Сравнительное метагеномное исследование микробиома углеродного цикла в регионах вечной мерзлоты на полуострове Ямал и Цинхай-Тибетском нагорье

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 24-44-00006

НазваниеСравнительное метагеномное исследование микробиома углеродного цикла в регионах вечной мерзлоты на полуострове Ямал и Цинхай-Тибетском нагорье

Руководитель Абакумов Евгений Васильевич, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет" , г Санкт-Петербург

Конкурс №86 - Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований международными научными коллективами» (NSFC)

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-108 - Почвоведение

Ключевые слова многолетнемерзлые породы, криогенные почвы, микробиом, органическое вещество, Ямальский регион, Цинхай-Тибетское плато

Код ГРНТИ68.05.00

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
В криолитозоне депонировано около половины глобального почвенного органического углерода, она играет непропорционально большую роль в потенциальных климатических изменениях. Ямальский регион и Цинхай-Тибетское плато являются типичными высокоширотными и высокогорными регионами распространения многолетнемерзлых пород (ММП), и в обоих регионах темпы потепления примерно в два раза превышают среднемировые. Потепление климата ускоряет темпы деградации ММП, вызывает трансформацию экосистем, при этом усиливая микробное разложение органического углерода и высвобождение парниковых газов. Однако микробные механизмы разложения органического вещества до сих пор остаются слабоизученными, что представляет собой серьезное препятствие для прогнозирования влияния процессов высвобождения углерода мерзлотной толщи на изменение климата. Исследования микроорганизмов в мерзлотных почвах направлены на выявление связей и механизмов микробных циклов углерода и азота, приводящих к изменению климата. Несмотря на множество предыдущих работ, обобщающих реакцию микробного сообщества на потепление климата, многие из этих исследований сосредоточены на локальных или региональных масштабах без сопоставления результатов в глобальном географическом масштабе. В данном проекте в качестве объектов исследования будет выбраны районы распространения многолетнемерзлых пород с различными гидротермическими характеристиками и типами почвенного покрова. Будет изучатся весь почвенный профиль - от активного слоя до многолетнемерзлых пород. Будут определены физико-химические показатели почв, а затем, с помощью сравнительного метагеномного подхода будет изучен генетический потенциал микробных сообществ, а также их функциональное и таксономическое разнообразие. Будут изучены сходства и различия в условиях окружающей среды, которые определяют параметры функционирования микробных сообществ их адаптацию в регионах распространения многолетнемерзлых пород. Международный проект будет способствовать признанию проблем климатически и экологически инициированных процессов деградации ММП в Российской Арктике и на Цинхай-Тибетском нагорье на мировом уровне, а полученные результаты сыграют важную роль в углублении понимания роли микробных сообществ в высвобождении углерода мерзлотной толщи в высокоширотных и в высокогорных регионах распространения многолетнемерзлых пород.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Аннотация результатов, полученных в 2024 году
Российскими и китайскими учеными проведены экспедиционные исследования в Ямальский регионе и на Цинхай-Тибетском плато. В процессе полевых работ были заложены ключевые участки исследований в ландшафтных позициях с различными типами распространения многолетнемерзлых пород и с различной глубиной залегания верхней границы мерзлоты. На ключевых участках были заложены полнопрофильные почвенные разрезы, было установлено таксономическое положение почв по региональным и международным классификациям, исследованы их морфометрические параметры и дано детальное морфологическое описание каждого почвенного профиля. Установлено, что степень гумусированности мелкозема почв большинства почв севера Западной Сибири в несколько раз выше таковой в почвах ключевых участков Цинхай-Тибетского плато, что приводит и к различных величинам запасов органического вещества и ключевых биогенных элементов. С помощью методов спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР) и методов элементного анализа состава вещества была оценена степень стабилизации почвенного органического вещества для основных референсных типов почв Ямальского региона. На молекулярном уровне исследован структурный состав гуминовых кислот, изолированных из данных почв. Исследован минералогический состав почв с помощью рентгендифрактометрического метода, также определен минералогический состав илистой фракции в отдельных почвах. С помощью долгосрочных и экспрессных инкубационных экспериментов, методом биокинетического фракционирования, определено содержание потенциально минерализуемого органического углерода путем аппроксимации кумулятивных кривых продуцирования углекислого газа из почв. С помощью современных протоколов проведена экстракция ДНК из образцов почв различного генезиса. Проведено исследование таксономического состава микробных сообществ почв двух регионов с помощью методов высокопроизводительного секвенирования (HT-NGS). Оценено альфа- и бета разнообразие микробиомов мерзлотных почв Ямальского региона и Цинхай-Тибетского плато, методами многомерной статистики проведен анализ внутренних взаимосвязей таксономического состава микробиоты почв с биотическими и абиотическими параметрами почв. Полученные и ранее опубликованные литературные данные обобщены с помощью мета-анализа, по результатам которого было установлено, что на ключевые почвенно-химические предикторы микробного разнообразия почв Ямальского региона это содержание органического вещества и других биогенных элементов, а для почв исследованной части Цинхай-Тибетского плато — это параметры кислотно-основных свойств и солевой состав почвенного раствора. Таким образом, для щелочных почв северо-восточной части Тибетского нагорья доминирующими филами в составе почвенного микробиома являются Alphaproteobacteria, Chloroflexota и Actinomycetota. Для более кислых почв северо-восточного Китая наиболее распространенными являются Gammaproteobacteria и Acidobacteriota. Для Ямальского региона доминирующими филами являются Proteobacteria и Acidobacteriota, также большая доля в микробной биомассе принадлежит метанобразующим археям Euryarchaeota. Для почв Ямальского региона проведено имитационное моделирование трансформации органического вещества почв, для почв Цинхай-Тибетского плато подготовлены первичные данные и сценарии для моделирования. С помощью методов машинного обучения было проведено картирование численности отдельных микробных таксонов, выявлены основные биотические и абиотические факторы которые необходимо в дальнейшем использовать для построения современных прогностических пространственных моделей почвенного микробиологического разнообразия. О состоянии почвы на Ямале узнал весь мир Статья о состоянии почв на Ямале вышла в научном журнале Geoderma https://yamal-media.ru/news/o-sostojanii-pochvy-na-jamale-uznal-ves-mir Экологи СПбГУ начали мониторинг углеродного следа в почвах на Ямале https://spbu.ru/news-events/novosti/ekologi-spbgu-nachali-monitoring-uglerodnogo-sleda-v-pochvakh-na-yamale

