КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 16-14-00109
НазваниеПоиск, исследования и разработка эффективных биокатализаторов на основе микробных гликозидгидролаз для модификации биологически ценных гликозидов.
Руководитель Кульминская Анна Алексеевна, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение "Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра "Курчатовский институт" , Ленинградская обл
Конкурс №11 - Конкурс 2015 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований по приоритетным тематическим направлениям исследований» (11)
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-209 - Биотехнология (в том числе бионанотехнология)
Ключевые слова Гликозидгидролазы, трансгликозилирование, углеводсодержащие молекулы, методы белковой инженерии, геном, секвенирование, фукоидан, целлюлазы, альфа-L-фукозидаза, арилсульфатаза, целлобиогидролаза.
Код ГРНТИ34.15.15
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект предполагает всесторонние исследования и разработку новых эффективных биокатализаторов. Мы планируем продолжить изучение молекулярных механизмов реакций, катализируемых микробными гликозидгидролазами (реакции гидролиза и трансгликозилирования олиго- и полисахаридов, гликоконьюгатов) для разработки эффективных схем ферментативного получения биологически значимых гликоконьюгатов, востребованных в современных процессах биотехнологии, медицины и фармацевтики.
В рамках проекта планируется решить два основных блока задач.
1. Поиск и характеристика ферментов целлюлоз-деградирующего комплекса для создания альтернатив известным и используемым в современной биотехнологической промышленности целлюлазам. В частности, мы планируем поиск генов целлюлазных ферментов (эндо-глюканаз, целлобиогидролаз, бета-гликозидаз) в геноме Geotrichum candidum 3C, и сравнительный анализ этих генов для последующего детального исследования новых целлюлаз, включающего изучение их биохимических, ферментативных, физико-химических и структурных особенностей. Мы планируем продолжение исследования недавно полученных целлобиогидролаз из других грибных источников, в частности Getrichum candidum и Trichoderma atroviride, вкючающие биохимический и структурный анализ этих ферментов. В рамках этих работ предполагается разработка новых коктейлей ферментов, способных эффективно гидролизовать различные природные целлюлозо-содержащие субстраты.
2. Второй блок задач предполагает исследование физико-химических, структурных и функциональных особенностей ферментов фукоидан-гидролизующего комплекса из Fusarium proliferatum LE1, получение информации о механизме действия этих ферментов, их субстратной специфичности, способности катализировать реакции трансгликозилирования, что крайне важно для гидролиза или синтеза фукозосодержащих соединений. Мы планируем осуществить создание систем экспрессии двух ферментов, являющихся частью фукоидан-гидролизующего комплекса мицелиального гриба Fusarium proliferatum LE1: α-L-фукозидазы и арилсульфатазы. Предполагается исследовать и сравнить свойства двух альфа-L-фукозидаз (мажорную, дикого типа, выделенную из культуральной жидкости фермента и минорную, ген которой предполагается клонировать в дрожжи Pichia pastoris) и дать предварительную характеристику ферменту арилсульфатаза, обнаруженных в мицелиальном грибе F. proliferatum LE1. Мы надеемся, что исследования биохимических свойств ферментов фукоидан-модифицирующего комплекса расширят представления о механизмах действия таких ферментов, в целом, и могут иметь не только теоретический, но и практический интерес. Мы планируем создать: а. системы иммобилизованных ферментов (фукозидаз(ы) и арилсульфатазы) для осуществления мягкого фрагментирования фукоиданов; б. новые противоопухолевые средства на основе образцов фукоиданов различного молекулярного веса и протестировать их свойства на клетках человека.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Борисова А.С., Энейская Е.В., Йана С., Бадино С.Ф., Кари Йе., Аморе А., Карлссон М.,Ханссон Х., Сандгрен М., Химмель М.Е., Вест П., Пэйне К.М., Кульминская А.А., Столберг Йе.
Correlation of structure, function and protein dynamics in GH7 cellobiohydrolases from Trichoderma atroviride, T. reesei and T. harzianum.
Biotechnology for Biofuels, 11:5 (год публикации - 2018)
10.1186/s13068-017-1006-7
2.
