КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 25-24-20046
НазваниеОценка влияния халькоген- и металлосодержащих нанокомпозитов на уровень экспрессии патоген-зависимых (PR) генов культурных растений Сибирского региона при заражении фитопатогенной бактерией Pectobacterium carotovorum
Руководитель Перфильева Алла Иннокентьевна, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук , Иркутская обл
Конкурс №100 - Конкурс 2025 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами» (региональный конкурс)
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-209 - Биотехнология (в том числе бионанотехнология)
Ключевые слова Картофель, соя, PR гены, биотический стресс, наночастицы, нанокомпозиты, марганец, селен, медь, Pectobacterium carotovorum.
Код ГРНТИ62.13.43
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Ожидаемые результаты
1. В результате выполнения Проекта впервые в мире будут получены сведения по влиянию полисахаридных нанокомпозитов селена, нанокомпозитов марганца и нанокомпозитов меди на уровень экспрессии патоген-зависимых (PR) генов в тканях сои и картофеля при биотическом стрессе. Будут получены данные об уровне экспрессии PR генов в контрольных образцах, в исследуемых образцах при заражении растения фитопатогенной бактерией (Pseudomonas carotivorum) и при комбинированном влиянии заражения и обработки растений нанокомпозитами.
2. На основе результатов уровня экспрессии патоген-зависимых (PR) генов будут выявлены наиболее эффективные нанокомпозиты, способствующие повышению устойчивости к растения фитопатогенам. Это позволит высказать предположение о роли нанокомпозитов в адаптации исследуемых растений к биотическому стрессу.
3. Будет исследовано влияние нанокомпозитов на уровень синтеза патоген-зависимых (PR) белков в тканях растений картофеля и сои при биотическом стрессе.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Аннотация результатов, полученных в 2025 году
В ходе эволюции растения сформировали механизмы устойчивости к стрессовым факторам различной природы, в том числе биотическим. Эти механизмы базируются как на наличии конститутивных, так и индуцированных факторов и включают сложную сигнальную сеть, связывающую структурную и биохимическую защиту. Одним из механизмов защиты растений при биотическом стрессе являются антимикробные и связанные с патогенезом (PR) белки, присутствующие в небольших концентрациях в тканях здоровых растений. При взаимодействии с патогеном количество PR-белков может увеличиваться, выступая в качестве первой линии защиты растений. Таким образом, PR-белки играют ключевую роль в защитных реакциях, которые могут снизить негативные эффекты, вызванные фитопатогенами.
Настоящий проект посвящен изучению влияния нанокомпозитов (НК) – веществ состоящих из наночастиц (НЧ) металлов или халькогенов погруженных с помощью химического синтеза в полимерную матрицу природного происхождения, на уровень экспрессии PR генов в тканях сельскохозяйственно-значимых растений. Согласно предварительным исследованиям НК снимали негативные эффекты заражения растений фитопатогенными бактериями, что отражалось на их биометрических и биохимических характеристиках. Однако механизмы такого протекторного эффекта оставались неясными.
В результате работы над Проектом на первом этапе осуществили химический синтез НК. Разработаны и реализованы простые и сохраняющие нативную структуру полисахарида арабиногалактана (АГ) методы синтеза 6 водорастворимых нанокомпозитов на основе АГ (содержащие НЧ Se, биофлавоноидных хелатов Cu и Mn, гидроксида меди, сульфида меди, селенида меди). Также реализован твердофазный механохимический синтез 6 водорастворимых НК полисахарида метилцеллюлозы умеренной молекулярной массы (содержащих НЧ Se, биофлавоноидных хелатов Cu и Mn, гидроксида меди, сульфида меди, селенида меди). Все полученные НК, дающие устойчивые водные растворы и перспективные для дальнейшего использования охарактеризованы методами оптической спектрометрии ультрафиолетового, видимого и инфракрасного диапазонов, а также фотон-корреляционной спектрометрией.
