КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 25-24-00351
НазваниеЭпизоотологический мониторинг синдрома белого носа и других грибковых инфекций рукокрылых в Ростовской области
Руководитель Попов Игорь Витальевич, PhD (признаваемый в РФ)
Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Донской государственный технический университет" , Ростовская обл
Конкурс №102 - Конкурс 2025 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-110 - Общая и молекулярная микробиология; вирусология
Ключевые слова рукокрылые, биоразнообразие, Pseudogymnoascus spp., синдром белого носа
Код ГРНТИ34.27.59
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Ожидаемые результаты
Главные ожидаемые результаты проекта:
1. Выполнен эпизоотологический мониторинг распространённости синдрома белого носа (СБН) и других грибковых инфекций у рукокрылых Ростовской области в 2025 и 2026 годах, определены виды летучих мышей Ростовской области наиболее подверженные грибковым инфекциям.
2. Проведена комплексная оценка видового разнообразия рукокрылых на территории Ростовской области, включающая изучение представленности различных видов рукокрылых в естественных и искусственных укрытиях, а также мониторинг видового разнообразия в центре реабилитации ДГТУ.
3. Создана коллекция культур грибов, поражающих рукокрылых, включая Pseudogymnoascus destructans при обнаружении.
4. Проведено высокопроизводительное секвенирование образцов ДНК, сборка и аннотация геномов каузативных агентов грибковых инфекций рукокрылых.
5. Выполнен сравнительный геномный и филогенетический анализ грибов, определены векторы и скорость молекулярной эволюции.
Значимость предполагаемых результатов проекта для развития новой научной тематики:
Результаты проекта имеют фундаментальное значение для углубленного понимания распространения СБН и других грибковых инфекций, на территории Ростовской области. Оценка видового разнообразия рукокрылых создаст базу данных для дальнейших экологических исследований и мониторинга состояния популяций. Эпизоотологическое исследование позволит выявить виды рукокрылых, наиболее подверженные инфекциям, что важно для разработки мер по их защите и сохранению. Полученные результаты будут соответствовать целям Всемирной организации по охране здоровья животных (МЭБ) в рамках программы "Worldwide Monitoring System for Wild Animal Diseases" и представят ценные эпизоотологические данные для юга России.
Практическая значимость заключается в создании коллекции биологического материала, которая будет использоваться для мониторинга и исследований в области микологии и ветеринарной медицины. Высокопроизводительное секвенирование и геномная аннотация позволят в перспективе разработать новые методы контроля грибковых инфекций. Сравнительный геномный анализ и филогенетическое исследование дадут возможность прогнозировать распространение патогенов и адаптировать стратегии борьбы с ними. По результатам выполнения проекта будут получены фундаментальные данные, которые будет возможно напрямую транслировать в практическую ветеринарную деятельность по сохранению рукокрылых, что обосновывает глобальную значимость нашего проекта для здоровьесбережения животных. Результаты проекта могут быть внедрены в других регионах, что повысит общий уровень биологической безопасности и устойчивости экосистем по всей стране.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Аннотация результатов, полученных в 2025 году
В 2025 году в рамках проекта по эпизоотологическому мониторингу синдрома белого носа (СБН) и других грибковых инфекций рукокрылых Ростовской области начаты полевые, лабораторные и аналитические работы, а также получены опережающие фундаментальные результаты по геномике возбудителя СБН и потенциального биоконтрольного агента.
В северной части Ростовской области и на базе центра реабилитации рукокрылых ДГТУ сформирована стартовая база данных о рукокрылых региона. В учёт включено порядка 96 особей четырех видов рукокрылых, для которых задокументированы вид, пол, возрастная группа, тип убежища (естественное или антропогенное) и наличие подозрений на грибковую инфекцию. Эти данные позволяют количественно описать современную структуру сообществ рукокрылых и служат «нулевой точкой» для последующего мониторинга динамики популяций.