Публикации

1. Абакумов Е., Низамутдинов Т., Костенко И. The Origin and Geography of Brown Forest Soils Land, Abakumov, E.; Nizamutdinov, T.; Kostenko, I. The Origin and Geography of Brown Forest Soils. Land 2024, 13, 1917. https://doi.org/10.3390/land13111917 (год публикации - 2024)
https://doi.org/10.3390/land13111917

2. Низамутдинов Т., Большиянова О., Моргун Е., Абакумов Е. Molecular Composition of Humic Acids and Soil Organic Matter Stabilization Rate of the First Arctic Carbon Measurement Supersite “Seven Larches”. Sustainability, Nizamutdinov, T.; Bolshiianova, O.; Morgun, E.; Abakumov, E. Molecular Composition of Humic Acids and Soil Organic Matter Stabilization Rate of the First Arctic Carbon Measurement Supersite “Seven Larches”. Sustainability 2024, 16, 6673. https://doi.org/10.3390/su16156673 (год публикации - 2024)
https://doi.org/10.3390/su16156673

3. Е.В. Абакумов, К. Джи, С. Янг, С. Ву Ключевые проблемы рекультивации земель в Ямальском регионе Рекультивация нарушенных земель: технологии, эффективность и биоразнообразие: сборник научных трудов всероссийской научно-практической конференции / Министерство науки и высшего образования Российской Федерации, Сибирский государственный индустриальный университет; под общ. ред. В. А. Андроханова. – Новокузнецк: Издательский центр СибГИУ, 2024. – 305 с. DOI:10.31251/conf-2-2024, Е.В. Абакумов, К. Джи, С. Янг, С. Ву. Ключевые проблемы рекультивации земель в Ямальском регионе // Рекультивация нарушенных земель: технологии, эффективность и биоразнообразие: сборник научных трудов всероссийской научно-практической конференции / Министерство науки и высшего образования Российской Федерации, Сибирский государственный индустриальный университет; под общ. ред. В. А. Андроханова. – Новокузнецк: Издательский центр СибГИУ, 2024. – 305 с. DOI:10.31251/conf-2-2024 (год публикации - 2024)
DOI:10.31251/conf-2-2024

4. Низамутдинов Т.И., Темботов Р.Х., Поляков В.И., Кушнов И.Д., Абакумов Е.В. Концентрации тяжелых металлов в криоконитах и почвоподобных телах горных и полярных регионов Горные экосистемы и их компоненты: Материалы IX Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 300-летию Российской академии наук, 35-летию научной школы чл.-корр. РАН А.К. Темботова, 30-летию Института экологии горных территорий им. А.К. Темботова РАН. Нальчик, 2024. 230 с., Низамутдинов Т.И., Темботов Р.Х., Поляков В.И., Кушнов И.Д., Абакумов Е.В. Концентрации тяжелых металлов в криоконитах и почвоподобных телах горных и полярных регионов // Горные экосистемы и их компоненты: Материалы IX Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 300-летию Российской академии наук, 35-летию научной школы чл.-корр. РАН А.К. Темботова, 30-летию Института экологии горных территорий им. А.К. Темботова РАН. Нальчик, 2024. 230 с. (год публикации - 2024)

5. Темботов Р., Абакумов Е Биологическая активность мерзлотных и периодически промерзающих почв в условиях агровоздействия Проблемы и перспективы устойчивого развития почвенного покрова горных и равнинных территорий: материалы Международной конференция (Геленджик, 4–6 июня 2024 г.) / отв. ред. О. С. Безуглова ; Южный федеральный университет. – Ростов-на-Дону; Таганрог : Издательство Южного федерального университета, 2024. – 182 с. ISBN 978-5-9275-4674-9, Темботов Р.Х., Абакумов Е. Биологическая активность мерзлотных и периодически промерзающих почв в условиях агровоздействия // Проблемы и перспективы устойчивого развития почвенного покрова горных и равнинных территорий: материалы Международной конференция (Геленджик, 4–6 июня 2024 г.) / отв. ред. О. С. Безуглова ; Южный федеральный университет. – Ростов-на-Дону; Таганрог : Издательство Южного федерального университета, 2024. – 182 с. ISBN 978-5-9275-4674 (год публикации - 2024)

6. Т. И. Низамутдинов, С. Ю. Евграфова, С. Янг Микробиом мерзлотных почв и грунтов Арктики Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов : Сборник тезисов III Международной конференции, Санкт-Петербург, 08–10 июля 2024 года. – Москва: ООО "Издательство "Перо", 2024. – С. 91. – EDN BQMRVV, Т. И. Низамутдинов, С. Ю. Евграфова, С. Янг / Микробиом мерзлотных почв и грунтов Арктики // Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов : Сборник тезисов III Международной конференции, Санкт-Петербург, 08–10 июля 2024 года. – Москва: ООО "Издательство "Перо", 2024. – С. 91. – EDN BQMRVV. (год публикации - 2024)

7. Вэнцьзюань Вэнь, Евгений Абакумов, Ксяодонг Ву, Джи Шен, Дженьшеньг Ли, Донг Ванг, Хайанг Ксю, Гуимин Лиу, Сиджонг Янг, Вячеслав Поляков, Тимур Низамутдинов, Ксяовень Джи Effects of permafrost collapse on soil carbon, nitrogen, and metal elements on the Qinghai-Tibet Plateau Catena, Wenjuan Wang, Evgeny Abakumov, Xiaodong Wu, Jie Chen, Gensheng Li, Dong Wang, Haiyan Xu, Guimin Liu, Sizhong Yang, Vyacheslav Polyakov, Timur Nizamutdinov, Xiaowen Ji. Effects of permafrost collapse on soil carbon, nitrogen, and metal elements on the Qinghai-Tibet Plateau, CATENA, Volume 246, 2024, 108425, https://doi.org/10.1016/j.catena.2024.108425 (год публикации - 2024)
https://doi.org/10.1016/j.catena.2024.108425

