КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 23-24-00390
НазваниеИзучение динамики спектральных характеристик хвойных растений в годичном цикле для дистанционного, неинвазивного и оперативного мониторинга их качественного состояния
Руководитель Дмитриев Павел Александрович, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Южный федеральный университет" , Ростовская обл
Конкурс №78 - Конкурс 2022 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-301 - Охрана окружающей среды
Ключевые слова Фенология растений, дистанционное зондирование, спектральный профиль, вегетационные индексы, NDVI, сосна обыкновенная, туя западная, экология растений, физиология растений
Код ГРНТИ34.35.00
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
При дальнейшем развитии средств дистанционного зондирования Земли (ДЗЗ) оперативный мониторинг состояния древесной растительности единовременно на больших пространствах позволит делать надежный прогноз ее развития, а также опосредованно через изменение фенологического цикла развития растений диагностировать мезо- и макроклиматические изменения.
Стандартными методами фенологии, с помощью наблюдений за изменениями внешних признаков невозможно точно в режиме реального времени определить критические точки в годовом цикле хвойных растений – начало и окончание циклов вегетации и покоя, период закаливания и его эффективность, непосредственное повреждение отрицательными температурами и засухой, преддверие вспышек поражения вредителями и болезнями и др. Анализ литературных источников (Sankey, Tatum, 2022; Seyednasrollah et al. 2021; Wu et al., 2020; Zarco-Tejada et al., 2019; Voss, Sugumaran, 2008) указывает на большие перспективы использования гиперспектральных сенсоров для решения этой проблемы.
Проект предполагает построить динамическую модель годового цикла спектральных характеристик хвойных растений по данным гиперспектральной съемки, связывающую значения спектральных каналов и вегетационных индексов с фенологическим состоянием растения и внешними абиотическими факторами. Определить наиболее информативные спектральные каналы и вегетационные индексы (или рассчитать оригинальные) для задания спектральных диапазонов мультиспектральным сенсорам для ДЗЗ.
В качестве объектов исследования будут выбраны туя западная (Thuja occidentalis L. ) и плосковеточник восточный (Platycladus orientalis (L.) Franco), обладающие значимыми различиями на действие факторов зимнего и летнего периодов (Козловский и др., 2009), удобные по строению побегов для осуществления гиперспектральной съемки, а также сосна обыкновенная (Pinus sylvestris L.) – ценный в хозяйственном отношении вид. В ходе решения поставленных задач на первом этапе исследования будет осуществлен лабораторный эксперимент в максимально контролируемых условиях по гиперспектральной съемке побегов хвойных растений в течение их годового цикла развития. Параллельно будут осуществляться фенологические наблюдения, фиксация данных метереологических измерений. Предполагается отработать методику съемки побегов хвойных растений, включающую отбор чистых (принадлежащих только фотосинтезирующим частям побега) спектральных профилей. Эксперимент будет охватывать весь годовой цикл развития хвойных растений, интервал между съемками будет составлять 7-10 дней. На втором этапе эксперимент будет воспроизведен на плосковеточнике восточном в лабораторных и полевых условиях. Полевой эксперимент будет заключаться в съемке крон объекта гиперспектральной камерой в течение вегетационного периода. По его результатам будет сделан окончательный вывод о возможности использования метода в практике ДЗЗ. Полученные результаты будут обработаны методами математической статистики (t-test, analysis of variance (ANOVA)) и математического анализа данных (principal component analysis (PCA), linear discriminant analysis (LDA), random forest (RF), decision tree (DT), support-vector machines (SVM)) и моделирования (построение математической модели, описывающей изменение спектральных характеристик хвойных растений в течение их годового цикла развития).
(см. файл с дополнительной информацией 1 и 2)
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Влияние компоновки побегов сосны при гиперспектральной съемке в лабораторных условиях на статистические характеристики вегетационных индексов
Влияние компоновки побегов сосны при гиперспектральной съемке в лабораторных условиях на статистические характеристики вегетационных индексов
Живые и биокосные системы, «Живые и биокосные системы». – 2023. – № 46 (год публикации - 2023)
10.18522/2308-9709-2023-46-3
2.