Павлов И.Ю., Бобров К.С., Сумачева А.Д., Машарский А.Е., Полев Д.Е., Журишкина Е.В., Кульминская А.А.
Scytalidium candidum 3C is a new name for the Geotrichum candidum Link 3C strain
Journal of Basic Microbiology, 58(10), 883-891 (год публикации - 2018)
10.1002/jobm.201800066
3.
Швецова С.В., Кульминская А.А.
Microbial sulfatases
Moscow University Chemistry Bulletin, 73 (4), 139–151 (год публикации - 2018)
10.3103/S0027131418040090
4.
Павлов И.Ю, Энейская Е.В., Бобров К.С., Полев Д.Е., Иванен Д.Р., Копылов А.Т., Нарыжный С.Н., Кульминская А.А.
Comprehensive analysis of carbohydrate-active enzymes from the filamentous fungus Scytalidium candidum 3C
Biochemistry (Moscow), 83 (11), 1399-1410 (год публикации - 2018)
10.1134/S000629791811010X
5. Иванова Л. А., Швецова С. В., Кульминская А. А. Иммобилизованная альфа-L-фукозидаза из Fusarium proliferatum LE1 в ферментативном синтезе фукоолигосахаридов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 209-210 (год публикации - 2018)
6. Энейская Е.В., Бобров К.С., Кашина М.В., Борисова А.С., Кульминская А.А. Новая эндо-β-1,4-ксиланаза из Scytalidium candidum 3C - эффективный инструмент для синтеза ксилоолигосахаридов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., c. 196-197 (год публикации - 2018)
7. Кульминская А.А. О возможностях микроорганизмов в синтезе/трансформациях углеводсодержащих продуктов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 15-16 (год публикации - 2018)
8. Швецова С.В., Иванова Л.А., Кульминская А.А. Особенности действия α-L-фукозидазы и сульфатазы из нового штамма гриба Fusarium proliferatum LE1 в реакциях гидролиза и синтеза Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 120-121 (год публикации - 2018)
9. Лапина И.М., Журишкина Е.В. Влияние фукоидана из Fucus vesiculosus на клетки Hep G2 и Chang Liver Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 43-44 (год публикации - 2018)
10. Иванова Л. А., Швецова С. В., Кульминская А. А. Ферментативный синтез фукоолигосахаридов иммобилизованной альфа-L-фукозидазой из Fusarium proliferatum LE1 в реакциях трансгликозилирования Неделя Науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием. Институт биомедицинских систем и технологий., с. 79-81 (год публикации - 2018)
11. Иванова Л. А., Швецова С. В., Волокитина М. В., Коржикова-Влах Е. Г., Кульминская А. А. Разработка модели ферментативного синтеза фукоолигосахаридов на основе реакций трансгликозилирования, катализируемых альфа-L-фукозидазой из Fusarium proliferatum LE1 сборник тезисов XIX зимней молодежной школы по биофизике и молекулярной биологии, с. 124-125 (год публикации - 2018)
12. Чеблоков А. А., Кульминская А. А., Бобров К. С. Высокостабильная эукариотическая фукозидаза FFpI, клонированная из Fusarium proliferatum LE1 сборник тезисов XIX зимней молодежной школы по биофизике и молекулярной биологии, c. 186-187 (год публикации - 2018)
13.
Кульминская А.А.
Scytalidium sp., 3C is a promising toolbox for biomass degradation.
