КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 23-74-10081

НазваниеМеханизмы регуляции метаболома микроводорослей при решении биотехнологических задач: филогенетический, экологический, географический, транзиентный, мультиомиксный аспекты

Руководитель Мальцев Евгений Иванович, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева Российской академии наук , г Москва

Конкурс №85 - Конкурс 2023 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-102 - Ботаника

Ключевые слова водоросли, омикс-технологии, многомерная статистика, филогения, коллекция культур, голодание, азот, фосфор, антиоксидантная активность, витамины, жирные кислоты, общие липиды, пигменты, ферменты

Код ГРНТИ62.09.00, 62.09.39, 69.25.15


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Микроводоросли обладают высоким биотехнологическим потенциалом, но недостаточная рентабельность производств ограничивает использование их биомассы. Для решения этой проблемы используются различные стратегии, в том числе, связанные с поиском штаммов с наилучшими биохимическими характеристиками или изменением условий культивирования и абиотического стрессирования, которые обеспечат увеличение продуктивности и стимулирование синтеза ценных метаболитов. Однако, противоречивость выводов, относительно направленности метаболических перестроек у микроводорослей в ответ на действие того или иного стрессора как на уровне филогенетических групп, так и на уровне отдельных видов или штаммов одного вида, не позволяет разрабатывать общие алгоритмы биотехнологического скрининга и прогнозировать возможные результаты культивирования со стрессированием. Это значительно снижает эффективность работ в данном направлении, несмотря на его высокую актуальность и востребованность в практической сфере. Реализация данного проекта поможет сформировать новую концепцию биотехнологического скрининга микроводорослей и цианобактерий на основании выяснения многомерной природы механизмов регуляции метаболома (на примере липидов, жирных кислот, каротиноидов) микроводорослей с учетом филогенетических, экологических, географических и транзиентных аспектов во время использования абиотических стрессоров. Обозначенная цель предусматривает решение ряда конкретных задач, предполагающих проведение экспериментальных исследований по изучению особенностей изменения содержания липидов, каротиноидов и состава жирных кислот при ограничении азотного и фосфорного питания со штаммами и видами микроводорослей, представляющих различные филогенетические линии (Chlorophyta, Heterokontophyta, Cyanobacteria) и экологические группы (морские, пресноводные, почвенные) и последующее перекрёстное сравнение и верификацию закономерностей с использованием подходов многомерной статистики. Также будет осуществлена оценка изменения синтеза исследуемых ценных метаболитов у видов и штаммов микроводорослей в пределах одной филогенетический линии и экологической группы, но с различным географическим происхождением; в пределах штаммов одного вида, выделенных из различных биотопов, а также штаммов одного вида, поддерживаемых в условиях альгологических коллекций в течении разного времени. В ходе исследований планируется осуществить сопоставление изменений в содержании липидов, хлорофилла-а, каротиноидов и составе жирных кислот с изменением антиоксидантного статуса штаммов и видов микроводорослей под действием абиотического стресса (ограничения азота и фосфора в питательной среде). Таким образом в результате выполнения проекта планируется получить новые данные о таких характеристиках метаболома, как содержание липидов, каротиноидов, α-токоферола, ретинола, составе жирных кислот видов и штаммов микроводорослей; сделать вывод о значимости филогенетических, экологических данных и данных о географическом происхождении штамма и времени, прошедшего после его выделения из природного биотопа и культивирования в режиме поддержания коллекционной культуры для усовершенствования подходов при скрининге штаммов микроводорослей с высоким биотехнологическим потенциалом. Будет проанализирована целесообразность выделения новых информационных омикc слоев в практике биотехнологических исследований микроводорослей: экоомики (eco-Omics), связанной с экологическими условиями биотопов, геоомики (geo-Omics), характеризующей биогеографические аспекты происхождения штамма, редоксомики (redox-Omics), соотносимой с ферментами и низкомолекулярными соединениями антиоксидантной системы клетки и таймомики (time-Omics), связанной со временем лабораторного культивирования штамма в отличных от типичных для его природного биотопа условиях и возможными транзиентными эффектами.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

Публикации

1. Мальцев Е.И., Куликовский М.С., Мальцева С.Ю. Nitrogen and phosphorus stress as a tool to induce lipid production in microalgae Microbial Cell Factories, V. 22., P. 239. (год публикации - 2023)
10.1186/s12934-023-02244-6

2. Мальцева И.А., Мацюра А.В., Гурова Т.Ю., Черкашина С.В., Мальцев Е.И. Fatty acid profiles in different phylogenetic and ecological groups of microalgae Acta Biologica Sibirica, Т. 10, С. 275–289 (год публикации - 2024)
10.5281/zenodo.11063206