8. Тимур Низамутдинов, Дарья Жемчуева, Алексей Зверев, Евгений Андронов, Александр Печкин, Евгений Абакумов Agropedogenesis and related changes in morphology, fertility and microbiome diversity of soils in cryogenic ecosystems on the example of the central part of Yamal region (West Siberia) Geoderma, Timur Nizamutdinov, Darya Zhemchueva, Aleksei Zverev, Evgeny Andronov, Alexandr Pechkin, Evgeny Abakumov, Agropedogenesis and related changes in morphology, fertility and microbiome diversity of soils in cryogenic ecosystems on the example of the central part of Yamal region (West Siberia), Geoderma, Volume 449, 2024, 117014, https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2024.117014. (год публикации - 2024)
https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2024.117014

9. Ванг В., Низамутдинов Т., Печкин А., Моргун Е., Ли Дж, Ву Кс., Янг С, Абакумов Е. Ecological Status Assessment of Permafrost-Affected Soils in the Nadym Region, Yamalo-Nenets Autonomous District, Russian Arctic Land, Wang, W.; Nizamutdinov, T.; Pechkin, A.; Morgun, E.; Li, G.; Wu, X.; Yang, S.; Abakumov, E. Ecological Status Assessment of Permafrost-Affected Soils in the Nadym Region, Yamalo-Nenets Autonomous District, Russian Arctic. Land 2024, 13, 1406. https://doi.org/10.3390/land13091406 (год публикации - 2024)
https://doi.org/10.3390/land13091406

10. Сиджонг Янг, Кси Вень, Ксяодонг Ву, Еонгуа Вуб Ксяолинг Ли, Евгений Абакумов, Хуиждун Джин Biogeographic patterns shape the bacterial community beyond permafrost gradients Environmental research letters, Sizhong Yang, Xi Wen, Xiaodong Wu, Tonghua Wu, Xiaoying Li, Evgeny Abakumov and Huijun Jin Biogeographic patterns shape the bacterial community beyond permafrost gradients // Environmental research letters, 2024 DOI 10.1088/1748-9326/ad8fbd (год публикации - 2024)
10.1088/1748-9326/ad8fbd

11. Низамутдинов Т.И., Моргун Е.Н., Печкин А.С., Абакумов Е.В. Морфогенез и некоторые химические характеристики залежных агропочв в окрестностях города Салехард (Ямало-Ненецкий автономный округ) Почвы – опора России: тезисы докладов IX съезда Общества почвоведов им. В.В. Докучаева (Казань, 12-16 августа 2024 г.). /Отв. ред.: П.В. Красильников, Н.О. Ковалева, Е.М. Столпникова. – Москва-Казань: МАКС-Пресс. 2024. 920 с., Низамутдинов Т.И., Моргун Е.Н., Печкин А.С., Абакумов Е.В. Морфогенез и некоторые химические характеристики залежных агропочв в окрестностях города Салехард (Ямало-Ненецкий автономный округ) // Почвы – опора России: тезисы докладов IX съезда Общества почвоведов им. В.В. Докучаева (Казань, 12-16 августа 2024 г.). /Отв. ред.: П.В. Красильников, Н.О. Ковалева, Е.М. Столпникова. – Москва-Казань: МАКС-Пресс. 2024. 920 с. (год публикации - 2024)

12. Е.В. Абакумов, Е.Ю. Чебыкина, Вэньзюань Вэнь, Сиджонг Янг, Сяодун Ву, С.Ю. Евграфова Органическое вещество и состав микробиома почв антропогенных экосистем криолитозоны Почвы – опора России: тезисы докладов IX съезда Общества почвоведов им. В.В. Докучаева (Казань, 12-16 августа 2024 г.). /Отв. ред.: П.В. Красильников, Н.О. Ковалева, Е.М. Столпникова. – Москва-Казань: МАКС-Пресс. 2024. 920 с., Е.В. Абакумов, Е.Ю. Чебыкина, Вэньзюань Вэнь, Сиджонг Янг, Сяодун Ву, С.Ю. Евграфова. Органическое вещество и состав микробиома почв антропогенных экосистем криолитозоны // Почвы – опора России: тезисы докладов IX съезда Общества почвоведов им. В.В. Докучаева (Казань, 12-16 августа 2024 г.). /Отв. ред.: П.В. Красильников, Н.О. Ковалева, Е.М. Столпникова. – Москва-Казань: МАКС-Пресс. 2024. 920 с. (год публикации - 2024)

13. Низамутдинов Т.И., Большиянова О.Д., Моргун Е.Н., Абакумов Е.В. Молекулярный состав гуминовых кислот основных типов почв карбонового полигона «Семь лиственниц» «Почвоведение. Горизонты будущего. 2024» Сборник тезисов докладов восьмой конференции молодых ученых Почвенного института им. В.В. Докучаева. Москва, 16-20 сентября 2024 г., – М.: Почвенный ин-т им. В.В. Докучаева, 2024. – 300 с., Низамутдинов Т.И., Большиянова О.Д., Моргун Е.Н., Абакумов Е.В. Молекулярный состав гуминовых кислот основных типов почв карбонового полигона «Семь лиственниц» // «Почвоведение. Горизонты будущего. 2024» Сборник тезисов докладов восьмой конференции молодых ученых Почвенного института им. В.В. Докучаева. Москва, 16-20 сентября 2024 г., – М.: Почвенный ин-т им. В.В. Докучаева, 2024. – 300 с. (год публикации - 2024)