Journal of Glycobiology, vol. 7, p. 78 (год публикации - 2018)
10.4172/2168-958X-C2-014
14. Павлов И.Ю., Полев Д.Е., Кульминская А.А. Биоинформатический подход к идентификации криптического вида гриба Сборник тезисов молодежного научного форума "Open science 2016", стр. 10 (год публикации - 2016)
15. Швецова С.В., Бобров К.С., Шабалин К.А., Иванен Д.Р., Устюжанина Н.Е., Нифантьев Н.Э., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Гагкаева Т.Ю., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Высокоактивный комплекс ферментов из Fusarium Proliferatum LE1 в гидролизе фукоолигосахаридов и сульфатированных гликоконьюгатов Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 1, стр. 227 (год публикации - 2016)
16. Бобров К.С., Корбан С.А., Майнскова М.А., Нарыжный С.Н., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Биохимическая характеристика немодифицированной рекомбинантной сульфатазы из Fusarium proliferatum LE1 Acta Naturae, 2017. Спецвыпуск с.136 (год публикации - 2017)
17. Корбан С.А., Бобров К.С., Швецова С.В., Кульминская А.А. Characterization of the first fungal sulfatase isolated from plant-pathogen fungi Fusarium proliferatum The biochemistry and chemistry of biocatalysis, стр. 81 (год публикации - 2016)
18. Кульминская А.А. Filamentous fungi is a promising toolbox for biotechnology Biocatalysis-2017: Fundamentals and Applications, c.62 (год публикации - 2017)
19. Журишкина Е.В., Степанов С.И., Швецова С.В., Кульминская А.А., Лапина И.М. Сравнительный анализ влияния фукоидана из водорослей Fucus vesiculosus и фракций, полученных из него с помощью анионообменной хроматографии, на клетки HeLa G-63, Hep G2 и Chang Liver Цитология, № 2, т. 57 (год публикации - 2017)
20. Швецова С.В. , Нарыжный С.Н. , Копылов А.Т. , Власова О.Л. , Кульминская А.А. Характеристика новой грибной арилсульфатазы из Fusarium proliferatum LE1 Неделя науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием., Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций. Секция "Медицинская физика", с.526 (год публикации - 2017)
21. Энейская Е.В., Иванен Д.Р., Бобров К.С., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Швецова С.В., Кульминская А.А. Исследование гемицеллюлазного комплекса Geotrichum Candidum 3C с использованием тиогликоолигосахаридов Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 2, стр. 46 (год публикации - 2016)
22. Энейская Е.В., Иванен Д.Р., Бобров К.С., Нарыжный С.Н., Майнскова М.А., Павлов И.Ю., Кусакин П., Каргалов А., Борисова А.С., Кульминская А.А. Two approaches for screening and characterization of lignocellulolytic system in microorganisms 19th European Carbohydrate Symposium, c. 435 (год публикации - 2017)
23. Борисова А.С., Энейская Е.В., Бобров К.С., Ибатуллин Ф., Сувамай Я., Пайн К. M., Кульминская А.А., Сандгрен М., Столберг Дж. Sequence, structure and function correlation concepts in the GH7 cellobiohydrolases Biocatalysis-2017: Fundamentals and Applications, с.46 (год публикации - 2017)
24. Энейская Е.В., Павлов И.Ю., Полев Д.Е., Иванен Д.Р., Сумачева А.Д., Журишкина Е.В., Бобров К.С. , Нарыжный С.Н., Згода В.Г. , Швецова С.В., Кульминская А.А. Идентификация и исследование мицелиального гриба Scytalidium sp. (бывш. Geotrichum Candidum 3C) - эффективного продуцента ферментов гемицеллюлазного комплекса XVIII Зимняя молодежная школа по биофизике и молекулярной биологии, с.73 (год публикации - 2017)
25.
Корбан С.А., Бобров К.С., Майнскова М.А., Нарыжный С.Н., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А.
Heterologous expression in Pichia pastoris and biochemical characterization of the unmodified sulfatase from Fusarium proliferatum LE1
Protein Engineering, Design&Selection: PEDS, 30(7):477-488 (год публикации - 2017)
10.1093/protein/gzx033
26. Корбан С.А., Бобров К.С., Швецова С.В., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Получение и характеристика рекомбинантной арилсульфатазы мицелиального гриба Fusarium Proliferatum LE1 Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 2, с. 223 (год публикации - 2016)
27. Сумачева А.Д., Журишкина Е.В., Кульминская А.А. Морфологическая идентификация криптического вида гриба Сборник тезисов молодежного научного форума "Open science 2016", стр.37 (год публикации - 2016)
28. Журишкина Е.В., Степанов С.И., Лапина И.М., Кульминская А.А. Сравнительный анализ влияния на клетки Hep G 2 И Chang liver нативного и низкомолекулярных фукоиданов из бурых водорослей Fucus vesiculosus Неделя науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием., Высшая школа биотехнологии и пищевых технологий. Секция "Актуальные проблемы прикладной биотехнологии", с.33 (год публикации - 2017)
29.
