КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 24-75-00165

НазваниеАнализ динамических изменений функционального коннектома мозга человека при обеспечении деятельности: разработка и валидация методов на основе крупномасштабного моделирования мозговой активности

Руководитель Машарипов Руслан Сулайманович, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт мозга человека им. Н.П. Бехтеревой Российской академии наук , г Санкт-Петербург

Конкурс №97 - Конкурс 2024 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-106 - Нейробиология

Ключевые слова Функциональная магнитно-резонансная томография, функциональная связность, функциональный коннектом мозга человека, нейровизуализация, модель нейронной массы Уилсона-Кована

Код ГРНТИ34.03.23


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Устройство системной организации головного мозга человека является одной из неразрешенных проблем современной науки о мозге. Исследования импульсной активности отдельных нейронных популяций показали, что целенаправленная деятельность человека обеспечивается распределенными в пространстве и принципиально динамичными во времени корково-подкорковыми системами, состоящих из звеньев различной степени жесткости, определяемой частотой их вовлечения в данный тип деятельности (Бехтерева, 1974, Медведев, 1987). При этом на макроуровне до сих пор малоизвестно, как именно организованы с системной точки зрения динамические взаимодействия между областями мозга при обеспечении различных видов целенаправленной деятельности. Построение коннектома головного мозга человека – полного описания структурных и функциональных связей – стало одним из крупнейших научных проектов в области нейронаук за последние два десятилетия. Изучение коннектома мозга человека позволит значительно расширить наше понимание системной организации работы мозга и обеспечения высших психических функций в норме и при патологии. Несмотря на активное развитие коннектомики в последние годы, остается нерешенным целый ряд дискуссионных вопросов относительно выбора методов анализа динамических изменений функциональных связей головного мозга человека, а также их принципиальных ограничений. Отсутствие стандартного подхода к анализу функционального коннектома мозга человека при выполнении деятельности является серьезным препятствием в изучении интегративной деятельности мозга человека. В частности, до сих пор ведутся дискуссии относительно принципиальной возможности определять быстрые изменения синхронизации нейронных осцилляций, обусловленные кратковременной синаптической пластичностью порядка сотен миллисекунд при учете того, что фМРТ-сигнал зависит от сверхмедленных гемодинамических колебаний и, как правило, регистрируется с низким временным разрешением порядка двух секунд. В наиболее полном и обширно цитируемом на сегодняшний день исследовании по сравнению существующих методов анализа контекстно-зависимых функциональных связей (Cisler et al., 2014) использовались биофизически неправдоподобные симуляции, игнорирующие осцилляторную природу мозговой активности, возникающую в результате взаимодействия между множеством возбуждающих и тормозных нейронных популяций. Для решения этой проблемы нами была разработана крупномасштабная модель мозговой активности на основе уравнений Уилсона-Кована, применявшаяся ранее только для симуляции нейронной активности и фМРТ-сигнала в состоянии покоя (Deco et al., 2009). Созданная нами новая модель позволяет контролировать структуру связей в зависимости от условия реализации тестового задания с помощью динамического изменения синаптических весов между моделируемыми нейронными популяциями. В рамках проекта впервые планируется разработать два новых корреляционных метода анализа контекстно-зависимых функциональных связей, которые будут превосходить существующие аналоги. Планируется определение принципиальных ограничений метода фМРТ в обнаружении быстрых контекстно-зависимых изменений функциональных связей. Впервые будет оценена возможность определения направления потока информации (направления взаимовлияний) между областями мозга в процессе реализации деятельности с помощью регрессионных методов контекстно-зависимых функциональных связей. Будет предложен новый методический подход для оценки отношения сигнал-шум при анализе контекстно-зависимых изменений функциональных связей на основе эмпирических данных и крупномасштабного моделирования мозговой активности. На основе полученных результатов будет разработано программное обеспечение для определения минимально необходимого размера выборки и длительности сканирования. В результате реализации проекта, будет разработано новое программное обеспечение с удобным графическим интерфейсом и возможностью параллельного анализа больших объемов данных фМРТ.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2025 году
Настоящий проект посвящен проблеме построения функционального коннектома головного мозга человека при обеспечении различных видов деятельности. Данное научное направление требует разработки эффективных методов анализа контекстно-зависимых функциональных связей (КЗФС) на основе данных функциональной магнитно-резонансной томографии (фМРТ) во время выполнения тестовых заданий. Для решения данной проблемы, нами было разработано два новых метода анализа КЗФС, проведена валидация ранее не тестировавшихся методов анализа КЗФС, а также проведено сравнение чувствительности всех существующих методов анализа КЗФС на основе эмпирических данных фМРТ и биофизически реалистичных крупномасштабных симуляций мозговой активности. В результате нами были впервые валидированы и сопоставлены четыре класса методов анализа КЗФС: генерализированная форма корреляционного метода психофизиологических взаимодействий (gcPPI), модифицированные корреляционные методы психофизиологических взаимодействий (mod-scPPI и mod-gcPPI), метод взвешенных корреляций и взвешенный метод наименьших квадратов (wCorr и WLS), а также метод общих линейных моделей для временных серий ребер графа (Edge-wise GLMs). Все перечисленные методы способны определять истинный паттерн изменения КЗФС, однако, только модификация корреляционных метод психофизиологических