Аннотация результатов, полученных в 2025 году
В 2025 году в рамках выполнения работ по проекту проведен комплексный анализ микробиома почв арктических и высокогорных регионов. Проведены две совместные совместных российско-китайские экспедиции в северо-восточную часть Тибетского плато и Ямало-Ненецкий автономный округ. Были заложены почвенные разрезы, получены сведения об основных почвообразующих процессах в регионах и отобраны дополнительные образцы почв. Ключевым достижением стал метаанализ данных секвенирования ДНК, выделенной из 730 образцов мерзлотных почв, охватывающих территории Западной Сибири, севера Европейской части России, Полярного Урала, Восточной Сибири, северо-восточного Китая и Цинхай-Тибетского плато. Установлено, что в микробных сообществах мерзлотных почв доминируют представители четырех филумов: Pseudomonadota, Acidobacteriota, Actinomycetota и Bacteroidota, составляющие в совокупности 89% от общего состава микробного сообщества. Анализ бета-разнообразия выявил четкую географическую структуру микробных сообществ: образцы с Цинхай-Тибетского плато образовали когерентный кластер с высокой внутрирегиональной схожестью, тогда как северо-восточный Китай характеризовался сниженным видовым богатством микробиома. Для ямальских почв детально изучено вертикальное распределение микроорганизмов по профилю. На уровне филумов в таксономическом составе микробиома доминировали Proteobacteria (26,6%), Acidobacteriota (16,7%) и Actinobacteriota (12,9%). Была выявлена специфическая реакция микробных сообществ на антропогенное воздействие: в недавно возделанных почвах отмечалось повышенная численность Proteobacteria (до 37,5%), тогда как в залежных почвах наблюдалось увеличение доли Acidobacteriota (до 19,1%) и Verrucomicrobiota. Сетевой анализ микробиомов почв Западной Сибири выявил четыре основных модуля микробных сообществ, вносящих вклад от 11,8 до 88,5% в общую численность микроорганизмов. Представители модуля M1 проявляли повышенную встречаемость в сельскохозяйственных и карьерных почвах, что указывает на их адаптацию к антропогенно нарушенным условиям. Создана и отправлена на регистрацию база данных «SoilSeqYAMAL», объединяющая метаданные о почвенных образцах с данными секвенирования ДНК (по вариабельной области гена 16s рРНК на платформе Illumina MiSEQ) и химическими характеристиками почв Ямало-Ненецкого автономного округа. База включает информацию по 11 наборам данных с географическими координатами, классификацией почв, типом природной зоны и химическими характеристиками. Эта база станет основой для исследований микробного разнообразия арктических почв, мониторинга последствий изменения климата и экологического контроля нефтегазовых регионов. Проведено исследование активности микроорганизмов при различных температурах окружающей среды в почвах Ямальского региона. Выявлена положительная корреляция между содержанием органического углерода и коэффициентом Q₁₀ (r = 0,66), что указывает на повышенную уязвимость богатых углеродом почв к потеплению климата. Максимальные значения потенциально минерализуемого углерода зафиксированы в верхних органогенных горизонтах почв. Проведен биогеохимический анализ супрагляциальных отложений и перигляциальных почв Северного Тянь-Шаня и Центрального Кавказа. Установлено, что значения субстрат-индуцированного дыхания существенно превышали базальное дыхание (до 8 раз), что указывает на высокий потенциал микробных сообществ к быстрому отклику на поступление лабильных биогенных элементов. При этом содержание цинка в почвах часто превышало ПДК более чем в 2 раза (макс. 114 мг/кг), что может представлять потенциальную опасность для функционирования микробиоценозов. Дополнительно выполнено пространственное прогнозирование содержания почвенного органического углерода на территории России с использованием методов машинного обучения, с особым акцентом на интерпретируемость модели. Прогностическая модель показала удовлетворительную точность (R² = 0.39, RMSE = 70.03 г/кг). Сгенерированная карта содержания углерода продемонстрировала четкий градиент снижения содержания углерода с севера на юг, с максимумом в Западной Сибири.

Публикации

1. Темботов Р., Гангапшев А., Гежаев А, Абакумов Е. Specific Activity of Radionuclides in Cryoconite Sediments of Glaciers of the Central Caucasus (Tsey, Skazka, Bezengi), Russia Earth, Tembotov, R., Gangapshev, A., Gezhaev, A., & Abakumov, E. (2025). Specific Activity of Radionuclides in Cryoconite Sediments of Glaciers of the Central Caucasus (Tsey, Skazka, Bezengi), Russia. Earth, 6(2), 60. https://doi.org/10.3390/earth6020060 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.3390/earth6020060

2. Иван Кушнов, Рустам Темботов, Тимур Низамутдинов и Евгений Абакумов Influence of Trace Elements Translocation from Cryoconite on Local Soil Pollution Level at the Mount Elbrus Region Çiner, A., et al. Recent Research on Environmental Earth Sciences, Geomorphology, Soil Science, Paleoclimate, and Karst. MedGU 2023. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-031-86866-5_34, Kushnov, I., Tembotov, R., Nizamutdinov, T., Abakumov, E. (2025). Influence of Trace Elements Translocation from Cryoconite on Local Soil Pollution Level at the Mount Elbrus Region. In: Çiner, A., et al. Recent Research on Environmental Earth Sciences, Geomorphology, Soil Science, Paleoclimate, and Karst. MedGU 2023. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-031-86866-5_34 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.1007/978-3-031-86866-5_34

3. Е. В. Абакумов, В. И. Поляков, Т. И. Низамутдинов, Д. Ю. Власов, Б. Р. Мавлюдов ОРГАНИЧЕСКОЕ ВЕЩЕСТВО ПОЧВ И КРИОКОНИТОВ ЛЕДНИКОВ ЗАПАДНОГО ШПИЦБЕРГЕНА Комплексные исследования природы Шпицбергена и прилегающего шельфа – 2025: Тез. докл. XVI Междунар. науч. конф., посвященной 100-летию вступления в силу договора о Шпицбергене (г. Мурманск, 23–24 октября 2025 г.). Апатиты: Изд-во ФИЦ КНЦ РАН, 2025., Е. В. Абакумов, В. И. Поляков, Т. И. Низамутдинов, Д. Ю. Власов, Б. Р. Мавлюдов. Комплексные исследования природы Шпицбергена и прилегающего шельфа – 2025: Тез. докл. XVI Междунар. науч. конф., посвященной 100-летию вступления в силу договора о Шпицбергене (г. Мурманск, 23–24 октября 2025 г.). Апатиты: Изд-во ФИЦ КНЦ РАН, 2025. с. 13-14. (год публикации - 2025)
10.37614/978.5.91137.550.8