Швецова С.В., Шабалин К.А., Бобров К.С., Иванен Д.Р., Устюжанина Н.Е., Нифантьев Н.Э., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Энейская Е.В., Кульминская А.А.
Characterization of a new α-L-fucosidase isolated from Fusarium proliferatum LE1 that is regioselective to α-(1→4)-L-fucosidic linkage in the hydrolysis of α-L-fucobiosides
Biochimie, Biochimie 132C (2017) pp. 54-65 (год публикации - 2017)
10.1016/j.biochi.2016.10.014
30. Лапина И.М., Журишкина Е.В., Степанов С.И., Кульминская А.А. Cytotoxic effect of native fucoidans and their fractions obtained by anion-exchange chromatography on cancer and non-malignant mammalian cells 19th European Carbohydrate Symposium, c.566 (год публикации - 2017)
Публикации
1.
Борисова А.С., Энейская Е.В., Йана С., Бадино С.Ф., Кари Йе., Аморе А., Карлссон М.,Ханссон Х., Сандгрен М., Химмель М.Е., Вест П., Пэйне К.М., Кульминская А.А., Столберг Йе.
Correlation of structure, function and protein dynamics in GH7 cellobiohydrolases from Trichoderma atroviride, T. reesei and T. harzianum.
Biotechnology for Biofuels, 11:5 (год публикации - 2018)
10.1186/s13068-017-1006-7
2.
Павлов И.Ю., Бобров К.С., Сумачева А.Д., Машарский А.Е., Полев Д.Е., Журишкина Е.В., Кульминская А.А.
Scytalidium candidum 3C is a new name for the Geotrichum candidum Link 3C strain
Journal of Basic Microbiology, 58(10), 883-891 (год публикации - 2018)
10.1002/jobm.201800066
3.
Швецова С.В., Кульминская А.А.
Microbial sulfatases
Moscow University Chemistry Bulletin, 73 (4), 139–151 (год публикации - 2018)
10.3103/S0027131418040090
4.
Павлов И.Ю, Энейская Е.В., Бобров К.С., Полев Д.Е., Иванен Д.Р., Копылов А.Т., Нарыжный С.Н., Кульминская А.А.
Comprehensive analysis of carbohydrate-active enzymes from the filamentous fungus Scytalidium candidum 3C
Biochemistry (Moscow), 83 (11), 1399-1410 (год публикации - 2018)
10.1134/S000629791811010X
5. Иванова Л. А., Швецова С. В., Кульминская А. А. Иммобилизованная альфа-L-фукозидаза из Fusarium proliferatum LE1 в ферментативном синтезе фукоолигосахаридов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 209-210 (год публикации - 2018)
6. Энейская Е.В., Бобров К.С., Кашина М.В., Борисова А.С., Кульминская А.А. Новая эндо-β-1,4-ксиланаза из Scytalidium candidum 3C - эффективный инструмент для синтеза ксилоолигосахаридов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., c. 196-197 (год публикации - 2018)
7. Кульминская А.А. О возможностях микроорганизмов в синтезе/трансформациях углеводсодержащих продуктов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 15-16 (год публикации - 2018)
8. Швецова С.В., Иванова Л.А., Кульминская А.А. Особенности действия α-L-фукозидазы и сульфатазы из нового штамма гриба Fusarium proliferatum LE1 в реакциях гидролиза и синтеза Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 120-121 (год публикации - 2018)
9. Лапина И.М., Журишкина Е.В. Влияние фукоидана из Fucus vesiculosus на клетки Hep G2 и Chang Liver Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 43-44 (год публикации - 2018)
10. Иванова Л. А., Швецова С. В., Кульминская А. А. Ферментативный синтез фукоолигосахаридов иммобилизованной альфа-L-фукозидазой из Fusarium proliferatum LE1 в реакциях трансгликозилирования Неделя Науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием. Институт биомедицинских систем и технологий., с. 79-81 (год публикации - 2018)
11. Иванова Л. А., Швецова С. В., Волокитина М. В., Коржикова-Влах Е. Г., Кульминская А. А. Разработка модели ферментативного синтеза фукоолигосахаридов на основе реакций трансгликозилирования, катализируемых альфа-L-фукозидазой из Fusarium proliferatum LE1 сборник тезисов XIX зимней молодежной школы по биофизике и молекулярной биологии, с. 124-125 (год публикации - 2018)
12. Чеблоков А. А., Кульминская А. А., Бобров К. С. Высокостабильная эукариотическая фукозидаза FFpI, клонированная из Fusarium proliferatum LE1 сборник тезисов XIX зимней молодежной школы по биофизике и молекулярной биологии, c. 186-187 (год публикации - 2018)
13.