3. Миронов А.В., Глущенко А.М., Мальцев Е.И., Генкал С.И., Кузнецова И.В., Коциолек Д.П., Лиу Я., Куликовский М.С. Reassessment of pore occlusion in some diatom taxa with re-evaluation of Placoneis Mereschkowsky (Bacillariophyceae: Cymbellales) and description of two new genera PeerJ, 12, e17278 (год публикации - 2024)
10.7717/peerj.17278

4. Мальцева И.А., Яковийчук А.В., Мальцева С.Ю., Черкашина С.В., Куликовский М.С., Мальцев Е.И. Biochemical and antioxidant characteristics of Chlorococcum oleofaciens (Chlorophyceae, Chlorophyta) under various cultivation conditions Plants, 13, 17, 2413 (год публикации - 2024)
10.3390/plants13172413


Аннотация результатов, полученных в 2025 году
За отчетный период (июль 2024 г. – июнь 2025 г.) вся запланированная экспериментальная работа выполнена в полном объеме. Второй год реализации проекта был посвящен многомерной оценке механизмов регуляции метаболома микроводорослей из отдела Heterokontophyta с учетом филогенетических, экологических, географических, транзиентных и мультиомиксных аспектов для решения биотехнологических задач. По результатам проекта опубликовано 2 научные статьи в изданиях, индексируемых в системах цитирования Web of Science и Scopus, входящих в первый квартиль (Q1) и принадлежащих к 1 уровню «Белого списка» научных журналов: PeerJ и Plants. Достигнутые результаты представлены 8 докладами на 2-х международных и 1-й всероссийской научных конференциях. Описанию биохимических и антиоксидантных свойств микроводоросли из рода Chlorococcum в различных условиях выращивания (DOI: 10.3390/plants13172413) посвящено 8 публикаций в ведущих новостных агентствах, в т.ч. Научная Россия (https://scientificrussia.ru/articles/stress-zastavil-mikrovodorosli-iz-samarskogo-lesa-sintezirovat-bolse-lipidov-i-vitaminov), Indicator (https://indicator.ru/biology/stress-zastavil-mikrovodorosli-iz-samarskogo-lesa-sintezirovat-bolshe-lipidov-i-vitaminov-09-09-2024.htm), Поиск (https://poisknews.ru/biologiya/bogatyj-potenczial-stress-zastavil-mikrovodorosli-iz-samarskogo-lesa-sintezirovat-bolshe-lipidov-i-vitaminov/) и др. Проведена морфологическая и молекулярно-генетическая ревизия диатомовых водорослей из рода Placoneis (DOI: 10.7717/peerj.17278). На основании обнаруженного в панцире нового типа поровых окклюзий, псевдотектулюма, в роде Placoneis оставлено только 4 валидно описанных вида. Остальные виды, у которых окклюзии представлены тектулюмом, перенесены в новый род – Witkowskia. Всего обосновано 168 новых номенклатурных комбинаций. Важно, что предложенная классификация согласуется с ранее опубликованными и новейшими филогенетическими реконструкциями. Полученные результаты важны для понимания разнообразия и распространения диатомовых водорослей из порядка Cymbellales, а также предлагают для них более подробную таксономию, основанную на выделении монофилетических групп. В ходе эксперимента с градиентом изменений условий питательного голодания (ограничений азота и фосфора) проанализированы изменения ключевых характеристик метаболома (содержание липидов, хлорофиллов и их предшественников, каротиноидов, α-токоферола, ретинола, белка и состава жирных кислот) и активности антиоксидантной системы 50 штаммов водорослей из отдела Heterokontophyta, представляющих почвенные, пресноводные и солоноводные экологические группы. Установлено, что повышение доступности азота и фосфора в питательных средах приводит к снижению концентрации хлорофилла у большинства изученных штаммов. Это особенно выражено для представителей родов Vischeria, Pleurochloris, Navicula и подтверждается отрицательными корреляционными связями. Для штаммов пресноводных диатомовых водорослей было зафиксировано уменьшение содержания предшественников и продуктов распада хлорофилла при увеличении концентрации азота и фосфора в среде. Показано, что при снижении или полном отсутствии азота и фосфора общее количество каротиноидов возрастает, а их состав смещается в сторону ксантофиллов. Отмечена прямая зависимость содержания липидов от концентрации фосфора в среде для большинства штаммов Heterokontophyta. Установлено, что фосфорный стресс приводит к более существенным изменениям состава жирных кислот по сравнению с азотным. Определена сильная зависимость содержания α-токоферола от уровня азота и фосфора в питательных средах. Повышение концентрации фосфора в среде для штаммов Vischeria и Witkowskia сопровождалось снижением уровня α-токоферола, исключением были штаммы Pleurochloris и Pseudocharaciopsis. Содержание ретинола было напрямую связано с доступностью азота в среде культивирования, в то время как реакция на фосфор являлась более специфичной. В ходе исследований выявлены новые закономерности, которые свидетельствуют о снижении уровня вторичных продуктов распада липидов при увеличении концентрации азота в среде. Также было установлено, что повышение содержания фосфора приводит к снижению интенсивности пероксидного окисления липидов и уменьшению накопления ТБК-активных продуктов, за исключением Pleurochloris и Pseudocharaciopsis и некоторых штаммов Vischeria. Зафиксировано, что у большинства исследованных штаммов диатомовых водорослей устойчивость к индуцированному пероксидному окислению возрастает при увеличении доступности азота и фосфора. Для антиоксидантной активности не выявлено стабильной взаимосвязи с концентрацией азота и фосфора – в большинстве случаев изменения носили индивидуальный характер для каждого штамма. Активность ферментов антиоксидантной защиты (каталазы, супероксиддисмутазы, глутатионпероксидазы) у штаммов Eustigmatophyceae была прямо пропорциональна доступности азота и фосфора в среде культивирования. Штаммы Xanthophyceae и центрические Bacillariophyceae продемонстрировали прямую зависимость активности SOD от концентрации азота. Активность CAT также коррелировала с азотом у всех штаммов, кроме Pseudocharaciopsis и Nitzschia, а активность GPx – во всех случаях, кроме Pleurochloris и Pseudocharaciopsis. Повышение концентрации фосфора оказывало меньшее влияние на активность ферментов антиоксидантной защиты, чем азот. С точки зрения антиоксидантной активности, для обеспечения биосинтеза вторичных метаболитов в условиях дефицита азота, установлена ценность штаммов с повышенной устойчивостью к пероксидному окислению: V. vischeri MZ–E3, MZ–E4, MZ–E8 и MZ–Ch18. В условиях дефицита фосфора обосновано использование штаммов V. calaminaris MZ–E6, Stephanocyclus meneghiniana М418 и М100, для которых рассчитан высокий показатель коэффициента антиоксидантной активности. В целом для получения ценных биопродуктов на фоне повышенной антиоксидантной устойчивости в условиях нехватки азота и/или фосфора, из всей изученных штаммов Heterokontophyta наиболее целесообразно использовать V. calaminaris MZ–E6 и V. vischeri MZ–E8 – для производства каротиноидов; Pseudocharaciopsis ovalis MZ–Е5 и V. vischeri MZ–E3 – для синтеза липидов; V. vischeri MZ–E4 – для получения белка; V. calaminaris MZ–E6 и V. stellata MZ–E7 – для получения α-токоферола. Анализ полученных результатов методом главных компонент показал, что сила взаимосвязи между содержанием разных метаболитов в биомассе, количеством азота и фосфора в питательной среде, их соотношением, интенсивностью света и временем культивирования для почвенных, пресноводных и солоноводных водорослей трех классов Heterokontophyta (Eustigmatophyceae, Xanthophyceae и Bacillariophyceae) разная и отражает специфику их метаболических стратегий в ответ на изменение условий культивирования.