4. Иван Кушнов, Рустам Темботов, Евгений Абакумов Role of supraglacial sediments in redistribution of nutrients at the alpine environment: a case study from the Central Caucasus, Russia Catena, Ivan Kushnov, Rustam Tembotov, Evgeny Abakumov, Role of supraglacial sediments in redistribution of nutrients at the alpine environment: a case study from the Central Caucasus, Russia, CATENA, Volume 262, 2026, 109622, https://doi.org/10.1016/j.catena.2025.109622. (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.1016/j.catena.2025.109622

5. Донг, Юнхиа, Гуимин Лиу, Xиаодонг Ву, Лин Ванг, Хаиян Xу, Сижонг Янг, Тонгхуа Ву, Евгений Абакумов, Йун Жао, Xингюан Цуи, Spatiotemporal Variations in Compound Extreme Events and Their Cumulative and Lagged Effects on Vegetation in the Northern Permafrost Regions from 1982 to 2022 Remote Sensing, Dong, Yunxia, Guimin Liu, Xiaodong Wu, Lin Wang, Haiyan Xu, Sizhong Yang, Tonghua Wu, Evgeny Abakumov, Jun Zhao, Xingyuan Cui, and et al. 2025. "Spatiotemporal Variations in Compound Extreme Events and Their Cumulative and Lagged Effects on Vegetation in the Northern Permafrost Regions from 1982 to 2022" Remote Sensing 17, no. 1: 169. https://doi.org/10.3390/rs17010169 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.3390/rs17010169

6. Е.А. Иванова, А.Р. Сулейманов, Д.А. Никитин, М.В. Семенов, Е.В. Абакуомв Machine learning-based mapping of Acidobacteriota and Planctomycetota using 16 S rRNA gene metabarcoding data across soils in Russia Scientific Reports, Ivanova, E.A., Suleymanov, A.R., Nikitin, D.A. et al. Machine learning-based mapping of Acidobacteriota and Planctomycetota using 16 S rRNA gene metabarcoding data across soils in Russia. Sci Rep 15, 23763 (2025). https://doi.org/10.1038/s41598-025-08050-x (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.1038/s41598-025-08050-x

7. Низамутдинов Тимур, Сиджонг Янг, Ксяодонг Ву, Владислав Гуржий, Евгений Абакумов Multivariate Insight into Soil OrganicMatter Dynamics in Subarctic Abandoned Farmland by the Chronosequence Approach Agronomy, Nizamutdinov, T.; Yang, S.; Wu, X.; Gurzhiy, V.; Abakumov, E. Multivariate Insight into Soil Organic Matter Dynamics in Subarctic Abandoned Farmland by the Chronosequence Approach. Agronomy 2025, 15, 893. https://doi.org/10.3390/agronomy15040893 (год публикации - 2025)

8. Юнхиа Донг, Гуимин Лиу, Xиаодонг Ву, Лин Ванг, Сиджонг Янг, Тонгхуа Ву, Ксяодонг Xу, Евгены Абакумов, Йун Жао, Xингюан Цуи, Меикьюи Шао Spatiotemporal variations of extreme climate and their effects on vegetation growth in the northern permafrost regions during 1982–2022 Catena, Yunxia Dong, Guimin Liu, Xiaodong Wu, Lin Wang, Sizhong Yang, Tonghua Wu, Haiyan Xu, Evgeny Abakumov, Jun Zhao, Xingyuan Cui, Meiqi Shao, Spatiotemporal variations of extreme climate and their effects on vegetation growth in the northern permafrost regions during 1982–2022, CATENA, Volume 260, 2025, 109420, ISSN 0341-8162, https://doi.org/10.1016/j.catena.2025.109420. (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.1016/j.catena.2025.109420.

9. Т. И. Низамутдиновa, Е. В. Абакумов, Р. М. Халитов, В. В. Гуржий МИКРОСТРОЕНИЕ И МИНЕРАЛОГИЧЕСКИЙ СОСТАВ СТАРОПАХОТНЫХ МЕРЗЛОТНЫХ ПОЧВ ЯМАЛЬСКОЙ ОПЫТНОЙ АГРОСТАНЦИИ (САЛЕХАРД, ЯНАО) Почвоведение (Eurasian Soil Science), МИКРОСТРОЕНИЕ И МИНЕРАЛОГИЧЕСКИЙ СОСТАВ СТАРОПАХОТНЫХ МЕРЗЛОТНЫХ ПОЧВ ЯМАЛЬСКОЙ ОПЫТНОЙ АГРОСТАНЦИИ (САЛЕХАРД, ЯНАО) // ПОЧВОВЕДЕНИЕ, 2025, № 12, с. 1863–1877. DOI: 10.7868/S3034561825120145 (год публикации - 2025)
DOI: 10.7868/S3034561825120145

10. Е.В. Абакумов ПРОБЛЕМЫ ДИНАМИКИ, СОХРАНЕНИЯ И УПРАВЛЕНИЯ ЭКОСИСТЕМ ПЕРИГЛЯЦИАЛЬНОЙ ЗОНЫ В УСЛОВИЯХ СТРЕМИТЕЛЬНОЙ ДЕГЛЯЦИАЦИИ Экологическая безопасность и сохранение генетических ресурсов растений и животных России и сопредельных территорий: материалы XV Всероссийской научной конференции с международным участием / под ред. докт. биол. наук, проф. Хетагурова Х.М. – [Электронный ресурс] Электрон. текстовые дан. – Владикавказ: ИПЦ Сев. Осет. гос. ун-т им. К. Л. Хетагурова, 2025., Е.В. Абакумов ПРОБЛЕМЫ ДИНАМИКИ, СОХРАНЕНИЯ И УПРАВЛЕНИЯ ЭКОСИСТЕМ ПЕРИГЛЯЦИАЛЬНОЙ ЗОНЫ В УСЛОВИЯХ СТРЕМИТЕЛЬНОЙ ДЕГЛЯЦИАЦИИ // Экологическая безопасность и сохранение генетических ресурсов растений и животных России и сопредельных территорий: материалы XV Всероссийской научной конференции с международным участием / под ред. докт. биол. наук, проф. Хетагурова Х.М. – [Электронный ресурс] Электрон. текстовые дан. – Владикавказ: ИПЦ Сев. Осет. гос. ун-т им. К. Л. Хетагурова, 2025. с. 395-400 (год публикации - 2025)