Кульминская А.А.
Scytalidium sp., 3C is a promising toolbox for biomass degradation.
Journal of Glycobiology, vol. 7, p. 78 (год публикации - 2018)
10.4172/2168-958X-C2-014
14. Павлов И.Ю., Полев Д.Е., Кульминская А.А. Биоинформатический подход к идентификации криптического вида гриба Сборник тезисов молодежного научного форума "Open science 2016", стр. 10 (год публикации - 2016)
15. Швецова С.В., Бобров К.С., Шабалин К.А., Иванен Д.Р., Устюжанина Н.Е., Нифантьев Н.Э., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Гагкаева Т.Ю., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Высокоактивный комплекс ферментов из Fusarium Proliferatum LE1 в гидролизе фукоолигосахаридов и сульфатированных гликоконьюгатов Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 1, стр. 227 (год публикации - 2016)
16. Бобров К.С., Корбан С.А., Майнскова М.А., Нарыжный С.Н., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Биохимическая характеристика немодифицированной рекомбинантной сульфатазы из Fusarium proliferatum LE1 Acta Naturae, 2017. Спецвыпуск с.136 (год публикации - 2017)
17. Корбан С.А., Бобров К.С., Швецова С.В., Кульминская А.А. Characterization of the first fungal sulfatase isolated from plant-pathogen fungi Fusarium proliferatum The biochemistry and chemistry of biocatalysis, стр. 81 (год публикации - 2016)
18. Кульминская А.А. Filamentous fungi is a promising toolbox for biotechnology Biocatalysis-2017: Fundamentals and Applications, c.62 (год публикации - 2017)
19. Журишкина Е.В., Степанов С.И., Швецова С.В., Кульминская А.А., Лапина И.М. Сравнительный анализ влияния фукоидана из водорослей Fucus vesiculosus и фракций, полученных из него с помощью анионообменной хроматографии, на клетки HeLa G-63, Hep G2 и Chang Liver Цитология, № 2, т. 57 (год публикации - 2017)
20. Швецова С.В. , Нарыжный С.Н. , Копылов А.Т. , Власова О.Л. , Кульминская А.А. Характеристика новой грибной арилсульфатазы из Fusarium proliferatum LE1 Неделя науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием., Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций. Секция "Медицинская физика", с.526 (год публикации - 2017)
21. Энейская Е.В., Иванен Д.Р., Бобров К.С., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Швецова С.В., Кульминская А.А. Исследование гемицеллюлазного комплекса Geotrichum Candidum 3C с использованием тиогликоолигосахаридов Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 2, стр. 46 (год публикации - 2016)
22. Энейская Е.В., Иванен Д.Р., Бобров К.С., Нарыжный С.Н., Майнскова М.А., Павлов И.Ю., Кусакин П., Каргалов А., Борисова А.С., Кульминская А.А. Two approaches for screening and characterization of lignocellulolytic system in microorganisms 19th European Carbohydrate Symposium, c. 435 (год публикации - 2017)
23. Борисова А.С., Энейская Е.В., Бобров К.С., Ибатуллин Ф., Сувамай Я., Пайн К. M., Кульминская А.А., Сандгрен М., Столберг Дж. Sequence, structure and function correlation concepts in the GH7 cellobiohydrolases Biocatalysis-2017: Fundamentals and Applications, с.46 (год публикации - 2017)
24. Энейская Е.В., Павлов И.Ю., Полев Д.Е., Иванен Д.Р., Сумачева А.Д., Журишкина Е.В., Бобров К.С. , Нарыжный С.Н., Згода В.Г. , Швецова С.В., Кульминская А.А. Идентификация и исследование мицелиального гриба Scytalidium sp. (бывш. Geotrichum Candidum 3C) - эффективного продуцента ферментов гемицеллюлазного комплекса XVIII Зимняя молодежная школа по биофизике и молекулярной биологии, с.73 (год публикации - 2017)
25.
