Аннотация результатов, полученных в 2025 году
В 2025 году в рамках проекта был выполнен комплекс научно-исследовательских работ, направленных на изучение связи между биопленкообразованием и множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) у бактерий, циркулирующих в агропромышленном комплексе. Осуществлен целенаправленный отбор и анализ 455 проб от сельскохозяйственных животных (крупный рогатый скот, свиньи) и птицы (куры, индейки, перепела), диких перелетных птиц, а также смывов с объектов животноводческой среды. Сформирована уникальная коллекция клинических изолятов, характеризующая современный микробный пейзаж регионального АПК. Детально изучен состав пристеночной и просветной микробиоты кишечника птиц, выявлены доминирующие таксоны (Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., E. coli) и установлены устойчивые синергические ассоциации между ними. С помощью методов фенотипического анализа выявлен критически высокий уровень распространения штаммов с МЛУ. Более 40 % изолятов Escherichia coli обладали устойчивостью к трём и более классам антибиотиков, с доминированием резистентности к тетрациклинам, бета-лактамам и фторхинолонам. Впервые для региона описаны комплексные профили ассоциативной устойчивости, показывающие тесную связь между резистентностью к фторхинолонам и цефалоспоринам III–IV поколений. Для стафилококков зафиксированы признаки циркуляции метициллин-резистентных штаммов (MRSA). Данные внесены в национальную платформу мониторинга AMRcloud. Экспериментально доказана прямая корреляция биопленкообразования и антибиотикорезистентности. Микроорганизмы, образующие биопленки на поверхностях оборудования, в 1,4 раза чаще проявляли антибиотикорезистентность по сравнению с не образующими биопленку культурами. Проведена модификация стандартного микротитровального теста оценки биопленкообразующей способности. Доказано, что использование красителя сафранина обеспечивает более высокую чувствительность и воспроизводимость, особенно для штаммов со слабой и умеренной адгезивной активностью, оставаясь при этом в сильной корреляции с классическим методом. Впервые на модели клинических изолятов E. coli показана нелинейная зависимость формирования биопленки от нутриентного ограничения. Установлено, что умеренный стресс (разведение питательной среды 1:8-1:32) является индуктором процесса, а выраженный дефицит – его супрессором. Эти данные важны для прогнозирования поведения патогенов в условиях изменяющейся среды животноводческих помещений. Разработан набор для одновременной детекции трех ключевых генов биопленкообразования у E. coli: регуляторных (csgD, fliA) и структурного (bcsA). Установлена практически 100 % распространенность генов-регуляторов csgD и fliA среди изолятов E. coli от сельскохозяйственных животных, что свидетельствует о консервативности генетической основы адгезии и колонизации у циркулирующих штаммов. Высокая встречаемость гена целлюлозосинтазы bcsA (90,6%) указывает на вариабельность потенциала синтеза полисахаридного матрикса. Результаты проекта вносят существенный вклад в понимание экологии и эволюции бактерий в условиях антропогенного давления. Установленные закономерности подтверждают гипотезу о взаимосвязи между способностью к образованию биопленок и комплексной лекарственной устойчивостью, что является ключевым фактором персистенции патогенов. Разработанные методические решения готовы к внедрению в практику научных и диагностических лабораторий.