКСА МУЛЬТИПОТЕНТНЫХ МЕЗЕНХИМАЛЬНЫХ СТРОМАЛЬНЫХ КЛЕТОК Гены и клетки, Т.18. №S. С.76 (год публикации - 2024)

5. Горностаева А.Н. , Матвеева Д.К. , Кочетова Э.С. ХАРАКТЕРИСТИКА ВНЕКЛЕТОЧНОГО МАТРИКСА И АССОЦИИРОВАННЫХ С НИМ МОЛЕКУЛ, ПРОДУЦИРУЕМЫХ МУЛЬТИПОТЕНТНЫМИ МЕЗЕНХИМАЛЬНЫМИ СТРОМАЛЬНЫМИ КЛЕТКАМИ ИЗ РАЗНЫХ ТКАНЕВЫХ ИСТОЧНИКОВ Материалы VI национального конгресса по регенеративной медицине Сборник, Эко-Вектор. , 2024. 1157 c. (год публикации - 2024)

6. Кочетова Э.С. , Матвеева Д.К., Мелик-Пашаев А.Э. , Андреева Е.Р., Романов Ю.А. , Буравкова Л.Б. ВЫБОР ОПТИМАЛЬНОГО ПРОТОКОЛА ПОЛУЧЕНИЯ ДЕЦЕЛЛЮЛЯРИЗИРОВАННОГО ВНЕКЛЕТОЧНОГО МАТРИКСА МЕЗЕНХИМНЫХ СТРОМАЛЬНЫХ КЛЕТОК ИЗ ТКАНИ ПУПОЧНОГО КАНАТИКА ЧЕЛОВЕКА Клеточные технологии в биологии и медицине , №4б стр. 1-5 (год публикации - 2024)
10.47056/1814-3490-2024-4-

7. Андреева Е.Р., Матвеева Д.К., Жидкова О.В., Буравкова Л.Б. ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ МАТРИКС КАК ФАКТОР РЕГУЛЯЦИИ ФИЗИОЛОГИЧЕСКОГО МИКРООКРУЖЕНИЯ КЛЕТКИ Успехи физиологических наук, том 55, №1, стр. 17-31 (год публикации - 2024)
10.31857/s0301179824010033

8. Мелик-Пашаев А.Э., Матвеева Д. К., Буравков С. В., Атякшин Д. А., Кочетова Э. С., Андреева Е.Р. Microscopy and Image Analysis of Сell-Derived Decellularized Extracellular Matrix Cell and Tissue Biology, Vol. 19, No. 1, pp. 33–47 (год публикации - 2025)
10.1134/S1990519X2501004

9. Матвеева Д.К. , Кочетова Э.С. , Горностаева А.Н. СТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ВНЕКЛЕТОЧНОГО МАТРИКСА КУЛЬТИВИРУЕМЫХ МУЛЬТИПОТЕНТНЫХ МЕЗЕНХИМАЛЬНЫХ СТРОМАЛЬНЫХ КЛЕТОК ПРИ РАЗЛИЧНЫХ УРОВНЯХ О2 Материалы IX Молодежной школы-конференции по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН, С.-Петербург, 15–18 октября 2024 г. Сборник, Астерион. , 2024. 332 c. (год публикации - 2024)
10.53115/9785001885320