Корбан С.А., Бобров К.С., Майнскова М.А., Нарыжный С.Н., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А.
Heterologous expression in Pichia pastoris and biochemical characterization of the unmodified sulfatase from Fusarium proliferatum LE1
Protein Engineering, Design&Selection: PEDS, 30(7):477-488 (год публикации - 2017)
10.1093/protein/gzx033
26. Корбан С.А., Бобров К.С., Швецова С.В., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Получение и характеристика рекомбинантной арилсульфатазы мицелиального гриба Fusarium Proliferatum LE1 Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 2, с. 223 (год публикации - 2016)
27. Сумачева А.Д., Журишкина Е.В., Кульминская А.А. Морфологическая идентификация криптического вида гриба Сборник тезисов молодежного научного форума "Open science 2016", стр.37 (год публикации - 2016)
28. Журишкина Е.В., Степанов С.И., Лапина И.М., Кульминская А.А. Сравнительный анализ влияния на клетки Hep G 2 И Chang liver нативного и низкомолекулярных фукоиданов из бурых водорослей Fucus vesiculosus Неделя науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием., Высшая школа биотехнологии и пищевых технологий. Секция "Актуальные проблемы прикладной биотехнологии", с.33 (год публикации - 2017)
29.
Швецова С.В., Шабалин К.А., Бобров К.С., Иванен Д.Р., Устюжанина Н.Е., Нифантьев Н.Э., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Энейская Е.В., Кульминская А.А.
Characterization of a new α-L-fucosidase isolated from Fusarium proliferatum LE1 that is regioselective to α-(1→4)-L-fucosidic linkage in the hydrolysis of α-L-fucobiosides
Biochimie, Biochimie 132C (2017) pp. 54-65 (год публикации - 2017)
10.1016/j.biochi.2016.10.014
30. Лапина И.М., Журишкина Е.В., Степанов С.И., Кульминская А.А. Cytotoxic effect of native fucoidans and their fractions obtained by anion-exchange chromatography on cancer and non-malignant mammalian cells 19th European Carbohydrate Symposium, c.566 (год публикации - 2017)
Публикации
1.
Борисова А.С., Энейская Е.В., Йана С., Бадино С.Ф., Кари Йе., Аморе А., Карлссон М.,Ханссон Х., Сандгрен М., Химмель М.Е., Вест П., Пэйне К.М., Кульминская А.А., Столберг Йе.
Correlation of structure, function and protein dynamics in GH7 cellobiohydrolases from Trichoderma atroviride, T. reesei and T. harzianum.
Biotechnology for Biofuels, 11:5 (год публикации - 2018)
10.1186/s13068-017-1006-7
2.
Павлов И.Ю., Бобров К.С., Сумачева А.Д., Машарский А.Е., Полев Д.Е., Журишкина Е.В., Кульминская А.А.
Scytalidium candidum 3C is a new name for the Geotrichum candidum Link 3C strain
Journal of Basic Microbiology, 58(10), 883-891 (год публикации - 2018)
10.1002/jobm.201800066
3.
Швецова С.В., Кульминская А.А.
Microbial sulfatases
Moscow University Chemistry Bulletin, 73 (4), 139–151 (год публикации - 2018)
10.3103/S0027131418040090
4.
Павлов И.Ю, Энейская Е.В., Бобров К.С., Полев Д.Е., Иванен Д.Р., Копылов А.Т., Нарыжный С.Н., Кульминская А.А.