взаимодействий, обладают высокой чувствительностью для всех типов экспериментальных дизайнов (блоковых и дискретных). Таким образом, методы mod-scPPI и mod-gcPPI, впервые предложенные в рамках настоящей работы, могут использоваться в качестве корреляционной альтернативы ранее предложенным регрессионным методам sPPI (Friston et al., 1997) и gPPI (McLaren et al., 2012). При этом важно отметить, что метод взвешенных корреляций (wCorr), ранее использовавшийся в десятках работ, опубликованных в рецензируемых научных журналах, обладает значительно более низкой чувствительностью к обнаружению изменений КЗФС и, на основании полученных нами данных, не может быть рекомендован к использованию при анализе данных фМРТ. Кроме этого, показано, что новый перспективный метод Edge-wise GLMs, предложенный в 2024 году двумя независимыми группами исследователей (Jones et al., 2024; Rasero et al., 2024), обладает такой же низкой чувствительностью, как и метод wCorr и также не рекомендуется для анализа КЗФС на основе данных фМРТ. За отчетный период нами также изучался вопрос относительно предельных возможностей впервые в мировой практике тестируемых методов КЗФС в обнаружении кратковременных контекстно-зависимых изменений нейронной синхронизации на основе сверхмедленных осцилляций BOLD-сигнала. На основе симуляций с варьирующей задержкой гемодинамического ответа (от 3.5 до 8 секунд в соответствии с эмпирическими данными) было продемонстрировано, что не смотря на медлительность гемодинамических процессов, модифицированный корреляционный метод психофизиологических взаимодействий (mod-gcPPI) способен определять быстрые изменения КЗФС в пробах длительностью порядка 100 мс, даже при регистрации данных с разрешением 2 секунды (наиболее распространенное временное разрешение в фМРТ исследованиях). Для того, чтобы выявлять быстрые изменения КЗФС методу требуется довольно большое количество предъявлений на один стимул (более 100 штук). Помимо этого, для впервые тестируемых методов было подтверждено, что высокая вариабельность гемодинамических процессов значительно снижает чувствительность к обнаружению КЗФС, особенно при быстром предъявлении стимулов (менее 1 секунды). Наиболее устойчивыми к гемодинамической вариабельности оказались ранее валидированные методы, основанные на корреляции амплитуд индивидуальных гемодинамических ответов (методы корреляции бета серий, BSC-LSS и BSC-FRR), эффективно работающие только для дискретных (event-related) дизайнов. При этом межстимульный интервал оказывает незначительное влияние на чувствительность всех методов КЗФС: избегать следует только очень коротких (менее 2 секунд) межстимульных интервалов из-за наложения гемодинамических ответов и проблемы мультиколлинеарности. Суммируя вышесказанное, в случае использования блоковых дизайнов фМРТ-исследований, рекомендуется использование генерализованного метода психофизиологических взаимодействий с деконволюцией в регрессионной форме (gPPI) или корреляционной форме (Mod-gcPPI), предложенной в рамках настоящей работы. В случае высокой гемодинамической вариабельности, рекомендуется использование методов корреляции бета серий (BSC-LSS и BSC-FRR), а также применение дискретных (event-related) дизайнов с большим количеством предъявлений (более 100 на одно условие) и относительно коротким межстимульным интервалом (от 2 с до 6 с): при этом становится возможным определение быстрых изменений синхронизации нейрональной активности порядка 100 мс (изменения синхронизации осцилляций локальных потенциалов в гамма диапазоне). Кроме этого, по возможности, рекомендуется использование скоростных импульсных последовательностей фМРТ, позволяющих сократить временное разрешение до 1 с или 500-700 мс, что значительно повышает чувствительность при анализе КЗФС. Кроме этого, нами была проанализирована принципиальная возможность определения потока информации между областями мозга во время выполнения тестового задания с помощью методов КЗФС. Ранее на основе симуляций с асимметричным изменением синаптических весов в зависимости от контекста, было продемонстрировано, что метод gPPI с применением деконволюции BOLD-сигнала, способен корректно определять направление связей. Главными требованиями для корректного определения потока информации является длительное сканирование одного человека, высокое отношение сигнала к шуму и низкая вариабельность гемодинамических процессов. Однако реальное отношение сигнала к шуму в эмпирических данных практически никогда не известно. В рамках настоящей работы была впервые продемонстрирована возможность корректного определения направления связей с помощью метола gPPI на эмпирических данных с выполнением задания стоп-сигнал из базы данных ИМЧ РАН. В соответствии с электрофизиологическими исследованиями метод gPPI смог выявить причинно-следственное влияние пред-ДМО на первичную моторную кору при успешном подавления действия. Обнаружение данного влияния стало возможным благодаря повышению отношения сигнал шум с помощью двух подходов: устранение не-нейронального шума с помощью разработанного в рамках настоящей работы программного обеспечения «TMFC denoise» (https://github.com/Masharipov/TMFC_denoise), а также использование индивидуальных областей интереса, смещающихся к локальному максимуму мозговой активности, вместо стандартного использования фиксированных областей интереса.

 

Публикации

1. Машарипов Р.С., Дидур М.Д., Чередниченко Д.В., Киреев М.В. ИЗУЧЕНИЕ КОНТЕКСТНО-ЗАВИСИМЫХ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ СВЯЗЕЙ С ПОМОЩЬЮ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ МАГНИТНО-РЕЗОНАНСНОЙ ТОМОГРАФИИ Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова, Том 75, №5, с. 530-552 (год публикации - 2025)
10.31857/S0044467725050037

2. Машарипов Р.С., Корелов М.С., Романов М.И., Киреев М.В. Повышение чувствительности фМРТ анализа контекстно-зависимых функциональных связей с использованием индивидуальных областей интереса СПбГУПТД, Всероссийская научная конференция "Императив академика А.А. Ухтомского - мозг и его самопознание". Тезисы докладов и материалы. Санкт-Петербург, 15-18 апреля 2025 г. - СПБ.: СПбГУПТД. -196. (год публикации - 2025)