Аннотация результатов, полученных в 2025 году
Этап 2025 г. был посвящен исследованию модификации активности сигнальных путей, вовлеченных в самоподдержание и коммитирование МСК, при культивировании на децеллюляризированных внеклеточных матриксах (дцВКМ), полученных при различном уровне О2. Объектом исследования были МСК на разных сроках после повторного заселения на дцВКМ, полученные при культивировании МСК при 20% и 5% О2 (20-дцВКМ и 5-дцВКМ). В качестве покрытия сравнения использовали стандартный лабораторный пластик. Выполнены следующие работы. Из МСК через 72 часа после заселения покрытий получены образцы мРНК и проведены РНК секвенирование нового поколения (NGS) и ОТ-ПЦР анализ. Проведен детальный анализ активности Wnt-сигналинга. С помощью ОТ-ПЦР определен уровень экспрессии генов, продукты которых принимают участие в каноническом и неканоническом Wnt-пути передачи сигнала, и негативной регуляции Wnt- сигналинга. С помощью вестерн-блоттинга определено содержание общего и фосфорилированного b-катенина. Чувствительность рецеллюлялизированных МСК к остеокоммитированию на разных дцВКМ оценивали с использованием экзогенного BMP-2. После экспозиции с BMP-2 в МСК определяли транскрипцию генов-мишеней BMP-2. Для оценки сохранения «гипоксических» компетенций 5-дцВКМ в рецеллляризированных МСК выявляли метаболические сдвиги, характерные для МСК в условиях гипоксии. В дополнение к данным NGS проведена оценка изменения функциональной активности МСК: определено соотношение Yla/glu, с помощью флуоресцентных зондов охарактеризованы уровень внутриклеточных АФК и активность митохондриального компартмента. В МСК, культивируемых на 5-дцВКМ против МСК на 20-дц-ВКМ выявлено 143 ДЭГ с увеличенной (и 192 – с уменьшенной транскрипцией (p-val<0.05). Анализ функционального обогащения с использованием генной онтологии показал, что ряд генов со сниженной экспрессией в МСК на 5-дцВКМ кодируют белки ответа на стресс (HSA-2262752 Cellular responses to stress). Основную часть этого кластера составляют гены, продукты которых вовлечены в биогенез рибосом и синтеза, что может предполагать торможение синтеза белка. Также отмечено снижение транскрипции генов белков межклеточных контактов. 41 ген с повышенной экспрессией кодирует РНК-связывающие белки. Установлено, что в обеих группах МСК на дцВКМ продукты генов с увеличенной транскрипционной активностью вовлечены в такие процессы, как регуляция адгезии, клеточной дифференцировки, миграции, ангиогенеза и метаболических процессов, а также в ассоциированы с контролируемыми провоспалительными цитокинами сигнальными путями. Характер изменения профиля транскрипции МСК на дцВКМ дает основания предполагать, что такие МСК могут быть более подготовленными для регенерации тканей, усиливая миграционный и ангиогенный потенциал и активируя сигнальные пути для взаимодействия с воспалительной средой, одновременно ослабляя продукцию собственных молекул ВКМ и адгезии. Сигнальный путь WNT. Изменение профиля транскрипции ДЭГ в МСК на дцВКМ vs пластик свидетельствует о подавлении канонического (пролиферативного) и неканонического (миграционного) путей WNT в рецеллюляризированных МСК, что свидетельствует о что ВКМ поддерживает более стабильный фенотип «покоя» клеток, исключая стресс-ориентированную функциональную активность. На 20-дцВКМ более значимо изменяется ядро канонического WNT-пути, включая GSK3B, APC, CTNNB1 и MYC, а снижение активности канонического WNT более выражено. Вероятно, более жесткий 5-дцВКМ вызывает механозависимый компенсаторный ответ клеток. Специфический ответ МСК на 20д-цВКМ проявился в повышении экспрессии EDNRA, MYO19, SLC2A6, ответственных за пролиферативный и ремоделирующий потенциал клетки, и снижении экспрессии проапоптотического гена BMF и генов COX5B, AAAS, MGARP, связанных с митохондриальной дисфункцией. В МСК на 5-дцВКМ увеличивалась экспрессия генов, связанных с ангиогенным ответом и дифференцировкой (ADCY10, KDR), и снизилась – BBC3 и AKT3, связанных с апоптозом. Это может говорить об активации репаративной и васкулогенной функции МСК. NGS-анализ выявил изменения экспрессии генов, кодирующих молекулы, вовлеченные в энергетический метаболизм, переносчика глюкозы SLC2A1 и двух изоформ бифункционального фермента 6-фосфофруктокиназы-2/фруктозо-2,6-дифосфатазы - PFKFB3/PFKFB4. Транскрипция гена G6PD фермента пентозофосфатного пути глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы, катализирующего окисление глюкозо-6-фосфата с образованием НАДФ-Н, была увеличена. ОТ-ПЦР подтвердил данные NGS-анализа относительно увеличения транскрипции G6PD на дцВКМ и снижения транскрипции SLC2A1. В МСК, культивируемых на 20-дцВКМ, 5- дцВКМ или на пластике соотношение Yla/glu было близким и составляло 1,2. Общая масса и мембранный потенциал не отличались в зависимости от типа ВКМ или пластика. Уровень АФК на дцВКМ был вдвое ниже, чем в МСК на пластике, что может свидетельствовать об активации антиоксидантных систем. По сравнению с 20-дцВКМ на 5-дцВКМ МСК имели более низкий уровень экспресии WNT2, WNT5A, DKK1 и более высокий - генов, кодирующих белки-ингибиторы сигнального пути Wnt SFRP1, GSK3B, а также генов рецепторов лигандов Wnt (LRP5, FZD3, FZD4) канонического пути. Культивирование МСК на 5-дцВКМ способствовало снижению уровня фосфорилирования β-катенина, а также индуцировало возрастание уровня транскрипции генов-мишеней b-catenin AXIN2, CCND1, что может косвенно указывать на повышение его активности как транскрипционного фактора. По сравнению с пластиком в МСК на 20-дцВКМ и 5-дцВКМ активность Wnt-сигналинга была снижена, что выражалось в изменении экспрессии генов Wnt- пути и усилении фосфорилирования β-катенина. Это может предполагать ослабление WNT-сигналинга на уровне продукции лигандов, их рецепции и транслокации β-катенина в ядро, где он участвует в индукции транскрипции целого ряда генов. На дцВКМ ослаблялась способность МСК к спонтанной дифференцировке в остео-, адипо- и хондро-направлениях. ДцВКМ отменяли активирующий эффект остеогенной среды на Wnt/β катениновый путь. ДцВКМ нивелировал эффект BMP-2: отменялось стимулирующее действие на экспрессию практически всех Wnt генов по сравнению с пластиком. Таким образом, остеогенные индукторы способствуют активации Wnt-сигналинга при культивировании клеток на пластике, но не на матриксах. При культивировании на матриксах в присутствии остео-индукторов активность ЩФ и уровень RunX2 также были понижены на дцВКМ. Это указывает на то, что дцВКМ поддерживает некоммитированное состояние МСК. BMP-2 в сочетании с остеогенными стимулами не способствовал стимуляции остеогенеза в МСК на дцВКМ. При этом экспрессия BMP2 в МСК на дцВКМ спонтанно увеличилась. Добавление BMP-2 к МСК на 5-дцВКМ снижало уровень RunX2 в а также экспрессию гена ALPL и активность ЩФ. В целом активность ЩФ в МСК на 5-дцВКМ была снижена, по сравнению с 20-дцВКМ, что подтверждает эффект «гипоксической» памяти 5-дцВКМ.

