КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-14-00227

НазваниеСетчатая эволюция и роль гибридов происхождении однополых и обоеполых видов рептилий.

РуководительГалоян Эдуард Арташесович, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук, г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2022 г. - 2024 г. 

Конкурс№68 - Конкурс 2022 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-101 - Зоология

Ключевые словаЭволюция, гибридизация, партеногенез, цитогенетика, мейоз, изоляция видов

Код ГРНТИ34.33.27


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Возникновение способных к размножению межвидовых гибридов противоречит биологической концепции вида, однако более интригует вопрос, почему в одном случае два близких вида скрещиваются и дают плодовитое потомство, хотя в других условиях те же виды сосуществуют на протяжении продолжительного времени без очевидных свидетельств потока генов между ними. В случае, если гибридизация происходит, фенотипы гибридного происхождения объединяют свойства родительских филогенетических линий, что значительно расширяет их адаптивные возможности. Даже в случае, если геномы родительских видов произошли от общего предка миллионы лет назад и значительно дивергировали, одним из механизмов, позволяющем обойти стерильность у гибрида становится партеногенез, описанный для разнообразных групп рептилий. Объединение в одном организме двух слабо скореллированных родительских геномов должно приводить к состоянию геномного шока, и, как следствие – к повышенному разнообразию фенотипов гибридов первых поколений. Наша гипотеза заключается в том, что появление межвидовых гибридов, в том числе однополых форм, сопряжено с нарушением возрастного и полового состава популяции одного из родительских видов в субоптимальных условиях в местах вторичного перекрывания ареалов. Гибриды в этом случае получают возможность выживания в новых условиях благодаря разнообразному фенотипу, возникшему в результате объединения двух родительских генотипов. Партеногенез в этом случае может быть промежуточным этапом в эволюции таксонов надвидового ранга, позволяющим впоследствии вернуться к обоеполому размножению. Для проверки этих гипотез мы предлагаем мультидисциплинарный подход для изучения многовидовых комплексов рептилий, для которых известны как обоеполые, так и однополые виды, относящиеся к разным семействам ящериц и змей (Lacertidae, Agamidae, Gekkonidae, Typhlopidae). Выбор рептилий в качестве объекта эволюционных исследований обусловлен тем, что они обладают значительно большим разнообразием репродуктивных стратегий и систем определения пола, чем птицы и млекопитающие вместе взятые. Кроме того, постзиготические механизмы изоляции у рептилий развиты слабее, чем у птиц и млекопитающих, а изоляция обеспечивается преимущественно презиготическими (экологическими или этологическими) механизмами, преодоление которых приводит к нормальному развитию межвидовых гибридов. В рамках работы мы планируем подробно исследовать механизмы презиготической и постзиготической репродуктивной изоляции; особенности морфологии, экологии, генетики и цитогенетики межвидовых гибридов обоеполых видов и партеногенетических форм, имеющих гибридное происхождение. Нами впервые будут описаны и опубликованы соматические и мейотические кариотипы ранее неописанных модельных рептилий. В ходе работы мы разрабатываем методы определения родительских хромосом в гибридных кариотипах с помощью дизайна FISH зондов на основе анализа геномных данных перицентромерных локусов. Кроме того, в ходе выполнения Проекта мы развиваем технологии искусственного содержания и перекрестного оплодотворения модельных видов ящериц.