Comprehensive analysis of carbohydrate-active enzymes from the filamentous fungus Scytalidium candidum 3C
Biochemistry (Moscow), 83 (11), 1399-1410 (год публикации - 2018)
10.1134/S000629791811010X
5. Иванова Л. А., Швецова С. В., Кульминская А. А. Иммобилизованная альфа-L-фукозидаза из Fusarium proliferatum LE1 в ферментативном синтезе фукоолигосахаридов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 209-210 (год публикации - 2018)
6. Энейская Е.В., Бобров К.С., Кашина М.В., Борисова А.С., Кульминская А.А. Новая эндо-β-1,4-ксиланаза из Scytalidium candidum 3C - эффективный инструмент для синтеза ксилоолигосахаридов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., c. 196-197 (год публикации - 2018)
7. Кульминская А.А. О возможностях микроорганизмов в синтезе/трансформациях углеводсодержащих продуктов Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 15-16 (год публикации - 2018)
8. Швецова С.В., Иванова Л.А., Кульминская А.А. Особенности действия α-L-фукозидазы и сульфатазы из нового штамма гриба Fusarium proliferatum LE1 в реакциях гидролиза и синтеза Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 120-121 (год публикации - 2018)
9. Лапина И.М., Журишкина Е.В. Влияние фукоидана из Fucus vesiculosus на клетки Hep G2 и Chang Liver Фундаментальная гликобиология. Сборник материалов IV Всероссийской конференции., с. 43-44 (год публикации - 2018)
10. Иванова Л. А., Швецова С. В., Кульминская А. А. Ферментативный синтез фукоолигосахаридов иммобилизованной альфа-L-фукозидазой из Fusarium proliferatum LE1 в реакциях трансгликозилирования Неделя Науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием. Институт биомедицинских систем и технологий., с. 79-81 (год публикации - 2018)
11. Иванова Л. А., Швецова С. В., Волокитина М. В., Коржикова-Влах Е. Г., Кульминская А. А. Разработка модели ферментативного синтеза фукоолигосахаридов на основе реакций трансгликозилирования, катализируемых альфа-L-фукозидазой из Fusarium proliferatum LE1 сборник тезисов XIX зимней молодежной школы по биофизике и молекулярной биологии, с. 124-125 (год публикации - 2018)
12. Чеблоков А. А., Кульминская А. А., Бобров К. С. Высокостабильная эукариотическая фукозидаза FFpI, клонированная из Fusarium proliferatum LE1 сборник тезисов XIX зимней молодежной школы по биофизике и молекулярной биологии, c. 186-187 (год публикации - 2018)
13.
Кульминская А.А.
Scytalidium sp., 3C is a promising toolbox for biomass degradation.
Journal of Glycobiology, vol. 7, p. 78 (год публикации - 2018)
10.4172/2168-958X-C2-014
14. Павлов И.Ю., Полев Д.Е., Кульминская А.А. Биоинформатический подход к идентификации криптического вида гриба Сборник тезисов молодежного научного форума "Open science 2016", стр. 10 (год публикации - 2016)
15. Швецова С.В., Бобров К.С., Шабалин К.А., Иванен Д.Р., Устюжанина Н.Е., Нифантьев Н.Э., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Гагкаева Т.Ю., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Высокоактивный комплекс ферментов из Fusarium Proliferatum LE1 в гидролизе фукоолигосахаридов и сульфатированных гликоконьюгатов Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 1, стр. 227 (год публикации - 2016)
16. Бобров К.С., Корбан С.А., Майнскова М.А., Нарыжный С.Н., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Биохимическая характеристика немодифицированной рекомбинантной сульфатазы из Fusarium proliferatum LE1 Acta Naturae, 2017. Спецвыпуск с.136 (год публикации - 2017)
17. Корбан С.А., Бобров К.С., Швецова С.В., Кульминская А.А. Characterization of the first fungal sulfatase isolated from plant-pathogen fungi Fusarium proliferatum The biochemistry and chemistry of biocatalysis, стр. 81 (год публикации - 2016)
18. Кульминская А.А. Filamentous fungi is a promising toolbox for biotechnology Biocatalysis-2017: Fundamentals and Applications, c.62 (год публикации - 2017)