11. Абакумов Е.В., Турдалиев А., Юлдашев Г., Сулейманов Р.Р. ЗАСОЛЕННЫЕ ПОЧВЫ РОССИИ И УЗБЕКИСТАНА: МОРОФЛОГИЯ, ГЕНЕЗИС И АГРОЭКОЛОГИЧЕСКИЕ ПРОБЛЕМЫ Atrof muhit muhofazasi, iqlim о‘zgarishi, degradatsiyaga uchragan tuproqlar unumdorligini oshirishda innovatsion texnologiyalar mavzusidagi Xalqaro ilmiy-amali konferensiyasi ma’ruzalar to‘plami 22 aprel-Xalqaro Yer Kuni, Абакумов Е.В., Турдалиев А., Юлдашев Г., Сулейманов Р.Р. ЗАСОЛЕННЫЕ ПОЧВЫ РОССИИ И УЗБЕКИСТАНА: МОРОФЛОГИЯ, ГЕНЕЗИС И АГРОЭКОЛОГИЧЕСКИЕ ПРОБЛЕМЫ. Atrof muhit muhofazasi, iqlim о‘zgarishi, degradatsiyaga uchragan tuproqlar unumdorligini oshirishda innovatsion texnologiyalar mavzusidagi Xalqaro ilmiy-amali konferensiyasi ma’ruzalar to‘plami 22 aprel-Xalqaro Yer Kuni. pp. 516-521. (год публикации - 2025)

12. Е.В. Абакумов МЕТОДИЧЕСКИЕ И ТЕРМИНОЛОГИЧЕСКИЕ ПРОБЛЕМЫ В ИЗУЧЕНИИ ОРГАНИЧЕСКОГО ВЕЩЕСТВА КРИОГЕННЫХ ПОЧВ Проблемы криосферы Земли [Электронное издание]: сборник тезисов Всероссийской научной конференции (Пущино, Россия, 12-16 мая, 2025 г.) / отв. ред.: А.В. Лупачев, А.А. Абрамов. – Пущино: ИФХиБПП РАН, 2025. – 323 с., Е.В. Абакумов. МЕТОДИЧЕСКИЕ И ТЕРМИНОЛОГИЧЕСКИЕ ПРОБЛЕМЫ В ИЗУЧЕНИИ ОРГАНИЧЕСКОГО ВЕЩЕСТВА КРИОГЕННЫХ ПОЧВ // Проблемы криосферы Земли [Электронное издание]: сборник тезисов Всероссийской научной конференции (Пущино, Россия, 12-16 мая, 2025 г.) / отв. ред.: А.В. Лупачев, А.А. Абрамов. – Пущино: ИФХиБПП РАН, 2025. с. 265-266. (год публикации - 2025)

13. Т.И. Низамутдинов АГРОХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА ХРОНОСЕРИЙНОГО РЯДА АГРОГЕННО-ПРЕОБРАЗОВАННЫХ МЕРЗЛОТНЫХ ПОЧВ Материалы Международной научной конференции XXVIII Докучаевские молодежные чтения «Информационная емкость знаний о почве» / Под ред. Б.Ф. Апарина. – СПб., 2025. – 234 стр., Т.И. Низамутдинов. АГРОХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА ХРОНОСЕРИЙНОГО РЯДА АГРОГЕННО-ПРЕОБРАЗОВАННЫХ МЕРЗЛОТНЫХ ПОЧВ // Материалы Международной научной конференции XXVIII Докучаевские молодежные чтения «Информационная емкость знаний о почве» / Под ред. Б.Ф. Апарина. – СПб., 2025. с. 157-158. (год публикации - 2025)

14. И.Д. Кушнов, Р.Х. Темботов, И.О. Нехаев, Е.В. Абакумов НАКОПЛЕНИЕ И МИГРАЦИЯ ТЯЖЕЛЫХ МЕТАЛЛОВ В СИСТЕМЕ «ЛЕДНИК – ПОЧВА» НА ПРИМЕРЕ ДВУХ ГОРНЫХ УЩЕЛИЙ С РАЗЛИЧНОЙ АНТРОПОГЕННОЙ НАГРУЗКОЙ Проблемы геохимической экологии в условиях техногенеза биосферы : материалы XIV Международной Биогеохимической школы-конференции, г. Томск, 15–20 сентября 2025 г. / под ред. Н.В. Баранов-ской, Н.С. Безаевой, Б.Р. Соктоева, В.А. Сафонова. – Томск : STT, 2025. – 710 с., И.Д. Кушнов, Р.Х. Темботов, И.О. Нехаев, Е.В. Абакумов. Проблемы геохимической экологии в условиях техногенеза биосферы : материалы XIV Международной Биогеохимической школы-конференции, г. Томск, 15–20 сентября 2025 г. / под ред. Н.В. Барановской, Н.С. Безаевой, Б.Р. Соктоева, В.А. Сафонова. – Томск : STT, 2025. с. 440-442. (год публикации - 2025)