Ожидаемые результаты
1. Впервые будут получены гибриды у ящериц родов Darevskia, Eublepharis, Ptyodactylus, Hemidactylus и Podarcis для проверки степени репродуктивной изоляции у родительских видов и фенотипической пластичности у гибридов. В рамках работы будет впервые разработана методика искусственного оплодотворения у вышеобозначенных групп рептилий. 2. Впервые на базе ИПЭЭ РАН будет создан криобанк сперматозоидов модельных видов рептилий для проведения регулярных исследований по межвидовой гибридизации и поддержанию линий модельных видов. 3. Будут описаны сезонные изменения гормонального статуса модельных партеногенетических и обоеполых видов ящериц. 4. Впервые будет произведено сравнение между двумя центрами разнообразия обоеполых и партеногенетических видов скальных ящериц рода Darevskia в двух центрах разнообразия Эльбурс в Иране и на Кавказе. 5. Будут изучены особенности экологии и поведения партеногенетических и обоеполых видов агам бабочек (виды рода Leiolepis) в прибрежных зонах в Тайланде и Вьетнаме. 6. Будут обнаружены зоны вторичного перекрывания ареалов и возможные зоны гибридизации для гекконов рода Ptyodactulus, Lepidodactylus, агам бабочек Leiolepis, скальных ящериц Darevskia. 7. Будет получена оценка плоидности особей в местах вторичного перекрывания ареалов в сообществах многовидовых группировок, в состав которых входят как обоеполые, так и однополые виды ящериц. 8. Будут изучены особенности морфологии, генетики и цитогенетики диплоидных и полиплоидных гибридов между партеногенетическими самками и обоеполыми видами модельных видов ящериц, что необходимо для прогнозирования эволюционных перспектив клональных популяций. 9. Будут выявлены механизмы межвидовой изоляции для разных филогенетических линий в условиях сосуществования. 10. Впервые будут получены сравнительные данные о структуре мейотических и соматических кариотипов, хромосомных перестройках и особенностях систем половых хромосом в модельных группах рептилий. 11. Будет уточнен цитологический механизм восстановления плоидности у партеногенетических видов рептилий из родов Darevskia и описан у других модельных видов из родов Leiolepis, Hemidactylus, Lepidodactulus и Ramphotyphlops. 12. Будет проведен анализ последствий геномного шока (объединения двух дивергировавших хромосомных наборов в гибридном кариотипе) в первом поколении у модельных видов ящериц и гекконов, определена их фертильность и морфологические признаки. 13. Будут определены основные стадиоспецифические мейотические ограничения развития половых клеток у рептилий гибридного происхождения. 14. Будет разработан новый метод исследования гибридных кариотипов, применимый для всех модельных групп Проекта, и, в перспективе, для других биологических объектов. На основе биоинформатического анализа геномных данных перицентромерных районов хромосом родительских видов будут выбраны видоспецифичные пары мономеров сателлитной ДНК для получения надежных FISH-зондов. В 2021 году мы успешно получили такие ДНК-зонды для двух видов скальных ящериц и планируем разработать надежный метод, применимый для широкого круга объектов. 15. Полученные нами результаты будут опубликованы в высокорейтинговых журналах.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Вопрос сетчатого видообразования был и остается чрезвычайно актуальным для понимания механизмов появления новых видов. Рептилии представляют собой особенный интерес, поскольку межвидовая гибридизация может приводить к появлению партеногенетических особей, способных к размножению без самцов. При этом, будучи близкими к своим родителям, они регулярно встречаются с родственными видами в местах вторичного перекрывания ареалов, где может происходить вторичная гибридизация и возникновение полиплоидных особей. Для работы мы выбрали несколько модельных групп, удобных для изучения предпосылок межвидовой гибридизации и ее последствий. В центре нашего исследования стоят скальные ящерицы из рода Darevskia, агамы бабочки из рода Leiolepis и гекконы из рода Ptyodactylus и змеи из рода Vipera (Pelias), где также встречаются гибридные популяции. В 2022 году мы впервые подробно описали мейотический кариотип обыкновенной гадюки Vipera berus, характеризующийся ярко выраженной бимодальностью (большая разница размеров макро- и микрохромосом). Мы разработали маркеры для определения гибридных особей и продолжаем работу по изучению особенностей кариотипов видов, имеющих гибридное происхождение. Центр биоразнообразия многовидовой группы скальных ящериц приходится на Кавказ, где встречается более 20 обоеполых видов и семь партеногенетических видов. Последние, как известно, имеют гибридное происхождение, поэтому описание ареалов и условий обитания родительских видов необходимо для понимания причин возникновения однополых видов. В этом году мы совершили экспедицию в северный и центральный Эльбурс на севере Ирана. В 2014 году отсюда было описано несколько новых видов скальных ящериц, относящихся к группам D. chlorogaster и D. defilippii (Ahmadzadeh et al., 2014). Однако до сих пор этот регион остается малоизученным, поэтому в 2022 году