Аннотация результатов, полученных в 2024 году
1. Было собрано 876 образцов серых крыс Rattus norvegicus из более чем 50 субьектов РФ. Большая часть материала была собрано при сотрудничестве с Роспоребнадзором . Проведены молекулярно-генетические исследований с собранным материалом по серым крысам из населённых пунктов Европейской части России (Москва, Московская обл., Тульская область, Калужская область, Орловская область, Ростовская область, г. Санкт-Петербург, Калининградская область, Мурманская область), Сибири (Тюменская область, Забайкальский край), Зауралья (Оренбургская область) и Дальнего Востока (Приморский край, Хабаровский край, Еврейская автономная область, Амурская область, Камчатский край). 2. На основе проведённых исследований выявлена филогеографическая структура серых крыс России по отдельным генетическим линиям. Анализ генетической изменчивости был проведен с помощью митохондриального маркера (контрольный регион (D-loop) Несмотря на относительно недавнее заселение территории России серыми крысами, их внутривидовая структура неоднородна и характеризуется разделением на два подвида: R. n. norvegicus и R. n. caraco. Cинантропный подвид R. n. norvegicus заселяет большую часть территории России и представлен европейской и азиатской гаплогруппами. Экзоантропный подвид R. n. caraco обитает преимущественно на Дальнем Востоке и гибридизирует с номинативной синантропной формой. Приспособление отдельных форм серой крысы к разным природным условиям и переход к синантропному образу жизни могли способствовать дифференциации до подвидового уровня. 3. Получены данные по генетической структуре городских популяций серых крыс разных городов (Москва, Чита, г.Ростов-на-Дону) с помощью 13 микросателлитных локусов (D5Rat43, D18Rat116, D20Mit4, D4Rat59, D13Rat21, D11Rat11, D14Rat110, D3Rat159, D8Rat162, D19Rat62, D12Rat49, D10Rat105, D15Rat64). г. Москва. Дискриминантный анализ главных компонент разделяет генотипы изученных особей на четыре основные группы: одну из них образуют крысы из Зеленограда, северо-запада, запада и юга Москвы, остальные – крысы из юго-западной, центральной (зоопарка) и восточной частей города . Г. Чита. Апостериорный анализ результатов кластеризации показал оптимальное подразделение популяции на четыре генетических кластера, о чем свидетельствует максимальная статистика ΔK и максимальные апостериорная вероятность данных, полученные при K = 4. В соответствии с результатами кластеризации особей, две четких генетических группы образуют крысы из центра Читы и из остальной части города (Чита – город). Крысы из пригорода (Антипихи) генетически обособлены от конспецификов из городской черты, но не формируют единой генетической группы, разделяясь на два кластера (не понятно, чем обусловлено, может какая-то семейная структура?). Единственная особь из аэропорта имеет смешанный генетический состав, проявляя сходство с крысами как из Антипихи, так и из центра Читы. г.Ростов-на-Дону. В соответствии с распределением генетических различий наиболее генетически обособлены крысы из пригорода (Арпачин) и из западной части Ростова. Крысы из северной (Тимерничка) и восточной (Кизетеринка) частей Ростова достоверно не отличаются друг от друга. Апостериорный анализ результатов байесовской кластеризации показывает оптимальное подразделение популяции на три кластера (модальное значение ΔK получено при K = 3). При этом наибольшая апостериорная вероятность данных соответствует числу кластеров K = 6. Результаты кластеризации при K = 3 соответствуют результатам анализа FST, подтверждая генетические отличия крыс из Арпачина и из западной части Ростова и высокое сходство крыс из районов Кизетеринка и Темерничка. 4. Проанализирована генетическая структура серых крыс из регионов Дальнего Востока. Всего исследовано 47 образов R. norvegicus из разных регионов Дальнего Востока России: Владивосток, Приморский край (две особи из Пограничного района в анализах генетической структуры популяции обозначены как “Приморье-1”, особь из Дальнереченского района – как “Приморье-2”), Еврейская автономная область (ЕАО), Хабаровский край (в том числе Комсомольск-на-Амуре), Амурская обл. Среди них 14 особей из Приморского края и ЕАО фенотипически определены как подвид R. norvegicus coraco. Наибольший уровень генетического разнообразия, как по гетерозиготности, так и по аллельному разнообразию, выявлен у крыс ЕАО. Невысокий, но статистически достоверный, коэффициент инбридинга зарегистрирован у крыс из Владивостока. Наиболее генетически обособлены крысы из Хабаровского края, различия между ними и остальными выборками примерно вдвое больше, чем между крысами из Владивостока и ЕАО. 5. Проведена оценка полимофизма гена VCORC1 (эпоксид-редуктазы Витамина К) по наличию или отсутствию однонуклеотидных (SNP) мутаций из регионов населенных пунктов России, ранее не исследованных. Выявлена новая мутация в гене VCORC1- Tyr139Phe в Ивановской области. Гомозиготная мутация связана с устойчивостью серых крыс к антикоагулянтам 1го и 2го поколения (бромадиалон). Найдены новые точки (10) с обнаружением мутации Tyr 139 Ser в г.Москве 6. Участие в конференции с международным участием, посвященной юбилею академика Б.Л. Астаурова «Генетика и индивидуальное развитие» 29–31 октября 2024 г. и Школы-конференции «Генетические модификации и анализ генома клеток» 31 октября – 1 ноября 2024 г. Москва, ИБР РАН. 7. Публикация статьи в журналах : Доклады Академии Наук и Живые и биокостные системы Генетика по филогеографической структуре серых крыс и резистентности серых крыс по гену эпоксидредуктазы VCORC1. Подготовлены материалы для публикации в журналах : Генетика,Mamalian genom и Дезинфекционое дело.