15. Xиаоыинг Фан, Ксяаодонг Ву,· Дейинцуо Ма, · Тонгхуа Ву, · Гуимин Лиу, · Хаиян Xу, · Дефу Зоу, · Гуойие Ху, · Ядонг Лиу ,· Xианхуа Веи, · Xучун Ян, · Ёнгxианг Лиу,· Сиджонг Янг, · Евгений Абакумов Land cover types and depth regulate carbon and nitrogen cycle functional genes in permafrost regions on the Qinghai‑Tibet Plateau Plant and Soil, Xiaoying Fan, Xiaodong Wu,· Dejincuo Ma, · Tonghua Wu, · Guimin Liu, · Haiyan Xu, · Defu Zou, · Guojie Hu, · Yadong Liu ,· Xianhua Wei, · Xuchun Yan, · Yongxiang Liu,· Sizhong Yang, · Evgeny Abakumov. Land cover types and depth regulate carbon and nitrogen cycle functional genes in permafrost regions on the Qinghai-Tibet Plateau. Plant Soil 514, 1507–1525 (2025). https://doi.org/10.1007/s11104-025-07472-w (год публикации - 2025)
doi.org/10.1007/s11104-025-07472-w

16. Абакумов Е., Печкин А., Коузов С., Кравчук А. Soils of the Settlements of the Yamal Region (Russia): Morphology, Diversity, and Their Environmental Role Applied Sciences, Abakumov, E., Pechkin, A., Kouzov, S., & Kravchuk, A. (2025). Soils of the Settlements of the Yamal Region (Russia): Morphology, Diversity, and Their Environmental Role. Applied Sciences, 15(15), 8569. https://doi.org/10.3390/app15158569 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.3390/app15158569

17. Низамутдинов Т., Янг С., Абакумов Е. Post-Agricultural Shifts in Soils of Subarctic Environment on the Example of Plaggic Podzols Chronosequence Agronomy, Nizamutdinov, T.; Yang, S.; Abakumov, E. Post-Agricultural Shifts in Soils of Subarctic Environment on the Example of Plaggic Podzols Chronosequence. Agronomy 2025, 15, 584. https://doi.org/10.3390/agronomy15030584 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.3390/agronomy15030584

18. Иван Кушнов, Иван Нехаев и Евгений Абакумов Glacial–Periglacial Biogeochemical Dynamics in Alpine Ecosystems of the Northern Tian Shan under Climate Change and Anthropogenic Load Ecosystems, Kushnov, I., Nekhaev, I. & Abakumov, E. Glacial–Periglacial Biogeochemical Dynamics in Alpine Ecosystems of the Northern Tian Shan under Climate Change and Anthropogenic Load. Ecosystems 28, 65 (2025). https://doi.org/10.1007/s10021-025-01016-0 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.1007/s10021-025-01016-0

19. Р. Тамботов, Е. Абакумов МЕТОДИЧЕСКИЕ ПОДХОДЫ К СОЗДАНИЮ ИНТЕРАКТИВНЫХ КАРТОГРАФИЧЕСКИХ МОДЕЛЕЙ ПОЧВЕННЫХ ПОКАЗАТЕЛЕЙ* Международная конференция «Водосбор-река-устье: исследования эрозии почв, русловых и устьевых процессов» и XL совещание Межвузовского научно-координационного Совета по проблеме эрозионных, русловых и устьевых процессов при МГУ: сборник тезисов (г. Ростов-на-Дону, 15–18 сентября 2025 г.) / Под ред. Чалова С.Р., Панченко Е.Д., Голосова В.Н., Манджиевой С.С., Минкиной Т.М., Сушковой С.Н., Чалова Р.С.; Южный федеральный ун-т и Южный научный центр РАН. Ростов-на-Дону, 2025. 226 с., Р.Х. Темботов, Е.В. Абакумов. МЕТОДИЧЕСКИЕ ПОДХОДЫ К СОЗДАНИЮ ИНТЕРАКТИВНЫХ КАРТОГРАФИЧЕСКИХ МОДЕЛЕЙ ПОЧВЕННЫХ ПОКАЗАТЕЛЕЙ // Международная конференция «Водосбор-река-устье: исследования эрозии почв, русловых и устьевых процессов» и XL совещание Межвузовского научно-координационного Совета по проблеме эрозионных, русловых и устьевых процессов при МГУ: сборник тезисов (г. Ростов-на-Дону, 15–18 сентября 2025 г.) / Под ред. Чалова С.Р., Панченко Е.Д., Голосова В.Н., Манджиевой С.С., Минкиной Т.М., Сушковой С.Н., Чалова Р.С.; Южный федеральный ун-т и Южный научный центр РАН. Ростов-на-Дону, 2025. с. 156-157. (год публикации - 2025)

20. Е.В. Абакумов, Е.А. Иванова, М.В. Семенов, Д.А. Никитин, А.Р. Сулейманов ЦИФРОВАЯ КАРТА МИКРОБИОМА ПОЧВ РОССИИ Сборник тезисов IV Международной конференции СОХРАНЕНИЕ И ПРЕУМНОЖЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ МИКРООРГАНИЗМОВ». — Москва: Издательство Перо, 2025. — 1,8 Мб. Электронное издание, Е.В. Абакумов, Е.А. Иванова, М.В. Семенов, Д.А. Никитин, А.Р. Сулейманов ЦИФРОВАЯ КАРТА МИКРОБИОМА ПОЧВ РОССИИ // Сборник тезисов IV Международной конференции СОХРАНЕНИЕ И ПРЕУМНОЖЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ МИКРООРГАНИЗМОВ». — Москва: Издательство Перо, 2025. — 1,8 Мб. Электронное издание, с. 67. (год публикации - 2025)

21. Т.И. Низамутдинов, Е.В. Абакумов ЭКОТОКСИКОЛОГИЧЕСКОЕ СОСТОЯНИЕ ПОЧВ РАЗНОВОЗРАСТНЫХ ЗАЛЕЖНЫХ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ ЗЕМЕЛЬ НА ТЕРРИТОРИИ ЯМАЛО-НЕНЕЦКОГО АВТОНОМНОГО ОКРУГА Экобиотех-2025. Материалы VIII Всероссийской конференции с международным участием, г. Уфа 1-4 октября 2025 г. Электрон. текст. данные (1 файл: 2,84 Мб). – Уфа: УИБ УФИЦ РАН, 2025. 183 с., Т.И. Низамутдинов, Е.В. Абакумов. ЭКОТОКСИКОЛОГИЧЕСКОЕ СОСТОЯНИЕ ПОЧВ РАЗНОВОЗРАСТНЫХ ЗАЛЕЖНЫХ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ ЗЕМЕЛЬ НА ТЕРРИТОРИИ ЯМАЛО-НЕНЕЦКОГО АВТОНОМНОГО ОКРУГА // Экобиотех-2025. Материалы VIII Всероссийской конференции с международным участием, г. Уфа 1-4 октября 2025 г. Электрон. текст. данные (1 файл: 2,84 Мб). – Уфа: УИБ УФИЦ РАН, 2025. c. 122. (год публикации - 2025)
10.31163/978-5-6047532-2-4