мы с иранскими коллегами предприняли попытку поиска однополых видов на территории Эльбурса. Экспедицию проводили в июле с тем расчетом, что если мы обнаружим однополых ящериц, то самки такого вида будут носить яйца, однако на них не будет следов от попыток спаривания с самцами. В 2022 году нам не удалось обнаружить партеногенетический вид, однако в северной части Эльбурса мы обнаружили скальную ящерицу, напоминающую по своей морфологии D. portschinskii, не известную из этого региона. Сейчас мы проводим молекулярно-генетический анализ для уточнения таксономического статуса обнаруженной формы. В предыдущих работах мы показали, что межвидовая гибридизация у ящериц происходит значительно реже, чем может показаться на первый взгляд: близкие виды скальных ящериц не скрещиваются между собой даже если сосуществуют вместе (Galoyan et al., 2019). Даже те из них, что когда-то дали начало партеногенетическим видам, не скрещиваются между собой в настоящее время: D. raddei не гибридизирует с D. portschinskii, хотя ранее эти два вида были родительскими для D. rostombekowi. Наши коллеги (Freitas et al., 2022) показали, что межвидовая гибридизация у скальных ящериц в прошлом была весьма редким событием. Тем не менее, если ящерицы разных видов попадают в условия депривации половых партнеров, например, в террариуме, то самцы спариваются с самками другого вида и в этом случае происходит преодоление поведенческой репродуктивной изоляции. В 2022 году в террариуме нам удалось получить гибридов между видами из разных филогенетических клад D. portshicnskii/D. raddei nairensis. Важно, что многие из гибридов погибли на ранних стадиях эмбриогенеза. Это свидетельствуют о том, что молекулярно-цитологические механизмы изоляции между изучаемыми видами работают не абсолютно. Мы предположили, что оледенения приводили не только к смещению ареалов, но и загоняли виды в субоптимальные условия, где самцы одного из видов испытывали недостаток самок своего вида, в результате чего у них смещался порог аттрактивности к самкам и они спаривались с самками другого вида (Arakelyan et al., 2022). Именно такой сценарий мог привести к возникновению партеногенетических самок. В дальнейшем они распространялись за пределы места происхождения, где встретились с обоеполыми видами. В настоящее время партеногенетические самки встречаются с самцами родительских видов, что приводит к появлению триплоидного потомства (Danielyan et al., 2008). Ранее мы обратили внимание на то, что в местах вторичного перекрывания ареалов очень мало самцов обоеполого вида, поэтому мы предположили, что у партеногенетических самок может происходить сегрегация геномов и они продуцируют нормальные гаплоидные гаметы, как это известно для съедобных лягушек из рода Pelophyllax (Dedukh, 2022). В 2022 году мы временно изъяли из природы партеногенетических самок Darevskia armeniaca, на теле которых были следы от спаривания с самцами родительского вида D. valentini и получили от них несколько десятков потомков. Однако среди них не обнаружено особей обоеполого родительского вида, а большая часть потомков были клонами своих партеногенетических матерей. Четыре потомка из одной кладки имели триплоидный кариотип, что подтверждает возможность возникновения полиплоидных особей в природе и требует дальнейших экспериментов по их гибридизации для понимания тех процессов, которые происходят в многовидовых сообществах скальных ящериц. Подсчет укусов на теле самок обоих видов показал, что самцы в условиях выбора предпочитают своих самок партеногенетическим, однако число следов от попыток спаривания с самцами на самках обоеполого вида в условиях сосуществования с партеногенетическими самками ниже, чем это же число при отсутствии самок однополого вида. Это свидетельствует о том, что партеногенетические самки интегрируются в социум родительского вида и частично заменяют самок обоеполого вида, оттягивая на себя внимание самцов. Они ничем не отличаются от самок обоеполого вида по реакциям на самцов и выступают в роли социальных и сексуальных партнеров. Мы полагаем, что это может приводит к снижению эффективности размножения обоеполого вида, что впоследствии должно приводить к частичному или полному замещению обоеполого вида партеногенетическим. Если это действительно так, то это интересный механизм конкурентного исключения, работающий в условиях синтопии однополых и обоеполых видов животных. Молекулярно-генетические данные однозначно свидетельствуют в пользу гибридного происхождения изучаемых партеногенетических видов рептилий. Тем не менее, до сих пор не было создано надежных и доступных маркеров, позволяющих идентифицировать родительские хромосомы в кариотипах однополых видов. В 2022 году мы завершили работу по сравнительному анализу данных секвенирования перицентромерной сателлитной ДНК для видов, вовлеченных в гибридизацию. Таким образом, разработан метод исследования гибридных кариотипов, который включет в себя микродиссекцию перицентромерных регионов хромосом, секвенирование, биоинформатический анализ, дизайн FISH-проб и цитогенетическое исследование метафазных хромосом.