На втором этапе выполнения Проекта осуществляли исследования, посвященные изучению влияния синтезированных НК на уровень экспрессии PR генов в тканях растений при заражении фитопатогенной бактерией. Исследования проводились на модельных системах: растения картофеля in vitro сорта Лукьяновский – фитопатоген Pectabacterium carotovorum (Pcc) и проростки семян сои сорта Иркутской селекции «Саяна» - Pcc. Осуществлен подбор праймеров к PR генам сои и картофеля из литературных источников. Отработана методика выделения РНК из тканей проростков сои, листьев и корней картофеля. Проведено исследование влияния различных видов НК (НК на основе АГ с НЧ Se, НК АГ с НЧ Cu, НК АГ с НЧ Mn, НК АГ с хелатнокоординированными НЧ меди и гидрооксида меди) на уровень экспрессии PR генов в тканях проростков сои сорта «Саяна», выросших из семян сои, подвергнутых заражению фитопатогеном Pcc. Показано, что при заражении семян сои Pcc в тканях проростков не увеличивалась экспрессия генов GmCHIO2, GmPR1-6, GmPR1L, GmPR10 и GmGlyma. В присутствии НК Se/Аг была отмечена тенденция к повышению экспрессии гена GmPR1L как в зараженных, так и в незараженных проростках. Для гена PR1-9 наблюдали выраженное повышение уровня транскриптов для зараженных проростков при обработке НК Se/Аг и НК Mn/Аг относительно его уровня экспрессии без обработки НК. При сравнении уровня транскриптов исследуемых генов при всех вариантах обработки незараженных проростков с зараженными проростками без обработки НК можно видеть, что уровень транскриптов в зараженных проростках во всех случаях ниже или равен уровню транскрипции в незараженных. При заражении и обработке нанокомпозитами уровень транскриптов исследуемых генов (НК Se/Аг НКCuOH/Аг для Glyma, НК Se/Аг для PR1, НК Se/Аг и НК Mn/Аг для PR1-9) был значительно выше не только уровней в зараженных проростках без обработки НК, но и с уровнями в незараженных проростках. Возможно, это отражает активизацию антимикробного ответа в присутствии НК. Полученные результаты могут свидетельствовать о модифицирующем воздействии НК Se/Аг на антимикробный ответ заражённых Pcc проростков сои.
Проведено исследование влияния различных видов НК (НК на основе АГ с НЧ Se, НК АГ с НЧ Cu, НК АГ с НЧ Mn, НК АГ с хелатнокоординированными НЧ меди) на уровень экспрессии PR генов в тканях картофеля in vitro сорта «Лукьяновский», подвергнутых заражению фитопатогеном Pcc. При сравнении уровней транскриптов генов антимикробного ответа в листьях зараженных и незараженных растений картофеля обнаружено, что гены POX, PR3, PR-5-18, PR1, PR2, PR6, PR10 индуцируются в ответ на заражение Pcc в 2 раза и более. Возможно, это отражает дополнительную активизацию антимикробного ответа в присутствии НК в условиях заражения. Таким образом, в присутствии НК для ряда генов мы наблюдаем индукцию экспрессии, характерную для антимикробного ответа при заражении Pcc. Возможно, наблюдавшееся нами ранее повышение устойчивости растений к заражению на уровне морфометрических и биохимических характеристик после обработки НК можно объяснить тем, что сама по себе обработка НК может инициировать ключевые элементы антимикробного ответа на уровне экспрессии PR генов.
Таким образом, в результате выполнения работы над Проектом в первый год были синтезированы НК, охарактеризованы и получены новые интересные данные об их влиянии на уровень экспрессии PR генов культурных растений.
Со ссылкой на грант в 2025 г опубликованы: 1 обзорная статья в журнале Q1, посвященная характеристике фитопатогена Pectobacterium carotovorum и тезисы доклада на международной научной конференции, посвященной генетике растений. Подготовлена рукопись обзорной статьи о влиянии НЧ металлов на растения с составе почвенной экосистемы.
Публикации
1.
Перфильева А.И.,Стрекаловская Е.И., Клушина Н.В., Горбенко И.В., Крутовский К.В.
The Causative Agent of Soft Rot in Plants, the Phytopathogenic Bacterium Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum: A Brief Description and an Overview of Methods to Control It
MDPI (Multidisciplinary Digital Publishing Institute) , Agronomy 2025, 15, 1578. https://doi.org/10.3390/agronomy15071578 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.3390/agronomy15071578
2. Перфильева А.И. Новые подходы для профилактики бактериальных заболеваний сельскохозяйственных растений с использованием инновационных наноструктурируемых биосовместимых веществ Федер. исслед. центр Ин-т цитологии и генетики Сиб. отделения Рос. академии наук; Новосибирский нац. исслед. гос. ун-т. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН,, Тезисы докладов 8-я Международной научной конференции "Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений (PlantGen2025)" (2–5 июля 2025 г., Новосибирск): тезисы докладов / Федер. исслед. центр Ин-т цитологии и генетики Сиб. отделения Рос. академии наук; Новосибирский нац. исслед. гос. ун-т. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2025. 314 с. 163. (год публикации - 2025)