Создана коллекция биологического материала: от рукокрылых с признаками поражения кожных покровов отобраны образцы кожи и патагиума (243 образца от 96 особей), сформирована серия контрольных образцов, выделены и культивированы микроскопические грибы (22 изолята), из части культур и биоптатов получены образцы ДНК. Все материалы промаркированы, снабжены метаданными и внесены в электронный каталог, что обеспечивает их использование для микологического и молекулярно-генетического анализа на следующем этапе проекта.
По результатам первичного эпизоотологического анализа установлено, что в обследованных в 2025 году районах Ростовской области признаков активных очагов СБН не выявлено: характерный психрофильный патоген Pseudogymnoascus destructans в исследованных образцах пока не обнаружен. Вместе с тем, у небольшой доли животных 23%) отмечены кожные изменения, а при посеве биоптатов выделены условно-патогенные плесневые грибы рода Penicillium. Это свидетельствует о фоновой обсеменённости кожных покровов рукокрылых психротолерантными микромицетами и подчёркивает необходимость дальнейшего мониторинга и молекулярной характеризации изолятов.
Параллельно выполнен важный комплекс опережающих фундаментальных работ, полностью основанный на открытых геномных данных, напрямую усиливающий научную базу проекта. В статье, опубликованной в журнале Journal of Fungi (Q1), проведён сравнительный митогеномный и функциональный анализ Pseudogymnoascus destructans и родственных психрофильных грибов: построены филогенетические деревья, оценены показатели геномного сходства, реконструированы этапы эволюции линии возбудителя СБН и выполнена подробная функциональная аннотация его генома. В работе, опубликованной в Brazilian Journal of Microbiology, выполнен пангеномный и метаболический анализ штамма Streptomyces albidoflavus SM254 на фоне других штаммов S. albidoflavus, выявлены уникальные метаболические особенности SM254 и сформулированы гипотезы о механизмах его потенциальной анти-P. destructans активности.
Оба исследования проведены на публикуемых референсных геномах (NCBI/RefSeq) и служат опережающим методическим и концептуальным фундаментом для последующего анализа собственных изолятов, полученных в рамках проекта. Важный элемент подхода коллектива — ориентация на принципы открытой науки: основные этапы биоинформатического анализа реализованы в виде воспроизводимых пайплайнов (Snakemake, Python, R), размещённых в открытых репозиториях GitHub.
Основные результаты 2025 года отражены в следующих ресурсах:
– статья в Journal of Fungi (2025): https://www.mdpi.com/2309-608X/11/8/550
– статья в Brazilian Journal of Microbiology (2025): https://link.springer.com/article/10.1007/s42770-025-01740-8
– научно-популярная статья на портале «Биомолекула»: https://biomolecula.ru/articles/okhotniki-za-mikrobami-delo-sm254
– лабораторные журналы и пайплайны анализа данных: https://github.com/PopovIILab/beyondWNS и https://github.com/PopovIILab/AntiPd_SM254
В совокупности эти результаты показывают, что первый этап проекта выполнен: создана база наблюдений и коллекция биоматериала по рукокрылым Ростовской области, уточнены актуальные эпизоотологические риски, а также получены и опубликованы фундаментальные геномные данные о возбудителе СБН и потенциальном биоконтрольном агенте, что создаёт прочную основу для задач второго года.
Публикации
1.
Попов И.В., Тодоров С.Д., Чикиндас М.Л., Венема К., Ермаков А.М., Попов И.В.
Beyond White-Nose Syndrome: Mitochondrial and Functional Genomics of Pseudogymnoascus destructans
Journal of Fungi, 11, 8, 550 (год публикации - 2025)
10.3390/jof11080550
2.
Попов И.В., Чикиндас М.Л., Попов И.В.
Genomic insights into Streptomyces albidoflavus SM254: tracing the putative signs of anti-Pseudogymnoascus destructans properties
Brazilian Journal of Microbiology, 56, 2121–2131 (год публикации - 2025)
10.1007/s42770-025-01740-8