Публикации

1. Матвеева Д. К., Андреева Е. Р., Рудимова Ю.В., Горностаева А. Н., Якубец Д. А., Андрианова И. В., Буравкова Л. Б. Alterations of matrisome gene expression in multipotent mesenchymal stromal cells under physiological hypoxia in vitro Elsevier, 97:103064. doi: 10.1016/j.tice.2025.103064. (год публикации - 2025)
10.1016/j.tice.2025.103064

2. Андреева Е. Р., Жидкова О. В., Матвеева Д. К., Горностаева А. Н., Лобанова М. В., Буравкова Л. Б. Ex Vivo Preconditioning as a Useful Tool for Modification of the Extracellular Matrix of Multipotent Mesenchymal Stromal Cells MDPI, Int. J. Mol. Sci. 2025, 26, 6301 https://doi.org/10.3390/ijms26136301 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.3390/ijms26136301

3. Матвеева Д.К., Горностаева А.Н., Андреева Е.Р. ГИПОКСИЧЕСКОЕ КОНДИЦИОНИРОВАНИЕ КАК ИНСТРУМЕНТ ДЛЯ МОДИФИКАЦИИ СВОЙСТВ ВНЕКЛЕТОЧНОГО МАТРИКСА МСК Сборник тезисов Школы-конференции для молодых ученых Института цитологии РАН 22–23 октября 2025 года Санкт-Петербург , Сборник тезисов Школы-конференции для молодых ученых Института цитологии РАН, сс. 100-101 (год публикации - 2025)

4. Мелик-Пашаев А.Е. СОХРАННОСТЬ ФИБРИЛЛЯРНЫХ БЕЛКОВ ВНЕКЛЕТОЧНОГО МАТРИКСА МУЛЬТИПОТЕНТНЫХ МЕЗЕНХИМАЛЬНЫХ СТРОМАЛЬНЫХ КЛЕТОК ПОСЛЕ ЭКСТРАКЦИИ РАСТВОРИМОГО КОМПОНЕНТА Сборник тезисов 28-й Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА». , Сборник тезисов 28-й Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА». Пущино: ФИЦ ПНЦБИ РАН, 2025. С.198 (год публикации - 2025)

5. Мелик-Пашаев А.Э., Андрианова И.В., Романов Ю.А., Буравков С.В., Андреева Е.Р. Геометрия и упаковка фибриллярных компонентов межклеточного вещества МСК на разных сроках культивирования Клиническая и экспериментальная морфология, 14(6):29-39. (год публикации - 2025)
10.31088/CEM2025.14.6.29-39.