КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 25-14-20061
НазваниеПатогенный потенциал микробиома клещей Ставропольского края
Руководитель Волынкина Анна Сергеевна, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Северо-Кавказский федеральный университет" , Ставропольский край
Конкурс №101 - Конкурс 2025 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами» (региональный конкурс)
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-110 - Общая и молекулярная микробиология; вирусология
Ключевые слова Иксодовые клещи, возбудители природно-очаговых инфекций, микроорганизмы, бактерии, вирусы, метагеномное секвенирование, патогенный потенциал, генетическая идентификация
Код ГРНТИ34.25.29
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Ожидаемые результаты
В результате реализации проекта будут получены следующие результаты:
1. Изучен видовой состав микроорганизмов (микробиом) клещей разных видов, встречающихся в Ставропольском крае, оценена доля возбудителей трансмиссивных инфекций человека и животных в структуре микробиома клещей.
2. Оценен уровень инфицированности иксодовых клещей в Ставропольском крае возбудителями трансмиссивных инфекций бактериальной и вирусной природы, актуальных для региона, идентифицированы генетические варианты выявленных возбудителей.
3. Выбраны виды иксодовых клещей, обитающие на территории Ставропольского края, для проведения скрининга на наличие новых видов возбудителей клещевых инфекций различных таксономических групп, на основе анализа опубликованных данных об особенностях экологии выявленных в мире новых патогенных для человека и животных видов бактерий и вирусов.
4. Выполнен скрининг иксодовых клещей на наличие РНК представителей таксномических групп, вирусов, в состав которых входят патогенные для человека и животных виды, способные передаваться клещами (семейств Flavivirudae, Nairoviridae и др.).
Получение новых данных о структуре микробиома иксодовых клещей, обитающих в Ставропольском крае, видах патогенных для человека и животных микроорганизмов, видовом составе эндосимбионтов на основе использования комплекса современных молекулярно-генетических методов позволит в дальнейшем усовершенствовать существующие наборы реагентов для ПЦР диагностики, для повышения их чувствительности и специфичности, а также усовершенствовать тактику планового мониторинга за циркуляцией возбудителей природно-очаговых инфекций.
Факт выявления новых видов патогенных для человека и животных микроорганизмов на территории Ставропольского края приведет к расширению перечня возбудителей для дифференциальной диагностики трансмиссивных клещевых инфекций и повышению эффективности этиологической расшифровки лихорадок неустановленной этиологии. Определение геномных последовательностей новых видов и геновариантов патогенных микроорганизмов позволит разработать наборы реагентов для специфической индикации выявленных возбудителей методом ПЦР и, в дальнейшем провести углубленное изучение особенностей их распространения на территории региона и сопредельных территорий, изучение биологических свойств штаммов и оценку патогенного потенциала.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Аннотация результатов, полученных в 2025 году
Все запланированные на 2025 год задачи в рамках выполнения Проекта «Патогенный потенциал микробиома клещей Ставропольского края» выполнены, получены и проанализированы результаты экспериментальных исследований.
Собрана коллекция иксодовых клещей, относящихся к 5 родам и 12 видам (Dermacentor marginatus, D. reticulatus, Haemaphysalis punctata, Hyalomma marginatum, H. scupense, Ixodes redikorzevi, I. ricinus, Rhipicephalus annulatus, R. bursa, R. rossicus, R. sanquineus, R. turanicus, включающая 1000 пулов.
Проведен скрининг иксодовых клещей методом ПЦР с режиме реального времени на наличие РНК вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, ДНК Coxiella burnetii, Francisella tularensis, Borrelia burgdorferi s.l., Rickettsia sp., Anaplasma phagocytophilum. В результате проведенного исследования в иксодовых клещах на территории Ставропольского края выявлена РНК вируса ККГЛ, ДНК C. burnetii, F. tularensis, B. burgdorferi s.l., Rickettsia sp., A. phagocytophilum, сформирована коллекция пулов иксодовых клещей, положительных на наличие ДНК/РНК возбудителей трансмиссивных клещевых инфекций, включающая 462 пула, для проведения углубленной молекулярно-генетической характеристики возбудителей.
В результате метагеномного секвенирования охарактеризована таксономическая структура микробиома иксодовых клещей видов Hyalomma marginatum, Rhipicephalus turanicus, Dermacentor marginatus, Haemaphysalis punctata и Ixodes redikorzevi. На территории Ставропольского края в пулах иксодовых клещей H. marginatum впервые выявлен вирус Bole tick 4 – новый флавивирус, патогенность которого для человека не изучена.
Таким образом, за отчетный период проведено обширное исследование по выявлению циркулирующих территории Ставропольского края возбудителей трансмиссивных клещевых инфекций. Полученные результаты имеют большое фундаментальное значение для изучения видового состава патогенных микроорганизмов, способных передаваться иксодовыми клещами в Ставропольском крае, а также могут быть использованы при планировании мероприятий по эпизоотологическому обследованию территории Ставропольского края с целью мониторинга за циркуляцией возбудителей клещевых инфекций.