 

Публикации

1. Мальцев Е.И., Куликовский М.С., Мальцева С.Ю. Nitrogen and phosphorus stress as a tool to induce lipid production in microalgae Microbial Cell Factories, V. 22., P. 239. (год публикации - 2023)
10.1186/s12934-023-02244-6

2. Мальцева И.А., Мацюра А.В., Гурова Т.Ю., Черкашина С.В., Мальцев Е.И. Fatty acid profiles in different phylogenetic and ecological groups of microalgae Acta Biologica Sibirica, Т. 10, С. 275–289 (год публикации - 2024)
10.5281/zenodo.11063206

3. Миронов А.В., Глущенко А.М., Мальцев Е.И., Генкал С.И., Кузнецова И.В., Коциолек Д.П., Лиу Я., Куликовский М.С. Reassessment of pore occlusion in some diatom taxa with re-evaluation of Placoneis Mereschkowsky (Bacillariophyceae: Cymbellales) and description of two new genera PeerJ, 12, e17278 (год публикации - 2024)
10.7717/peerj.17278

4. Мальцева И.А., Яковийчук А.В., Мальцева С.Ю., Черкашина С.В., Куликовский М.С., Мальцев Е.И. Biochemical and antioxidant characteristics of Chlorococcum oleofaciens (Chlorophyceae, Chlorophyta) under various cultivation conditions Plants, 13, 17, 2413 (год публикации - 2024)
10.3390/plants13172413