 

Публикации

1. Ровацос М, Галоян Э.А., Спангенберг В.Е., Васильева А.Б., Кратохвил Л XX/XY sex chromosomes in a blind lizard (Dibamidae): Towards understanding the evolution of sex determination in squamates Journal of Evolutionary biology, N 35, 1791–1796 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1111/jeb.14123

2. Спангенберг В.Е., Редекоп И., Симановский С.А., Коломиец О.Л. Cytogenetic Analysis of the Bimodal Karyotype of the Common 2 European Adder, Vipera berus (Viperidae) Animals, - (год публикации - 2022)


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
В результате проделанной в 2023 году работы нам удалось разобраться в частных и общих вопросах сетчатой эволюции изучаемых нами групп рептилий. Наиболее важные результаты связаны с филогеографией в двух многовидовых комплексах рептилий: скальных ящериц из рода Darevskia в северной части Ирана агам-бабочек из рода Leiolepis, обитающих во Вьетнаме. В северном Иране нам удалось подтвердить существование выделенных в 2014 году нашими коллегами видов из комплексов D. chlorogaster и D. defilippii и уточнить их ареалы. Мы собрали и обработали обширные данные по этим видам и по D. raddei, что позволит в будущем выявить основные паттерны распространения и диверсификации в этом роде ящериц. К сожалению, попытка обнаружить партеногенетический вид на севере Ирана не увенчалась успехом, однако это позволяет задуматься о причинах многократного появления однополых видов скальных ящериц на Кавказе, сравнив биоклиматические модели распространения их в прошлом и в настоящем. В этом году мы обнаружили и доказали существование триплоидных гибридов между партеногенетическим видом D. dahli и самцами обоеполого вида D. portschinskii, о чем свидетельствуют метафазные препараты и размеры эритроцитов. Нахождение этой устойчивой популяции с многочисленными гибридами поможет нам разобраться в возможности реализации потока генов между обоеполыми и партеногенетчиескими видами. Однако отчасти нам на эту возможность намекает результат, полученный на агамах-бабочках во Вьетнаме, где был обнаружен самец обоеполого с морфологической точки зрения вида Leiolepis guttata из зоны синтопии с партеногенетическим видов L. guentherpetersi, однако обладающий плохо развитыми семенниками и имеющим гетерозиготный аллель по гену C-mos, что характерно для гибридного партеногенетического вида, но не для родительских обоеполых диплоидных видов. Проведя подробный анализ полученных в ходе экспедиции во Вьетнам сборов образцов тканей мы показали, что вид L. ngovantrii, традиционно считающийся партеногенетическим, скорее всего, таковым быть не может. В пользу этого свидетельствует то, что он обладает большим генетическим разнообразием, чем однополый вид L. guentherpetesi; тем, что он имеет диплоидный набор хромосом и тем, что нам удалось обнаружить несколько самцов (хотя причина смещения полового сооотношения в пользу самок остается загадкой). Биоклиматические карты, построенные на основании зарегистрированных нами в природе ящериц и полученные из общедоступных баз данных показали, что три вида: два родительских, L. reevesii и L. guttata хорошо расходятся по своим экологическим нишам, однако в зоне перекрывания их ареала, в условиях экологического субоптимума родительских видов, обитает гибридный партеногенетический вид L. guentherpetersi, занимающий специфическую и узкую экологическую нишу. Наибольший интерес