Дмитриев П.А., Козловский Б.Л., Дмитриева А.А.
Assessing the phenological state of evergreen conifers using hyperspectral imaging time series
Remote Sensing Applications: Society and Environment, Remote Sensing Applications: Society and Environment 2024, 36, 101342 (год публикации - 2024)
10.1016/j.rsase.2024.101342
3.
Дмитриев П.А., Козловский Б.Л., Дмитриева А.А.
Spectral phenology features of Platycladus orientalis (L.) Franco
E3S Web of Conferences, E3S Web Conf., 555 (2024) 02003 (год публикации - 2024)
10.1051/e3sconf/202455502003
4.
Дмитриев П.А., Козловский Б.Л., Дмитриева А.А.
Vegetation and Dormancy States Identification in Coniferous Plants Based on Hyperspectral Imaging Data
Horticulturae, Horticulturae 2024, 10(3), 241 (год публикации - 2024)
10.3390/horticulturae10030241
Аннотация результатов, полученных в 2024 году
В ходе реализации проекта в 2024 г. проведена проксимальная гиперспектральная съемка побегов Thuja occidentalis, Platycladus orientalis, Pinus sylvestris и P. nigra subsp. pallasiana в лабораторных условиях, охватывающая весь годовой цикл фенологического развития этих хвойных растений. Проведена приповерхностная гиперспектральная съемка крон P. orientalis. В результате эксперимента сформирована база из 2064 гиперспектральных снимков. Параллельно велись фенологические наблюдения за всеми четырьмя видами хвойных растений, определялось содержание фотосинтетических пигментов и воды в побегах Platycladus orientalis.
На этапе предварительной обработки данных гиперспектральной съемки все спектральные профили были сглажены с помощью фильтра Савицкого–Голея (шаг 15 нм). С помощью программно-реализованной авторами двухэтапной сегментации данных гиперспектральной съемки сформирована совокупность «чистых» пикселей (спектральных профилей) исследуемых хвойных растений. Для каждого спектрального профиля, состоящего из 125 спектральных каналов, было рассчитано по 84 узкополосных вегетационных индекса (ВИ). Проведен разведочный анализ полученных данных. Из совокупности данных были исключены сильно отклоняющиеся значения ВИ. С помощью тестов Шапиро-Уилка, χ2 - Пирсона и графика квантиль-квантиль (Q-Q plot) установлено, что большинство ВИ не распределялись по нормальному закону (распределение ВИ по значениям характеризовались левосторонней асимметрией и коэффициентом эксцесса выше 0). Поэтому в качестве среднего значения в дальнейшем анализе данных использовалась медиана признака.
Сформирован датасет, представляющий подробные временные ряды значений ВИ и спектральных каналов побегов T. occidentalis, P. orientalis, P. sylvestris и P. nigra subsp. pallasiana, концентраций фотосинтетических пигментов и содержания воды в побегах P. orientalis за 2024 г.
Установлено, что модели спектральных характеристик, полученных в результате проксимальной гиперспектральной съемки побегов хвойных растений в лабораторных условиях, эффективно работают на спектральных характеристиках, полученных в результате приповерхностной съемки крон растений в полевых условиях. Точность тестирования LDA-модели для P. orientalis, построенной по данным лабораторной съемки (побеги) на данных полевой съемки (кроны) составила 92.7%.
Подтверждена эффективность LDA- и RF-моделей, созданных в результате реализации проекта в 2023 г., для идентификации состояний «вегетация» и «покой» у хвойных растений путем их тестирования на данных 2024 г. Предсказанные LDA- и RF-моделями периоды вегетации и покоя совпадают с метеорологическим (МВП) и фенологическим вегетационными периодами (ФВП) и соотносятся с динамикой среднесуточной температуры воздуха и динамикой фотосинтетических пигментов.