22. В. Ван, Е. В. Абакумов, Т. И. Низамутдинов, А. С. Печкин РАСПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ МИКРОЭЛЕМЕНТОВ В КРИОГЕННЫХ ПОЧВАХ НАДЫМСКОГО РАЙОНА ЯНАО Проблемы криосферы Земли [Электронное издание]: сборник тезисов Всероссийской научной конференции (Пущино, Россия, 12-16 мая, 2025 г.) / отв. ред.: А.В. Лупачев, А.А. Абрамов. – Пущино: ИФХиБПП РАН, 2025. – 323 с., В. Ван, Е. В. Абакумов, Т. И. Низамутдинов, А. С. Печкин. РАСПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ МИКРОЭЛЕМЕНТОВ В КРИОГЕННЫХ ПОЧВАХ НАДЫМСКОГО РАЙОНА ЯНАО // Проблемы криосферы Земли [Электронное издание]: сборник тезисов Всероссийской научной конференции (Пущино, Россия, 12-16 мая, 2025 г.) / отв. ред.: А.В. Лупачев, А.А. Абрамов. – Пущино: ИФХиБПП РАН, 2025. с. 269. (год публикации - 2025)

23. Низамутдинов Т.И., Чебыкина Е.Ю., Кимеклис А.К., Абакумов Е.В. «База первичных данных секвенирования ДНК почв Ямало-Ненецкого автономного округа и их химических свойств» (SoilSeqYAMAL), номер заявки № EA-172087 от 02-12-2025 «База первичных данных секвенирования ДНК почв Ямало-Ненецкого автономного округа и их химических свойств» (SoilSeqYAMAL), номер заявки № EA-172087 от 02-12-2025, «База первичных данных секвенирования ДНК почв Ямало-Ненецкого автономного округа и их химических свойств» (SoilSeqYAMAL), номер заявки № EA-172087 от 02-12-2025 (год публикации - 2026)

24. Ван В., Абакумов Е. В., Ву С., Ли Г. Вертикальное профильное распределение углерода, азота и металлов в криогенных почвах и породах центральной части Цинхай-Тибетского плато Живые и биокосные системы, Ван В., Абакумов Е. В., Ву С., Ли Г., Вертикальное профильное распределение углерода, азота и металлов в криогенных почвах и породах центральной части Цинхай Тибетского плато // «Живые и биокосные системы». – 2025. – № 52; URL: https://jbks.ru/archive/issue-52/article-1; DOI: 10.18522/2308-9709-2025-52-1 (год публикации - 2025)
DOI: 10.18522/2308-9709-2025-52-1

25. Т.И. Низамутдинов, Е.В. Абакумоов АГРОЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА ПОЧВ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ УГОДИЙ ЯМАЛО-НЕНЕЦКОГО АВТОНОМНОГО ОКРУГА ЭКОГИДРОМЕТ – НОВЫЕ ГОРИЗОНТЫ: сборник трудов IV Международной молодежной научно-практической конференции «Экологические и гидрометеорологические проблемы больших городов и промышленных зон», 13-14 марта 2025 года / под редакцией В.Л. Михеева, Д.К. Алексеева; Российский государственный гидрометеорологический университет. – Санкт-Петербург: РГГМУ, 2025. – 199 с., Т.И. Низамутдинов, Е.В. Абакумов. АГРОЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА ПОЧВ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ УГОДИЙ ЯМАЛО-НЕНЕЦКОГО АВТОНОМНОГО ОКРУГА. ЭКОГИДРОМЕТ – НОВЫЕ ГОРИЗОНТЫ Сборник трудов IV Международной молодежной научно-практической конференции «Экологические и гидрометеорологические проблемы больших городов и промышленных зон» 13-14 марта 2025 года c. 7-9 (год публикации - 2025)

26. Т.И. Низамутдинов, Е.В. Абакумов ВЛИЯНИЕ КЛИМАТИЧЕСКИХ УСЛОВИЙ НА СИСТЕМУ ПОЧВЕННОГО ОРГАНИЧЕСКОГО ВЕЩЕСТВА АГРОГЕННЫХ И ПОСТАГРОГЕННЫХ ПОЧВ ЯМАЛО-НЕНЕЦКОГО АВТОНОМНОГО ОКРУГА Проблемы криосферы Земли [Электронное издание]: сборник тезисов Всероссийской научной конференции (Пущино, Россия, 12-16 мая, 2025 г.) / отв. ред.: А.В. Лупачев, А.А. Абрамов. – Пущино: ИФХиБПП РАН, 2025. – 323 с., Т.И. Низамутдинов, Е.В. Абакумов. . ВЛИЯНИЕ КЛИМАТИЧЕСКИХ УСЛОВИЙ НА СИСТЕМУ ПОЧВЕННОГО ОРГАНИЧЕСКОГО ВЕЩЕСТВА АГРОГЕННЫХ И ПОСТАГРОГЕННЫХ ПОЧВ ЯМАЛО-НЕНЕЦКОГО АВТОНОМНОГО ОКРУГА. Проблемы криосферы Земли [Электронное издание]: сборник тезисов Всероссийской научной конференции (Пущино, Россия, 12-16 мая, 2025 г.) / отв. ред.: А.В. Лупачев, А.А. Абрамов. – Пущино: ИФХиБПП РАН, 2025. с. 281. (год публикации - 2025)