с точки зрения изучения механизмов сетчатой эволюции представляют зоны перекрывания ареалов однополых и обоеполых видов этого рода. Одним из самых важных результатов работы этого года стала работа по выяснению механизмов восстановления плоидности у партеногенетических агам бабочек и скальных ящериц. Оказалось, что в обоих случаях этот процесс происходит благодаря премейотической эндодупликации. Нам удалось убедительно доказать это как на стадиях пахитены у взрослых самок, сравнив их с пахитенами самок обоеполых видов, так и на более ранних стадиях профазы мейоза I, взятых у молодых особей скальных ящериц и агам-бабочек. Таким образом, можно сказать, что премейотический эндомитоз к настоящему моменту становится основным способом восстановления плоидности у рептилий и возникал многократно в разных группах ящериц независимо. Немаловажным результатом в этом году стала проверка гипотезы Черной королевы, согласно которой партеногенетические виды хуже, чем обоеполые родственные виды противостоят паразитарной нагрузке. Проверив концентрацию гемагрегорин в крови у однополых и обоеполых ящериц в условиях синтопии в нескольких ландшафтах и на нескольких парах видов мы убедились, что однополые виды заражены сопоставимо или даже немного сильнее своих обоеполых родственников. Безусловно, нельзя сказать, что иммунная система однополых видов совсем не справляется с защитными функциями, делает она это несколько менее эффективно, чем у обоеполых видов. Проверка уровня гормонов в террариуме показал что имитация условий зимовки в целом позволяет запустить репродуктивный цикл у скальных ящериц: наблюдается закономерное изменение половых гормонов зимой с пиком весной и минимальным уровнем в конце лета, однако происходят они не настолько синхронно и четко, как в природе, где циклика выражена ярко и отчетливо. Случайным открытием для нас стал новый метод определения возраста у ящериц. В отличие от традиционного скелетохронологического метода, основанного на измерении числа линий склеивания в трубчатых костях фаланг пальцев, новый метод основан на подсчете кератиновых линий в когте на том же пальце, что позволяет верифицировать эти методы друг относительно друга.

 

Публикации

1. Галоян Э.А., Сопилко Н.Г., Ковалева А.В., Ци Инь Do Larger and Older Individuals Occupy Better Areas in the Colony of Qinghai Toad-headed Agamas? Asian Herpetological Research, 14(3): 183–190. (год публикации - 2023) https://doi.org/2095-0357.2022.0068

2. Галоян Э.А., Сопилко Н.Г., Ковалева А.В., Чамкина А.В. Double-check in Lizard Age Estimation: “Use of Phalanx Bone and Keratin Claw Sheath Lamellas Asian herpetological research, - (год публикации - 2024)

3. Ирышков Е.С., Соловьёва Е.Н., Аракелян М.С., Растегар- Пуяни Е., Моаддаб М., Мильто К.Д., Галоян Э.А. PHYLOGENY AND GEOGRAPHIC DISTRIBUTION OF ROCK LIZARDS IN ALBORZ MOUNTAIN RANGE Современная герпетология, - (год публикации - 2023)

4. Кропачев И.И., Тархнишвили Д., Мурцхваладзе М., Галоян Э. Living apart together: Morphological, spatial, and genetic differentiation of three sympatric rock lizard species (Lacertidae: Darevskia) of the Caucasus Zoologischer Anzeiger, 303: 71-79 (год публикации - 2023) https://doi.org/j.jcz.2023.01.010

5. Редекоп И.В., Спангенберг В.Е, Особенности митоза, мейоза и видового разнообразия гадюк рода Vipera Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2023», 1-2 (год публикации - 2023)