В ходе реализации проекта, путем построения двойных логистических моделей было протестировано 79 ВИ на возможность использования их в качестве метрик для описания фенологии хвойных растений. Было показано, что фенология хвойных растений в пределах их МВП и ФВП может быть охарактеризована значительным количеством ВИ. Динамика их временных рядов имеет хорошо выраженный сезонный характер и точно описывается моделью двойной логистической кривой (R2˃0,7, RMSE от 0,110 до 0,260). Однако ни одна из 79 логистических моделей не дала одновременного совпадения предсказанных сроков начала и завершения ФВП (SOS и EOS) с фактическими сроками. Некоторые модели хорошо предсказывали начало вегетационного периода (ВП), другие – завершение ВП. Это подчеркивает проблему варьирования результатов оценки состояния растений по спектральным характеристикам в процессе их фенологического развития в зависимости от выбранных моделей и метрик, известную для листопадных растений. Наиболее точное предсказание сроков начала и завершения ВП дает усреднение результатов всех 79 моделей. Результаты исследования свидетельствуют о том, что для вечнозеленых деревьев многофакторные регрессионные модели (с использованием двух и более ВИ в качестве переменных) будут более перспективными для описания их фенологии, чем однофакторные модели.
Установлено, что наиболее информативными для описания состояний хвойных растений в процессе их фенологического развития являются индексы Chlorophyll / Carotenoid Index (CCI) и Photochemical Reflectance Index (PRI), которые рассчитываются на основе спектральных каналов 528, 645 нм и 531, 570 нм соответственно. Эти индексы имеют высокую силу связи (r ≥ 0.7, p ≤0.001) со значениями среднесуточных температур и продолжительностью светового дня для всех четырех видов экспериментальных хвойных растений. Кроме того, установлено, что CCI и PRI являются значимыми для идентификации состояний «вегетация» и «покой» с помощью RF- и LDA-моделей.
Показано, что побеги и кроны P. orientalis могут быть успешно разделены по состояниям «вегетация» и «покой» в плоскости этих двух индексов, без использования алгоритмов машинного обучения. Значимыми спектральными каналами для LDA-модели были каналы в синем, зеленом и красном диапазонах – 450, 530 и 686 нм. По результатам проведенного исследования, для создания мультиспектрального сенсора, предназначенного для оценки состояний хвойных растений в процессе их фенологического развития, рекомендуется использовать спектральные каналы, центрированные на 530, 570 и 645 нм.
Публикации
1.
Влияние компоновки побегов сосны при гиперспектральной съемке в лабораторных условиях на статистические характеристики вегетационных индексов
Влияние компоновки побегов сосны при гиперспектральной съемке в лабораторных условиях на статистические характеристики вегетационных индексов
Живые и биокосные системы, «Живые и биокосные системы». – 2023. – № 46 (год публикации - 2023)
10.18522/2308-9709-2023-46-3
2.
Дмитриев П.А., Козловский Б.Л., Дмитриева А.А.
Assessing the phenological state of evergreen conifers using hyperspectral imaging time series
Remote Sensing Applications: Society and Environment, Remote Sensing Applications: Society and Environment 2024, 36, 101342 (год публикации - 2024)
10.1016/j.rsase.2024.101342
3.
Дмитриев П.А., Козловский Б.Л., Дмитриева А.А.
Spectral phenology features of Platycladus orientalis (L.) Franco
E3S Web of Conferences, E3S Web Conf., 555 (2024) 02003 (год публикации - 2024)
10.1051/e3sconf/202455502003
4.
Дмитриев П.А., Козловский Б.Л., Дмитриева А.А.
Vegetation and Dormancy States Identification in Coniferous Plants Based on Hyperspectral Imaging Data
Horticulturae, Horticulturae 2024, 10(3), 241 (год публикации - 2024)
10.3390/horticulturae10030241
Возможность практического использования результатов
Дальнейшая разработка методологии спектральной фенологии хвойных растений может быть использована для разработки и внедрения технологии дистанционной оценки их состояний, что позволит решить проблему оперативной оценки состояния древесной растительности на больших территориях. Учитывая то, что в России на хвойные леса приходится около 75,3 % площади земель, занятых основными лесообразующими породами, планирование хозяйственных мероприятий в этих лесах на основе дистанционного спектрального фенотипирования их состояния может дать существенный экономический эффект.