19. Журишкина Е.В., Степанов С.И., Швецова С.В., Кульминская А.А., Лапина И.М. Сравнительный анализ влияния фукоидана из водорослей Fucus vesiculosus и фракций, полученных из него с помощью анионообменной хроматографии, на клетки HeLa G-63, Hep G2 и Chang Liver Цитология, № 2, т. 57 (год публикации - 2017)
20. Швецова С.В. , Нарыжный С.Н. , Копылов А.Т. , Власова О.Л. , Кульминская А.А. Характеристика новой грибной арилсульфатазы из Fusarium proliferatum LE1 Неделя науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием., Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций. Секция "Медицинская физика", с.526 (год публикации - 2017)
21. Энейская Е.В., Иванен Д.Р., Бобров К.С., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Швецова С.В., Кульминская А.А. Исследование гемицеллюлазного комплекса Geotrichum Candidum 3C с использованием тиогликоолигосахаридов Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 2, стр. 46 (год публикации - 2016)
22. Энейская Е.В., Иванен Д.Р., Бобров К.С., Нарыжный С.Н., Майнскова М.А., Павлов И.Ю., Кусакин П., Каргалов А., Борисова А.С., Кульминская А.А. Two approaches for screening and characterization of lignocellulolytic system in microorganisms 19th European Carbohydrate Symposium, c. 435 (год публикации - 2017)
23. Борисова А.С., Энейская Е.В., Бобров К.С., Ибатуллин Ф., Сувамай Я., Пайн К. M., Кульминская А.А., Сандгрен М., Столберг Дж. Sequence, structure and function correlation concepts in the GH7 cellobiohydrolases Biocatalysis-2017: Fundamentals and Applications, с.46 (год публикации - 2017)
24. Энейская Е.В., Павлов И.Ю., Полев Д.Е., Иванен Д.Р., Сумачева А.Д., Журишкина Е.В., Бобров К.С. , Нарыжный С.Н., Згода В.Г. , Швецова С.В., Кульминская А.А. Идентификация и исследование мицелиального гриба Scytalidium sp. (бывш. Geotrichum Candidum 3C) - эффективного продуцента ферментов гемицеллюлазного комплекса XVIII Зимняя молодежная школа по биофизике и молекулярной биологии, с.73 (год публикации - 2017)
25.
Корбан С.А., Бобров К.С., Майнскова М.А., Нарыжный С.Н., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А.
Heterologous expression in Pichia pastoris and biochemical characterization of the unmodified sulfatase from Fusarium proliferatum LE1
Protein Engineering, Design&Selection: PEDS, 30(7):477-488 (год публикации - 2017)
10.1093/protein/gzx033
26. Корбан С.А., Бобров К.С., Швецова С.В., Власова О.Л., Энейская Е.В., Кульминская А.А. Получение и характеристика рекомбинантной арилсульфатазы мицелиального гриба Fusarium Proliferatum LE1 Acta Naturae, СПЕЦВЫПУСК том 2, с. 223 (год публикации - 2016)
27. Сумачева А.Д., Журишкина Е.В., Кульминская А.А. Морфологическая идентификация криптического вида гриба Сборник тезисов молодежного научного форума "Open science 2016", стр.37 (год публикации - 2016)
28. Журишкина Е.В., Степанов С.И., Лапина И.М., Кульминская А.А. Сравнительный анализ влияния на клетки Hep G 2 И Chang liver нативного и низкомолекулярных фукоиданов из бурых водорослей Fucus vesiculosus Неделя науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием., Высшая школа биотехнологии и пищевых технологий. Секция "Актуальные проблемы прикладной биотехнологии", с.33 (год публикации - 2017)
29.
Швецова С.В., Шабалин К.А., Бобров К.С., Иванен Д.Р., Устюжанина Н.Е., Нифантьев Н.Э., Нарыжный С.Н., Згода В.Г., Энейская Е.В., Кульминская А.А.
Characterization of a new α-L-fucosidase isolated from Fusarium proliferatum LE1 that is regioselective to α-(1→4)-L-fucosidic linkage in the hydrolysis of α-L-fucobiosides
Biochimie, Biochimie 132C (2017) pp. 54-65 (год публикации - 2017)
10.1016/j.biochi.2016.10.014
30. Лапина И.М., Журишкина Е.В., Степанов С.И., Кульминская А.А. Cytotoxic effect of native fucoidans and their fractions obtained by anion-exchange chromatography on cancer and non-malignant mammalian cells 19th European Carbohydrate Symposium, c.566 (год публикации - 2017)